MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain Ia20-97 genome

Total Repeats: 23002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_022120	TCG	2	6	91384	91389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427195
2003	NC_022120	GAA	2	6	91411	91416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427195
2004	NC_022120	TGA	2	6	91430	91435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427195
2005	NC_022120	TCC	2	6	91487	91492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532427195
2006	NC_022120	GTA	2	6	91502	91507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427195
2007	NC_022120	GTTT	2	8	91827	91834	0 %	75 %	25 %	0 %	532427195
2008	NC_022120	ATT	2	6	91877	91882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427195
2009	NC_022120	TTG	2	6	91931	91936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427195
2010	NC_022120	AGT	2	6	92006	92011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427195
2011	NC_022120	GGA	2	6	92035	92040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427195
2012	NC_022120	AGG	2	6	92058	92063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427195
2013	NC_022120	A	6	6	92072	92077	100 %	0 %	0 %	0 %	532427195
2014	NC_022120	CCA	2	6	92126	92131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532427196
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2016	NC_022120	T	6	6	92253	92258	0 %	100 %	0 %	0 %	532427196
2017	NC_022120	ATC	2	6	92264	92269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427196
2018	NC_022120	TTTA	2	8	92272	92279	25 %	75 %	0 %	0 %	532427196
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2042	NC_022120	TGA	2	6	93222	93227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427197
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2245	NC_022120	GGT	2	6	101136	101141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532427204
2246	NC_022120	AG	3	6	101192	101197	50 %	0 %	50 %	0 %	532427204
2247	NC_022120	GAT	2	6	101249	101254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427204
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2249	NC_022120	AC	3	6	101274	101279	50 %	0 %	0 %	50 %	532427204
2250	NC_022120	GTA	2	6	101283	101288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427204
2251	NC_022120	A	7	7	101295	101301	100 %	0 %	0 %	0 %	532427204
2252	NC_022120	TC	3	6	101302	101307	0 %	50 %	0 %	50 %	532427204
2253	NC_022120	GA	3	6	101348	101353	50 %	0 %	50 %	0 %	532427204
2254	NC_022120	TGC	2	6	101356	101361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427204
2255	NC_022120	CTT	3	9	101393	101401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427204
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2257	NC_022120	GAA	2	6	101498	101503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427204
2258	NC_022120	GA	3	6	101595	101600	50 %	0 %	50 %	0 %	532427204
2259	NC_022120	TATC	2	8	101636	101643	25 %	50 %	0 %	25 %	532427204
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2263	NC_022120	TGC	2	6	101788	101793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427205
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2270	NC_022120	TTA	2	6	102171	102176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2271	NC_022120	GTG	2	6	102195	102200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532427206
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2290	NC_022120	TCT	2	6	103124	103129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427206
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2354	NC_022120	ATA	2	6	106457	106462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427208
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2358	NC_022120	TA	3	6	106730	106735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_022120	AAGA	2	8	106748	106755	75 %	0 %	25 %	0 %	532427967
2360	NC_022120	T	8	8	106818	106825	0 %	100 %	0 %	0 %	532427967
2361	NC_022120	TAA	3	9	106883	106891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2362	NC_022120	CTT	2	6	106927	106932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2363	NC_022120	TAG	2	6	106966	106971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427209
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2366	NC_022120	TCAG	2	8	107116	107123	25 %	25 %	25 %	25 %	532427209
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2374	NC_022120	GA	3	6	107377	107382	50 %	0 %	50 %	0 %	532427209
2375	NC_022120	A	6	6	107406	107411	100 %	0 %	0 %	0 %	532427209
2376	NC_022120	CTTT	2	8	107490	107497	0 %	75 %	0 %	25 %	532427209
2377	NC_022120	TGA	2	6	107567	107572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427209
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