MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_022119	TGG	2	6	46504	46509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423984
1003	NC_022119	CAT	2	6	46636	46641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423984
1004	NC_022119	ACTT	2	8	46724	46731	25 %	50 %	0 %	25 %	532423984
1005	NC_022119	AGTTT	2	10	46863	46872	20 %	60 %	20 %	0 %	532423984
1006	NC_022119	AGA	2	6	46948	46953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423984
1007	NC_022119	AGT	2	6	47033	47038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423984
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1009	NC_022119	A	6	6	47289	47294	100 %	0 %	0 %	0 %	532423984
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1011	NC_022119	ATGG	2	8	47350	47357	25 %	25 %	50 %	0 %	532423984
1012	NC_022119	AGGA	2	8	47381	47388	50 %	0 %	50 %	0 %	532423984
1013	NC_022119	GTT	2	6	47410	47415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423984
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1016	NC_022119	ATA	2	6	47436	47441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423984
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1021	NC_022119	GAAC	2	8	47928	47935	50 %	0 %	25 %	25 %	532423984
1022	NC_022119	AAGT	2	8	47963	47970	50 %	25 %	25 %	0 %	532423984
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1025	NC_022119	G	6	6	48006	48011	0 %	0 %	100 %	0 %	532423984
1026	NC_022119	AG	3	6	48028	48033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1031	NC_022119	AACA	2	8	48172	48179	75 %	0 %	0 %	25 %	532423985
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1062	NC_022119	CTATT	2	10	49574	49583	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1099	NC_022119	ACG	2	6	51027	51032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423987
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1107	NC_022119	TG	4	8	51375	51382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022119	TAA	2	6	51392	51397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022119	T	6	6	51416	51421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022119	AGT	3	9	51460	51468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022119	GCA	2	6	51516	51521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423988
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1260	NC_022119	AGTTGT	2	12	57649	57660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532424786
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1262	NC_022119	CTA	2	6	57736	57741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424786
1263	NC_022119	TGA	2	6	57906	57911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424786
1264	NC_022119	TGT	2	6	57978	57983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424786
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1280	NC_022119	CTT	2	6	58607	58612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424786
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1291	NC_022119	T	6	6	59030	59035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1339	NC_022119	AAAAAT	2	12	60872	60883	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1382	NC_022119	AG	3	6	63151	63156	50 %	0 %	50 %	0 %	532423994
1383	NC_022119	TC	4	8	63158	63165	0 %	50 %	0 %	50 %	532423994
1384	NC_022119	T	6	6	63178	63183	0 %	100 %	0 %	0 %	532423994
1385	NC_022119	GTTCTT	2	12	63297	63308	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532423994
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1499	NC_022119	TTCG	2	8	69175	69182	0 %	50 %	25 %	25 %	532424000
1500	NC_022119	TGT	2	6	69200	69205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424000

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