MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022119	ATCC	2	8	611084	611091	25 %	25 %	0 %	50 %	532424838
13502	NC_022119	CGC	2	6	611097	611102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424838
13503	NC_022119	CT	3	6	611120	611125	0 %	50 %	0 %	50 %	532424838
13504	NC_022119	TCT	2	6	611145	611150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424838
13505	NC_022119	GAC	2	6	611182	611187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_022119	TAC	2	6	611190	611195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_022119	ATG	2	6	611207	611212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_022119	A	6	6	611242	611247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_022119	AC	3	6	611315	611320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13510	NC_022119	CCT	2	6	611367	611372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424460
13511	NC_022119	TCT	2	6	611440	611445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424460
13512	NC_022119	TTC	2	6	611469	611474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424460
13513	NC_022119	TGCCA	2	10	611501	611510	20 %	20 %	20 %	40 %	532424460
13514	NC_022119	GTA	2	6	611560	611565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424460
13515	NC_022119	CT	3	6	611566	611571	0 %	50 %	0 %	50 %	532424460
13516	NC_022119	GATT	2	8	611650	611657	25 %	50 %	25 %	0 %	532424460
13517	NC_022119	TCT	2	6	611677	611682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424460
13518	NC_022119	TC	3	6	611687	611692	0 %	50 %	0 %	50 %	532424460
13519	NC_022119	GGTT	2	8	611733	611740	0 %	50 %	50 %	0 %	532424460
13520	NC_022119	GGATGG	2	12	611745	611756	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532424460
13521	NC_022119	AG	4	8	611798	611805	50 %	0 %	50 %	0 %	532424460
13522	NC_022119	TGG	2	6	611811	611816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424460
13523	NC_022119	ATA	2	6	611836	611841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424460
13524	NC_022119	GGCGC	2	10	611896	611905	0 %	0 %	60 %	40 %	532424460
13525	NC_022119	ATT	2	6	611922	611927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424460
13526	NC_022119	TAT	2	6	611930	611935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424460
13527	NC_022119	ATCG	2	8	611952	611959	25 %	25 %	25 %	25 %	532424460
13528	NC_022119	AGA	2	6	612014	612019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424460
13529	NC_022119	GAA	2	6	612036	612041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424460
13530	NC_022119	AG	3	6	612075	612080	50 %	0 %	50 %	0 %	532424460
13531	NC_022119	CT	3	6	612081	612086	0 %	50 %	0 %	50 %	532424460
13532	NC_022119	TTAC	2	8	612103	612110	25 %	50 %	0 %	25 %	532424460
13533	NC_022119	TAA	2	6	612119	612124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424460
13534	NC_022119	CCT	2	6	612148	612153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424460
13535	NC_022119	TTTA	2	8	612156	612163	25 %	75 %	0 %	0 %	532424460
13536	NC_022119	CT	3	6	612196	612201	0 %	50 %	0 %	50 %	532424460
13537	NC_022119	ATT	2	6	612220	612225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424460
13538	NC_022119	TTTG	2	8	612254	612261	0 %	75 %	25 %	0 %	532424460
13539	NC_022119	ATT	2	6	612272	612277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424460
13540	NC_022119	GGCT	2	8	612294	612301	0 %	25 %	50 %	25 %	532424460
13541	NC_022119	TCT	2	6	612346	612351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424460
13542	NC_022119	ATT	2	6	612359	612364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424460
13543	NC_022119	TGG	2	6	612408	612413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424460
13544	NC_022119	T	6	6	612443	612448	0 %	100 %	0 %	0 %	532424460
13545	NC_022119	ATG	2	6	612465	612470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424460
13546	NC_022119	ATTGG	2	10	612471	612480	20 %	40 %	40 %	0 %	532424460
13547	NC_022119	A	6	6	612501	612506	100 %	0 %	0 %	0 %	532424460
13548	NC_022119	AGC	2	6	612554	612559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424460
13549	NC_022119	TTG	2	6	612616	612621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424460
13550	NC_022119	TCAA	2	8	612781	612788	50 %	25 %	0 %	25 %	532424461
13551	NC_022119	TTG	2	6	612794	612799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424461
13552	NC_022119	CGCT	2	8	612827	612834	0 %	25 %	25 %	50 %	532424461
13553	NC_022119	TTTG	2	8	612852	612859	0 %	75 %	25 %	0 %	532424461
13554	NC_022119	ATC	2	6	612907	612912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424461
13555	NC_022119	A	9	9	612952	612960	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13556	NC_022119	CTT	2	6	612994	612999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424461
13557	NC_022119	GAA	2	6	613009	613014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13558	NC_022119	TTTG	2	8	613028	613035	0 %	75 %	25 %	0 %	532424461
13559	NC_022119	CTCTC	2	10	613036	613045	0 %	40 %	0 %	60 %	532424461
13560	NC_022119	ATAG	2	8	613081	613088	50 %	25 %	25 %	0 %	532424461
13561	NC_022119	GAA	2	6	613174	613179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13562	NC_022119	AAG	2	6	613220	613225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13563	NC_022119	AGA	2	6	613260	613265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13564	NC_022119	GAA	2	6	613282	613287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13565	NC_022119	AAAAC	2	10	613296	613305	80 %	0 %	0 %	20 %	532424461
13566	NC_022119	AAC	2	6	613325	613330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424461
13567	NC_022119	GCTC	2	8	613425	613432	0 %	25 %	25 %	50 %	532424461
13568	NC_022119	AG	3	6	613459	613464	50 %	0 %	50 %	0 %	532424461
13569	NC_022119	TAG	2	6	613524	613529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424461
13570	NC_022119	ATTTT	2	10	613533	613542	20 %	80 %	0 %	0 %	532424461
13571	NC_022119	GCA	2	6	613573	613578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424461
13572	NC_022119	CTATC	2	10	613653	613662	20 %	40 %	0 %	40 %	532424461
13573	NC_022119	A	8	8	613682	613689	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13574	NC_022119	AGA	2	6	613701	613706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13575	NC_022119	CTT	2	6	613731	613736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424461
13576	NC_022119	AGA	2	6	613737	613742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13577	NC_022119	AC	3	6	613772	613777	50 %	0 %	0 %	50 %	532424461
13578	NC_022119	TAT	3	9	613863	613871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424461
13579	NC_022119	ATT	2	6	613912	613917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424461
13580	NC_022119	TTC	2	6	614032	614037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424461
13581	NC_022119	TCA	2	6	614045	614050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424461
13582	NC_022119	CGATAT	3	18	614073	614090	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532424461
13583	NC_022119	AG	3	6	614104	614109	50 %	0 %	50 %	0 %	532424461
13584	NC_022119	TTA	2	6	614114	614119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424461
13585	NC_022119	ATT	2	6	614161	614166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424461
13586	NC_022119	TGTA	2	8	614321	614328	25 %	50 %	25 %	0 %	532424461
13587	NC_022119	A	6	6	614365	614370	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13588	NC_022119	TGC	2	6	614403	614408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424461
13589	NC_022119	T	6	6	614535	614540	0 %	100 %	0 %	0 %	532424461
13590	NC_022119	CA	3	6	614574	614579	50 %	0 %	0 %	50 %	532424461
13591	NC_022119	A	7	7	614590	614596	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13592	NC_022119	TC	3	6	614648	614653	0 %	50 %	0 %	50 %	532424461
13593	NC_022119	TTC	2	6	614654	614659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424461
13594	NC_022119	GAA	2	6	614743	614748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13595	NC_022119	CAT	2	6	614798	614803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424461
13596	NC_022119	CGC	2	6	614962	614967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424461
13597	NC_022119	GA	3	6	615008	615013	50 %	0 %	50 %	0 %	532424461
13598	NC_022119	TAA	2	6	615105	615110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424461
13599	NC_022119	ACA	2	6	615145	615150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424461
13600	NC_022119	GCC	2	6	615187	615192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424461
13601	NC_022119	AAG	2	6	615242	615247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13602	NC_022119	CCT	2	6	615274	615279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424461
13603	NC_022119	TTG	2	6	615380	615385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424461
13604	NC_022119	AG	4	8	615387	615394	50 %	0 %	50 %	0 %	532424461
13605	NC_022119	A	7	7	615395	615401	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13606	NC_022119	A	6	6	615448	615453	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13607	NC_022119	TGG	2	6	615479	615484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424461
13608	NC_022119	TAA	2	6	615513	615518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424461
13609	NC_022119	A	8	8	615569	615576	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13610	NC_022119	GCT	2	6	615580	615585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424461
13611	NC_022119	T	7	7	615601	615607	0 %	100 %	0 %	0 %	532424461
13612	NC_022119	TC	3	6	615647	615652	0 %	50 %	0 %	50 %	532424461
13613	NC_022119	GTT	2	6	615684	615689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424461
13614	NC_022119	ATT	2	6	615814	615819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424461
13615	NC_022119	ACT	2	6	615847	615852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424461
13616	NC_022119	GCAGA	2	10	615865	615874	40 %	0 %	40 %	20 %	532424461
13617	NC_022119	A	6	6	615874	615879	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13618	NC_022119	GAA	2	6	615967	615972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
13619	NC_022119	TTAT	2	8	615980	615987	25 %	75 %	0 %	0 %	532424461
13620	NC_022119	CGA	2	6	616086	616091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424461
13621	NC_022119	A	6	6	616135	616140	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13622	NC_022119	A	7	7	616170	616176	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
13623	NC_022119	AG	3	6	616186	616191	50 %	0 %	50 %	0 %	532424461
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13982	NC_022119	TAT	2	6	632151	632156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424475
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13991	NC_022119	TCT	2	6	632700	632705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424476
13992	NC_022119	CAT	2	6	632719	632724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424476
13993	NC_022119	TCCT	2	8	632781	632788	0 %	50 %	0 %	50 %	532424476
13994	NC_022119	TCCC	2	8	632813	632820	0 %	25 %	0 %	75 %	532424476
13995	NC_022119	ATT	2	6	632835	632840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424476
13996	NC_022119	ACT	2	6	632871	632876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424476
13997	NC_022119	GCT	2	6	632915	632920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424476
13998	NC_022119	CTAC	2	8	632937	632944	25 %	25 %	0 %	50 %	532424476
13999	NC_022119	TCC	2	6	632970	632975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424476
14000	NC_022119	AGA	2	6	632985	632990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424476

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