MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022121	T	6	6	251024	251029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_022121	T	7	7	251043	251049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_022121	A	6	6	251051	251056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_022121	ACA	2	6	251151	251156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431373
5505	NC_022121	CTT	2	6	251158	251163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431373
5506	NC_022121	AAG	2	6	251189	251194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431373
5507	NC_022121	GCA	2	6	251208	251213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431373
5508	NC_022121	TTG	2	6	251228	251233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431373
5509	NC_022121	CAAA	2	8	251392	251399	75 %	0 %	0 %	25 %	532431374
5510	NC_022121	ATA	2	6	251415	251420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431374
5511	NC_022121	CAAT	2	8	251502	251509	50 %	25 %	0 %	25 %	532431374
5512	NC_022121	CTTT	3	12	251554	251565	0 %	75 %	0 %	25 %	532431374
5513	NC_022121	CGA	2	6	251596	251601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431374
5514	NC_022121	CTT	2	6	251607	251612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431374
5515	NC_022121	ACA	2	6	251629	251634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431374
5516	NC_022121	CTC	2	6	251648	251653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_022121	CAA	2	6	251692	251697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_022121	AG	3	6	251737	251742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_022121	A	8	8	251743	251750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_022121	AAG	2	6	251761	251766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_022121	CAT	4	12	251811	251822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431375
5522	NC_022121	TTA	2	6	251957	251962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431375
5523	NC_022121	CTC	2	6	251988	251993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431375
5524	NC_022121	AGT	2	6	252012	252017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431375
5525	NC_022121	GCAG	2	8	252059	252066	25 %	0 %	50 %	25 %	532431375
5526	NC_022121	TCTT	2	8	252076	252083	0 %	75 %	0 %	25 %	532431375
5527	NC_022121	AGA	2	6	252104	252109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431375
5528	NC_022121	CTT	2	6	252120	252125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431375
5529	NC_022121	ACA	2	6	252136	252141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431375
5530	NC_022121	TC	3	6	252178	252183	0 %	50 %	0 %	50 %	532431375
5531	NC_022121	TCT	2	6	252257	252262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431375
5532	NC_022121	CAA	2	6	252314	252319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431375
5533	NC_022121	AGA	3	9	252387	252395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431375
5534	NC_022121	GGC	2	6	252398	252403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431375
5535	NC_022121	ACA	2	6	252428	252433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431375
5536	NC_022121	CAC	2	6	252435	252440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431375
5537	NC_022121	CAG	2	6	252441	252446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431375
5538	NC_022121	T	8	8	252510	252517	0 %	100 %	0 %	0 %	532431375
5539	NC_022121	TCC	2	6	252601	252606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_022121	GAAA	2	8	252622	252629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_022121	T	7	7	252643	252649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_022121	GCAG	2	8	252671	252678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_022121	AG	3	6	252746	252751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_022121	TAT	2	6	252769	252774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_022121	ACA	2	6	252810	252815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_022121	A	6	6	252859	252864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_022121	TTG	2	6	253039	253044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431376
5548	NC_022121	TCT	2	6	253061	253066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431376
5549	NC_022121	TC	3	6	253108	253113	0 %	50 %	0 %	50 %	532431376
5550	NC_022121	T	7	7	253144	253150	0 %	100 %	0 %	0 %	532431376
5551	NC_022121	CCA	2	6	253157	253162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431376
5552	NC_022121	AAC	2	6	253210	253215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431376
5553	NC_022121	AATA	2	8	253264	253271	75 %	25 %	0 %	0 %	532431376
5554	NC_022121	GCT	2	6	253274	253279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431376
5555	NC_022121	ACA	2	6	253339	253344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431376
5556	NC_022121	CCA	2	6	253371	253376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431376
5557	NC_022121	CAA	2	6	253419	253424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431376
5558	NC_022121	CCCA	2	8	253527	253534	25 %	0 %	0 %	75 %	532431377
5559	NC_022121	CTT	2	6	253656	253661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431377
5560	NC_022121	AAT	2	6	253735	253740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431377
5561	NC_022121	CTC	2	6	253746	253751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431377
5562	NC_022121	ACT	2	6	253754	253759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431377
5563	NC_022121	GAA	2	6	253772	253777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431377
5564	NC_022121	CTC	2	6	253803	253808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431377
5565	NC_022121	GCAA	2	8	253817	253824	50 %	0 %	25 %	25 %	532431377
5566	NC_022121	AAC	2	6	253834	253839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431377
5567	NC_022121	GTT	2	6	253879	253884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431377
5568	NC_022121	AAC	2	6	253918	253923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_022121	A	6	6	253932	253937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_022121	TAA	2	6	253983	253988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_022121	TTC	2	6	254001	254006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431378
5572	NC_022121	GCT	2	6	254033	254038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431378
5573	NC_022121	T	7	7	254042	254048	0 %	100 %	0 %	0 %	532431378
5574	NC_022121	AGCA	2	8	254079	254086	50 %	0 %	25 %	25 %	532431378
5575	NC_022121	CTT	2	6	254096	254101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431378
5576	NC_022121	TCT	3	9	254107	254115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431378
5577	NC_022121	GATAA	2	10	254135	254144	60 %	20 %	20 %	0 %	532431378
5578	NC_022121	TCG	2	6	254201	254206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431378
5579	NC_022121	CATA	2	8	254222	254229	50 %	25 %	0 %	25 %	532431378
5580	NC_022121	TCC	2	6	254241	254246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431378
5581	NC_022121	TAA	2	6	254274	254279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431378
5582	NC_022121	AG	3	6	254299	254304	50 %	0 %	50 %	0 %	532431378
5583	NC_022121	A	6	6	254318	254323	100 %	0 %	0 %	0 %	532431378
5584	NC_022121	AGA	2	6	254329	254334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431378
5585	NC_022121	CAC	2	6	254336	254341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431378
5586	NC_022121	CAA	2	6	254382	254387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431378
5587	NC_022121	GTA	2	6	254404	254409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431378
5588	NC_022121	ACA	2	6	254463	254468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431378
5589	NC_022121	A	8	8	254503	254510	100 %	0 %	0 %	0 %	532431378
5590	NC_022121	TA	3	6	254552	254557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_022121	CCAA	2	8	254587	254594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_022121	A	7	7	254611	254617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_022121	TAT	2	6	254630	254635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_022121	TTCA	2	8	254662	254669	25 %	50 %	0 %	25 %	532431379
5595	NC_022121	AGA	2	6	254698	254703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431379
5596	NC_022121	TGTT	2	8	254736	254743	0 %	75 %	25 %	0 %	532431379
5597	NC_022121	CGA	2	6	254857	254862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431379
5598	NC_022121	GCAAA	2	10	254869	254878	60 %	0 %	20 %	20 %	532431379
5599	NC_022121	AATA	2	8	254955	254962	75 %	25 %	0 %	0 %	532431379
5600	NC_022121	A	6	6	255021	255026	100 %	0 %	0 %	0 %	532431379
5601	NC_022121	A	7	7	255052	255058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_022121	ATA	2	6	255065	255070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_022121	AACCCT	2	12	255111	255122	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_022121	AAAC	2	8	255185	255192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_022121	AAG	2	6	255309	255314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431380
5606	NC_022121	AGC	2	6	255343	255348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431380
5607	NC_022121	CAAT	2	8	255449	255456	50 %	25 %	0 %	25 %	532431380
5608	NC_022121	TTA	2	6	255521	255526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431380
5609	NC_022121	CTTCT	2	10	255553	255562	0 %	60 %	0 %	40 %	532431380
5610	NC_022121	T	6	6	255596	255601	0 %	100 %	0 %	0 %	532431380
5611	NC_022121	CA	3	6	255655	255660	50 %	0 %	0 %	50 %	532431380
5612	NC_022121	AAT	2	6	255670	255675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431380
5613	NC_022121	GCA	2	6	255680	255685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431380
5614	NC_022121	ACA	2	6	255746	255751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431380
5615	NC_022121	TTG	2	6	255810	255815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431380
5616	NC_022121	AGA	2	6	255865	255870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431380
5617	NC_022121	TAG	2	6	255885	255890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431380
5618	NC_022121	ATTTTT	2	12	255906	255917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_022121	GAG	2	6	256034	256039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_022121	ATT	2	6	256046	256051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431381
5621	NC_022121	T	6	6	256050	256055	0 %	100 %	0 %	0 %	532431381
5622	NC_022121	ACG	2	6	256056	256061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431381
5623	NC_022121	CCTGCA	2	12	256067	256078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431381
5624	NC_022121	CTG	2	6	256124	256129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431381
5625	NC_022121	TTG	2	6	256155	256160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431381
5626	NC_022121	TCTG	2	8	256180	256187	0 %	50 %	25 %	25 %	532431381
5627	NC_022121	TCC	2	6	256210	256215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431381
5628	NC_022121	TTC	2	6	256266	256271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431381
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5659	NC_022121	TTC	2	6	257626	257631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382
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5681	NC_022121	A	8	8	258357	258364	100 %	0 %	0 %	0 %	532431383
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5752	NC_022121	CTT	2	6	261908	261913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431386
5753	NC_022121	TGT	2	6	261924	261929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431386
5754	NC_022121	CAA	2	6	261958	261963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431386
5755	NC_022121	GCTT	2	8	261986	261993	0 %	50 %	25 %	25 %	532431386
5756	NC_022121	GAT	2	6	262002	262007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431386
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5766	NC_022121	ATGA	2	8	262281	262288	50 %	25 %	25 %	0 %	532431386
5767	NC_022121	A	6	6	262331	262336	100 %	0 %	0 %	0 %	532431386
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5864	NC_022121	T	6	6	267510	267515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5865	NC_022121	CAAA	2	8	267528	267535	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5866	NC_022121	A	6	6	267539	267544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5867	NC_022121	TCATT	2	10	267675	267684	20 %	60 %	0 %	20 %	532431392
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5873	NC_022121	TTC	3	9	267883	267891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431392
5874	NC_022121	TTG	2	6	267900	267905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431392
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5878	NC_022121	TTG	2	6	268194	268199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431392
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5881	NC_022121	CT	3	6	268338	268343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5882	NC_022121	T	7	7	268385	268391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5884	NC_022121	TC	3	6	268407	268412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5885	NC_022121	TTC	2	6	268422	268427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5992	NC_022121	TTTC	2	8	273205	273212	0 %	75 %	0 %	25 %	532431396
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5999	NC_022121	CT	3	6	273650	273655	0 %	50 %	0 %	50 %	532431396
6000	NC_022121	TTC	2	6	273656	273661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431396

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