MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022119	TC	3	6	113860	113865	0 %	50 %	0 %	50 %	532424793
2502	NC_022119	CTC	2	6	113911	113916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_022119	A	7	7	113930	113936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_022119	A	8	8	113939	113946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_022119	GCTCT	2	10	113973	113982	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2506	NC_022119	ATT	2	6	114007	114012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_022119	AGA	2	6	114035	114040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424034
2508	NC_022119	TTC	3	9	114041	114049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2509	NC_022119	AG	3	6	114161	114166	50 %	0 %	50 %	0 %	532424034
2510	NC_022119	TAC	2	6	114275	114280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424034
2511	NC_022119	T	7	7	114364	114370	0 %	100 %	0 %	0 %	532424034
2512	NC_022119	CTTT	2	8	114372	114379	0 %	75 %	0 %	25 %	532424034
2513	NC_022119	ACAG	2	8	114384	114391	50 %	0 %	25 %	25 %	532424034
2514	NC_022119	T	6	6	114416	114421	0 %	100 %	0 %	0 %	532424034
2515	NC_022119	T	6	6	114446	114451	0 %	100 %	0 %	0 %	532424034
2516	NC_022119	CTG	2	6	114541	114546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424034
2517	NC_022119	TTC	2	6	114572	114577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2518	NC_022119	TGTTT	2	10	114597	114606	0 %	80 %	20 %	0 %	532424034
2519	NC_022119	GA	4	8	114617	114624	50 %	0 %	50 %	0 %	532424034
2520	NC_022119	AGAA	2	8	114647	114654	75 %	0 %	25 %	0 %	532424034
2521	NC_022119	ACT	2	6	114657	114662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424034
2522	NC_022119	TCA	2	6	114669	114674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424034
2523	NC_022119	TTG	2	6	114678	114683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424034
2524	NC_022119	CTT	2	6	114754	114759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2525	NC_022119	AAGG	2	8	114781	114788	50 %	0 %	50 %	0 %	532424034
2526	NC_022119	GGA	2	6	114822	114827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424034
2527	NC_022119	TCT	2	6	114832	114837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2528	NC_022119	TTTG	2	8	114865	114872	0 %	75 %	25 %	0 %	532424034
2529	NC_022119	GAT	2	6	114914	114919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424034
2530	NC_022119	CATGT	2	10	114975	114984	20 %	40 %	20 %	20 %	532424034
2531	NC_022119	TCT	2	6	115136	115141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2532	NC_022119	ACA	2	6	115146	115151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424034
2533	NC_022119	CGA	2	6	115158	115163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424034
2534	NC_022119	ATC	2	6	115211	115216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424034
2535	NC_022119	TCT	2	6	115228	115233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2536	NC_022119	GGAA	2	8	115254	115261	50 %	0 %	50 %	0 %	532424034
2537	NC_022119	ACC	2	6	115289	115294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424034
2538	NC_022119	TTG	2	6	115375	115380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424034
2539	NC_022119	AAC	2	6	115397	115402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424034
2540	NC_022119	ACTTCG	2	12	115437	115448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532424034
2541	NC_022119	ACA	3	9	115527	115535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424034
2542	NC_022119	CAA	2	6	115552	115557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424034
2543	NC_022119	TTC	3	9	115601	115609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2544	NC_022119	TCT	2	6	115662	115667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2545	NC_022119	AAGC	2	8	115671	115678	50 %	0 %	25 %	25 %	532424034
2546	NC_022119	TATCG	2	10	115679	115688	20 %	40 %	20 %	20 %	532424034
2547	NC_022119	T	6	6	115695	115700	0 %	100 %	0 %	0 %	532424034
2548	NC_022119	ATG	2	6	115736	115741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424034
2549	NC_022119	AGT	2	6	115770	115775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_022119	A	6	6	115791	115796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_022119	TAA	2	6	115822	115827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_022119	A	7	7	115844	115850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_022119	TTTTAG	2	12	115872	115883	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_022119	TG	3	6	115888	115893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_022119	GGTT	2	8	116003	116010	0 %	50 %	50 %	0 %	532424035
2556	NC_022119	T	7	7	116019	116025	0 %	100 %	0 %	0 %	532424035
2557	NC_022119	GCT	2	6	116145	116150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424035
2558	NC_022119	TTTCT	2	10	116195	116204	0 %	80 %	0 %	20 %	532424035
2559	NC_022119	ACA	2	6	116232	116237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424035
2560	NC_022119	TAT	2	6	116420	116425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424035
2561	NC_022119	TATC	2	8	116452	116459	25 %	50 %	0 %	25 %	532424035
2562	NC_022119	TTTG	2	8	116549	116556	0 %	75 %	25 %	0 %	532424035
2563	NC_022119	AGG	3	9	116561	116569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424035
2564	NC_022119	AGA	2	6	116582	116587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424035
2565	NC_022119	GA	3	6	116636	116641	50 %	0 %	50 %	0 %	532424035
2566	NC_022119	A	6	6	116689	116694	100 %	0 %	0 %	0 %	532424035
2567	NC_022119	GTTC	2	8	116745	116752	0 %	50 %	25 %	25 %	532424035
2568	NC_022119	TAA	2	6	116765	116770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424035
2569	NC_022119	ACC	2	6	116781	116786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424035
2570	NC_022119	GCT	2	6	116799	116804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424035
2571	NC_022119	AGG	2	6	116849	116854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424035
2572	NC_022119	ATT	2	6	116883	116888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424035
2573	NC_022119	TTC	2	6	116900	116905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424035
2574	NC_022119	TGC	2	6	116930	116935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424035
2575	NC_022119	CTG	2	6	116977	116982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424035
2576	NC_022119	GCA	2	6	117182	117187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424036
2577	NC_022119	TGC	2	6	117193	117198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424036
2578	NC_022119	AAG	2	6	117201	117206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424036
2579	NC_022119	GAAA	2	8	117253	117260	75 %	0 %	25 %	0 %	532424036
2580	NC_022119	GTT	2	6	117296	117301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424036
2581	NC_022119	TAT	2	6	117312	117317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424036
2582	NC_022119	TCC	2	6	117339	117344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424036
2583	NC_022119	TAA	3	9	117402	117410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424036
2584	NC_022119	AGA	2	6	117485	117490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424794
2585	NC_022119	AGC	2	6	117507	117512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424794
2586	NC_022119	TTG	2	6	117517	117522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424794
2587	NC_022119	CAA	2	6	117533	117538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424794
2588	NC_022119	AGA	2	6	117539	117544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424794
2589	NC_022119	AAG	2	6	117585	117590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424795
2590	NC_022119	TAA	2	6	117598	117603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424795
2591	NC_022119	T	6	6	117619	117624	0 %	100 %	0 %	0 %	532424795
2592	NC_022119	CA	3	6	117806	117811	50 %	0 %	0 %	50 %	532424795
2593	NC_022119	ATC	2	6	117854	117859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424795
2594	NC_022119	T	6	6	117868	117873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_022119	TAA	2	6	117925	117930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_022119	AT	3	6	118012	118017	50 %	50 %	0 %	0 %	532424037
2597	NC_022119	T	6	6	118022	118027	0 %	100 %	0 %	0 %	532424037
2598	NC_022119	AGA	3	9	118028	118036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424037
2599	NC_022119	CTTT	2	8	118065	118072	0 %	75 %	0 %	25 %	532424037
2600	NC_022119	GTAG	2	8	118110	118117	25 %	25 %	50 %	0 %	532424037
2601	NC_022119	G	6	6	118158	118163	0 %	0 %	100 %	0 %	532424037
2602	NC_022119	T	6	6	118181	118186	0 %	100 %	0 %	0 %	532424037
2603	NC_022119	GTT	2	6	118299	118304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424037
2604	NC_022119	GA	3	6	118308	118313	50 %	0 %	50 %	0 %	532424037
2605	NC_022119	TTA	2	6	118329	118334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424037
2606	NC_022119	TCC	2	6	118343	118348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424037
2607	NC_022119	A	8	8	118384	118391	100 %	0 %	0 %	0 %	532424037
2608	NC_022119	CTC	2	6	118399	118404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424037
2609	NC_022119	AAAGA	2	10	118440	118449	80 %	0 %	20 %	0 %	532424037
2610	NC_022119	AAT	2	6	118450	118455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424037
2611	NC_022119	AG	4	8	118474	118481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_022119	CTT	2	6	118482	118487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_022119	TTA	2	6	118504	118509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424038
2614	NC_022119	T	6	6	118609	118614	0 %	100 %	0 %	0 %	532424038
2615	NC_022119	TTC	2	6	118695	118700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424038
2616	NC_022119	TCC	2	6	118708	118713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424038
2617	NC_022119	TTTA	2	8	118726	118733	25 %	75 %	0 %	0 %	532424038
2618	NC_022119	CTG	2	6	118924	118929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424038
2619	NC_022119	AGA	2	6	118953	118958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424038
2620	NC_022119	TTGCCA	2	12	118976	118987	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532424038
2621	NC_022119	GA	4	8	118999	119006	50 %	0 %	50 %	0 %	532424038
2622	NC_022119	GAA	2	6	119013	119018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424038
2623	NC_022119	TTC	2	6	119052	119057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424038
2624	NC_022119	TACT	2	8	119114	119121	25 %	50 %	0 %	25 %	532424038
2625	NC_022119	GTT	2	6	119158	119163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424038
2626	NC_022119	TAT	2	6	119193	119198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424038
2627	NC_022119	GAT	2	6	119209	119214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424038
2628	NC_022119	GAG	2	6	119240	119245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424038
2629	NC_022119	TC	3	6	119331	119336	0 %	50 %	0 %	50 %	532424038
2630	NC_022119	AG	3	6	119434	119439	50 %	0 %	50 %	0 %	532424039
2631	NC_022119	GCTA	2	8	119456	119463	25 %	25 %	25 %	25 %	532424039
2632	NC_022119	GA	3	6	119467	119472	50 %	0 %	50 %	0 %	532424039
2633	NC_022119	AAG	2	6	119475	119480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424039
2634	NC_022119	GCT	3	9	119481	119489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424039
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2638	NC_022119	GCTA	2	8	119588	119595	25 %	25 %	25 %	25 %	532424039
2639	NC_022119	CGGC	2	8	119637	119644	0 %	0 %	50 %	50 %	532424039
2640	NC_022119	AGC	2	6	119678	119683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424039
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2642	NC_022119	TCC	2	6	119699	119704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424039
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2644	NC_022119	GA	4	8	119788	119795	50 %	0 %	50 %	0 %	532424039
2645	NC_022119	GGC	2	6	119828	119833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424039
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2647	NC_022119	TCT	2	6	120012	120017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424039
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2649	NC_022119	ATC	2	6	120215	120220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424039
2650	NC_022119	TCT	2	6	120289	120294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2651	NC_022119	GA	3	6	120296	120301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_022119	TAT	2	6	120320	120325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_022119	ATA	2	6	120341	120346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_022119	CTGG	2	8	120364	120371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2655	NC_022119	TAAAAA	2	12	120468	120479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2656	NC_022119	TTGGTA	2	12	120516	120527	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532424040
2657	NC_022119	TG	3	6	120555	120560	0 %	50 %	50 %	0 %	532424040
2658	NC_022119	TCA	2	6	120563	120568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424040
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2662	NC_022119	CTG	2	6	120642	120647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424040
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2665	NC_022119	GTA	2	6	120872	120877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424040
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2670	NC_022119	CT	3	6	121180	121185	0 %	50 %	0 %	50 %	532424040
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2687	NC_022119	TGA	2	6	122026	122031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424040
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2690	NC_022119	ATC	2	6	122275	122280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424040
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2692	NC_022119	GA	3	6	122422	122427	50 %	0 %	50 %	0 %	532424040
2693	NC_022119	GCTTC	2	10	122430	122439	0 %	40 %	20 %	40 %	532424040
2694	NC_022119	TCTA	2	8	122471	122478	25 %	50 %	0 %	25 %	532424040
2695	NC_022119	TA	3	6	122531	122536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2696	NC_022119	T	6	6	122577	122582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2697	NC_022119	ACT	2	6	122632	122637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424041
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2700	NC_022119	T	6	6	122744	122749	0 %	100 %	0 %	0 %	532424041
2701	NC_022119	AGCT	2	8	122777	122784	25 %	25 %	25 %	25 %	532424041
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2707	NC_022119	TGA	2	6	123220	123225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424041
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2712	NC_022119	GT	3	6	123520	123525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2713	NC_022119	T	6	6	123564	123569	0 %	100 %	0 %	0 %	532424042
2714	NC_022119	GA	3	6	123642	123647	50 %	0 %	50 %	0 %	532424042
2715	NC_022119	GGGTTT	2	12	123665	123676	0 %	50 %	50 %	0 %	532424042
2716	NC_022119	CAA	2	6	123691	123696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424042
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2718	NC_022119	T	6	6	123723	123728	0 %	100 %	0 %	0 %	532424042
2719	NC_022119	TGGA	2	8	123733	123740	25 %	25 %	50 %	0 %	532424042
2720	NC_022119	GCAA	2	8	123768	123775	50 %	0 %	25 %	25 %	532424042
2721	NC_022119	TTA	2	6	123813	123818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424042
2722	NC_022119	TTA	2	6	123854	123859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424042
2723	NC_022119	GGA	2	6	123871	123876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424042
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2725	NC_022119	TTGCAT	2	12	123947	123958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532424042
2726	NC_022119	A	7	7	123965	123971	100 %	0 %	0 %	0 %	532424042
2727	NC_022119	CTG	2	6	123974	123979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424042
2728	NC_022119	TGA	2	6	124001	124006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424042
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2730	NC_022119	ATCG	2	8	124033	124040	25 %	25 %	25 %	25 %	532424042
2731	NC_022119	AG	3	6	124054	124059	50 %	0 %	50 %	0 %	532424042
2732	NC_022119	AGC	2	6	124242	124247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424042
2733	NC_022119	TGT	2	6	124269	124274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424042
2734	NC_022119	TGA	2	6	124301	124306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424042
2735	NC_022119	AAGAGA	2	12	124316	124327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424042
2736	NC_022119	TAC	2	6	124354	124359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424042
2737	NC_022119	AGA	2	6	124371	124376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424042
2738	NC_022119	TTG	2	6	124377	124382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424042
2739	NC_022119	GA	3	6	124424	124429	50 %	0 %	50 %	0 %	532424042
2740	NC_022119	TAG	2	6	124443	124448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424042
2741	NC_022119	CTTC	2	8	124450	124457	0 %	50 %	0 %	50 %	532424042
2742	NC_022119	TCA	2	6	124570	124575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424042
2743	NC_022119	T	6	6	124599	124604	0 %	100 %	0 %	0 %	532424042
2744	NC_022119	ATAA	2	8	124652	124659	75 %	25 %	0 %	0 %	532424042
2745	NC_022119	T	6	6	124675	124680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2746	NC_022119	T	7	7	124700	124706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2747	NC_022119	TGAA	2	8	124737	124744	50 %	25 %	25 %	0 %	532424043
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2749	NC_022119	AAC	2	6	125067	125072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424043
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2997	NC_022119	TCA	2	6	135960	135965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424052
2998	NC_022119	GCTA	2	8	136002	136009	25 %	25 %	25 %	25 %	532424052
2999	NC_022119	CGC	2	6	136035	136040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424052
3000	NC_022119	TG	3	6	136061	136066	0 %	50 %	50 %	0 %	532424052

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