MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022121	CA	3	6	273758	273763	50 %	0 %	0 %	50 %	532431396
6003	NC_022121	T	7	7	273790	273796	0 %	100 %	0 %	0 %	532431396
6004	NC_022121	CAA	2	6	273810	273815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431396
6005	NC_022121	CT	3	6	273821	273826	0 %	50 %	0 %	50 %	532431396
6006	NC_022121	T	9	9	273926	273934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_022121	CAG	2	6	273954	273959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_022121	TA	3	6	273960	273965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_022121	ATTT	2	8	274041	274048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_022121	TTCT	2	8	274176	274183	0 %	75 %	0 %	25 %	532431397
6011	NC_022121	A	7	7	274198	274204	100 %	0 %	0 %	0 %	532431397
6012	NC_022121	TTG	2	6	274259	274264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431397
6013	NC_022121	AAG	2	6	274292	274297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431397
6014	NC_022121	CAG	2	6	274307	274312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431397
6015	NC_022121	TTGC	2	8	274316	274323	0 %	50 %	25 %	25 %	532431397
6016	NC_022121	T	7	7	274342	274348	0 %	100 %	0 %	0 %	532431397
6017	NC_022121	CTG	3	9	274375	274383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431397
6018	NC_022121	GCA	2	6	274405	274410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431397
6019	NC_022121	GAAA	2	8	274422	274429	75 %	0 %	25 %	0 %	532431397
6020	NC_022121	TG	3	6	274466	274471	0 %	50 %	50 %	0 %	532431397
6021	NC_022121	TGG	2	6	274503	274508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431397
6022	NC_022121	GCA	2	6	274531	274536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431397
6023	NC_022121	TCT	2	6	274561	274566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431397
6024	NC_022121	TCCCT	2	10	274645	274654	0 %	40 %	0 %	60 %	532431397
6025	NC_022121	ATT	2	6	274663	274668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431397
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6027	NC_022121	TCTT	2	8	274755	274762	0 %	75 %	0 %	25 %	532431397
6028	NC_022121	ATTT	2	8	274784	274791	25 %	75 %	0 %	0 %	532431397
6029	NC_022121	CAA	2	6	274831	274836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431397
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6031	NC_022121	TCT	2	6	274935	274940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431397
6032	NC_022121	ATCCT	2	10	274949	274958	20 %	40 %	0 %	40 %	532431397
6033	NC_022121	GAT	2	6	275002	275007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431397
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6035	NC_022121	TGA	2	6	275161	275166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431398
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6037	NC_022121	GCT	2	6	275300	275305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431398
6038	NC_022121	TGGAAT	2	12	275311	275322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431398
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6042	NC_022121	TGC	2	6	275386	275391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431398
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6044	NC_022121	TAT	2	6	275423	275428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431398
6045	NC_022121	GCT	2	6	275480	275485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431398
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6050	NC_022121	GCT	2	6	275774	275779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431398
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6056	NC_022121	TTGTC	2	10	275887	275896	0 %	60 %	20 %	20 %	532431398
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6059	NC_022121	ACG	2	6	275942	275947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431398
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6109	NC_022121	CCAT	2	8	277836	277843	25 %	25 %	0 %	50 %	532431400
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6123	NC_022121	ATA	2	6	278622	278627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431400
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6125	NC_022121	GAA	2	6	278725	278730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431400
6126	NC_022121	AAAT	2	8	278738	278745	75 %	25 %	0 %	0 %	532431400
6127	NC_022121	TC	3	6	278756	278761	0 %	50 %	0 %	50 %	532431400
6128	NC_022121	GAA	2	6	278773	278778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431400
6129	NC_022121	TAA	2	6	278855	278860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431400
6130	NC_022121	CAT	2	6	278864	278869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431400
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6142	NC_022121	ACT	2	6	279686	279691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431400
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6146	NC_022121	GCTT	2	8	279816	279823	0 %	50 %	25 %	25 %	532431400
6147	NC_022121	GTTT	2	8	279883	279890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_022121	ATATTA	2	12	279906	279917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6149	NC_022121	AAAG	2	8	279918	279925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6150	NC_022121	A	6	6	279973	279978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_022121	T	6	6	279997	280002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_022121	AGG	2	6	280008	280013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_022121	GCA	2	6	280092	280097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431401
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6163	NC_022121	TGCC	2	8	280406	280413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6164	NC_022121	TCT	2	6	280426	280431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431402
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6192	NC_022121	TAC	2	6	281845	281850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6207	NC_022121	CTG	2	6	282400	282405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431403
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6226	NC_022121	ATA	2	6	283333	283338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431403
6227	NC_022121	CT	3	6	283429	283434	0 %	50 %	0 %	50 %	532431403
6228	NC_022121	TCT	2	6	283469	283474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431403
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6230	NC_022121	AC	3	6	283640	283645	50 %	0 %	0 %	50 %	532431403
6231	NC_022121	TCT	2	6	283646	283651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431403
6232	NC_022121	ATTC	2	8	283680	283687	25 %	50 %	0 %	25 %	532431403
6233	NC_022121	ATG	2	6	283707	283712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431403
6234	NC_022121	CTA	2	6	283803	283808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431403
6235	NC_022121	CTT	2	6	283866	283871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431403
6236	NC_022121	CAG	2	6	283984	283989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431403
6237	NC_022121	CTC	2	6	284038	284043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431403
6238	NC_022121	TAC	2	6	284062	284067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431403
6239	NC_022121	GCT	2	6	284112	284117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431403
6240	NC_022121	GAA	2	6	284158	284163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431403
6241	NC_022121	ATA	2	6	284205	284210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431403
6242	NC_022121	CGTT	2	8	284212	284219	0 %	50 %	25 %	25 %	532431403
6243	NC_022121	ATTC	2	8	284221	284228	25 %	50 %	0 %	25 %	532431403
6244	NC_022121	GGGA	2	8	284254	284261	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_022121	A	7	7	284300	284306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_022121	CTT	2	6	284333	284338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6247	NC_022121	C	6	6	284461	284466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6248	NC_022121	AT	4	8	284520	284527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_022121	CAT	2	6	284540	284545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431404
6250	NC_022121	T	9	9	284545	284553	0 %	100 %	0 %	0 %	532431404
6251	NC_022121	ATC	2	6	284588	284593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431404
6252	NC_022121	TTC	2	6	284629	284634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431404
6253	NC_022121	GT	3	6	284653	284658	0 %	50 %	50 %	0 %	532431404
6254	NC_022121	CTG	2	6	284709	284714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431404
6255	NC_022121	CCA	2	6	284834	284839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431404
6256	NC_022121	A	6	6	284844	284849	100 %	0 %	0 %	0 %	532431404
6257	NC_022121	CAC	2	6	285025	285030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431404
6258	NC_022121	CCT	2	6	285059	285064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431404
6259	NC_022121	CTCC	2	8	285107	285114	0 %	25 %	0 %	75 %	532431404
6260	NC_022121	AAGC	2	8	285129	285136	50 %	0 %	25 %	25 %	532431404
6261	NC_022121	ATG	2	6	285146	285151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431404
6262	NC_022121	T	6	6	285202	285207	0 %	100 %	0 %	0 %	532431404
6263	NC_022121	CTC	2	6	285208	285213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431404
6264	NC_022121	GAT	2	6	285257	285262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431404
6265	NC_022121	A	7	7	285263	285269	100 %	0 %	0 %	0 %	532431404
6266	NC_022121	AG	3	6	285330	285335	50 %	0 %	50 %	0 %	532431404
6267	NC_022121	CT	3	6	285372	285377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6268	NC_022121	TAAA	2	8	285396	285403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6269	NC_022121	A	6	6	285401	285406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6270	NC_022121	T	6	6	285421	285426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6271	NC_022121	A	6	6	285441	285446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6272	NC_022121	TC	4	8	285463	285470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6273	NC_022121	T	6	6	285591	285596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6274	NC_022121	CTT	2	6	285633	285638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431405
6275	NC_022121	ACT	2	6	285662	285667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431405
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6277	NC_022121	GTC	2	6	285743	285748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431405
6278	NC_022121	T	6	6	285762	285767	0 %	100 %	0 %	0 %	532431405
6279	NC_022121	ACT	2	6	285790	285795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431405
6280	NC_022121	ACT	2	6	285859	285864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431405
6281	NC_022121	TGC	2	6	285895	285900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431405
6282	NC_022121	T	7	7	285905	285911	0 %	100 %	0 %	0 %	532431405
6283	NC_022121	CTCCTA	2	12	285912	285923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431405
6284	NC_022121	AAC	2	6	285997	286002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431405
6285	NC_022121	TC	3	6	286112	286117	0 %	50 %	0 %	50 %	532431405
6286	NC_022121	ATC	2	6	286137	286142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431405
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6288	NC_022121	TTCGA	2	10	286166	286175	20 %	40 %	20 %	20 %	532431405
6289	NC_022121	ATT	2	6	286201	286206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431405
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6291	NC_022121	TTG	2	6	286215	286220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431405
6292	NC_022121	ACT	2	6	286248	286253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431405
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6294	NC_022121	TTG	2	6	286290	286295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431406
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6298	NC_022121	T	7	7	286485	286491	0 %	100 %	0 %	0 %	532431406
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6310	NC_022121	TCTTT	2	10	286923	286932	0 %	80 %	0 %	20 %	532431406
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6314	NC_022121	GATA	2	8	287056	287063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6315	NC_022121	A	6	6	287070	287075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6316	NC_022121	GCT	2	6	287119	287124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6317	NC_022121	TC	3	6	287153	287158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6318	NC_022121	TC	3	6	287210	287215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6319	NC_022121	TTA	2	6	287236	287241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431407
6320	NC_022121	T	6	6	287247	287252	0 %	100 %	0 %	0 %	532431407
6321	NC_022121	TTC	2	6	287278	287283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431407
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6325	NC_022121	AAG	2	6	287402	287407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431407
6326	NC_022121	AGTA	2	8	287425	287432	50 %	25 %	25 %	0 %	532431407
6327	NC_022121	TA	3	6	287512	287517	50 %	50 %	0 %	0 %	532431407
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6330	NC_022121	GTG	2	6	287648	287653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6331	NC_022121	TAA	2	6	287661	287666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6332	NC_022121	A	7	7	287665	287671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6333	NC_022121	CT	3	6	287683	287688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6334	NC_022121	TTC	2	6	287747	287752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6335	NC_022121	T	6	6	287758	287763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6336	NC_022121	AAT	2	6	287776	287781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6337	NC_022121	TTC	2	6	287816	287821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431408
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6339	NC_022121	CTT	2	6	287902	287907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431408
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6349	NC_022121	ATG	2	6	288439	288444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431408
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6351	NC_022121	GGT	2	6	288522	288527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431408
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6356	NC_022121	TGA	2	6	288707	288712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431408
6357	NC_022121	CTCA	2	8	288808	288815	25 %	25 %	0 %	50 %	532431408
6358	NC_022121	TGT	2	6	288824	288829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431408
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6361	NC_022121	TG	3	6	289014	289019	0 %	50 %	50 %	0 %	532431408
6362	NC_022121	TA	3	6	289029	289034	50 %	50 %	0 %	0 %	532431408
6363	NC_022121	AACT	2	8	289050	289057	50 %	25 %	0 %	25 %	532431408
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6367	NC_022121	AGA	2	6	289213	289218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431409
6368	NC_022121	TCA	2	6	289282	289287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431409
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6370	NC_022121	GTC	2	6	289351	289356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431409
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6372	NC_022121	TC	3	6	289385	289390	0 %	50 %	0 %	50 %	532431409
6373	NC_022121	A	6	6	289403	289408	100 %	0 %	0 %	0 %	532431409
6374	NC_022121	TCA	2	6	289575	289580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431409
6375	NC_022121	TCGT	2	8	289715	289722	0 %	50 %	25 %	25 %	532431409
6376	NC_022121	A	6	6	289791	289796	100 %	0 %	0 %	0 %	532431409
6377	NC_022121	TGT	2	6	289824	289829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431409
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6379	NC_022121	ATA	2	6	289931	289936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431409
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6382	NC_022121	AC	3	6	290057	290062	50 %	0 %	0 %	50 %	532431409
6383	NC_022121	ATT	2	6	290092	290097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431409
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6403	NC_022121	TGCT	2	8	291070	291077	0 %	50 %	25 %	25 %	532431410
6404	NC_022121	CTG	2	6	291093	291098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431410
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6423	NC_022121	CAA	2	6	292130	292135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431411
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6432	NC_022121	A	6	6	292378	292383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6433	NC_022121	TAA	2	6	292426	292431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6434	NC_022121	AAT	2	6	292479	292484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431412
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6455	NC_022121	TCTT	2	8	293704	293711	0 %	75 %	0 %	25 %	532431414
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6484	NC_022121	TCAG	2	8	294767	294774	25 %	25 %	25 %	25 %	532431415
6485	NC_022121	TAG	2	6	294855	294860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431415
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6487	NC_022121	ACTAC	2	10	294894	294903	40 %	20 %	0 %	40 %	532431415
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6489	NC_022121	A	6	6	294925	294930	100 %	0 %	0 %	0 %	532431415
6490	NC_022121	CT	3	6	294944	294949	0 %	50 %	0 %	50 %	532431415
6491	NC_022121	AT	3	6	294977	294982	50 %	50 %	0 %	0 %	532431415
6492	NC_022121	CAT	2	6	295022	295027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431416
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6494	NC_022121	CTT	2	6	295110	295115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431416
6495	NC_022121	TTC	2	6	295133	295138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431416
6496	NC_022121	GCA	2	6	295311	295316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431416
6497	NC_022121	TGC	2	6	295340	295345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431416
6498	NC_022121	TAA	2	6	295378	295383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431416
6499	NC_022121	GCTT	2	8	295430	295437	0 %	50 %	25 %	25 %	532431416
6500	NC_022121	CTT	3	9	295452	295460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431416

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