MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain Ia20-97 genome

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022120	GAAGGA	2	12	759	770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022120	TATGGA	2	12	812	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022120	AAAGCT	2	12	4937	4948	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427125
4	NC_022120	CAAAAA	2	12	6248	6259	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022120	TAGCAA	2	12	10824	10835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427131
6	NC_022120	AAAGCT	2	12	10955	10966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427131
7	NC_022120	TAGTGA	2	12	12101	12112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427132
8	NC_022120	GTTCCT	2	12	19384	19395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427138
9	NC_022120	CTTTTT	2	12	21538	21549	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427140
10	NC_022120	GTGAGG	2	12	25468	25479	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532427141
11	NC_022120	GGATTT	2	12	35945	35956	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427153
12	NC_022120	AATTAG	2	12	37365	37376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532427154
13	NC_022120	TTCCTG	2	12	37664	37675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427154
14	NC_022120	TTTTGA	2	12	44968	44979	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532427161
15	NC_022120	TGAACG	2	12	52318	52329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427168
16	NC_022120	GTGATT	2	12	52337	52348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427168
17	NC_022120	GATCTG	2	12	54986	54997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532427170
18	NC_022120	GTGTAA	2	12	55034	55045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427170
19	NC_022120	GGTTCA	2	12	55123	55134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532427170
20	NC_022120	GAAAAG	2	12	56382	56393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427962
21	NC_022120	AGTTGT	2	12	57733	57744	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427963
22	NC_022120	TTGTTC	2	12	58653	58664	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532427963
23	NC_022120	TGAAAA	2	12	59123	59134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532427171
24	NC_022120	TCCTAA	2	12	59462	59473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427171
25	NC_022120	AAAAAT	2	12	60957	60968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022120	GTTCTT	2	12	63382	63393	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532427173
27	NC_022120	CTATTT	2	12	71704	71715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532427180
28	NC_022120	ACTCTT	2	12	72833	72844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532427181
29	NC_022120	TTTCTG	2	12	73383	73394	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532427182
30	NC_022120	GATCAT	2	12	73513	73524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427182
31	NC_022120	TAGTAC	2	12	76506	76517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427183
32	NC_022120	ATCTAG	2	12	76685	76696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022120	GGTTTA	2	12	80157	80168	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427186
34	NC_022120	TTTAGT	2	12	81930	81941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532427188
35	NC_022120	GTCTGT	2	12	83201	83212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532427189
36	NC_022120	TTCTGA	2	12	88815	88826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427192
37	NC_022120	AAAAGA	2	12	93879	93890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532427198
38	NC_022120	AGCTGT	2	12	95972	95983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532427199
39	NC_022120	TCTTTT	2	12	96637	96648	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427201
40	NC_022120	GGGGCT	2	12	97585	97596	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532427201
41	NC_022120	TTTGAG	2	12	99788	99799	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427203
42	NC_022120	TCAGAA	2	12	106429	106440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427208
43	NC_022120	CATAAC	2	12	109473	109484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532427968
44	NC_022120	TGTTCT	2	12	112237	112248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532427212
45	NC_022120	ACTTCG	2	12	115521	115532	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427213
46	NC_022120	TTTTAG	2	12	115956	115967	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022120	TTGCCA	2	12	119059	119070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427217
48	NC_022120	TAAAAA	2	12	120551	120562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022120	TTGGTA	2	12	120599	120610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427219
50	NC_022120	AGGATC	2	12	120978	120989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427219
51	NC_022120	AAGGGT	2	12	122785	122796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532427220
52	NC_022120	GGGTTT	2	12	123748	123759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022120	TTGCAT	2	12	124030	124041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022120	AAGAGA	2	12	124399	124410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022120	TTAAAA	2	12	133333	133344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427226
56	NC_022120	AGGTTG	2	12	134575	134586	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	532427227
57	NC_022120	CTGTTT	2	12	135270	135281	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532427228
58	NC_022120	GAGTTA	2	12	139625	139636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427235
59	NC_022120	TGGAAA	2	12	142178	142189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532427238
60	NC_022120	TGGAAT	2	12	143053	143064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427239
61	NC_022120	ATGGTT	2	12	143297	143308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427239
62	NC_022120	TGCTCT	2	12	145488	145499	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427242
63	NC_022120	GAAAGG	2	12	149226	149237	50 %	0 %	50 %	0 %	532427244
64	NC_022120	GCTTTG	2	12	149469	149480	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532427244
65	NC_022120	CCTCAT	2	12	154889	154900	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427249
66	NC_022120	TGGAGA	2	12	156347	156358	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532427251
67	NC_022120	CTCCAT	2	12	157714	157725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427252
68	NC_022120	TCCTTG	2	12	158310	158321	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427253
69	NC_022120	AACAGC	2	12	160947	160958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532427256
70	NC_022120	AAAAAG	2	12	173533	173544	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532427263
71	NC_022120	TCCCAA	2	12	181963	181974	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532427267
72	NC_022120	AGAAAA	2	12	182580	182591	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022120	ACTTCT	2	12	189644	189655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532427980
74	NC_022120	ATTTGC	2	12	192336	192347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427982
75	NC_022120	AAACAT	2	12	193426	193437	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532427273
76	NC_022120	AGCAAC	2	12	193761	193772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532427273
77	NC_022120	TATGAA	2	12	195355	195366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532427274
78	NC_022120	TTGCCT	2	12	196467	196478	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427987
79	NC_022120	TCTGGA	2	12	199717	199728	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532427278
80	NC_022120	CTGGAT	2	12	215307	215318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532427291
81	NC_022120	GAAATA	2	12	215630	215641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532427291
82	NC_022120	TTTTAC	2	12	221360	221371	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022120	GATGCA	2	12	222521	222532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427298
84	NC_022120	ACTCCA	2	12	223411	223422	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532427299
85	NC_022120	CTGCTT	2	12	223643	223654	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427299
86	NC_022120	ATTGCT	2	12	226952	226963	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427302
87	NC_022120	TCCTAG	2	12	227242	227253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427302
88	NC_022120	GCAACG	2	12	227730	227741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427303
89	NC_022120	CTTAGC	2	12	230363	230374	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427305
90	NC_022120	TTCCTT	2	12	237195	237206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427310
91	NC_022120	TCTCCT	2	12	240076	240087	0 %	50 %	0 %	50 %	532427311
92	NC_022120	AAACCA	2	12	240651	240662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427312
93	NC_022120	AACCCT	2	12	255075	255086	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022120	ATTTTT	2	12	255869	255880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532427330
95	NC_022120	CCTGCA	2	12	256030	256041	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532427331
96	NC_022120	ACCTTT	2	12	261225	261236	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532427336
97	NC_022120	TCATAA	2	12	269072	269083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532427343
98	NC_022120	AAGTGT	2	12	269798	269809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427343
99	NC_022120	AGGAGA	2	12	270971	270982	50 %	0 %	50 %	0 %	532427343
100	NC_022120	ATCTAA	2	12	273076	273087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532427346
101	NC_022120	TGGAAT	2	12	275274	275285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427348
102	NC_022120	GGAACA	2	12	279161	279172	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532427350
103	NC_022120	ATATTA	2	12	279869	279880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022120	CACGCG	2	12	281534	281545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532427352
105	NC_022120	TTTCTT	2	12	281713	281724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427352
106	NC_022120	CTCCTA	2	12	285875	285886	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427355
107	NC_022120	GCAATG	2	12	291992	292003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427361
108	NC_022120	CGACAT	2	12	292660	292671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427362
109	NC_022120	CCCTTA	2	12	294114	294125	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427364
110	NC_022120	AAAATA	2	12	296212	296223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532427366
111	NC_022120	ACCACT	2	12	298567	298578	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532427368
112	NC_022120	CATTGC	2	12	301813	301824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427371
113	NC_022120	CCAAAA	2	12	302992	303003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427372
114	NC_022120	TCTTTT	2	12	304877	304888	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427374
115	NC_022120	CAAGAC	2	12	305968	305979	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532427375
116	NC_022120	AGCTTA	2	12	307249	307260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427377
117	NC_022120	CAAAGA	2	12	312621	312632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532427382
118	NC_022120	ATGGCT	2	12	313237	313248	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532427383
119	NC_022120	TACAAA	2	12	317427	317438	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532427386
120	NC_022120	TTAATT	2	12	319106	319117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427388
121	NC_022120	AAAACA	2	12	322591	322602	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532427390
122	NC_022120	AAAAAG	2	12	324017	324028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532427390
123	NC_022120	AGAGAA	2	12	324664	324675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427391
124	NC_022120	CAGAAC	2	12	344563	344574	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532427407
125	NC_022120	ATTCAA	2	12	349540	349551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532427412
126	NC_022120	AGAATA	2	12	361497	361508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022120	TTCTTA	2	12	361517	361528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022120	CAGCCT	2	12	373599	373610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532427432
129	NC_022120	AGCTGA	2	12	373649	373660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427432
130	NC_022120	ATGCTA	2	12	377516	377527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427434
131	NC_022120	CAATAG	2	12	384121	384132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427437
132	NC_022120	ACTGAA	2	12	384262	384273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427437
133	NC_022120	CTGCAC	2	12	384455	384466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532427437
134	NC_022120	TCCATA	2	12	394812	394823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427445
135	NC_022120	TTAGGT	2	12	396170	396181	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427447
136	NC_022120	AGGGAA	2	12	397496	397507	50 %	0 %	50 %	0 %	532427448
137	NC_022120	CTGAAG	2	12	398331	398342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427449
138	NC_022120	TAATCT	2	12	403748	403759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532427452
139	NC_022120	GAACAA	2	12	404250	404261	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532427453
140	NC_022120	CTAAAG	2	12	404633	404644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427454
141	NC_022120	CCTTTC	2	12	405797	405808	0 %	50 %	0 %	50 %	532427455
142	NC_022120	TTTTAA	2	12	409661	409672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427457
143	NC_022120	ACATGC	2	12	415339	415350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427463
144	NC_022120	GGCTCT	2	12	416074	416085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427464
145	NC_022120	ATCTTG	2	12	417668	417679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427465
146	NC_022120	CCCCCA	2	12	419002	419013	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	532427466
147	NC_022120	TTCCTC	2	12	423067	423078	0 %	50 %	0 %	50 %	532427469
148	NC_022120	CTCTAC	2	12	426316	426327	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427471
149	NC_022120	ACATCA	2	12	426961	426972	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532427472
150	NC_022120	CGGAAT	2	12	427223	427234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427473
151	NC_022120	TGATAA	2	12	429128	429139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532427474
152	NC_022120	AGCTAA	2	12	431502	431513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427476
153	NC_022120	TTCTCC	2	12	443538	443549	0 %	50 %	0 %	50 %	532427485
154	NC_022120	ATGAAG	2	12	452589	452600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532427493
155	NC_022120	TAACTC	2	12	453106	453117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427493
156	NC_022120	ATCCGC	2	12	454031	454042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532427493
157	NC_022120	CTAAAG	2	12	456449	456460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427494
158	NC_022120	CCAATA	2	12	461434	461445	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532427498
159	NC_022120	ATCGGC	2	12	467281	467292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532427506
160	NC_022120	TATTGG	2	12	467874	467885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427506
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162	NC_022120	TCTTCA	2	12	480652	480663	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532427511
163	NC_022120	CTACAA	2	12	484415	484426	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532427511
164	NC_022120	CCAATC	2	12	488883	488894	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532428001
165	NC_022120	TTCTTT	2	12	492705	492716	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427521
166	NC_022120	CTGAAG	2	12	495763	495774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427523
167	NC_022120	TGAGTA	2	12	496217	496228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427523
168	NC_022120	AAACTG	2	12	499664	499675	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427526
169	NC_022120	TAACTA	2	12	503184	503195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_022120	AAGAAA	2	12	503197	503208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022120	GGTAAT	2	12	507999	508010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427534
172	NC_022120	AGTTTT	2	12	509007	509018	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532427536
173	NC_022120	AGAATA	2	12	509172	509183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022120	GGTTGT	2	12	511135	511146	0 %	50 %	50 %	0 %	532427538
175	NC_022120	GCTGTT	2	12	513494	513505	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532427540
176	NC_022120	AACTAA	2	12	514905	514916	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
177	NC_022120	CTCTAT	2	12	516988	516999	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_022120	TGAACT	2	12	517495	517506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427544
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184	NC_022120	CAGGAA	2	12	526947	526958	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532427549
185	NC_022120	ACTGTA	2	12	531732	531743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532428006
186	NC_022120	AGCCAC	2	12	531767	531778	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532428006
187	NC_022120	AATGTC	2	12	533097	533108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532428006
188	NC_022120	CAAATC	2	12	535566	535577	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532427555
189	NC_022120	AGGGAA	2	12	540006	540017	50 %	0 %	50 %	0 %	532427560
190	NC_022120	AAAGAA	2	12	541863	541874	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532427562
191	NC_022120	CTTCCT	2	12	542512	542523	0 %	50 %	0 %	50 %	532427563
192	NC_022120	ACAAGA	2	12	544015	544026	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532427564
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199	NC_022120	TTTCAA	2	12	561268	561279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532427578
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201	NC_022120	AGATCC	2	12	564478	564489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427581
202	NC_022120	AAAAAT	2	12	566898	566909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_022120	TTTTGC	2	12	573764	573775	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532427589
204	NC_022120	TCATAT	2	12	577860	577871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532427593
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206	NC_022120	CTCCAT	2	12	579651	579662	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427594
207	NC_022120	TTCAAA	2	12	585998	586009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532427602
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209	NC_022120	TCTCCG	2	12	595506	595517	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532427619
210	NC_022120	CTGATA	2	12	601136	601147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427626
211	NC_022120	CTGCTC	2	12	601184	601195	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532427626
212	NC_022120	AGTCCA	2	12	603096	603107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427627
213	NC_022120	TAGGGG	2	12	606064	606075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
214	NC_022120	CAAAGA	2	12	606878	606889	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532427632
215	NC_022120	CCAAAA	2	12	610396	610407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427636
216	NC_022120	GGATGG	2	12	612168	612179	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532427637
217	NC_022120	CGATAT	3	18	614496	614513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427638
218	NC_022120	TCTTTT	2	12	618058	618069	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
219	NC_022120	ACTGTA	2	12	619750	619761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427642
220	NC_022120	CACTCT	2	12	620066	620077	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427642
221	NC_022120	CCTTAG	2	12	623851	623862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427646
222	NC_022120	AACCTC	2	12	631914	631925	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532427650
223	NC_022120	CTCTTT	2	12	638924	638935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427659
224	NC_022120	ATATCC	2	12	638941	638952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427659
225	NC_022120	TAAACA	2	12	639052	639063	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532427659
226	NC_022120	ATAAAC	2	12	642763	642774	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532427664
227	NC_022120	ATCTTG	2	12	643456	643467	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427664
228	NC_022120	TTAAAT	2	12	646227	646238	50 %	50 %	0 %	0 %	532427666
229	NC_022120	TTATTT	2	12	649266	649277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_022120	GCTTCT	2	12	650616	650627	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427670
231	NC_022120	TAGGAG	2	12	651583	651594	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532427670
232	NC_022120	CACAGG	2	12	653576	653587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427672
233	NC_022120	TTCTAT	2	12	667405	667416	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532427681
234	NC_022120	AGAAAG	2	12	669726	669737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427682
235	NC_022120	CATATT	2	12	681597	681608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532427691
236	NC_022120	AGCTGG	2	12	687771	687782	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532427699
237	NC_022120	GCATCA	2	12	689613	689624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427699
238	NC_022120	ATCAAT	2	12	693938	693949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532427704
239	NC_022120	CCGCAA	2	12	698816	698827	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532427709
240	NC_022120	AAATGC	2	12	704778	704789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427711
241	NC_022120	GAAAGA	2	12	706896	706907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427712
242	NC_022120	TCTTGA	2	12	712002	712013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427715
243	NC_022120	TATCCA	2	12	722183	722194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427725
244	NC_022120	TATTGA	2	12	738070	738081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532427734
245	NC_022120	TCTGCA	2	12	745723	745734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427740
246	NC_022120	TGTGAT	2	12	746365	746376	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427741
247	NC_022120	CAGGAA	2	12	749591	749602	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532427743
248	NC_022120	TATTTT	2	12	755200	755211	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532427750
249	NC_022120	GGGAAG	2	12	759322	759333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427754
250	NC_022120	GGAAGA	2	12	762986	762997	50 %	0 %	50 %	0 %	532427756
251	NC_022120	ATGCAA	2	12	765298	765309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427760
252	NC_022120	GAGAAA	2	12	765527	765538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427760
253	NC_022120	TATATT	2	12	770966	770977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427765
254	NC_022120	TTTCCA	2	12	777788	777799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532427771
255	NC_022120	ATGAAG	2	12	784397	784408	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532427774
256	NC_022120	ATTAGG	2	12	790182	790193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427779
257	NC_022120	CCCTGA	2	12	793178	793189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532427782
258	NC_022120	AGAATT	2	12	796100	796111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532427785
259	NC_022120	AAGCTC	2	12	796339	796350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427785
260	NC_022120	TTTCTT	2	12	799204	799215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427787
261	NC_022120	AGAAAT	2	12	802394	802405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532427790
262	NC_022120	GAGAAA	2	12	802664	802675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_022120	GAAATT	2	12	804007	804018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532427792
264	NC_022120	GCTGAG	2	12	804689	804700	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532427792
265	NC_022120	TTTTCT	2	12	805122	805133	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
266	NC_022120	TAGCCT	2	12	807636	807647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427793
267	NC_022120	ATTTTT	2	12	808901	808912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_022120	CACCTA	2	12	822197	822208	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532427803
269	NC_022120	AGCTAC	2	12	826165	826176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427805
270	NC_022120	AAGAGG	2	12	828036	828047	50 %	0 %	50 %	0 %	532427807
271	NC_022120	GAAAGG	2	12	832912	832923	50 %	0 %	50 %	0 %	532427812
272	NC_022120	AGCTTC	2	12	834366	834377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427813
273	NC_022120	TTTTTA	2	12	835339	835350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_022120	ATCACA	2	12	838471	838482	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532427817
275	NC_022120	GATCCG	2	12	843080	843091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532427821
276	NC_022120	TTATGC	2	12	850017	850028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427827
277	NC_022120	ATGGGG	2	12	853051	853062	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532427830
278	NC_022120	AAAGAA	2	12	853530	853541	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532427830
279	NC_022120	GGCTAG	2	12	853913	853924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532427830
280	NC_022120	GAGAAA	2	12	853960	853971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427830
281	NC_022120	TAAGGA	2	12	856301	856312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_022120	CCGGAG	2	12	857219	857230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_022120	CTTCTA	2	12	861144	861155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532427831
284	NC_022120	CTTTTT	2	12	861828	861839	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427832
285	NC_022120	GACCTG	2	12	866790	866801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532427835
286	NC_022120	CCTCTA	2	12	870365	870376	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427838
287	NC_022120	TAAGGA	2	12	878347	878358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022120	CCGGAG	2	12	879265	879276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_022120	TTTTCT	2	12	889647	889658	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427847
290	NC_022120	CTGTTC	2	12	889960	889971	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427847
291	NC_022120	GTTTTT	2	12	890614	890625	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532427848
292	NC_022120	GTGTAT	2	12	891526	891537	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427849
293	NC_022120	TATTGG	2	12	895604	895615	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532428031
294	NC_022120	CCAACG	2	12	897932	897943	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532427852
295	NC_022120	TCCAGA	2	12	900570	900581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532427856
296	NC_022120	TTTTGG	2	12	905772	905783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427860
297	NC_022120	CAATTT	2	12	906439	906450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532427862
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299	NC_022120	GATAGT	2	12	915388	915399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532428034
300	NC_022120	GACGGC	2	12	921684	921695	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532427872
301	NC_022120	CTTCTC	2	12	922593	922604	0 %	50 %	0 %	50 %	532427874
302	NC_022120	AAACAA	2	12	923372	923383	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532428037
303	NC_022120	GAGCAA	2	12	925195	925206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532427878
304	NC_022120	ATAGGG	2	12	945947	945958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532427893
305	NC_022120	CGGAGG	2	12	946268	946279	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	532427894
306	NC_022120	GGATTA	2	12	956184	956195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427899
307	NC_022120	GAAAAA	2	12	956730	956741	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532427899
308	NC_022120	TTAAAA	2	12	960618	960629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427903
309	NC_022120	GCTATT	2	12	968238	968249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532427910
310	NC_022120	CAAATG	2	12	970771	970782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427911
311	NC_022120	GGCTGG	2	12	981880	981891	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532428044
312	NC_022120	ACAGGA	2	12	981992	982003	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532427918
313	NC_022120	TTAAGC	2	12	983040	983051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427919
314	NC_022120	CAGGGA	2	12	992007	992018	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532427927
315	NC_022120	CTCCAT	2	12	994531	994542	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532427928
316	NC_022120	TCAGTA	2	12	995719	995730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
317	NC_022120	CAGAAT	2	12	996992	997003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427932
318	NC_022120	TACTAG	2	12	997505	997516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532427932
319	NC_022120	AGAATA	2	12	1004488	1004499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532427941
320	NC_022120	AATTAA	2	12	1007232	1007243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427942
321	NC_022120	GCAATA	2	12	1008178	1008189	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532427942
322	NC_022120	CTTTAT	2	12	1011572	1011583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532427944
323	NC_022120	AGCTGG	2	12	1012000	1012011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532427944
324	NC_022120	TTGTAA	2	12	1014868	1014879	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532427946
325	NC_022120	GAAAAA	2	12	1029117	1029128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532427954
326	NC_022120	TTTCTT	2	12	1029781	1029792	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532427955
327	NC_022120	GTTTCC	2	12	1031068	1031079	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532427955
328	NC_022120	CAGCAC	2	12	1035962	1035973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532427957
329	NC_022120	GTAATA	2	12	1036127	1036138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532427957
330	NC_022120	ACCATC	2	12	1036869	1036880	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532427957
331	NC_022120	ATTTTT	2	12	1038851	1038862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_022120	TAAAAT	2	12	1042476	1042487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.