MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 2870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022119	AATG	2	8	465	472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022119	CTAT	2	8	799	806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022119	AAGG	2	8	1308	1315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022119	AGTA	2	8	1488	1495	50 %	25 %	25 %	0 %	532423943
5	NC_022119	ATGA	2	8	1892	1899	50 %	25 %	25 %	0 %	532423944
6	NC_022119	GATA	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	532423944
7	NC_022119	TTTC	2	8	2227	2234	0 %	75 %	0 %	25 %	532423945
8	NC_022119	CATG	2	8	3108	3115	25 %	25 %	25 %	25 %	532423945
9	NC_022119	TTCC	2	8	3413	3420	0 %	50 %	0 %	50 %	532423945
10	NC_022119	TTTA	2	8	3811	3818	25 %	75 %	0 %	0 %	532423946
11	NC_022119	ATCC	2	8	4111	4118	25 %	25 %	0 %	50 %	532423946
12	NC_022119	GACG	2	8	4858	4865	25 %	0 %	50 %	25 %	532423946
13	NC_022119	TTGG	2	8	4961	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	532423946
14	NC_022119	TGGA	2	8	5320	5327	25 %	25 %	50 %	0 %	532423947
15	NC_022119	CTTT	2	8	5697	5704	0 %	75 %	0 %	25 %	532423947
16	NC_022119	GGGA	2	8	6212	6219	25 %	0 %	75 %	0 %	532423947
17	NC_022119	GGAG	2	8	6303	6310	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022119	GGTG	2	8	6515	6522	0 %	25 %	75 %	0 %	532423948
19	NC_022119	AAAT	2	8	6581	6588	75 %	25 %	0 %	0 %	532423948
20	NC_022119	TATG	2	8	6952	6959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022119	ATTT	2	8	7093	7100	25 %	75 %	0 %	0 %	532424783
22	NC_022119	ATTT	2	8	7184	7191	25 %	75 %	0 %	0 %	532424783
23	NC_022119	AAGC	2	8	7819	7826	50 %	0 %	25 %	25 %	532423949
24	NC_022119	ATTG	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	532423950
25	NC_022119	AGCG	2	8	8684	8691	25 %	0 %	50 %	25 %	532423950
26	NC_022119	AAAG	2	8	8705	8712	75 %	0 %	25 %	0 %	532423950
27	NC_022119	CTTT	2	8	9045	9052	0 %	75 %	0 %	25 %	532423950
28	NC_022119	TATT	2	8	9308	9315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022119	TTCG	2	8	9419	9426	0 %	50 %	25 %	25 %	532423951
30	NC_022119	AATT	2	8	9524	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	532423951
31	NC_022119	ATGG	2	8	9583	9590	25 %	25 %	50 %	0 %	532423951
32	NC_022119	CTTT	2	8	10208	10215	0 %	75 %	0 %	25 %	532423952
33	NC_022119	GCAA	2	8	10425	10432	50 %	0 %	25 %	25 %	532423952
34	NC_022119	AGCC	2	8	10655	10662	25 %	0 %	25 %	50 %	532423952
35	NC_022119	GAAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	532423952
36	NC_022119	AGAA	2	8	11202	11209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022119	AATG	2	8	11541	11548	50 %	25 %	25 %	0 %	532423953
38	NC_022119	GTTT	2	8	12573	12580	0 %	75 %	25 %	0 %	532423954
39	NC_022119	ATGC	2	8	13003	13010	25 %	25 %	25 %	25 %	532423954
40	NC_022119	AAGG	2	8	13438	13445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022119	TTGT	2	8	14039	14046	0 %	75 %	25 %	0 %	532423955
42	NC_022119	TTCT	2	8	14210	14217	0 %	75 %	0 %	25 %	532423955
43	NC_022119	ATTT	2	8	14416	14423	25 %	75 %	0 %	0 %	532423955
44	NC_022119	TTTC	2	8	15078	15085	0 %	75 %	0 %	25 %	532423956
45	NC_022119	AAAT	2	8	15560	15567	75 %	25 %	0 %	0 %	532423956
46	NC_022119	CAAA	2	8	16072	16079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022119	GTAA	2	8	16402	16409	50 %	25 %	25 %	0 %	532423957
48	NC_022119	CTAA	2	8	16595	16602	50 %	25 %	0 %	25 %	532423957
49	NC_022119	AGAA	2	8	16858	16865	75 %	0 %	25 %	0 %	532423957
50	NC_022119	ATTT	2	8	17004	17011	25 %	75 %	0 %	0 %	532423957
51	NC_022119	TGCG	2	8	18511	18518	0 %	25 %	50 %	25 %	532423959
52	NC_022119	GAAG	2	8	19495	19502	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
53	NC_022119	TTTG	2	8	19521	19528	0 %	75 %	25 %	0 %	532423959
54	NC_022119	TGTA	2	8	20213	20220	25 %	50 %	25 %	0 %	532423960
55	NC_022119	GCCA	2	8	21005	21012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022119	CGCT	2	8	21253	21260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022119	TTAA	2	8	21274	21281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022119	GTTA	2	8	21311	21318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022119	GATC	2	8	21366	21373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022119	TGGG	2	8	21631	21638	0 %	25 %	75 %	0 %	532423961
61	NC_022119	CATT	2	8	22688	22695	25 %	50 %	0 %	25 %	532423961
62	NC_022119	GCTT	2	8	23031	23038	0 %	50 %	25 %	25 %	532423961
63	NC_022119	GGTT	2	8	23079	23086	0 %	50 %	50 %	0 %	532423961
64	NC_022119	TTCT	2	8	23449	23456	0 %	75 %	0 %	25 %	532423961
65	NC_022119	TAAC	2	8	23551	23558	50 %	25 %	0 %	25 %	532423961
66	NC_022119	CATT	2	8	23674	23681	25 %	50 %	0 %	25 %	532423961
67	NC_022119	GGTA	2	8	24044	24051	25 %	25 %	50 %	0 %	532423961
68	NC_022119	TTGA	2	8	25039	25046	25 %	50 %	25 %	0 %	532423962
69	NC_022119	TTCG	2	8	25184	25191	0 %	50 %	25 %	25 %	532423962
70	NC_022119	TAGG	2	8	25263	25270	25 %	25 %	50 %	0 %	532423962
71	NC_022119	TTCC	2	8	25387	25394	0 %	50 %	0 %	50 %	532423962
72	NC_022119	TAGG	2	8	25501	25508	25 %	25 %	50 %	0 %	532423962
73	NC_022119	TTTC	2	8	25936	25943	0 %	75 %	0 %	25 %	532423962
74	NC_022119	GCTT	2	8	26273	26280	0 %	50 %	25 %	25 %	532423962
75	NC_022119	GGAA	2	8	26856	26863	50 %	0 %	50 %	0 %	532423963
76	NC_022119	TTAA	2	8	26929	26936	50 %	50 %	0 %	0 %	532423963
77	NC_022119	AAAG	2	8	26979	26986	75 %	0 %	25 %	0 %	532423963
78	NC_022119	GGGC	2	8	27259	27266	0 %	0 %	75 %	25 %	532423963
79	NC_022119	GTTT	2	8	27542	27549	0 %	75 %	25 %	0 %	532423964
80	NC_022119	CAGA	2	8	27564	27571	50 %	0 %	25 %	25 %	532423964
81	NC_022119	ATTG	2	8	27923	27930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022119	CTTT	2	8	29536	29543	0 %	75 %	0 %	25 %	532423966
83	NC_022119	TTTG	2	8	29551	29558	0 %	75 %	25 %	0 %	532423966
84	NC_022119	TTGT	2	8	29586	29593	0 %	75 %	25 %	0 %	532423966
85	NC_022119	TGGC	2	8	29749	29756	0 %	25 %	50 %	25 %	532423966
86	NC_022119	AAAG	2	8	30309	30316	75 %	0 %	25 %	0 %	532423967
87	NC_022119	AAAC	2	8	30379	30386	75 %	0 %	0 %	25 %	532423967
88	NC_022119	GATG	2	8	30522	30529	25 %	25 %	50 %	0 %	532423967
89	NC_022119	GATA	2	8	31631	31638	50 %	25 %	25 %	0 %	532423969
90	NC_022119	TGAT	2	8	34126	34133	25 %	50 %	25 %	0 %	532423972
91	NC_022119	AAGA	3	12	34254	34265	75 %	0 %	25 %	0 %	532423972
92	NC_022119	AAGC	2	8	34474	34481	50 %	0 %	25 %	25 %	532423973
93	NC_022119	GTTC	2	8	34507	34514	0 %	50 %	25 %	25 %	532423973
94	NC_022119	GGCA	2	8	34886	34893	25 %	0 %	50 %	25 %	532423974
95	NC_022119	TCGA	2	8	35143	35150	25 %	25 %	25 %	25 %	532423974
96	NC_022119	TGCT	2	8	35296	35303	0 %	50 %	25 %	25 %	532423974
97	NC_022119	TTGG	2	8	35528	35535	0 %	50 %	50 %	0 %	532423974
98	NC_022119	AGAT	2	8	36248	36255	50 %	25 %	25 %	0 %	532423974
99	NC_022119	CTTT	2	8	36621	36628	0 %	75 %	0 %	25 %	532423975
100	NC_022119	ATGA	2	8	37111	37118	50 %	25 %	25 %	0 %	532423975
101	NC_022119	TAGG	2	8	37270	37277	25 %	25 %	50 %	0 %	532423975
102	NC_022119	CAAT	2	8	37454	37461	50 %	25 %	0 %	25 %	532423975
103	NC_022119	AATG	2	8	38241	38248	50 %	25 %	25 %	0 %	532423975
104	NC_022119	AGAA	2	8	39078	39085	75 %	0 %	25 %	0 %	532423976
105	NC_022119	AAGA	2	8	39130	39137	75 %	0 %	25 %	0 %	532423976
106	NC_022119	ATCC	2	8	39138	39145	25 %	25 %	0 %	50 %	532423976
107	NC_022119	TAAT	2	8	39349	39356	50 %	50 %	0 %	0 %	532423976
108	NC_022119	GTGC	2	8	41438	41445	0 %	25 %	50 %	25 %	532423978
109	NC_022119	AGAA	2	8	41857	41864	75 %	0 %	25 %	0 %	532423978
110	NC_022119	GGAT	2	8	42009	42016	25 %	25 %	50 %	0 %	532423978
111	NC_022119	AAAC	2	8	43217	43224	75 %	0 %	0 %	25 %	532423980
112	NC_022119	CAAT	2	8	43421	43428	50 %	25 %	0 %	25 %	532423980
113	NC_022119	TGTT	2	8	43801	43808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022119	AATA	2	8	44040	44047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022119	ATTT	2	8	44178	44185	25 %	75 %	0 %	0 %	532423982
116	NC_022119	GCTC	2	8	44486	44493	0 %	25 %	25 %	50 %	532423982
117	NC_022119	TTCT	2	8	44628	44635	0 %	75 %	0 %	25 %	532423982
118	NC_022119	TTGA	2	8	45228	45235	25 %	50 %	25 %	0 %	532423983
119	NC_022119	TGTT	2	8	45400	45407	0 %	75 %	25 %	0 %	532423983
120	NC_022119	CTAT	2	8	45430	45437	25 %	50 %	0 %	25 %	532423983
121	NC_022119	TGTT	2	8	45459	45466	0 %	75 %	25 %	0 %	532423983
122	NC_022119	CTAT	2	8	45755	45762	25 %	50 %	0 %	25 %	532423983
123	NC_022119	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	532423984
124	NC_022119	AAGA	2	8	46308	46315	75 %	0 %	25 %	0 %	532423984
125	NC_022119	AAAG	2	8	46348	46355	75 %	0 %	25 %	0 %	532423984
126	NC_022119	AAGA	2	8	46463	46470	75 %	0 %	25 %	0 %	532423984
127	NC_022119	ACTT	2	8	46724	46731	25 %	50 %	0 %	25 %	532423984
128	NC_022119	ATGG	2	8	47350	47357	25 %	25 %	50 %	0 %	532423984
129	NC_022119	AGGA	2	8	47381	47388	50 %	0 %	50 %	0 %	532423984
130	NC_022119	GAAC	2	8	47928	47935	50 %	0 %	25 %	25 %	532423984
131	NC_022119	AAGT	2	8	47963	47970	50 %	25 %	25 %	0 %	532423984
132	NC_022119	AACA	2	8	48172	48179	75 %	0 %	0 %	25 %	532423985
133	NC_022119	CTTT	2	8	48368	48375	0 %	75 %	0 %	25 %	532423985
134	NC_022119	CTTT	2	8	49252	49259	0 %	75 %	0 %	25 %	532423986
135	NC_022119	GTAG	2	8	49270	49277	25 %	25 %	50 %	0 %	532423986
136	NC_022119	GAAG	2	8	50698	50705	50 %	0 %	50 %	0 %	532423987
137	NC_022119	TTCA	2	8	51120	51127	25 %	50 %	0 %	25 %	532423987
138	NC_022119	TCTA	2	8	51337	51344	25 %	50 %	0 %	25 %	532423987
139	NC_022119	TATT	2	8	52164	52171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022119	GGAA	2	8	52395	52402	50 %	0 %	50 %	0 %	532423989
141	NC_022119	TTAA	2	8	53136	53143	50 %	50 %	0 %	0 %	532423989
142	NC_022119	CCTT	2	8	53343	53350	0 %	50 %	0 %	50 %	532423990
143	NC_022119	TTTA	2	8	53510	53517	25 %	75 %	0 %	0 %	532423990
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