MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022119	TGA	2	6	159479	159484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424076
3502	NC_022119	GAA	2	6	159507	159512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424076
3503	NC_022119	TC	3	6	159542	159547	0 %	50 %	0 %	50 %	532424076
3504	NC_022119	GT	3	6	159580	159585	0 %	50 %	50 %	0 %	532424076
3505	NC_022119	AAT	2	6	159624	159629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424076
3506	NC_022119	GGA	2	6	159636	159641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424076
3507	NC_022119	AGGAA	2	10	159665	159674	60 %	0 %	40 %	0 %	532424076
3508	NC_022119	TAG	2	6	159695	159700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424076
3509	NC_022119	AGG	2	6	159701	159706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424076
3510	NC_022119	CTG	2	6	159721	159726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424076
3511	NC_022119	AG	3	6	159752	159757	50 %	0 %	50 %	0 %	532424076
3512	NC_022119	TCT	2	6	159780	159785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424076
3513	NC_022119	AGG	2	6	159899	159904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424076
3514	NC_022119	GAA	2	6	159912	159917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424076
3515	NC_022119	AGA	2	6	159960	159965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424077
3516	NC_022119	ATAC	2	8	160084	160091	50 %	25 %	0 %	25 %	532424077
3517	NC_022119	AGG	2	6	160110	160115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424077
3518	NC_022119	AGG	2	6	160125	160130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424077
3519	NC_022119	CT	3	6	160223	160228	0 %	50 %	0 %	50 %	532424077
3520	NC_022119	GA	3	6	160233	160238	50 %	0 %	50 %	0 %	532424077
3521	NC_022119	ATT	2	6	160253	160258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424077
3522	NC_022119	ATA	2	6	160349	160354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424077
3523	NC_022119	AC	3	6	160373	160378	50 %	0 %	0 %	50 %	532424077
3524	NC_022119	A	8	8	160418	160425	100 %	0 %	0 %	0 %	532424077
3525	NC_022119	ATG	2	6	160499	160504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424077
3526	NC_022119	TCT	2	6	160514	160519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424077
3527	NC_022119	TTC	2	6	160728	160733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424077
3528	NC_022119	AGG	2	6	160739	160744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424077
3529	NC_022119	ACA	2	6	160755	160760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424077
3530	NC_022119	ATA	3	9	160765	160773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424078
3531	NC_022119	TTTC	2	8	160783	160790	0 %	75 %	0 %	25 %	532424078
3532	NC_022119	AACAGC	2	12	160868	160879	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532424078
3533	NC_022119	AGT	2	6	160911	160916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424078
3534	NC_022119	TGG	2	6	160997	161002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424078
3535	NC_022119	TC	3	6	161324	161329	0 %	50 %	0 %	50 %	532424078
3536	NC_022119	A	6	6	161342	161347	100 %	0 %	0 %	0 %	532424078
3537	NC_022119	CTG	2	6	161410	161415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424078
3538	NC_022119	TTA	2	6	161433	161438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424078
3539	NC_022119	ACA	2	6	161472	161477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424078
3540	NC_022119	GCA	2	6	161496	161501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424078
3541	NC_022119	CTT	2	6	161515	161520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424078
3542	NC_022119	ATTG	2	8	161534	161541	25 %	50 %	25 %	0 %	532424078
3543	NC_022119	TCT	2	6	161565	161570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424078
3544	NC_022119	CT	4	8	161569	161576	0 %	50 %	0 %	50 %	532424078
3545	NC_022119	TGT	2	6	161597	161602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424078
3546	NC_022119	GCTT	2	8	161638	161645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_022119	CAAAA	2	10	161668	161677	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3548	NC_022119	TGT	2	6	161690	161695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_022119	CAA	2	6	161770	161775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_022119	GAG	2	6	161789	161794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_022119	TGG	2	6	162012	162017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424079
3552	NC_022119	TGT	2	6	162055	162060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424079
3553	NC_022119	GAA	2	6	162065	162070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424079
3554	NC_022119	GGAA	2	8	162107	162114	50 %	0 %	50 %	0 %	532424079
3555	NC_022119	GAA	3	9	162122	162130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424079
3556	NC_022119	TTTC	2	8	162225	162232	0 %	75 %	0 %	25 %	532424079
3557	NC_022119	ATCT	2	8	162251	162258	25 %	50 %	0 %	25 %	532424079
3558	NC_022119	CTT	2	6	162276	162281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424079
3559	NC_022119	GA	3	6	162330	162335	50 %	0 %	50 %	0 %	532424079
3560	NC_022119	TTG	2	6	162356	162361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424079
3561	NC_022119	GAA	2	6	162377	162382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424079
3562	NC_022119	TTA	2	6	162433	162438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424079
3563	NC_022119	TAG	2	6	162444	162449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424079
3564	NC_022119	GTT	2	6	162531	162536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424079
3565	NC_022119	ACA	3	9	162538	162546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424079
3566	NC_022119	AGA	2	6	162658	162663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424079
3567	NC_022119	TG	3	6	162717	162722	0 %	50 %	50 %	0 %	532424079
3568	NC_022119	AGC	2	6	162735	162740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424079
3569	NC_022119	TAG	2	6	162753	162758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424079
3570	NC_022119	TCGA	2	8	162767	162774	25 %	25 %	25 %	25 %	532424079
3571	NC_022119	AGAGA	2	10	162896	162905	60 %	0 %	40 %	0 %	532424079
3572	NC_022119	ATT	2	6	162919	162924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424079
3573	NC_022119	GAGG	2	8	162944	162951	25 %	0 %	75 %	0 %	532424079
3574	NC_022119	TC	3	6	162957	162962	0 %	50 %	0 %	50 %	532424079
3575	NC_022119	TGT	2	6	163189	163194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424079
3576	NC_022119	CTT	3	9	163215	163223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424079
3577	NC_022119	TTG	2	6	163228	163233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424079
3578	NC_022119	AGC	2	6	163273	163278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424079
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3580	NC_022119	GAA	2	6	163316	163321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424079
3581	NC_022119	AGCAA	2	10	163331	163340	60 %	0 %	20 %	20 %	532424079
3582	NC_022119	TAC	2	6	163357	163362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424079
3583	NC_022119	TGGC	2	8	163407	163414	0 %	25 %	50 %	25 %	532424079
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3585	NC_022119	GT	3	6	163515	163520	0 %	50 %	50 %	0 %	532424079
3586	NC_022119	GAG	2	6	163524	163529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424079
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3589	NC_022119	GAT	2	6	163668	163673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424080
3590	NC_022119	TAT	2	6	163716	163721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424080
3591	NC_022119	TCAA	2	8	163726	163733	50 %	25 %	0 %	25 %	532424080
3592	NC_022119	CGA	2	6	163735	163740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424080
3593	NC_022119	ATG	2	6	163756	163761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424080
3594	NC_022119	TGT	2	6	163888	163893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424080
3595	NC_022119	T	7	7	163932	163938	0 %	100 %	0 %	0 %	532424080
3596	NC_022119	ATT	2	6	163952	163957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424080
3597	NC_022119	GAG	2	6	164155	164160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424080
3598	NC_022119	TTTC	2	8	164166	164173	0 %	75 %	0 %	25 %	532424080
3599	NC_022119	GGA	2	6	164253	164258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424080
3600	NC_022119	TCT	2	6	164274	164279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424080
3601	NC_022119	GCT	2	6	164286	164291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424080
3602	NC_022119	A	8	8	164335	164342	100 %	0 %	0 %	0 %	532424080
3603	NC_022119	GGT	2	6	164429	164434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424080
3604	NC_022119	GA	3	6	164446	164451	50 %	0 %	50 %	0 %	532424080
3605	NC_022119	GC	3	6	164462	164467	0 %	0 %	50 %	50 %	532424080
3606	NC_022119	GTC	2	6	164493	164498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424080
3607	NC_022119	GGA	2	6	164606	164611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424080
3608	NC_022119	T	7	7	164671	164677	0 %	100 %	0 %	0 %	532424080
3609	NC_022119	A	8	8	164728	164735	100 %	0 %	0 %	0 %	532424080
3610	NC_022119	AGG	2	6	164771	164776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424080
3611	NC_022119	TTG	2	6	164794	164799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424080
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3613	NC_022119	TGT	2	6	164876	164881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424080
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3615	NC_022119	GA	3	6	164989	164994	50 %	0 %	50 %	0 %	532424080
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3618	NC_022119	AGA	3	9	165059	165067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424080
3619	NC_022119	CTT	2	6	165247	165252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424080
3620	NC_022119	ATCG	2	8	165299	165306	25 %	25 %	25 %	25 %	532424080
3621	NC_022119	TTC	2	6	165312	165317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424080
3622	NC_022119	AG	3	6	165333	165338	50 %	0 %	50 %	0 %	532424080
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3999	NC_022119	TGA	2	6	182596	182601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424800
4000	NC_022119	TGC	2	6	182632	182637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424800

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