MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022119	TTG	2	6	22958	22963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423961
502	NC_022119	AGA	2	6	23018	23023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423961
503	NC_022119	GCTT	2	8	23031	23038	0 %	50 %	25 %	25 %	532423961
504	NC_022119	GGTT	2	8	23079	23086	0 %	50 %	50 %	0 %	532423961
505	NC_022119	TGC	2	6	23105	23110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423961
506	NC_022119	ATT	2	6	23157	23162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423961
507	NC_022119	AAT	2	6	23199	23204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423961
508	NC_022119	TTG	2	6	23262	23267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423961
509	NC_022119	TTCT	2	8	23449	23456	0 %	75 %	0 %	25 %	532423961
510	NC_022119	TGC	2	6	23513	23518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423961
511	NC_022119	TAAC	2	8	23551	23558	50 %	25 %	0 %	25 %	532423961
512	NC_022119	GCA	2	6	23619	23624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423961
513	NC_022119	CATT	2	8	23674	23681	25 %	50 %	0 %	25 %	532423961
514	NC_022119	AGA	2	6	23693	23698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423961
515	NC_022119	GAG	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423961
516	NC_022119	TTC	2	6	23779	23784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423961
517	NC_022119	GGAAA	2	10	23792	23801	60 %	0 %	40 %	0 %	532423961
518	NC_022119	GA	3	6	23815	23820	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
519	NC_022119	GA	3	6	23907	23912	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
520	NC_022119	GAA	2	6	24038	24043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423961
521	NC_022119	GGTA	2	8	24044	24051	25 %	25 %	50 %	0 %	532423961
522	NC_022119	GTT	2	6	24132	24137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423961
523	NC_022119	CTT	2	6	24226	24231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423961
524	NC_022119	AG	3	6	24288	24293	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
525	NC_022119	TAA	2	6	24299	24304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423961
526	NC_022119	GAA	2	6	24319	24324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423961
527	NC_022119	AAG	2	6	24460	24465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423961
528	NC_022119	A	7	7	24545	24551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022119	TTA	2	6	24558	24563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022119	T	9	9	24573	24581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022119	T	6	6	24605	24610	0 %	100 %	0 %	0 %	532423962
532	NC_022119	AGA	2	6	24732	24737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423962
533	NC_022119	TAA	2	6	24864	24869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423962
534	NC_022119	GGA	3	9	24896	24904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423962
535	NC_022119	GAT	2	6	24941	24946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423962
536	NC_022119	TTGA	2	8	25039	25046	25 %	50 %	25 %	0 %	532423962
537	NC_022119	TTCG	2	8	25184	25191	0 %	50 %	25 %	25 %	532423962
538	NC_022119	TAGG	2	8	25263	25270	25 %	25 %	50 %	0 %	532423962
539	NC_022119	TGT	2	6	25354	25359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423962
540	NC_022119	TTA	2	6	25364	25369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423962
541	NC_022119	TTCC	2	8	25387	25394	0 %	50 %	0 %	50 %	532423962
542	NC_022119	TAG	2	6	25425	25430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423962
543	NC_022119	GTGAGG	2	12	25459	25470	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532423962
544	NC_022119	TAGG	2	8	25501	25508	25 %	25 %	50 %	0 %	532423962
545	NC_022119	AGAGG	2	10	25517	25526	40 %	0 %	60 %	0 %	532423962
546	NC_022119	AGC	2	6	25543	25548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423962
547	NC_022119	T	6	6	25552	25557	0 %	100 %	0 %	0 %	532423962
548	NC_022119	T	6	6	25583	25588	0 %	100 %	0 %	0 %	532423962
549	NC_022119	AAG	2	6	25689	25694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423962
550	NC_022119	GA	3	6	25705	25710	50 %	0 %	50 %	0 %	532423962
551	NC_022119	GT	3	6	25725	25730	0 %	50 %	50 %	0 %	532423962
552	NC_022119	TTTC	2	8	25936	25943	0 %	75 %	0 %	25 %	532423962
553	NC_022119	GAT	2	6	25948	25953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423962
554	NC_022119	CTC	2	6	26016	26021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423962
555	NC_022119	TGT	2	6	26083	26088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423962
556	NC_022119	A	6	6	26180	26185	100 %	0 %	0 %	0 %	532423962
557	NC_022119	GCA	2	6	26195	26200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423962
558	NC_022119	AGT	2	6	26227	26232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423962
559	NC_022119	T	6	6	26256	26261	0 %	100 %	0 %	0 %	532423962
560	NC_022119	GCTT	2	8	26273	26280	0 %	50 %	25 %	25 %	532423962
561	NC_022119	CTT	2	6	26343	26348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423962
562	NC_022119	GA	3	6	26373	26378	50 %	0 %	50 %	0 %	532423962
563	NC_022119	GAA	2	6	26408	26413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423962
564	NC_022119	GAA	2	6	26415	26420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423962
565	NC_022119	CGA	2	6	26423	26428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423962
566	NC_022119	GA	3	6	26497	26502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022119	CT	3	6	26504	26509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_022119	ACT	2	6	26512	26517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_022119	A	6	6	26528	26533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022119	T	7	7	26540	26546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022119	GGC	2	6	26688	26693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532423963
572	NC_022119	TAA	2	6	26717	26722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423963
573	NC_022119	AT	3	6	26790	26795	50 %	50 %	0 %	0 %	532423963
574	NC_022119	T	7	7	26803	26809	0 %	100 %	0 %	0 %	532423963
575	NC_022119	GAA	2	6	26821	26826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423963
576	NC_022119	GGAA	2	8	26856	26863	50 %	0 %	50 %	0 %	532423963
577	NC_022119	TTAA	2	8	26929	26936	50 %	50 %	0 %	0 %	532423963
578	NC_022119	AAAG	2	8	26979	26986	75 %	0 %	25 %	0 %	532423963
579	NC_022119	GA	3	6	27004	27009	50 %	0 %	50 %	0 %	532423963
580	NC_022119	T	7	7	27078	27084	0 %	100 %	0 %	0 %	532423963
581	NC_022119	TTC	2	6	27109	27114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423963
582	NC_022119	CTA	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423963
583	NC_022119	T	8	8	27135	27142	0 %	100 %	0 %	0 %	532423963
584	NC_022119	GAA	2	6	27193	27198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423963
585	NC_022119	GGGC	2	8	27259	27266	0 %	0 %	75 %	25 %	532423963
586	NC_022119	T	6	6	27275	27280	0 %	100 %	0 %	0 %	532423963
587	NC_022119	TGA	2	6	27288	27293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423963
588	NC_022119	GGAGA	2	10	27296	27305	40 %	0 %	60 %	0 %	532423963
589	NC_022119	A	7	7	27346	27352	100 %	0 %	0 %	0 %	532423963
590	NC_022119	AAG	2	6	27363	27368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423963
591	NC_022119	T	6	6	27383	27388	0 %	100 %	0 %	0 %	532423963
592	NC_022119	A	8	8	27480	27487	100 %	0 %	0 %	0 %	532423964
593	NC_022119	TTC	2	6	27524	27529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423964
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595	NC_022119	CAGA	2	8	27564	27571	50 %	0 %	25 %	25 %	532423964
596	NC_022119	TTC	2	6	27642	27647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423964
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598	NC_022119	TTC	2	6	27757	27762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423964
599	NC_022119	AAG	2	6	27771	27776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423964
600	NC_022119	AAG	2	6	27789	27794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423964
601	NC_022119	A	6	6	27795	27800	100 %	0 %	0 %	0 %	532423964
602	NC_022119	T	7	7	27854	27860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022119	TAA	2	6	27865	27870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022119	TC	3	6	27872	27877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_022119	ATTG	2	8	27923	27930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022119	AG	3	6	27955	27960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022119	AGA	2	6	27977	27982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022119	GAA	2	6	28027	28032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
609	NC_022119	ATCCG	2	10	28047	28056	20 %	20 %	20 %	40 %	532423965
610	NC_022119	TTC	2	6	28160	28165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423965
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612	NC_022119	AGA	2	6	28221	28226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
613	NC_022119	GAT	3	9	28303	28311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423965
614	NC_022119	GAG	2	6	28346	28351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423965
615	NC_022119	TG	3	6	28378	28383	0 %	50 %	50 %	0 %	532423965
616	NC_022119	GCA	2	6	28402	28407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423965
617	NC_022119	TC	3	6	28431	28436	0 %	50 %	0 %	50 %	532423965
618	NC_022119	AGGGT	2	10	28565	28574	20 %	20 %	60 %	0 %	532423965
619	NC_022119	TTC	2	6	28601	28606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423965
620	NC_022119	CAG	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423965
621	NC_022119	GAA	2	6	28627	28632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
622	NC_022119	TGA	2	6	28641	28646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423965
623	NC_022119	TTC	2	6	28674	28679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423965
624	NC_022119	GC	4	8	28845	28852	0 %	0 %	50 %	50 %	532423965
625	NC_022119	AAG	2	6	28853	28858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
626	NC_022119	TA	3	6	28967	28972	50 %	50 %	0 %	0 %	532423965
627	NC_022119	GAA	2	6	29056	29061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
628	NC_022119	TGT	2	6	29088	29093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423966
629	NC_022119	TTA	2	6	29144	29149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423966
630	NC_022119	TCT	2	6	29156	29161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423966
631	NC_022119	ACA	2	6	29384	29389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423966
632	NC_022119	ATG	2	6	29394	29399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423966
633	NC_022119	CTTT	2	8	29536	29543	0 %	75 %	0 %	25 %	532423966
634	NC_022119	TTTG	2	8	29551	29558	0 %	75 %	25 %	0 %	532423966
635	NC_022119	TTGT	2	8	29586	29593	0 %	75 %	25 %	0 %	532423966
636	NC_022119	CCTAT	2	10	29605	29614	20 %	40 %	0 %	40 %	532423966
637	NC_022119	T	6	6	29621	29626	0 %	100 %	0 %	0 %	532423966
638	NC_022119	ATC	2	6	29700	29705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423966
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640	NC_022119	T	8	8	29855	29862	0 %	100 %	0 %	0 %	532423966
641	NC_022119	ATG	2	6	29880	29885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423966
642	NC_022119	GA	3	6	29918	29923	50 %	0 %	50 %	0 %	532423966
643	NC_022119	AG	3	6	30016	30021	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
644	NC_022119	GTT	2	6	30097	30102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423967
645	NC_022119	GAA	2	6	30106	30111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423967
646	NC_022119	TC	3	6	30125	30130	0 %	50 %	0 %	50 %	532423967
647	NC_022119	TCT	2	6	30172	30177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423967
648	NC_022119	ACT	2	6	30262	30267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423967
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652	NC_022119	AAAC	2	8	30379	30386	75 %	0 %	0 %	25 %	532423967
653	NC_022119	T	6	6	30396	30401	0 %	100 %	0 %	0 %	532423967
654	NC_022119	AAGGA	2	10	30405	30414	60 %	0 %	40 %	0 %	532423967
655	NC_022119	GGC	2	6	30432	30437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532423967
656	NC_022119	GAT	2	6	30511	30516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423967
657	NC_022119	GATG	2	8	30522	30529	25 %	25 %	50 %	0 %	532423967
658	NC_022119	TAG	2	6	30533	30538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423967
659	NC_022119	GTT	2	6	30607	30612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423967
660	NC_022119	TAA	2	6	30717	30722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423967
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667	NC_022119	ATT	2	6	31054	31059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423967
668	NC_022119	ATG	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423967
669	NC_022119	AAG	2	6	31189	31194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423967
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671	NC_022119	GA	3	6	31214	31219	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
672	NC_022119	A	7	7	31237	31243	100 %	0 %	0 %	0 %	532423967
673	NC_022119	ACA	2	6	31283	31288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423968
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675	NC_022119	T	6	6	31423	31428	0 %	100 %	0 %	0 %	532423968
676	NC_022119	GAGCT	2	10	31444	31453	20 %	20 %	40 %	20 %	532423968
677	NC_022119	A	6	6	31518	31523	100 %	0 %	0 %	0 %	532423968
678	NC_022119	A	6	6	31549	31554	100 %	0 %	0 %	0 %	532423968
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693	NC_022119	AAG	2	6	32406	32411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423969
694	NC_022119	ATT	2	6	32456	32461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423969
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696	NC_022119	GGA	2	6	32586	32591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423969
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702	NC_022119	CTG	2	6	33106	33111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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709	NC_022119	CTT	2	6	33479	33484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423971
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727	NC_022119	AAGA	3	12	34254	34265	75 %	0 %	25 %	0 %	532423972
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737	NC_022119	GA	4	8	34616	34623	50 %	0 %	50 %	0 %	532423973
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746	NC_022119	TCGA	2	8	35143	35150	25 %	25 %	25 %	25 %	532423974
747	NC_022119	GAG	2	6	35155	35160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423974
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750	NC_022119	TGCT	2	8	35296	35303	0 %	50 %	25 %	25 %	532423974
751	NC_022119	TG	3	6	35441	35446	0 %	50 %	50 %	0 %	532423974
752	NC_022119	GCA	2	6	35490	35495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423974
753	NC_022119	GAA	2	6	35519	35524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423974
754	NC_022119	TTGG	2	8	35528	35535	0 %	50 %	50 %	0 %	532423974
755	NC_022119	ATA	2	6	35572	35577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423974
756	NC_022119	CTT	2	6	35578	35583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423974
757	NC_022119	TCAGT	2	10	35684	35693	20 %	40 %	20 %	20 %	532423974
758	NC_022119	TCT	2	6	35913	35918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423974
759	NC_022119	GGATTT	2	12	35936	35947	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532423974
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891	NC_022119	AAG	2	6	42252	42257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423978
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