MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022119	CTT	2	6	251585	251590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424147
5502	NC_022119	ACA	2	6	251601	251606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424147
5503	NC_022119	TC	3	6	251643	251648	0 %	50 %	0 %	50 %	532424147
5504	NC_022119	TTG	2	6	251700	251705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424147
5505	NC_022119	TCT	2	6	251722	251727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424147
5506	NC_022119	T	7	7	251762	251768	0 %	100 %	0 %	0 %	532424147
5507	NC_022119	CAA	2	6	251779	251784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424147
5508	NC_022119	AGA	3	9	251852	251860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424147
5509	NC_022119	GGC	2	6	251863	251868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424147
5510	NC_022119	ACA	2	6	251893	251898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424147
5511	NC_022119	CAC	2	6	251900	251905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424147
5512	NC_022119	CAG	2	6	251906	251911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424147
5513	NC_022119	T	8	8	251975	251982	0 %	100 %	0 %	0 %	532424147
5514	NC_022119	TCC	2	6	252066	252071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424147
5515	NC_022119	GAAA	2	8	252087	252094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_022119	T	7	7	252108	252114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_022119	GCAG	2	8	252136	252143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_022119	AGAA	2	8	252169	252176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_022119	AG	3	6	252211	252216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_022119	TAT	2	6	252234	252239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_022119	ACA	2	6	252275	252280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_022119	A	6	6	252324	252329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_022119	TTG	2	6	252504	252509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424148
5524	NC_022119	TCT	2	6	252526	252531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424148
5525	NC_022119	TC	3	6	252573	252578	0 %	50 %	0 %	50 %	532424148
5526	NC_022119	T	7	7	252609	252615	0 %	100 %	0 %	0 %	532424148
5527	NC_022119	CCA	2	6	252622	252627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424148
5528	NC_022119	AAC	2	6	252675	252680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424148
5529	NC_022119	AATA	2	8	252729	252736	75 %	25 %	0 %	0 %	532424148
5530	NC_022119	GCT	2	6	252739	252744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424148
5531	NC_022119	ACA	2	6	252804	252809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424148
5532	NC_022119	CCA	2	6	252836	252841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424148
5533	NC_022119	CAA	2	6	252884	252889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424148
5534	NC_022119	CCCA	2	8	252992	252999	25 %	0 %	0 %	75 %	532424149
5535	NC_022119	CTT	2	6	253121	253126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424149
5536	NC_022119	AAT	2	6	253200	253205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424149
5537	NC_022119	CTC	2	6	253211	253216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424149
5538	NC_022119	ACT	2	6	253219	253224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424149
5539	NC_022119	GAA	2	6	253237	253242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424149
5540	NC_022119	CTC	2	6	253268	253273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424149
5541	NC_022119	GCAA	2	8	253282	253289	50 %	0 %	25 %	25 %	532424149
5542	NC_022119	AAC	2	6	253299	253304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424149
5543	NC_022119	GTT	2	6	253344	253349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424149
5544	NC_022119	AAC	2	6	253383	253388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_022119	A	6	6	253397	253402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_022119	TAA	2	6	253448	253453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_022119	TTC	2	6	253466	253471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424150
5548	NC_022119	GCT	2	6	253498	253503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424150
5549	NC_022119	T	7	7	253507	253513	0 %	100 %	0 %	0 %	532424150
5550	NC_022119	AGCA	2	8	253544	253551	50 %	0 %	25 %	25 %	532424150
5551	NC_022119	CTT	2	6	253561	253566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424150
5552	NC_022119	TCT	3	9	253572	253580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424150
5553	NC_022119	GATAA	2	10	253600	253609	60 %	20 %	20 %	0 %	532424150
5554	NC_022119	TCG	2	6	253666	253671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424150
5555	NC_022119	CATA	2	8	253687	253694	50 %	25 %	0 %	25 %	532424150
5556	NC_022119	TCC	2	6	253706	253711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424150
5557	NC_022119	TAA	2	6	253739	253744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424150
5558	NC_022119	AG	3	6	253764	253769	50 %	0 %	50 %	0 %	532424150
5559	NC_022119	A	6	6	253783	253788	100 %	0 %	0 %	0 %	532424150
5560	NC_022119	AGA	2	6	253794	253799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424150
5561	NC_022119	CAC	2	6	253801	253806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424150
5562	NC_022119	CAA	2	6	253847	253852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424150
5563	NC_022119	GTA	2	6	253869	253874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424150
5564	NC_022119	ACA	2	6	253928	253933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424150
5565	NC_022119	A	8	8	253968	253975	100 %	0 %	0 %	0 %	532424150
5566	NC_022119	TA	3	6	254017	254022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_022119	CCAA	2	8	254052	254059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_022119	A	7	7	254076	254082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_022119	TAT	2	6	254095	254100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_022119	TTCA	2	8	254127	254134	25 %	50 %	0 %	25 %	532424151
5571	NC_022119	AGA	2	6	254163	254168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424151
5572	NC_022119	TGTT	2	8	254201	254208	0 %	75 %	25 %	0 %	532424151
5573	NC_022119	CGA	2	6	254322	254327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424151
5574	NC_022119	GCAAA	2	10	254334	254343	60 %	0 %	20 %	20 %	532424151
5575	NC_022119	AATA	2	8	254420	254427	75 %	25 %	0 %	0 %	532424151
5576	NC_022119	A	6	6	254486	254491	100 %	0 %	0 %	0 %	532424151
5577	NC_022119	A	7	7	254517	254523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_022119	ATA	2	6	254530	254535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_022119	AACCCT	2	12	254576	254587	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_022119	AAAC	2	8	254659	254666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_022119	AAG	2	6	254783	254788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424152
5582	NC_022119	AGC	2	6	254817	254822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424152
5583	NC_022119	CAAT	2	8	254923	254930	50 %	25 %	0 %	25 %	532424152
5584	NC_022119	TTA	2	6	254995	255000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424152
5585	NC_022119	CTTCT	2	10	255027	255036	0 %	60 %	0 %	40 %	532424152
5586	NC_022119	T	6	6	255070	255075	0 %	100 %	0 %	0 %	532424152
5587	NC_022119	CA	3	6	255129	255134	50 %	0 %	0 %	50 %	532424152
5588	NC_022119	AAT	2	6	255144	255149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424152
5589	NC_022119	GCA	2	6	255154	255159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424152
5590	NC_022119	ACA	2	6	255220	255225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424152
5591	NC_022119	TTG	2	6	255284	255289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424152
5592	NC_022119	AGA	2	6	255339	255344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424152
5593	NC_022119	TAG	2	6	255359	255364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424152
5594	NC_022119	ATTTTT	2	12	255380	255391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_022119	GAG	2	6	255508	255513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_022119	ATT	2	6	255520	255525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_022119	T	6	6	255524	255529	0 %	100 %	0 %	0 %	532424153
5598	NC_022119	ACG	2	6	255530	255535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5599	NC_022119	CCTGCA	2	12	255541	255552	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532424153
5600	NC_022119	CTG	2	6	255598	255603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5601	NC_022119	TTG	2	6	255629	255634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424153
5602	NC_022119	TCTG	2	8	255654	255661	0 %	50 %	25 %	25 %	532424153
5603	NC_022119	TCC	2	6	255684	255689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424153
5604	NC_022119	TTC	2	6	255740	255745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424153
5605	NC_022119	CGA	2	6	255774	255779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5606	NC_022119	TTC	2	6	255821	255826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424153
5607	NC_022119	ACG	2	6	255881	255886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5608	NC_022119	AACC	2	8	255925	255932	50 %	0 %	0 %	50 %	532424153
5609	NC_022119	AAG	2	6	255958	255963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424153
5610	NC_022119	CTG	2	6	255982	255987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5611	NC_022119	GCT	2	6	256110	256115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5612	NC_022119	ATTT	2	8	256167	256174	25 %	75 %	0 %	0 %	532424153
5613	NC_022119	TAT	2	6	256212	256217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_022119	ATA	2	6	256221	256226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_022119	AAT	2	6	256245	256250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_022119	A	8	8	256325	256332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_022119	TC	3	6	256333	256338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_022119	TC	3	6	256419	256424	0 %	50 %	0 %	50 %	532424154
5619	NC_022119	A	6	6	256428	256433	100 %	0 %	0 %	0 %	532424154
5620	NC_022119	ATG	2	6	256439	256444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424154
5621	NC_022119	ATCT	2	8	256488	256495	25 %	50 %	0 %	25 %	532424154
5622	NC_022119	T	7	7	256530	256536	0 %	100 %	0 %	0 %	532424154
5623	NC_022119	GCT	2	6	256540	256545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424154
5624	NC_022119	CTT	2	6	256550	256555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5625	NC_022119	T	6	6	256571	256576	0 %	100 %	0 %	0 %	532424154
5626	NC_022119	CT	4	8	256639	256646	0 %	50 %	0 %	50 %	532424154
5627	NC_022119	TTA	2	6	256704	256709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424154
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5747	NC_022119	A	6	6	261943	261948	100 %	0 %	0 %	0 %	532424158
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5983	NC_022119	T	7	7	273261	273267	0 %	100 %	0 %	0 %	532424168
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5996	NC_022119	T	7	7	273813	273819	0 %	100 %	0 %	0 %	532424169
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6000	NC_022119	TG	3	6	273937	273942	0 %	50 %	50 %	0 %	532424169

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