MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022121	TATGGA	2	12	813	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022121	AAAGCT	2	12	4939	4950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431175
4	NC_022121	CAAAAA	2	12	6250	6261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022121	TAGCAA	2	12	10826	10837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431181
6	NC_022121	AAAGCT	2	12	10957	10968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431181
7	NC_022121	TAGTGA	2	12	12103	12114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431182
8	NC_022121	GTTCCT	2	12	19387	19398	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431188
9	NC_022121	CTTTTT	2	12	21541	21552	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431190
10	NC_022121	GTGAGG	2	12	25471	25482	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532431191
11	NC_022121	GGATTT	2	12	35948	35959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431203
12	NC_022121	AATTAG	2	12	37368	37379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532431204
13	NC_022121	TTCCTG	2	12	37667	37678	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431204
14	NC_022121	TTTTGA	2	12	44974	44985	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532431211
15	NC_022121	TGAACG	2	12	52346	52357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431218
16	NC_022121	GTGATT	2	12	52365	52376	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431218
17	NC_022121	GATCTG	2	12	55014	55025	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431220
18	NC_022121	GTGTAA	2	12	55062	55073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431220
19	NC_022121	GGTTCA	2	12	55151	55162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431220
20	NC_022121	GAAAAG	2	12	56410	56421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432012
21	NC_022121	AGTTGT	2	12	57761	57772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532432013
22	NC_022121	TTGTTC	2	12	58681	58692	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532432013
23	NC_022121	TGAAAA	2	12	59151	59162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532431221
24	NC_022121	TCCTAA	2	12	59490	59501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431221
25	NC_022121	AAAAAT	2	12	60985	60996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022121	GTTCTT	2	12	63410	63421	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532431223
27	NC_022121	CTATTT	2	12	71732	71743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532431230
28	NC_022121	ACTCTT	2	12	72861	72872	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431231
29	NC_022121	TTTCTG	2	12	73411	73422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532431232
30	NC_022121	GATCAT	2	12	73541	73552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431232
31	NC_022121	TAGTAC	2	12	76535	76546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431233
32	NC_022121	ATCTAG	2	12	76714	76725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022121	GGTTTA	2	12	80186	80197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431236
34	NC_022121	TTTAGT	2	12	81959	81970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532431238
35	NC_022121	GTCTGT	2	12	83230	83241	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532431239
36	NC_022121	TTCTGA	2	12	88844	88855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431242
37	NC_022121	AAAAGA	2	12	93908	93919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532431248
38	NC_022121	AGCTGT	2	12	96001	96012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431249
39	NC_022121	TCTTTT	2	12	96666	96677	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431251
40	NC_022121	GGGGCT	2	12	97614	97625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532431251
41	NC_022121	TTTGAG	2	12	99818	99829	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431253
42	NC_022121	TCAGAA	2	12	106459	106470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431258
43	NC_022121	CATAAC	2	12	109503	109514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532432018
44	NC_022121	TGTTCT	2	12	112267	112278	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532431262
45	NC_022121	ACTTCG	2	12	115551	115562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431263
46	NC_022121	TTTTAG	2	12	115986	115997	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022121	TTGCCA	2	12	119089	119100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431267
48	NC_022121	TAAAAA	2	12	120581	120592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022121	TTGGTA	2	12	120629	120640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431269
50	NC_022121	AGGATC	2	12	121008	121019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431269
51	NC_022121	AAGGGT	2	12	122815	122826	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532431270
52	NC_022121	GGGTTT	2	12	123778	123789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022121	TTGCAT	2	12	124060	124071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022121	AAGAGA	2	12	124429	124440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022121	TTAAAA	2	12	133363	133374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431276
56	NC_022121	AGGTTG	2	12	134605	134616	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	532431277
57	NC_022121	CTGTTT	2	12	135300	135311	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532431278
58	NC_022121	GAGTTA	2	12	139655	139666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431285
59	NC_022121	TGGAAA	2	12	142208	142219	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532431288
60	NC_022121	TGGAAT	2	12	143083	143094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431289
61	NC_022121	ATGGTT	2	12	143327	143338	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431289
62	NC_022121	TGCTCT	2	12	145518	145529	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431292
63	NC_022121	GAAAGG	2	12	149256	149267	50 %	0 %	50 %	0 %	532431294
64	NC_022121	GCTTTG	2	12	149499	149510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532431294
65	NC_022121	CCTCAT	2	12	154919	154930	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431299
66	NC_022121	TGGAGA	2	12	156377	156388	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532431301
67	NC_022121	CTCCAT	2	12	157744	157755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431302
68	NC_022121	TCCTTG	2	12	158340	158351	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431303
69	NC_022121	AACAGC	2	12	160977	160988	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431306
70	NC_022121	AAAAAG	2	12	173564	173575	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532431313
71	NC_022121	TCCCAA	2	12	181994	182005	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532431317
72	NC_022121	AGAAAA	2	12	182611	182622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022121	ACTTCT	2	12	189675	189686	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532432031
74	NC_022121	ATTTGC	2	12	192367	192378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532432033
75	NC_022121	AAACAT	2	12	193457	193468	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532431323
76	NC_022121	AGCAAC	2	12	193792	193803	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431323
77	NC_022121	TATGAA	2	12	195386	195397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022121	TTGCCT	2	12	196500	196511	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532432038
79	NC_022121	TCTGGA	2	12	199750	199761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431328
80	NC_022121	CTGGAT	2	12	215341	215352	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431341
81	NC_022121	GAAATA	2	12	215664	215675	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532431341
82	NC_022121	TTTTAC	2	12	221395	221406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022121	GATGCA	2	12	222556	222567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431348
84	NC_022121	ACTCCA	2	12	223446	223457	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532431349
85	NC_022121	CTGCTT	2	12	223678	223689	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431349
86	NC_022121	ATTGCT	2	12	226987	226998	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431352
87	NC_022121	TCCTAG	2	12	227277	227288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431352
88	NC_022121	GCAACG	2	12	227765	227776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431353
89	NC_022121	CTTAGC	2	12	230398	230409	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431355
90	NC_022121	TTCCTT	2	12	237230	237241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
91	NC_022121	TCTCCT	2	12	240111	240122	0 %	50 %	0 %	50 %	532431361
92	NC_022121	AAACCA	2	12	240686	240697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431362
93	NC_022121	AACCCT	2	12	255111	255122	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022121	ATTTTT	2	12	255906	255917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022121	CCTGCA	2	12	256067	256078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431381
96	NC_022121	ACCTTT	2	12	261262	261273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431386
97	NC_022121	TCATAA	2	12	269109	269120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431393
98	NC_022121	AAGTGT	2	12	269835	269846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431393
99	NC_022121	AGGAGA	2	12	271008	271019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022121	ATCTAA	2	12	273113	273124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431396
101	NC_022121	TGGAAT	2	12	275311	275322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431398
102	NC_022121	GGAACA	2	12	279198	279209	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532431400
103	NC_022121	ATATTA	2	12	279906	279917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022121	CACGCG	2	12	281571	281582	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532431402
105	NC_022121	TTTCTT	2	12	281750	281761	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431402
106	NC_022121	CTCCTA	2	12	285912	285923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431405
107	NC_022121	GCAATG	2	12	292030	292041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431411
108	NC_022121	CGACAT	2	12	292700	292711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431412
109	NC_022121	CCCTTA	2	12	294154	294165	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431414
110	NC_022121	AAAATA	2	12	296252	296263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532431416
111	NC_022121	ACCACT	2	12	298607	298618	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532431418
112	NC_022121	CATTGC	2	12	301853	301864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431421
113	NC_022121	CCAAAA	2	12	303032	303043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431422
114	NC_022121	TCTTTT	2	12	304917	304928	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431424
115	NC_022121	CAAGAC	2	12	306008	306019	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431425
116	NC_022121	AGCTTA	2	12	307289	307300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431427
117	NC_022121	CAAAGA	2	12	312661	312672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532431432
118	NC_022121	ATGGCT	2	12	313277	313288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431433
119	NC_022121	TACAAA	2	12	317467	317478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532431436
120	NC_022121	TTAATT	2	12	319146	319157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431438
121	NC_022121	AAAACA	2	12	322633	322644	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532431440
122	NC_022121	AAAAAG	2	12	324059	324070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022121	CAGAAC	2	12	344606	344617	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431457
124	NC_022121	ATTCAA	2	12	349582	349593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431462
125	NC_022121	AGAATA	2	12	361539	361550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022121	TTCTTA	2	12	361559	361570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532431470
127	NC_022121	CAGCCT	2	12	373641	373652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431482
128	NC_022121	AGCTGA	2	12	373691	373702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431482
129	NC_022121	ATGCTA	2	12	377558	377569	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431484
130	NC_022121	CAATAG	2	12	384164	384175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431487
131	NC_022121	ACTGAA	2	12	384305	384316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431487
132	NC_022121	CTGCAC	2	12	384498	384509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431487
133	NC_022121	TCCATA	2	12	394856	394867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431495
134	NC_022121	TTAGGT	2	12	396214	396225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431497
135	NC_022121	AGGGAA	2	12	397540	397551	50 %	0 %	50 %	0 %	532431498
136	NC_022121	CTGAAG	2	12	398375	398386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431499
137	NC_022121	TAATCT	2	12	403792	403803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532431502
138	NC_022121	GAACAA	2	12	404294	404305	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532431503
139	NC_022121	CTAAAG	2	12	404677	404688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431504
140	NC_022121	CCTTTC	2	12	405841	405852	0 %	50 %	0 %	50 %	532431505
141	NC_022121	TTTTAA	2	12	409705	409716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431507
142	NC_022121	ACATGC	2	12	415384	415395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431513
143	NC_022121	GGCTCT	2	12	416119	416130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431514
144	NC_022121	ATCTTG	2	12	417713	417724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431515
145	NC_022121	CCCCCA	2	12	419047	419058	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	532431516
146	NC_022121	TTCCTC	2	12	423112	423123	0 %	50 %	0 %	50 %	532431519
147	NC_022121	CTCTAC	2	12	426361	426372	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431521
148	NC_022121	ACATCA	2	12	427006	427017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431522
149	NC_022121	CGGAAT	2	12	427268	427279	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431523
150	NC_022121	TGATAA	2	12	429173	429184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532431524
151	NC_022121	AGCTAA	2	12	431547	431558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431526
152	NC_022121	TTCTCC	2	12	443583	443594	0 %	50 %	0 %	50 %	532431535
153	NC_022121	ATGAAG	2	12	452634	452645	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532431543
154	NC_022121	TAACTC	2	12	453151	453162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431543
155	NC_022121	ATCCGC	2	12	454076	454087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431543
156	NC_022121	CTAAAG	2	12	456494	456505	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431544
157	NC_022121	CCAATA	2	12	461479	461490	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431548
158	NC_022121	ATCGGC	2	12	467326	467337	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532431556
159	NC_022121	TATTGG	2	12	467919	467930	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431556
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161	NC_022121	TCTTCA	2	12	480698	480709	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431561
162	NC_022121	CTACAA	2	12	484461	484472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431561
163	NC_022121	CCAATC	2	12	488929	488940	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532432051
164	NC_022121	TTCTTT	2	12	492751	492762	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431571
165	NC_022121	CTGAAG	2	12	495810	495821	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431573
166	NC_022121	TGAGTA	2	12	496264	496275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431573
167	NC_022121	AAACTG	2	12	499711	499722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431576
168	NC_022121	TAACTA	2	12	503234	503245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_022121	AAGAAA	2	12	503247	503258	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022121	GGTAAT	2	12	508049	508060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431584
171	NC_022121	AGTTTT	2	12	509057	509068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532431586
172	NC_022121	AGAATA	2	12	509222	509233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022121	GGTTGT	2	12	511185	511196	0 %	50 %	50 %	0 %	532431588
174	NC_022121	GCTGTT	2	12	513544	513555	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532431590
175	NC_022121	AACTAA	2	12	514955	514966	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
176	NC_022121	CTCTAT	2	12	517038	517049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431594
177	NC_022121	TGAACT	2	12	517545	517556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431594
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184	NC_022121	ACTGTA	2	12	531781	531792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532432056
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187	NC_022121	CAAATC	2	12	535615	535626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431605
188	NC_022121	CTCCAG	2	12	536397	536408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431606
189	NC_022121	AGGGAA	2	12	540056	540067	50 %	0 %	50 %	0 %	532431610
190	NC_022121	AAAGAA	2	12	541913	541924	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532431612
191	NC_022121	CTTCCT	2	12	542562	542573	0 %	50 %	0 %	50 %	532431613
192	NC_022121	ACAAGA	2	12	544065	544076	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532431614
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195	NC_022121	ATTACA	2	12	551156	551167	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431619
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201	NC_022121	AGATCC	2	12	564528	564539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431631
202	NC_022121	AAAAAT	2	12	566948	566959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_022121	TTTTGC	2	12	573815	573826	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532431639
204	NC_022121	TCATAT	2	12	577912	577923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532431643
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206	NC_022121	CTCCAT	2	12	579703	579714	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431644
207	NC_022121	TTCAAA	2	12	586050	586061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431652
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209	NC_022121	TCTCCG	2	12	595558	595569	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532431669
210	NC_022121	CTGATA	2	12	601188	601199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431676
211	NC_022121	CTGCTC	2	12	601236	601247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532431676
212	NC_022121	AGTCCA	2	12	603148	603159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431677
213	NC_022121	TAGGGG	2	12	606116	606127	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
214	NC_022121	CAAAGA	2	12	606930	606941	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532431682
215	NC_022121	CCAAAA	2	12	610448	610459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431686
216	NC_022121	GGATGG	2	12	612220	612231	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532431687
217	NC_022121	CGATAT	3	18	614548	614565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431688
218	NC_022121	TCTTTT	2	12	618110	618121	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431690
219	NC_022121	ACTGTA	2	12	619802	619813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431692
220	NC_022121	CACTCT	2	12	620118	620129	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431692
221	NC_022121	CCTTAG	2	12	623903	623914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431696
222	NC_022121	AACCTC	2	12	631968	631979	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532431700
223	NC_022121	CTCTTT	2	12	638978	638989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431709
224	NC_022121	ATATCC	2	12	638995	639006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431709
225	NC_022121	TAAACA	2	12	639106	639117	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532431709
226	NC_022121	ATAAAC	2	12	642817	642828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532431714
227	NC_022121	ATCTTG	2	12	643510	643521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431714
228	NC_022121	TTAAAT	2	12	646281	646292	50 %	50 %	0 %	0 %	532431716
229	NC_022121	TTATTT	2	12	649320	649331	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_022121	GCTTCT	2	12	650670	650681	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431720
231	NC_022121	TAGGAG	2	12	651637	651648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532431720
232	NC_022121	TCCGCA	2	12	652026	652037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431721
233	NC_022121	CACAGG	2	12	653630	653641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431722
234	NC_022121	TTCTAT	2	12	667459	667470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532431731
235	NC_022121	AGAAAG	2	12	669781	669792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431732
236	NC_022121	CATATT	2	12	681656	681667	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532431741
237	NC_022121	AGCTGG	2	12	687831	687842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532431749
238	NC_022121	GCATCA	2	12	689673	689684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431750
239	NC_022121	ATCAAT	2	12	693998	694009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431754
240	NC_022121	CCGCAA	2	12	698878	698889	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532431759
241	NC_022121	AAATGC	2	12	704840	704851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431761
242	NC_022121	GAAAGA	2	12	706958	706969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431762
243	NC_022121	TCTTGA	2	12	712064	712075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431765
244	NC_022121	TATCCA	2	12	722246	722257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431775
245	NC_022121	TATTGA	2	12	738134	738145	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532431784
246	NC_022121	TCTGCA	2	12	745787	745798	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532432069
247	NC_022121	TGTGAT	2	12	746430	746441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431791
248	NC_022121	CAGGAA	2	12	749656	749667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532431793
249	NC_022121	TATTTT	2	12	755265	755276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_022121	GGGAAG	2	12	759387	759398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431804
251	NC_022121	GGAAGA	2	12	763053	763064	50 %	0 %	50 %	0 %	532431806
252	NC_022121	ATGCAA	2	12	765365	765376	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431810
253	NC_022121	GAGAAA	2	12	765594	765605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431810
254	NC_022121	TATATT	2	12	771034	771045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431815
255	NC_022121	TTTCCA	2	12	777856	777867	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431821
256	NC_022121	ATGAAG	2	12	784465	784476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532431824
257	NC_022121	ATTAGG	2	12	790250	790261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431829
258	NC_022121	CCCTGA	2	12	793246	793257	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431832
259	NC_022121	AGAATT	2	12	796168	796179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532431835
260	NC_022121	AAGCTC	2	12	796407	796418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431835
261	NC_022121	TTTCTT	2	12	799272	799283	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431837
262	NC_022121	AGAAAT	2	12	802462	802473	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532431840
263	NC_022121	GAGAAA	2	12	802732	802743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_022121	GAAATT	2	12	804075	804086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532431842
265	NC_022121	GCTGAG	2	12	804757	804768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532431842
266	NC_022121	TTTTCT	2	12	805190	805201	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
267	NC_022121	TAGCCT	2	12	807704	807715	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431843
268	NC_022121	ATTTTT	2	12	808969	808980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_022121	CACCTA	2	12	822265	822276	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532431853
270	NC_022121	AGCTAC	2	12	826233	826244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431855
271	NC_022121	AAGAGG	2	12	828104	828115	50 %	0 %	50 %	0 %	532431857
272	NC_022121	GAAAGG	2	12	832980	832991	50 %	0 %	50 %	0 %	532431862
273	NC_022121	AGCTTC	2	12	834434	834445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431863
274	NC_022121	TTTTTA	2	12	835407	835418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_022121	ATCACA	2	12	838539	838550	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431867
276	NC_022121	GATCCG	2	12	843148	843159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532431871
277	NC_022121	TTATGC	2	12	850086	850097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431877
278	NC_022121	ATGGGG	2	12	853120	853131	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532431880
279	NC_022121	AAAGAA	2	12	853599	853610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532431880
280	NC_022121	GGCTAG	2	12	853982	853993	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532431880
281	NC_022121	GAGAAA	2	12	854029	854040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431880
282	NC_022121	TAAGGA	2	12	856370	856381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_022121	CCGGAG	2	12	857288	857299	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_022121	CTTCTA	2	12	861213	861224	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431881
285	NC_022121	CTTTTT	2	12	861897	861908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431882
286	NC_022121	GACCTG	2	12	866859	866870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532431886
287	NC_022121	CCTCTA	2	12	870434	870445	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431888
288	NC_022121	TAAGGA	2	12	878416	878427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022121	CCGGAG	2	12	879334	879345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_022121	TTTTCT	2	12	889716	889727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431897
291	NC_022121	CTGTTC	2	12	890029	890040	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431897
292	NC_022121	GTTTTT	2	12	890683	890694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532431898
293	NC_022121	GTGTAT	2	12	891595	891606	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431899
294	NC_022121	TATTGG	2	12	895674	895685	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431902
295	NC_022121	CCAACG	2	12	898002	898013	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532431902
296	NC_022121	TCCAGA	2	12	900640	900651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431906
297	NC_022121	TTTTGG	2	12	905843	905854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431910
298	NC_022121	CAATTT	2	12	906510	906521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532431912
299	NC_022121	ATCGCC	2	12	906781	906792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431912
300	NC_022121	GATAGT	2	12	915464	915475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432081
301	NC_022121	GACGGC	2	12	921763	921774	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_022121	CTTCTC	2	12	922672	922683	0 %	50 %	0 %	50 %	532431924
303	NC_022121	AAACAA	2	12	923451	923462	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
304	NC_022121	GAGCAA	2	12	925274	925285	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532431928
305	NC_022121	ATAGGG	2	12	946026	946037	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532431943
306	NC_022121	CGGAGG	2	12	946347	946358	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	532431944
307	NC_022121	GGATTA	2	12	956263	956274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431949
308	NC_022121	GAAAAA	2	12	956809	956820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532431949
309	NC_022121	TTAAAA	2	12	960698	960709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431953
310	NC_022121	GCTATT	2	12	968318	968329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431960
311	NC_022121	CAAATG	2	12	970851	970862	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431961
312	NC_022121	GGCTGG	2	12	981961	981972	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532431968
313	NC_022121	ACAGGA	2	12	982073	982084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532431968
314	NC_022121	TTAAGC	2	12	983121	983132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431969
315	NC_022121	CAGGGA	2	12	992090	992101	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532431977
316	NC_022121	CTCCAT	2	12	994614	994625	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431978
317	NC_022121	TCAGTA	2	12	995802	995813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431979
318	NC_022121	CAGAAT	2	12	997075	997086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431982
319	NC_022121	TACTAG	2	12	997588	997599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431982
320	NC_022121	AGAATA	2	12	1004571	1004582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532431991
321	NC_022121	AATTAA	2	12	1007315	1007326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431992
322	NC_022121	GCAATA	2	12	1008261	1008272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431992
323	NC_022121	CTTTAT	2	12	1011655	1011666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532431994
324	NC_022121	AGCTGG	2	12	1012083	1012094	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532431994
325	NC_022121	TTGTAA	2	12	1014951	1014962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532432092
326	NC_022121	GAAAAA	2	12	1029202	1029213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532432004
327	NC_022121	TTTCTT	2	12	1029866	1029877	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532432005
328	NC_022121	GTTTCC	2	12	1031153	1031164	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532432005
329	NC_022121	CAGCAC	2	12	1036047	1036058	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532432007
330	NC_022121	GTAATA	2	12	1036212	1036223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532432007
331	NC_022121	ACCATC	2	12	1036954	1036965	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532432007
332	NC_022121	ATTTTT	2	12	1038936	1038947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_022121	TAAAAT	2	12	1042561	1042572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.