MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022119	ATGCT	2	10	633017	633026	20 %	40 %	20 %	20 %	532424476
14002	NC_022119	ACGGA	2	10	633151	633160	40 %	0 %	40 %	20 %	532424476
14003	NC_022119	ATT	2	6	633170	633175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424476
14004	NC_022119	GGA	2	6	633228	633233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424476
14005	NC_022119	CTT	2	6	633276	633281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424476
14006	NC_022119	AGA	2	6	633300	633305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424476
14007	NC_022119	GATA	2	8	633384	633391	50 %	25 %	25 %	0 %	532424476
14008	NC_022119	TCT	2	6	633464	633469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_022119	AT	3	6	633488	633493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_022119	A	11	11	633496	633506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_022119	T	6	6	633530	633535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_022119	A	6	6	633597	633602	100 %	0 %	0 %	0 %	532424839
14013	NC_022119	CCTG	2	8	633688	633695	0 %	25 %	25 %	50 %	532424839
14014	NC_022119	GTC	2	6	633768	633773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424477
14015	NC_022119	TAA	2	6	633776	633781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424477
14016	NC_022119	A	6	6	633780	633785	100 %	0 %	0 %	0 %	532424477
14017	NC_022119	TC	3	6	633788	633793	0 %	50 %	0 %	50 %	532424477
14018	NC_022119	AAG	2	6	633847	633852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424477
14019	NC_022119	GAA	2	6	633882	633887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424477
14020	NC_022119	AGGA	2	8	633928	633935	50 %	0 %	50 %	0 %	532424477
14021	NC_022119	TTA	2	6	633967	633972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424477
14022	NC_022119	CCTC	2	8	634006	634013	0 %	25 %	0 %	75 %	532424477
14023	NC_022119	ATC	2	6	634044	634049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424477
14024	NC_022119	AAC	2	6	634171	634176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424477
14025	NC_022119	A	7	7	634190	634196	100 %	0 %	0 %	0 %	532424477
14026	NC_022119	CT	3	6	634224	634229	0 %	50 %	0 %	50 %	532424477
14027	NC_022119	A	6	6	634350	634355	100 %	0 %	0 %	0 %	532424477
14028	NC_022119	ACA	2	6	634371	634376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424477
14029	NC_022119	AAGA	2	8	634392	634399	75 %	0 %	25 %	0 %	532424477
14030	NC_022119	TGA	2	6	634423	634428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424478
14031	NC_022119	TCT	2	6	634438	634443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424478
14032	NC_022119	GCA	2	6	634491	634496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424478
14033	NC_022119	CTT	2	6	634507	634512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424478
14034	NC_022119	CTC	2	6	634531	634536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424478
14035	NC_022119	A	6	6	634561	634566	100 %	0 %	0 %	0 %	532424478
14036	NC_022119	CCT	2	6	634626	634631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424478
14037	NC_022119	AAG	2	6	634633	634638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424478
14038	NC_022119	TCC	2	6	634644	634649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424478
14039	NC_022119	CCT	2	6	634741	634746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424478
14040	NC_022119	ATT	2	6	634758	634763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424478
14041	NC_022119	ACA	2	6	634796	634801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424478
14042	NC_022119	CCT	2	6	634806	634811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424478
14043	NC_022119	A	6	6	634893	634898	100 %	0 %	0 %	0 %	532424478
14044	NC_022119	TCGAG	2	10	634903	634912	20 %	20 %	40 %	20 %	532424478
14045	NC_022119	T	6	6	634930	634935	0 %	100 %	0 %	0 %	532424478
14046	NC_022119	TTG	2	6	634960	634965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424478
14047	NC_022119	TTA	2	6	635002	635007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424478
14048	NC_022119	CAA	2	6	635079	635084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424478
14049	NC_022119	ATC	2	6	635106	635111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424478
14050	NC_022119	TCA	2	6	635122	635127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424478
14051	NC_022119	CTTT	2	8	635176	635183	0 %	75 %	0 %	25 %	532424478
14052	NC_022119	ATG	3	9	635226	635234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424478
14053	NC_022119	TC	4	8	635251	635258	0 %	50 %	0 %	50 %	532424478
14054	NC_022119	CTA	2	6	635304	635309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424478
14055	NC_022119	TGA	2	6	635317	635322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424478
14056	NC_022119	CAA	2	6	635361	635366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424479
14057	NC_022119	TTTG	2	8	635380	635387	0 %	75 %	25 %	0 %	532424479
14058	NC_022119	TTA	2	6	635408	635413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424479
14059	NC_022119	CTC	2	6	635430	635435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424479
14060	NC_022119	TAT	2	6	635437	635442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424479
14061	NC_022119	TGG	2	6	635466	635471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424479
14062	NC_022119	AGC	2	6	635482	635487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424479
14063	NC_022119	GGCT	2	8	635564	635571	0 %	25 %	50 %	25 %	532424479
14064	NC_022119	TGC	2	6	635593	635598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424479
14065	NC_022119	GGCTC	2	10	635667	635676	0 %	20 %	40 %	40 %	532424480
14066	NC_022119	TA	3	6	635690	635695	50 %	50 %	0 %	0 %	532424480
14067	NC_022119	AGCC	2	8	635703	635710	25 %	0 %	25 %	50 %	532424480
14068	NC_022119	TCTT	2	8	635727	635734	0 %	75 %	0 %	25 %	532424480
14069	NC_022119	ATC	2	6	635768	635773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424480
14070	NC_022119	CT	3	6	635825	635830	0 %	50 %	0 %	50 %	532424480
14071	NC_022119	TGC	2	6	635841	635846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424480
14072	NC_022119	CTT	2	6	635909	635914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424480
14073	NC_022119	ACCA	2	8	635999	636006	50 %	0 %	0 %	50 %	532424480
14074	NC_022119	CT	3	6	636037	636042	0 %	50 %	0 %	50 %	532424480
14075	NC_022119	ATT	2	6	636084	636089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424480
14076	NC_022119	AGG	2	6	636115	636120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424480
14077	NC_022119	ATC	2	6	636161	636166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424480
14078	NC_022119	ATG	2	6	636194	636199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424480
14079	NC_022119	CAG	2	6	636279	636284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424480
14080	NC_022119	ATC	2	6	636320	636325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424480
14081	NC_022119	CTC	2	6	636336	636341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424480
14082	NC_022119	CTAC	2	8	636355	636362	25 %	25 %	0 %	50 %	532424480
14083	NC_022119	TGG	2	6	636410	636415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424480
14084	NC_022119	ATT	2	6	636435	636440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424480
14085	NC_022119	CTA	2	6	636468	636473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424480
14086	NC_022119	TCC	2	6	636490	636495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424480
14087	NC_022119	A	8	8	636512	636519	100 %	0 %	0 %	0 %	532424480
14088	NC_022119	T	6	6	636530	636535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_022119	GGAG	2	8	636536	636543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_022119	TTC	2	6	636544	636549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_022119	TTG	2	6	636570	636575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_022119	TGC	2	6	636614	636619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424481
14093	NC_022119	AAT	2	6	636640	636645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424481
14094	NC_022119	CAA	2	6	636813	636818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424481
14095	NC_022119	CAC	2	6	636873	636878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424481
14096	NC_022119	C	6	6	636919	636924	0 %	0 %	0 %	100 %	532424481
14097	NC_022119	TG	3	6	636937	636942	0 %	50 %	50 %	0 %	532424481
14098	NC_022119	GAG	2	6	636998	637003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424481
14099	NC_022119	CT	3	6	637004	637009	0 %	50 %	0 %	50 %	532424481
14100	NC_022119	T	7	7	637043	637049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_022119	ATTAA	2	10	637056	637065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_022119	A	6	6	637110	637115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_022119	TCT	2	6	637132	637137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424482
14104	NC_022119	CAG	2	6	637200	637205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424482
14105	NC_022119	CTT	2	6	637228	637233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424482
14106	NC_022119	AAAG	2	8	637241	637248	75 %	0 %	25 %	0 %	532424482
14107	NC_022119	GCA	2	6	637331	637336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424482
14108	NC_022119	CTG	2	6	637366	637371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424482
14109	NC_022119	CG	3	6	637373	637378	0 %	0 %	50 %	50 %	532424482
14110	NC_022119	GAA	2	6	637446	637451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424482
14111	NC_022119	CAAC	2	8	637564	637571	50 %	0 %	0 %	50 %	532424482
14112	NC_022119	GGA	2	6	637587	637592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424482
14113	NC_022119	AAT	2	6	637636	637641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424482
14114	NC_022119	AGCA	2	8	637654	637661	50 %	0 %	25 %	25 %	532424482
14115	NC_022119	GAA	2	6	637754	637759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424482
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14117	NC_022119	GGC	2	6	637823	637828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424482
14118	NC_022119	AAC	2	6	637870	637875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424482
14119	NC_022119	GCTCT	2	10	637908	637917	0 %	40 %	20 %	40 %	532424482
14120	NC_022119	TCGTT	2	10	637936	637945	0 %	60 %	20 %	20 %	532424482
14121	NC_022119	TTG	2	6	637978	637983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424482
14122	NC_022119	CTT	2	6	637998	638003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424482
14123	NC_022119	GCA	2	6	638048	638053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424482
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14241	NC_022119	T	7	7	643008	643014	0 %	100 %	0 %	0 %	532424488
14242	NC_022119	CAA	2	6	643033	643038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424488
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14244	NC_022119	CTT	2	6	643059	643064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424488
14245	NC_022119	CTT	2	6	643131	643136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424488
14246	NC_022119	ACT	2	6	643225	643230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424488
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14263	NC_022119	GA	3	6	644203	644208	50 %	0 %	50 %	0 %	532424488
14264	NC_022119	CTT	2	6	644214	644219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424488
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14298	NC_022119	A	8	8	645711	645718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14362	NC_022119	A	7	7	648692	648698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14363	NC_022119	AC	3	6	648712	648717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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