MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022121	GAA	2	6	158361	158366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431303
3502	NC_022121	GTT	2	6	158378	158383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431303
3503	NC_022121	T	6	6	158545	158550	0 %	100 %	0 %	0 %	532431303
3504	NC_022121	CG	3	6	158581	158586	0 %	0 %	50 %	50 %	532431303
3505	NC_022121	AGA	2	6	158607	158612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431303
3506	NC_022121	CAT	2	6	158616	158621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431303
3507	NC_022121	TTC	2	6	158711	158716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431303
3508	NC_022121	AGA	3	9	158721	158729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431303
3509	NC_022121	T	6	6	158780	158785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_022121	ATA	2	6	158812	158817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_022121	T	7	7	158904	158910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_022121	ATT	2	6	159023	159028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_022121	T	7	7	159053	159059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_022121	A	7	7	159087	159093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_022121	TAAT	2	8	159111	159118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_022121	ATT	2	6	159178	159183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431304
3517	NC_022121	CAT	2	6	159330	159335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431304
3518	NC_022121	TCAA	2	8	159391	159398	50 %	25 %	0 %	25 %	532431304
3519	NC_022121	TGA	2	6	159588	159593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431304
3520	NC_022121	GAA	2	6	159616	159621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431304
3521	NC_022121	TC	3	6	159651	159656	0 %	50 %	0 %	50 %	532431304
3522	NC_022121	GT	3	6	159689	159694	0 %	50 %	50 %	0 %	532431304
3523	NC_022121	AAT	2	6	159733	159738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431304
3524	NC_022121	GGA	2	6	159745	159750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431304
3525	NC_022121	AGGAA	2	10	159774	159783	60 %	0 %	40 %	0 %	532431304
3526	NC_022121	TAG	2	6	159804	159809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431304
3527	NC_022121	AGG	2	6	159810	159815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431304
3528	NC_022121	CTG	2	6	159830	159835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431304
3529	NC_022121	AG	3	6	159861	159866	50 %	0 %	50 %	0 %	532431304
3530	NC_022121	TCT	2	6	159889	159894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431304
3531	NC_022121	AGG	2	6	160008	160013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431304
3532	NC_022121	GAA	2	6	160021	160026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431305
3533	NC_022121	AGA	2	6	160069	160074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431305
3534	NC_022121	ATAC	2	8	160193	160200	50 %	25 %	0 %	25 %	532431305
3535	NC_022121	AGG	2	6	160219	160224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431305
3536	NC_022121	AGG	2	6	160234	160239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431305
3537	NC_022121	CT	3	6	160332	160337	0 %	50 %	0 %	50 %	532431305
3538	NC_022121	GA	3	6	160342	160347	50 %	0 %	50 %	0 %	532431305
3539	NC_022121	ATT	2	6	160362	160367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431305
3540	NC_022121	ATA	2	6	160458	160463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431305
3541	NC_022121	AC	3	6	160482	160487	50 %	0 %	0 %	50 %	532431305
3542	NC_022121	A	8	8	160527	160534	100 %	0 %	0 %	0 %	532431305
3543	NC_022121	ATG	2	6	160608	160613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431305
3544	NC_022121	TCT	2	6	160623	160628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431305
3545	NC_022121	TTC	2	6	160837	160842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431305
3546	NC_022121	AGG	2	6	160848	160853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431305
3547	NC_022121	ACA	2	6	160864	160869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431306
3548	NC_022121	ATA	3	9	160874	160882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431306
3549	NC_022121	TTTC	2	8	160892	160899	0 %	75 %	0 %	25 %	532431306
3550	NC_022121	AACAGC	2	12	160977	160988	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431306
3551	NC_022121	AGT	2	6	161020	161025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431306
3552	NC_022121	TGG	2	6	161106	161111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431306
3553	NC_022121	AG	3	6	161336	161341	50 %	0 %	50 %	0 %	532431306
3554	NC_022121	AGA	2	6	161349	161354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431306
3555	NC_022121	TC	3	6	161433	161438	0 %	50 %	0 %	50 %	532431306
3556	NC_022121	A	6	6	161451	161456	100 %	0 %	0 %	0 %	532431306
3557	NC_022121	CTG	2	6	161519	161524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431306
3558	NC_022121	GCG	2	6	161535	161540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431306
3559	NC_022121	ACA	2	6	161581	161586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431306
3560	NC_022121	GCA	2	6	161605	161610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431306
3561	NC_022121	CTT	2	6	161624	161629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431306
3562	NC_022121	ATTG	2	8	161643	161650	25 %	50 %	25 %	0 %	532431306
3563	NC_022121	TCT	2	6	161674	161679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431306
3564	NC_022121	CT	4	8	161678	161685	0 %	50 %	0 %	50 %	532431306
3565	NC_022121	TGT	2	6	161706	161711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431306
3566	NC_022121	GCTT	2	8	161747	161754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3567	NC_022121	CAAAA	2	10	161777	161786	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3568	NC_022121	TGT	2	6	161799	161804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_022121	GAG	2	6	161898	161903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_022121	TGG	2	6	162121	162126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431307
3571	NC_022121	TGT	2	6	162164	162169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431307
3572	NC_022121	GAA	2	6	162174	162179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431307
3573	NC_022121	GGAA	2	8	162216	162223	50 %	0 %	50 %	0 %	532431307
3574	NC_022121	GAA	3	9	162231	162239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431307
3575	NC_022121	TTTC	2	8	162334	162341	0 %	75 %	0 %	25 %	532431307
3576	NC_022121	ATCT	2	8	162360	162367	25 %	50 %	0 %	25 %	532431307
3577	NC_022121	CTT	2	6	162385	162390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431307
3578	NC_022121	CCA	2	6	162412	162417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431307
3579	NC_022121	GA	3	6	162439	162444	50 %	0 %	50 %	0 %	532431307
3580	NC_022121	TTG	2	6	162465	162470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431307
3581	NC_022121	GAA	2	6	162486	162491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431307
3582	NC_022121	TTA	2	6	162542	162547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431307
3583	NC_022121	TAG	2	6	162553	162558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431307
3584	NC_022121	GTT	2	6	162640	162645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431307
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3588	NC_022121	AGC	2	6	162844	162849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431307
3589	NC_022121	TAG	2	6	162862	162867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431307
3590	NC_022121	TCGA	2	8	162876	162883	25 %	25 %	25 %	25 %	532431307
3591	NC_022121	AGAGA	2	10	163005	163014	60 %	0 %	40 %	0 %	532431307
3592	NC_022121	ATT	2	6	163028	163033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431307
3593	NC_022121	GAGG	2	8	163053	163060	25 %	0 %	75 %	0 %	532431307
3594	NC_022121	TC	3	6	163066	163071	0 %	50 %	0 %	50 %	532431307
3595	NC_022121	TGT	2	6	163298	163303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431307
3596	NC_022121	CTT	3	9	163324	163332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431307
3597	NC_022121	TTG	2	6	163337	163342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431307
3598	NC_022121	AGC	2	6	163382	163387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431307
3599	NC_022121	AGG	2	6	163391	163396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431307
3600	NC_022121	GAA	2	6	163425	163430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431307
3601	NC_022121	AGCAA	2	10	163440	163449	60 %	0 %	20 %	20 %	532431307
3602	NC_022121	TAC	2	6	163466	163471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431307
3603	NC_022121	TGGC	2	8	163516	163523	0 %	25 %	50 %	25 %	532431307
3604	NC_022121	CCT	2	6	163605	163610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431307
3605	NC_022121	GT	3	6	163624	163629	0 %	50 %	50 %	0 %	532431307
3606	NC_022121	GAG	2	6	163633	163638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431307
3607	NC_022121	GAT	2	6	163659	163664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431307
3608	NC_022121	AAT	2	6	163689	163694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431307
3609	NC_022121	GAT	2	6	163777	163782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431308
3610	NC_022121	TAT	2	6	163825	163830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431308
3611	NC_022121	TCAA	2	8	163835	163842	50 %	25 %	0 %	25 %	532431308
3612	NC_022121	CGA	2	6	163844	163849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431308
3613	NC_022121	ATG	2	6	163865	163870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431308
3614	NC_022121	TGT	2	6	163997	164002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431308
3615	NC_022121	T	7	7	164041	164047	0 %	100 %	0 %	0 %	532431308
3616	NC_022121	ATT	2	6	164061	164066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431308
3617	NC_022121	GAG	2	6	164264	164269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431308
3618	NC_022121	TTTC	2	8	164275	164282	0 %	75 %	0 %	25 %	532431308
3619	NC_022121	GGA	2	6	164362	164367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431308
3620	NC_022121	TCT	2	6	164383	164388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431308
3621	NC_022121	GCT	2	6	164395	164400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431308
3622	NC_022121	A	8	8	164444	164451	100 %	0 %	0 %	0 %	532431308
3623	NC_022121	GGT	2	6	164538	164543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431308
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3625	NC_022121	GTC	2	6	164602	164607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431308
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3871	NC_022121	CCAC	2	8	176055	176062	25 %	0 %	0 %	75 %	532431315
3872	NC_022121	GTA	2	6	176073	176078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431315
3873	NC_022121	AGAT	2	8	176118	176125	50 %	25 %	25 %	0 %	532431315
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3875	NC_022121	T	6	6	176207	176212	0 %	100 %	0 %	0 %	532431315
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3999	NC_022121	TG	3	6	182377	182382	0 %	50 %	50 %	0 %	532431317
4000	NC_022121	G	7	7	182384	182390	0 %	0 %	100 %	0 %	532431317

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