MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022121	TTCG	2	8	69288	69295	0 %	50 %	25 %	25 %	532431229
1502	NC_022121	TGT	2	6	69313	69318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431229
1503	NC_022121	TGAT	2	8	69405	69412	25 %	50 %	25 %	0 %	532431229
1504	NC_022121	T	6	6	69453	69458	0 %	100 %	0 %	0 %	532431229
1505	NC_022121	TC	3	6	69503	69508	0 %	50 %	0 %	50 %	532431229
1506	NC_022121	TCT	2	6	69569	69574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431229
1507	NC_022121	TGC	2	6	69775	69780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431229
1508	NC_022121	A	7	7	69812	69818	100 %	0 %	0 %	0 %	532431229
1509	NC_022121	CT	3	6	69820	69825	0 %	50 %	0 %	50 %	532431229
1510	NC_022121	AGA	2	6	69829	69834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431229
1511	NC_022121	GCGAT	2	10	69882	69891	20 %	20 %	40 %	20 %	532431229
1512	NC_022121	GTT	2	6	69904	69909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431229
1513	NC_022121	GCT	2	6	69926	69931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431229
1514	NC_022121	GCA	3	9	70028	70036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431229
1515	NC_022121	AAAG	2	8	70061	70068	75 %	0 %	25 %	0 %	532431229
1516	NC_022121	GCA	2	6	70075	70080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431229
1517	NC_022121	ATT	2	6	70089	70094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431229
1518	NC_022121	TAT	2	6	70197	70202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431229
1519	NC_022121	CTT	2	6	70221	70226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431229
1520	NC_022121	GA	3	6	70230	70235	50 %	0 %	50 %	0 %	532431229
1521	NC_022121	CTCTT	2	10	70236	70245	0 %	60 %	0 %	40 %	532431229
1522	NC_022121	AGAA	2	8	70248	70255	75 %	0 %	25 %	0 %	532431229
1523	NC_022121	TGA	2	6	70276	70281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431229
1524	NC_022121	TTG	2	6	70365	70370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431229
1525	NC_022121	TCT	2	6	70388	70393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431229
1526	NC_022121	GA	3	6	70429	70434	50 %	0 %	50 %	0 %	532431229
1527	NC_022121	AGCT	2	8	70470	70477	25 %	25 %	25 %	25 %	532431229
1528	NC_022121	TGA	2	6	70516	70521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431229
1529	NC_022121	GCAT	2	8	70531	70538	25 %	25 %	25 %	25 %	532431229
1530	NC_022121	AGA	2	6	70549	70554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431229
1531	NC_022121	GT	3	6	70705	70710	0 %	50 %	50 %	0 %	532431229
1532	NC_022121	CT	3	6	70786	70791	0 %	50 %	0 %	50 %	532431229
1533	NC_022121	GA	3	6	70807	70812	50 %	0 %	50 %	0 %	532431229
1534	NC_022121	AGT	2	6	70849	70854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431229
1535	NC_022121	AGGGG	2	10	70882	70891	20 %	0 %	80 %	0 %	532431229
1536	NC_022121	AAGAA	2	10	70924	70933	80 %	0 %	20 %	0 %	532431229
1537	NC_022121	AGA	2	6	70996	71001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431229
1538	NC_022121	TGA	2	6	71032	71037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431229
1539	NC_022121	TAT	2	6	71043	71048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431229
1540	NC_022121	T	6	6	71132	71137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_022121	T	8	8	71153	71160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_022121	CAT	2	6	71218	71223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431230
1543	NC_022121	CCTT	2	8	71247	71254	0 %	50 %	0 %	50 %	532431230
1544	NC_022121	GCTT	2	8	71277	71284	0 %	50 %	25 %	25 %	532431230
1545	NC_022121	A	6	6	71372	71377	100 %	0 %	0 %	0 %	532431230
1546	NC_022121	ATT	2	6	71422	71427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431230
1547	NC_022121	CAA	2	6	71569	71574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431230
1548	NC_022121	TCC	2	6	71593	71598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431230
1549	NC_022121	TTCT	2	8	71615	71622	0 %	75 %	0 %	25 %	532431230
1550	NC_022121	ATG	2	6	71627	71632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431230
1551	NC_022121	GCTT	2	8	71661	71668	0 %	50 %	25 %	25 %	532431230
1552	NC_022121	AGA	2	6	71670	71675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431230
1553	NC_022121	GAGC	2	8	71689	71696	25 %	0 %	50 %	25 %	532431230
1554	NC_022121	TCA	2	6	71714	71719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431230
1555	NC_022121	A	7	7	71721	71727	100 %	0 %	0 %	0 %	532431230
1556	NC_022121	CTATTT	2	12	71732	71743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532431230
1557	NC_022121	TGA	2	6	71766	71771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431230
1558	NC_022121	ATG	2	6	71804	71809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431230
1559	NC_022121	AGA	2	6	71934	71939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022121	CT	3	6	71942	71947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_022121	CGT	2	6	71982	71987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_022121	T	7	7	71987	71993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_022121	CTTGC	2	10	72013	72022	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1564	NC_022121	GATA	2	8	72037	72044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022121	TTC	2	6	72128	72133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431231
1566	NC_022121	CTT	2	6	72196	72201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431231
1567	NC_022121	ATTGG	2	10	72214	72223	20 %	40 %	40 %	0 %	532431231
1568	NC_022121	T	6	6	72230	72235	0 %	100 %	0 %	0 %	532431231
1569	NC_022121	AGC	2	6	72245	72250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431231
1570	NC_022121	TTG	2	6	72274	72279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431231
1571	NC_022121	ATA	2	6	72358	72363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431231
1572	NC_022121	GCTA	2	8	72387	72394	25 %	25 %	25 %	25 %	532431231
1573	NC_022121	AAT	2	6	72417	72422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431231
1574	NC_022121	TGG	2	6	72448	72453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431231
1575	NC_022121	T	6	6	72455	72460	0 %	100 %	0 %	0 %	532431231
1576	NC_022121	AGC	2	6	72517	72522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431231
1577	NC_022121	TTAT	2	8	72563	72570	25 %	75 %	0 %	0 %	532431231
1578	NC_022121	TGC	2	6	72571	72576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431231
1579	NC_022121	TGT	2	6	72614	72619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431231
1580	NC_022121	GGAG	2	8	72630	72637	25 %	0 %	75 %	0 %	532431231
1581	NC_022121	GATT	2	8	72665	72672	25 %	50 %	25 %	0 %	532431231
1582	NC_022121	GAA	2	6	72740	72745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431231
1583	NC_022121	CTGG	2	8	72773	72780	0 %	25 %	50 %	25 %	532431231
1584	NC_022121	CTC	2	6	72793	72798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431231
1585	NC_022121	ACTCTT	2	12	72861	72872	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431231
1586	NC_022121	GAA	2	6	72882	72887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431231
1587	NC_022121	TGA	2	6	72899	72904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431231
1588	NC_022121	GAA	2	6	72932	72937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431231
1589	NC_022121	T	6	6	73014	73019	0 %	100 %	0 %	0 %	532431231
1590	NC_022121	TAG	2	6	73054	73059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431231
1591	NC_022121	TAG	2	6	73063	73068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431231
1592	NC_022121	AGA	2	6	73170	73175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431231
1593	NC_022121	ATCA	2	8	73200	73207	50 %	25 %	0 %	25 %	532431231
1594	NC_022121	TGT	2	6	73273	73278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431231
1595	NC_022121	GAAAA	2	10	73286	73295	80 %	0 %	20 %	0 %	532431231
1596	NC_022121	A	7	7	73292	73298	100 %	0 %	0 %	0 %	532431231
1597	NC_022121	AGG	2	6	73318	73323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431231
1598	NC_022121	TGG	2	6	73396	73401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431232
1599	NC_022121	TTTCTG	2	12	73411	73422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532431232
1600	NC_022121	AGA	2	6	73448	73453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431232
1601	NC_022121	GA	3	6	73471	73476	50 %	0 %	50 %	0 %	532431232
1602	NC_022121	TAC	2	6	73496	73501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431232
1603	NC_022121	GATCAT	2	12	73541	73552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532431232
1604	NC_022121	TGA	2	6	73574	73579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431232
1605	NC_022121	G	6	6	73632	73637	0 %	0 %	100 %	0 %	532431232
1606	NC_022121	TAT	2	6	73644	73649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431232
1607	NC_022121	A	6	6	73680	73685	100 %	0 %	0 %	0 %	532431232
1608	NC_022121	TGGGA	2	10	73703	73712	20 %	20 %	60 %	0 %	532431232
1609	NC_022121	TGGA	2	8	73822	73829	25 %	25 %	50 %	0 %	532431232
1610	NC_022121	AGG	2	6	73856	73861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431232
1611	NC_022121	TC	3	6	73958	73963	0 %	50 %	0 %	50 %	532431232
1612	NC_022121	T	6	6	73986	73991	0 %	100 %	0 %	0 %	532431232
1613	NC_022121	AGC	3	9	74030	74038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431232
1614	NC_022121	AGGC	2	8	74146	74153	25 %	0 %	50 %	25 %	532431232
1615	NC_022121	ATT	2	6	74169	74174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431232
1616	NC_022121	AAG	2	6	74209	74214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431232
1617	NC_022121	AAG	2	6	74272	74277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431232
1618	NC_022121	TGC	2	6	74350	74355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431232
1619	NC_022121	TC	3	6	74365	74370	0 %	50 %	0 %	50 %	532431232
1620	NC_022121	TCA	2	6	74459	74464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431232
1621	NC_022121	ATT	2	6	74509	74514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431232
1622	NC_022121	TCT	2	6	74601	74606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431232
1623	NC_022121	ATG	2	6	74620	74625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431232
1624	NC_022121	AAG	2	6	74775	74780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022121	ACT	2	6	74790	74795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_022121	T	6	6	74801	74806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022121	AGT	2	6	74826	74831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022121	CAA	2	6	74852	74857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431233
1629	NC_022121	T	6	6	74910	74915	0 %	100 %	0 %	0 %	532431233
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1884	NC_022121	T	6	6	85593	85598	0 %	100 %	0 %	0 %	532431241
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