MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022121	ATT	2	6	23169	23174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431190
502	NC_022121	AAT	2	6	23211	23216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431190
503	NC_022121	TTG	2	6	23274	23279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431190
504	NC_022121	TTCT	2	8	23461	23468	0 %	75 %	0 %	25 %	532431190
505	NC_022121	TGC	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431190
506	NC_022121	TAAC	2	8	23563	23570	50 %	25 %	0 %	25 %	532431190
507	NC_022121	GCA	2	6	23631	23636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431190
508	NC_022121	CATT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	532431190
509	NC_022121	AGA	2	6	23705	23710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431190
510	NC_022121	GAG	2	6	23728	23733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431190
511	NC_022121	TTC	2	6	23791	23796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431190
512	NC_022121	GGAAA	2	10	23804	23813	60 %	0 %	40 %	0 %	532431190
513	NC_022121	GA	3	6	23827	23832	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
514	NC_022121	GA	3	6	23919	23924	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
515	NC_022121	GAA	2	6	24050	24055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431190
516	NC_022121	GGTA	2	8	24056	24063	25 %	25 %	50 %	0 %	532431190
517	NC_022121	GTT	2	6	24144	24149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431190
518	NC_022121	CTT	2	6	24238	24243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431190
519	NC_022121	AG	3	6	24300	24305	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
520	NC_022121	TAA	2	6	24311	24316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431190
521	NC_022121	GAA	2	6	24331	24336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431190
522	NC_022121	AAG	2	6	24472	24477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431190
523	NC_022121	A	7	7	24557	24563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022121	TTA	2	6	24570	24575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022121	T	9	9	24585	24593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022121	T	6	6	24617	24622	0 %	100 %	0 %	0 %	532431191
527	NC_022121	AGA	2	6	24744	24749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431191
528	NC_022121	TAA	2	6	24876	24881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431191
529	NC_022121	GGA	3	9	24908	24916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431191
530	NC_022121	GAT	2	6	24953	24958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431191
531	NC_022121	TTCG	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	532431191
532	NC_022121	TAGG	2	8	25275	25282	25 %	25 %	50 %	0 %	532431191
533	NC_022121	TGT	2	6	25366	25371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431191
534	NC_022121	TTA	2	6	25376	25381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431191
535	NC_022121	TTCC	2	8	25399	25406	0 %	50 %	0 %	50 %	532431191
536	NC_022121	TAG	2	6	25437	25442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431191
537	NC_022121	GTGAGG	2	12	25471	25482	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532431191
538	NC_022121	TAGG	2	8	25513	25520	25 %	25 %	50 %	0 %	532431191
539	NC_022121	AGAGG	2	10	25529	25538	40 %	0 %	60 %	0 %	532431191
540	NC_022121	AGC	2	6	25555	25560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431191
541	NC_022121	T	6	6	25595	25600	0 %	100 %	0 %	0 %	532431191
542	NC_022121	AAG	2	6	25701	25706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431191
543	NC_022121	GA	3	6	25717	25722	50 %	0 %	50 %	0 %	532431191
544	NC_022121	GT	3	6	25737	25742	0 %	50 %	50 %	0 %	532431191
545	NC_022121	TA	3	6	25939	25944	50 %	50 %	0 %	0 %	532431191
546	NC_022121	T	6	6	25948	25953	0 %	100 %	0 %	0 %	532431191
547	NC_022121	GAT	2	6	25960	25965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431191
548	NC_022121	TGT	2	6	26095	26100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431191
549	NC_022121	TAG	2	6	26133	26138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431191
550	NC_022121	A	6	6	26192	26197	100 %	0 %	0 %	0 %	532431191
551	NC_022121	GCA	2	6	26207	26212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431191
552	NC_022121	T	6	6	26268	26273	0 %	100 %	0 %	0 %	532431191
553	NC_022121	GCTT	2	8	26285	26292	0 %	50 %	25 %	25 %	532431191
554	NC_022121	CTT	2	6	26355	26360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431191
555	NC_022121	GA	3	6	26385	26390	50 %	0 %	50 %	0 %	532431191
556	NC_022121	GAA	2	6	26420	26425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431191
557	NC_022121	GAA	2	6	26427	26432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431191
558	NC_022121	CGA	2	6	26435	26440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431191
559	NC_022121	GA	3	6	26509	26514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022121	CT	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_022121	ACT	2	6	26524	26529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_022121	A	6	6	26540	26545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022121	T	7	7	26552	26558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022121	AGG	3	9	26693	26701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431192
565	NC_022121	TAA	2	6	26729	26734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431192
566	NC_022121	AT	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	532431192
567	NC_022121	T	7	7	26815	26821	0 %	100 %	0 %	0 %	532431192
568	NC_022121	GAA	2	6	26833	26838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431192
569	NC_022121	GGAA	2	8	26868	26875	50 %	0 %	50 %	0 %	532431192
570	NC_022121	TTAA	2	8	26941	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	532431192
571	NC_022121	AAAG	2	8	26991	26998	75 %	0 %	25 %	0 %	532431192
572	NC_022121	GA	3	6	27016	27021	50 %	0 %	50 %	0 %	532431192
573	NC_022121	T	7	7	27090	27096	0 %	100 %	0 %	0 %	532431192
574	NC_022121	TTC	2	6	27121	27126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431192
575	NC_022121	CTA	2	6	27140	27145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431192
576	NC_022121	T	8	8	27147	27154	0 %	100 %	0 %	0 %	532431192
577	NC_022121	GAA	2	6	27205	27210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431192
578	NC_022121	GGGC	2	8	27271	27278	0 %	0 %	75 %	25 %	532431192
579	NC_022121	T	6	6	27287	27292	0 %	100 %	0 %	0 %	532431192
580	NC_022121	TGA	2	6	27300	27305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431192
581	NC_022121	GGAGA	2	10	27308	27317	40 %	0 %	60 %	0 %	532431192
582	NC_022121	A	7	7	27358	27364	100 %	0 %	0 %	0 %	532431192
583	NC_022121	AAG	2	6	27375	27380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431192
584	NC_022121	T	6	6	27395	27400	0 %	100 %	0 %	0 %	532431192
585	NC_022121	A	8	8	27492	27499	100 %	0 %	0 %	0 %	532431193
586	NC_022121	TTC	2	6	27536	27541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431193
587	NC_022121	GTTT	2	8	27554	27561	0 %	75 %	25 %	0 %	532431193
588	NC_022121	CAGA	2	8	27576	27583	50 %	0 %	25 %	25 %	532431193
589	NC_022121	TTC	2	6	27654	27659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431193
590	NC_022121	AAG	2	6	27669	27674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431193
591	NC_022121	TTC	2	6	27769	27774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431193
592	NC_022121	AAG	2	6	27783	27788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431193
593	NC_022121	AAG	2	6	27801	27806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431193
594	NC_022121	A	6	6	27807	27812	100 %	0 %	0 %	0 %	532431193
595	NC_022121	T	7	7	27866	27872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022121	TAA	2	6	27877	27882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022121	TC	3	6	27884	27889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_022121	ATTG	2	8	27935	27942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022121	AG	3	6	27967	27972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022121	AGA	2	6	27989	27994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022121	GAA	2	6	28039	28044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
602	NC_022121	ATCCG	2	10	28059	28068	20 %	20 %	20 %	40 %	532431194
603	NC_022121	TTC	2	6	28172	28177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431194
604	NC_022121	TAG	2	6	28220	28225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431194
605	NC_022121	AGA	2	6	28233	28238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
606	NC_022121	GAT	3	9	28315	28323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431194
607	NC_022121	GAG	2	6	28358	28363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431194
608	NC_022121	TG	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	532431194
609	NC_022121	GCA	2	6	28414	28419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431194
610	NC_022121	TC	3	6	28443	28448	0 %	50 %	0 %	50 %	532431194
611	NC_022121	AGGGT	2	10	28577	28586	20 %	20 %	60 %	0 %	532431194
612	NC_022121	TTC	2	6	28613	28618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431194
613	NC_022121	CAG	2	6	28625	28630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431194
614	NC_022121	GAA	2	6	28639	28644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
615	NC_022121	TGA	2	6	28653	28658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431194
616	NC_022121	TTC	2	6	28686	28691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431194
617	NC_022121	GC	4	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	532431194
618	NC_022121	AAG	2	6	28865	28870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
619	NC_022121	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	532431194
620	NC_022121	GAA	2	6	29068	29073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
621	NC_022121	TGT	2	6	29100	29105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431195
622	NC_022121	TCT	2	6	29168	29173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431195
623	NC_022121	ACA	2	6	29396	29401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431195
624	NC_022121	ATG	2	6	29406	29411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431195
625	NC_022121	CTTT	2	8	29548	29555	0 %	75 %	0 %	25 %	532431195
626	NC_022121	TTTG	2	8	29563	29570	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
627	NC_022121	TTGT	2	8	29598	29605	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
628	NC_022121	CCTAT	2	10	29617	29626	20 %	40 %	0 %	40 %	532431195
629	NC_022121	T	6	6	29633	29638	0 %	100 %	0 %	0 %	532431195
630	NC_022121	ATC	2	6	29712	29717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431195
631	NC_022121	TGGC	2	8	29761	29768	0 %	25 %	50 %	25 %	532431195
632	NC_022121	T	8	8	29867	29874	0 %	100 %	0 %	0 %	532431195
633	NC_022121	ATG	2	6	29892	29897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431195
634	NC_022121	GA	3	6	29930	29935	50 %	0 %	50 %	0 %	532431195
635	NC_022121	AG	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
636	NC_022121	GTT	2	6	30109	30114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431196
637	NC_022121	GAA	2	6	30118	30123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
638	NC_022121	TC	3	6	30137	30142	0 %	50 %	0 %	50 %	532431196
639	NC_022121	TCT	2	6	30184	30189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431196
640	NC_022121	ACT	2	6	30274	30279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431196
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645	NC_022121	T	6	6	30408	30413	0 %	100 %	0 %	0 %	532431196
646	NC_022121	GAAGG	2	10	30416	30425	40 %	0 %	60 %	0 %	532431196
647	NC_022121	GGC	2	6	30444	30449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431196
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649	NC_022121	GATG	2	8	30534	30541	25 %	25 %	50 %	0 %	532431196
650	NC_022121	TAG	2	6	30545	30550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431196
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653	NC_022121	GA	3	6	30758	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
654	NC_022121	GAA	2	6	30868	30873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
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659	NC_022121	GAA	2	6	31030	31035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
660	NC_022121	ATT	2	6	31066	31071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431196
661	NC_022121	ATG	2	6	31189	31194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431196
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663	NC_022121	T	6	6	31207	31212	0 %	100 %	0 %	0 %	532431196
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665	NC_022121	A	7	7	31249	31255	100 %	0 %	0 %	0 %	532431196
666	NC_022121	ACA	2	6	31295	31300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431197
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669	NC_022121	T	6	6	31435	31440	0 %	100 %	0 %	0 %	532431197
670	NC_022121	GAGCT	2	10	31456	31465	20 %	20 %	40 %	20 %	532431197
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672	NC_022121	A	6	6	31561	31566	100 %	0 %	0 %	0 %	532431197
673	NC_022121	TGC	2	6	31589	31594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431197
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746	NC_022121	ATA	2	6	35584	35589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431203
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749	NC_022121	GGATTT	2	12	35948	35959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431203
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751	NC_022121	ATG	2	6	36076	36081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431203
752	NC_022121	CTATT	2	10	36130	36139	20 %	60 %	0 %	20 %	532431203
753	NC_022121	TCCTA	2	10	36177	36186	20 %	40 %	0 %	40 %	532431203
754	NC_022121	AGAT	2	8	36260	36267	50 %	25 %	25 %	0 %	532431203
755	NC_022121	T	6	6	36291	36296	0 %	100 %	0 %	0 %	532431203
756	NC_022121	ATT	2	6	36335	36340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431203
757	NC_022121	GA	3	6	36381	36386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
758	NC_022121	T	8	8	36415	36422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
759	NC_022121	CTT	2	6	36474	36479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
760	NC_022121	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
761	NC_022121	GA	3	6	36530	36535	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
762	NC_022121	AAG	2	6	36555	36560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431204
763	NC_022121	TTG	2	6	36573	36578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431204
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772	NC_022121	TGC	2	6	37002	37007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431204
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887	NC_022121	T	8	8	42479	42486	0 %	100 %	0 %	0 %	532432011
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889	NC_022121	A	6	6	42578	42583	100 %	0 %	0 %	0 %	532432011
890	NC_022121	GA	5	10	42588	42597	50 %	0 %	50 %	0 %	532432011
891	NC_022121	A	7	7	42627	42633	100 %	0 %	0 %	0 %	532432011
892	NC_022121	CAAAA	2	10	42642	42651	80 %	0 %	0 %	20 %	532432011
893	NC_022121	A	7	7	42648	42654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
894	NC_022121	GAT	2	6	42672	42677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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