MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022119	TGAT	2	8	69292	69299	25 %	50 %	25 %	0 %	532424000
1502	NC_022119	T	6	6	69340	69345	0 %	100 %	0 %	0 %	532424000
1503	NC_022119	TCT	2	6	69456	69461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424000
1504	NC_022119	GGAGC	2	10	69579	69588	20 %	0 %	60 %	20 %	532424000
1505	NC_022119	TGC	2	6	69662	69667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424000
1506	NC_022119	A	7	7	69699	69705	100 %	0 %	0 %	0 %	532424000
1507	NC_022119	CT	3	6	69707	69712	0 %	50 %	0 %	50 %	532424000
1508	NC_022119	AGA	2	6	69716	69721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424000
1509	NC_022119	GCGAT	2	10	69769	69778	20 %	20 %	40 %	20 %	532424000
1510	NC_022119	GTT	2	6	69791	69796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424000
1511	NC_022119	GCT	2	6	69813	69818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424000
1512	NC_022119	GCA	3	9	69915	69923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424000
1513	NC_022119	AAAG	2	8	69948	69955	75 %	0 %	25 %	0 %	532424000
1514	NC_022119	GCA	2	6	69962	69967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424000
1515	NC_022119	ATT	2	6	69976	69981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424000
1516	NC_022119	TAT	2	6	70084	70089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424000
1517	NC_022119	CTT	2	6	70108	70113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424000
1518	NC_022119	GA	3	6	70117	70122	50 %	0 %	50 %	0 %	532424000
1519	NC_022119	CTCTT	2	10	70123	70132	0 %	60 %	0 %	40 %	532424000
1520	NC_022119	AGAA	2	8	70135	70142	75 %	0 %	25 %	0 %	532424000
1521	NC_022119	TGA	2	6	70163	70168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424000
1522	NC_022119	TTG	2	6	70252	70257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424000
1523	NC_022119	TCT	2	6	70275	70280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424000
1524	NC_022119	GA	3	6	70316	70321	50 %	0 %	50 %	0 %	532424000
1525	NC_022119	AGCT	2	8	70357	70364	25 %	25 %	25 %	25 %	532424000
1526	NC_022119	TGA	2	6	70403	70408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424000
1527	NC_022119	GCAT	2	8	70418	70425	25 %	25 %	25 %	25 %	532424000
1528	NC_022119	AGA	2	6	70436	70441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424000
1529	NC_022119	TCAA	2	8	70562	70569	50 %	25 %	0 %	25 %	532424000
1530	NC_022119	GT	3	6	70592	70597	0 %	50 %	50 %	0 %	532424000
1531	NC_022119	CT	3	6	70673	70678	0 %	50 %	0 %	50 %	532424000
1532	NC_022119	GA	3	6	70694	70699	50 %	0 %	50 %	0 %	532424000
1533	NC_022119	AGT	2	6	70736	70741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424000
1534	NC_022119	AGGGG	2	10	70769	70778	20 %	0 %	80 %	0 %	532424000
1535	NC_022119	AAGAA	2	10	70811	70820	80 %	0 %	20 %	0 %	532424000
1536	NC_022119	AGA	2	6	70883	70888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424000
1537	NC_022119	TGA	2	6	70919	70924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424000
1538	NC_022119	TAT	2	6	70930	70935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424000
1539	NC_022119	T	6	6	71019	71024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_022119	T	8	8	71040	71047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_022119	CAT	2	6	71105	71110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424001
1542	NC_022119	CCTT	2	8	71134	71141	0 %	50 %	0 %	50 %	532424001
1543	NC_022119	GCTT	2	8	71164	71171	0 %	50 %	25 %	25 %	532424001
1544	NC_022119	A	6	6	71259	71264	100 %	0 %	0 %	0 %	532424001
1545	NC_022119	ATT	2	6	71309	71314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424001
1546	NC_022119	CAA	2	6	71456	71461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424001
1547	NC_022119	TCC	2	6	71480	71485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424001
1548	NC_022119	TTCT	2	8	71502	71509	0 %	75 %	0 %	25 %	532424001
1549	NC_022119	ATG	2	6	71514	71519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424001
1550	NC_022119	GCTT	2	8	71548	71555	0 %	50 %	25 %	25 %	532424001
1551	NC_022119	AGA	2	6	71557	71562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424001
1552	NC_022119	GAGC	2	8	71576	71583	25 %	0 %	50 %	25 %	532424001
1553	NC_022119	TCA	2	6	71601	71606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424001
1554	NC_022119	A	7	7	71608	71614	100 %	0 %	0 %	0 %	532424001
1555	NC_022119	CTATTT	2	12	71619	71630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532424001
1556	NC_022119	TGA	2	6	71653	71658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424001
1557	NC_022119	ATG	2	6	71691	71696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424001
1558	NC_022119	AGA	2	6	71821	71826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_022119	CGT	2	6	71869	71874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424788
1560	NC_022119	T	7	7	71874	71880	0 %	100 %	0 %	0 %	532424788
1561	NC_022119	CTTGC	2	10	71900	71909	0 %	40 %	20 %	40 %	532424788
1562	NC_022119	GATA	2	8	71924	71931	50 %	25 %	25 %	0 %	532424788
1563	NC_022119	TTC	2	6	72015	72020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424002
1564	NC_022119	CTT	2	6	72083	72088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424002
1565	NC_022119	ATTGG	2	10	72101	72110	20 %	40 %	40 %	0 %	532424002
1566	NC_022119	T	6	6	72117	72122	0 %	100 %	0 %	0 %	532424002
1567	NC_022119	AGC	2	6	72132	72137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424002
1568	NC_022119	TTG	2	6	72161	72166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424002
1569	NC_022119	ATA	2	6	72245	72250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424002
1570	NC_022119	GCT	2	6	72265	72270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424002
1571	NC_022119	GCTA	2	8	72274	72281	25 %	25 %	25 %	25 %	532424002
1572	NC_022119	AAT	2	6	72304	72309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424002
1573	NC_022119	TGG	2	6	72335	72340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424002
1574	NC_022119	T	6	6	72342	72347	0 %	100 %	0 %	0 %	532424002
1575	NC_022119	AGC	2	6	72404	72409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424002
1576	NC_022119	TTAT	2	8	72450	72457	25 %	75 %	0 %	0 %	532424002
1577	NC_022119	TGC	2	6	72458	72463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424002
1578	NC_022119	TGT	2	6	72501	72506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424002
1579	NC_022119	GGAG	2	8	72517	72524	25 %	0 %	75 %	0 %	532424002
1580	NC_022119	GATT	2	8	72552	72559	25 %	50 %	25 %	0 %	532424002
1581	NC_022119	GAA	2	6	72627	72632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424002
1582	NC_022119	CTGG	2	8	72660	72667	0 %	25 %	50 %	25 %	532424002
1583	NC_022119	CTC	2	6	72680	72685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424002
1584	NC_022119	ACTCTT	2	12	72748	72759	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532424002
1585	NC_022119	GAA	2	6	72769	72774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424002
1586	NC_022119	TGA	2	6	72786	72791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424002
1587	NC_022119	GAA	2	6	72819	72824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424002
1588	NC_022119	T	6	6	72901	72906	0 %	100 %	0 %	0 %	532424002
1589	NC_022119	TAG	2	6	72941	72946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424002
1590	NC_022119	TAG	2	6	72950	72955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424002
1591	NC_022119	AGA	2	6	73057	73062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424002
1592	NC_022119	ATCA	2	8	73087	73094	50 %	25 %	0 %	25 %	532424002
1593	NC_022119	TGT	2	6	73160	73165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424002
1594	NC_022119	GAAAA	2	10	73173	73182	80 %	0 %	20 %	0 %	532424002
1595	NC_022119	A	7	7	73179	73185	100 %	0 %	0 %	0 %	532424002
1596	NC_022119	AGG	2	6	73205	73210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424002
1597	NC_022119	TGG	2	6	73283	73288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424003
1598	NC_022119	TTTCTG	2	12	73298	73309	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532424003
1599	NC_022119	AGA	2	6	73335	73340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424003
1600	NC_022119	GA	3	6	73358	73363	50 %	0 %	50 %	0 %	532424003
1601	NC_022119	TAC	2	6	73383	73388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424003
1602	NC_022119	GATCAT	2	12	73428	73439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532424003
1603	NC_022119	TGA	2	6	73461	73466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424003
1604	NC_022119	G	6	6	73519	73524	0 %	0 %	100 %	0 %	532424003
1605	NC_022119	TAT	2	6	73531	73536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424003
1606	NC_022119	A	6	6	73567	73572	100 %	0 %	0 %	0 %	532424003
1607	NC_022119	TGGGA	2	10	73590	73599	20 %	20 %	60 %	0 %	532424003
1608	NC_022119	GCT	2	6	73699	73704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424003
1609	NC_022119	TGGA	2	8	73709	73716	25 %	25 %	50 %	0 %	532424003
1610	NC_022119	AGG	2	6	73743	73748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424003
1611	NC_022119	TC	3	6	73845	73850	0 %	50 %	0 %	50 %	532424003
1612	NC_022119	T	6	6	73873	73878	0 %	100 %	0 %	0 %	532424003
1613	NC_022119	AGC	3	9	73917	73925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424003
1614	NC_022119	AGGC	2	8	74033	74040	25 %	0 %	50 %	25 %	532424003
1615	NC_022119	ATT	2	6	74056	74061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424003
1616	NC_022119	AAG	2	6	74096	74101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424003
1617	NC_022119	AAG	2	6	74159	74164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424003
1618	NC_022119	TGC	2	6	74237	74242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424003
1619	NC_022119	TC	3	6	74252	74257	0 %	50 %	0 %	50 %	532424003
1620	NC_022119	TCA	2	6	74346	74351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424003
1621	NC_022119	ATT	2	6	74396	74401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424003
1622	NC_022119	TCT	2	6	74488	74493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424003
1623	NC_022119	ATG	2	6	74507	74512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424003
1624	NC_022119	AAG	2	6	74662	74667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424003
1625	NC_022119	ACT	2	6	74677	74682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_022119	T	6	6	74688	74693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022119	AGT	2	6	74713	74718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022119	CAA	2	6	74739	74744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424004
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