MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 2887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022121	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022121	AAGG	2	8	1307	1314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022121	AGTA	2	8	1487	1494	50 %	25 %	25 %	0 %	532431172
5	NC_022121	ATGA	2	8	1891	1898	50 %	25 %	25 %	0 %	532431173
6	NC_022121	GATA	2	8	1929	1936	50 %	25 %	25 %	0 %	532431173
7	NC_022121	TTTC	2	8	2226	2233	0 %	75 %	0 %	25 %	532431174
8	NC_022121	CATG	2	8	3107	3114	25 %	25 %	25 %	25 %	532431174
9	NC_022121	TTCC	2	8	3412	3419	0 %	50 %	0 %	50 %	532431174
10	NC_022121	TTTA	2	8	3810	3817	25 %	75 %	0 %	0 %	532431175
11	NC_022121	ATCC	2	8	4110	4117	25 %	25 %	0 %	50 %	532431175
12	NC_022121	GACG	2	8	4857	4864	25 %	0 %	50 %	25 %	532431175
13	NC_022121	TTGG	2	8	4960	4967	0 %	50 %	50 %	0 %	532431175
14	NC_022121	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532431176
15	NC_022121	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532431176
16	NC_022121	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532431176
17	NC_022121	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022121	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532431177
19	NC_022121	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532431177
20	NC_022121	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022121	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532432010
22	NC_022121	TTTG	2	8	7186	7193	0 %	75 %	25 %	0 %	532432010
23	NC_022121	AAGC	2	8	7819	7826	50 %	0 %	25 %	25 %	532431178
24	NC_022121	ATTG	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	532431179
25	NC_022121	AGCG	2	8	8684	8691	25 %	0 %	50 %	25 %	532431179
26	NC_022121	AAAG	2	8	8705	8712	75 %	0 %	25 %	0 %	532431179
27	NC_022121	CTTT	2	8	9045	9052	0 %	75 %	0 %	25 %	532431179
28	NC_022121	TATT	2	8	9308	9315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022121	TTCG	2	8	9417	9424	0 %	50 %	25 %	25 %	532431180
30	NC_022121	AATT	2	8	9522	9529	50 %	50 %	0 %	0 %	532431180
31	NC_022121	ATGG	2	8	9581	9588	25 %	25 %	50 %	0 %	532431180
32	NC_022121	CTTT	2	8	10206	10213	0 %	75 %	0 %	25 %	532431181
33	NC_022121	GCAA	2	8	10423	10430	50 %	0 %	25 %	25 %	532431181
34	NC_022121	AGCC	2	8	10653	10660	25 %	0 %	25 %	50 %	532431181
35	NC_022121	GAAA	2	8	10796	10803	75 %	0 %	25 %	0 %	532431181
36	NC_022121	AGAA	2	8	11200	11207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022121	AATG	2	8	11539	11546	50 %	25 %	25 %	0 %	532431182
38	NC_022121	GTTT	2	8	12571	12578	0 %	75 %	25 %	0 %	532431183
39	NC_022121	ATGC	2	8	13001	13008	25 %	25 %	25 %	25 %	532431183
40	NC_022121	AAGG	2	8	13435	13442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022121	TTGT	2	8	14036	14043	0 %	75 %	25 %	0 %	532431184
42	NC_022121	TTCT	2	8	14207	14214	0 %	75 %	0 %	25 %	532431184
43	NC_022121	ATTT	2	8	14413	14420	25 %	75 %	0 %	0 %	532431184
44	NC_022121	TTTC	2	8	15075	15082	0 %	75 %	0 %	25 %	532431185
45	NC_022121	AAAT	2	8	15557	15564	75 %	25 %	0 %	0 %	532431185
46	NC_022121	CAAA	2	8	16069	16076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022121	GTAA	2	8	16399	16406	50 %	25 %	25 %	0 %	532431186
48	NC_022121	CTAA	2	8	16592	16599	50 %	25 %	0 %	25 %	532431186
49	NC_022121	AGAA	2	8	16855	16862	75 %	0 %	25 %	0 %	532431186
50	NC_022121	ATTT	2	8	17001	17008	25 %	75 %	0 %	0 %	532431186
51	NC_022121	TGCG	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	532431188
52	NC_022121	GAAG	2	8	19507	19514	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
53	NC_022121	TTTG	2	8	19533	19540	0 %	75 %	25 %	0 %	532431188
54	NC_022121	TGTA	2	8	20225	20232	25 %	50 %	25 %	0 %	532431189
55	NC_022121	CGCT	2	8	21265	21272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022121	TTAA	2	8	21286	21293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022121	GTTA	2	8	21323	21330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022121	GATC	2	8	21378	21385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022121	GATG	2	8	21641	21648	25 %	25 %	50 %	0 %	532431190
60	NC_022121	CATT	2	8	22700	22707	25 %	50 %	0 %	25 %	532431190
61	NC_022121	GCTT	2	8	23043	23050	0 %	50 %	25 %	25 %	532431190
62	NC_022121	GGTT	2	8	23091	23098	0 %	50 %	50 %	0 %	532431190
63	NC_022121	TTCT	2	8	23461	23468	0 %	75 %	0 %	25 %	532431190
64	NC_022121	TAAC	2	8	23563	23570	50 %	25 %	0 %	25 %	532431190
65	NC_022121	CATT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	532431190
66	NC_022121	GGTA	2	8	24056	24063	25 %	25 %	50 %	0 %	532431190
67	NC_022121	TTCG	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	532431191
68	NC_022121	TAGG	2	8	25275	25282	25 %	25 %	50 %	0 %	532431191
69	NC_022121	TTCC	2	8	25399	25406	0 %	50 %	0 %	50 %	532431191
70	NC_022121	TAGG	2	8	25513	25520	25 %	25 %	50 %	0 %	532431191
71	NC_022121	GCTT	2	8	26285	26292	0 %	50 %	25 %	25 %	532431191
72	NC_022121	GGAA	2	8	26868	26875	50 %	0 %	50 %	0 %	532431192
73	NC_022121	TTAA	2	8	26941	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	532431192
74	NC_022121	AAAG	2	8	26991	26998	75 %	0 %	25 %	0 %	532431192
75	NC_022121	GGGC	2	8	27271	27278	0 %	0 %	75 %	25 %	532431192
76	NC_022121	GTTT	2	8	27554	27561	0 %	75 %	25 %	0 %	532431193
77	NC_022121	CAGA	2	8	27576	27583	50 %	0 %	25 %	25 %	532431193
78	NC_022121	ATTG	2	8	27935	27942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022121	CTTT	2	8	29548	29555	0 %	75 %	0 %	25 %	532431195
80	NC_022121	TTTG	2	8	29563	29570	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
81	NC_022121	TTGT	2	8	29598	29605	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
82	NC_022121	TGGC	2	8	29761	29768	0 %	25 %	50 %	25 %	532431195
83	NC_022121	AAAG	2	8	30321	30328	75 %	0 %	25 %	0 %	532431196
84	NC_022121	AAAC	2	8	30391	30398	75 %	0 %	0 %	25 %	532431196
85	NC_022121	GATG	2	8	30534	30541	25 %	25 %	50 %	0 %	532431196
86	NC_022121	GATA	2	8	31643	31650	50 %	25 %	25 %	0 %	532431198
87	NC_022121	TGAT	2	8	34138	34145	25 %	50 %	25 %	0 %	532431201
88	NC_022121	AAGA	3	12	34266	34277	75 %	0 %	25 %	0 %	532431201
89	NC_022121	AAGC	2	8	34486	34493	50 %	0 %	25 %	25 %	532431202
90	NC_022121	GTTC	2	8	34519	34526	0 %	50 %	25 %	25 %	532431202
91	NC_022121	GGCA	2	8	34898	34905	25 %	0 %	50 %	25 %	532431203
92	NC_022121	TCGA	2	8	35155	35162	25 %	25 %	25 %	25 %	532431203
93	NC_022121	TGCT	2	8	35308	35315	0 %	50 %	25 %	25 %	532431203
94	NC_022121	TATG	2	8	35451	35458	25 %	50 %	25 %	0 %	532431203
95	NC_022121	TTGG	2	8	35540	35547	0 %	50 %	50 %	0 %	532431203
96	NC_022121	AGAT	2	8	36260	36267	50 %	25 %	25 %	0 %	532431203
97	NC_022121	CTTT	2	8	36632	36639	0 %	75 %	0 %	25 %	532431204
98	NC_022121	ATGA	2	8	37122	37129	50 %	25 %	25 %	0 %	532431204
99	NC_022121	TAGG	2	8	37281	37288	25 %	25 %	50 %	0 %	532431204
100	NC_022121	CAAT	2	8	37465	37472	50 %	25 %	0 %	25 %	532431204
101	NC_022121	AATG	2	8	38252	38259	50 %	25 %	25 %	0 %	532431204
102	NC_022121	AGAA	2	8	39089	39096	75 %	0 %	25 %	0 %	532431205
103	NC_022121	AAGA	2	8	39141	39148	75 %	0 %	25 %	0 %	532431205
104	NC_022121	ATCC	2	8	39149	39156	25 %	25 %	0 %	50 %	532431205
105	NC_022121	TAAT	2	8	39360	39367	50 %	50 %	0 %	0 %	532431205
106	NC_022121	GTGC	2	8	41449	41456	0 %	25 %	50 %	25 %	532431207
107	NC_022121	AGAA	2	8	41868	41875	75 %	0 %	25 %	0 %	532431207
108	NC_022121	GGAT	2	8	42020	42027	25 %	25 %	50 %	0 %	532431207
109	NC_022121	AAAC	2	8	43228	43235	75 %	0 %	0 %	25 %	532431209
110	NC_022121	CAAT	2	8	43432	43439	50 %	25 %	0 %	25 %	532431209
111	NC_022121	TGTT	2	8	43812	43819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022121	AATA	2	8	44050	44057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022121	ATTT	2	8	44188	44195	25 %	75 %	0 %	0 %	532431211
114	NC_022121	GGAA	2	8	44215	44222	50 %	0 %	50 %	0 %	532431211
115	NC_022121	GCTC	2	8	44496	44503	0 %	25 %	25 %	50 %	532431211
116	NC_022121	TTCT	2	8	44638	44645	0 %	75 %	0 %	25 %	532431211
117	NC_022121	TTGA	2	8	45238	45245	25 %	50 %	25 %	0 %	532431212
118	NC_022121	TGTT	2	8	45410	45417	0 %	75 %	25 %	0 %	532431212
119	NC_022121	CTAT	2	8	45440	45447	25 %	50 %	0 %	25 %	532431212
120	NC_022121	TGTT	2	8	45469	45476	0 %	75 %	25 %	0 %	532431212
121	NC_022121	CTAT	2	8	45765	45772	25 %	50 %	0 %	25 %	532431212
122	NC_022121	AAGA	2	8	46260	46267	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
123	NC_022121	AAGA	2	8	46317	46324	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
124	NC_022121	AAAG	2	8	46357	46364	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
125	NC_022121	AAGA	2	8	46472	46479	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
126	NC_022121	ACTT	2	8	46733	46740	25 %	50 %	0 %	25 %	532431213
127	NC_022121	ATGG	2	8	47359	47366	25 %	25 %	50 %	0 %	532431213
128	NC_022121	AGGA	2	8	47390	47397	50 %	0 %	50 %	0 %	532431213
129	NC_022121	GAAC	2	8	47936	47943	50 %	0 %	25 %	25 %	532431213
130	NC_022121	AAGT	2	8	47971	47978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022121	AACA	2	8	48181	48188	75 %	0 %	0 %	25 %	532431214
132	NC_022121	CTTT	2	8	48377	48384	0 %	75 %	0 %	25 %	532431214
133	NC_022121	CTTT	2	8	49262	49269	0 %	75 %	0 %	25 %	532431215
134	NC_022121	GTAG	2	8	49280	49287	25 %	25 %	50 %	0 %	532431215
135	NC_022121	ATCA	2	8	49507	49514	50 %	25 %	0 %	25 %	532431215
136	NC_022121	GAAG	2	8	50731	50738	50 %	0 %	50 %	0 %	532431216
137	NC_022121	TTCA	2	8	51153	51160	25 %	50 %	0 %	25 %	532431216
138	NC_022121	TATT	2	8	52197	52204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022121	GGAT	2	8	52278	52285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022121	GGAA	2	8	52428	52435	50 %	0 %	50 %	0 %	532431218
141	NC_022121	TTAA	2	8	53169	53176	50 %	50 %	0 %	0 %	532431218
142	NC_022121	CCTT	2	8	53376	53383	0 %	50 %	0 %	50 %	532431219
143	NC_022121	TTTA	2	8	53543	53550	25 %	75 %	0 %	0 %	532431219
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