MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022118	AGA	2	6	182920	182925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
4002	NC_022118	GCA	2	6	182929	182934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422681
4003	NC_022118	GAA	2	6	182957	182962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
4004	NC_022118	AGA	2	6	182996	183001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
4005	NC_022118	GA	3	6	183035	183040	50 %	0 %	50 %	0 %	532422681
4006	NC_022118	GTT	2	6	183052	183057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422681
4007	NC_022118	GTT	2	6	183087	183092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422681
4008	NC_022118	CTT	2	6	183095	183100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422681
4009	NC_022118	GA	3	6	183138	183143	50 %	0 %	50 %	0 %	532422681
4010	NC_022118	GTT	2	6	183149	183154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422681
4011	NC_022118	GAG	2	6	183170	183175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422681
4012	NC_022118	GAA	2	6	183190	183195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
4013	NC_022118	TTG	2	6	183201	183206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422681
4014	NC_022118	AGG	2	6	183240	183245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422681
4015	NC_022118	AGA	2	6	183336	183341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
4016	NC_022118	TGA	2	6	183358	183363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422681
4017	NC_022118	CAG	3	9	183431	183439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422681
4018	NC_022118	GTA	2	6	183474	183479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422681
4019	NC_022118	GTTG	2	8	183514	183521	0 %	50 %	50 %	0 %	532422681
4020	NC_022118	GGA	3	9	183529	183537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422681
4021	NC_022118	TC	3	6	183545	183550	0 %	50 %	0 %	50 %	532422681
4022	NC_022118	ATT	2	6	183564	183569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422681
4023	NC_022118	A	7	7	183594	183600	100 %	0 %	0 %	0 %	532422681
4024	NC_022118	T	8	8	183606	183613	0 %	100 %	0 %	0 %	532422681
4025	NC_022118	ATA	2	6	183656	183661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422681
4026	NC_022118	A	6	6	183661	183666	100 %	0 %	0 %	0 %	532422681
4027	NC_022118	TAT	2	6	183737	183742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_022118	GA	3	6	183777	183782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_022118	AGA	2	6	183819	183824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_022118	TGT	2	6	183878	183883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421971
4031	NC_022118	TCT	3	9	183947	183955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421971
4032	NC_022118	TTTC	2	8	184020	184027	0 %	75 %	0 %	25 %	532421971
4033	NC_022118	CTG	2	6	184068	184073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421971
4034	NC_022118	GGA	2	6	184095	184100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421971
4035	NC_022118	TAG	2	6	184120	184125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421971
4036	NC_022118	AGT	2	6	184250	184255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421971
4037	NC_022118	ATCG	2	8	184277	184284	25 %	25 %	25 %	25 %	532421971
4038	NC_022118	TCA	2	6	184360	184365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421972
4039	NC_022118	GGA	2	6	184375	184380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421972
4040	NC_022118	AGAGA	2	10	184468	184477	60 %	0 %	40 %	0 %	532421972
4041	NC_022118	GCA	2	6	184564	184569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421972
4042	NC_022118	TTA	2	6	184861	184866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421972
4043	NC_022118	GAA	2	6	184930	184935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421972
4044	NC_022118	ATA	2	6	184990	184995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421972
4045	NC_022118	TCTA	2	8	185031	185038	25 %	50 %	0 %	25 %	532421972
4046	NC_022118	GTT	2	6	185099	185104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_022118	TGC	2	6	185232	185237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421973
4048	NC_022118	CA	3	6	185253	185258	50 %	0 %	0 %	50 %	532421973
4049	NC_022118	AGA	2	6	185368	185373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421973
4050	NC_022118	GTT	4	12	185497	185508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_022118	T	6	6	185514	185519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_022118	T	7	7	185522	185528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_022118	T	6	6	185534	185539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_022118	T	7	7	185584	185590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_022118	A	7	7	185606	185612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_022118	T	6	6	185629	185634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_022118	T	7	7	185724	185730	0 %	100 %	0 %	0 %	532421974
4058	NC_022118	TCT	2	6	185748	185753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
4059	NC_022118	TG	3	6	185758	185763	0 %	50 %	50 %	0 %	532421974
4060	NC_022118	GTC	2	6	185849	185854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421974
4061	NC_022118	ATT	2	6	185919	185924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421974
4062	NC_022118	TCT	2	6	185938	185943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
4063	NC_022118	CTT	2	6	185954	185959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
4064	NC_022118	AAGC	2	8	185992	185999	50 %	0 %	25 %	25 %	532421974
4065	NC_022118	GAA	2	6	186022	186027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421974
4066	NC_022118	AAC	2	6	186099	186104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421974
4067	NC_022118	TA	3	6	186176	186181	50 %	50 %	0 %	0 %	532421974
4068	NC_022118	CTT	2	6	186197	186202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
4069	NC_022118	TAG	2	6	186203	186208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421974
4070	NC_022118	CAT	2	6	186247	186252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421974
4071	NC_022118	T	6	6	186254	186259	0 %	100 %	0 %	0 %	532421974
4072	NC_022118	GCTT	2	8	186273	186280	0 %	50 %	25 %	25 %	532421974
4073	NC_022118	CAC	2	6	186305	186310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421974
4074	NC_022118	GAA	2	6	186340	186345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421974
4075	NC_022118	AAG	2	6	186446	186451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421974
4076	NC_022118	TGT	2	6	186468	186473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421974
4077	NC_022118	ACGAT	2	10	186540	186549	40 %	20 %	20 %	20 %	532421974
4078	NC_022118	TTTA	2	8	186558	186565	25 %	75 %	0 %	0 %	532421974
4079	NC_022118	AAG	2	6	186569	186574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421974
4080	NC_022118	AGA	2	6	186654	186659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421974
4081	NC_022118	CTT	2	6	186691	186696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
4082	NC_022118	A	6	6	186709	186714	100 %	0 %	0 %	0 %	532421974
4083	NC_022118	AGG	2	6	186737	186742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421974
4084	NC_022118	GCTT	2	8	186765	186772	0 %	50 %	25 %	25 %	532421974
4085	NC_022118	T	7	7	186771	186777	0 %	100 %	0 %	0 %	532421974
4086	NC_022118	A	6	6	186812	186817	100 %	0 %	0 %	0 %	532421974
4087	NC_022118	GCT	2	6	186901	186906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421974
4088	NC_022118	TTC	2	6	187080	187085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
4089	NC_022118	GCTT	2	8	187206	187213	0 %	50 %	25 %	25 %	532421974
4090	NC_022118	TAG	2	6	187244	187249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421974
4091	NC_022118	GAT	2	6	187282	187287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421974
4092	NC_022118	T	7	7	187287	187293	0 %	100 %	0 %	0 %	532421974
4093	NC_022118	TTA	2	6	187317	187322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421974
4094	NC_022118	ATC	2	6	187324	187329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421974
4095	NC_022118	CGATA	2	10	187352	187361	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4096	NC_022118	T	6	6	187365	187370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_022118	TCC	2	6	187385	187390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_022118	ACA	3	9	187391	187399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_022118	AGT	2	6	187409	187414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_022118	AAAC	2	8	187434	187441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_022118	TGC	2	6	187500	187505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_022118	AGT	2	6	187568	187573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_022118	AGT	2	6	187591	187596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_022118	TTG	2	6	187599	187604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_022118	TAT	2	6	187679	187684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_022118	T	6	6	187698	187703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_022118	GCA	2	6	187751	187756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_022118	CTT	2	6	187766	187771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_022118	GGAC	2	8	187793	187800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_022118	AAG	2	6	187903	187908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_022118	TTG	2	6	187925	187930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022118	CAT	2	6	187935	187940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_022118	T	7	7	187974	187980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_022118	TAA	2	6	188053	188058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_022118	TTG	2	6	188081	188086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_022118	CTC	2	6	188156	188161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_022118	CAC	2	6	188202	188207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_022118	TAC	2	6	188283	188288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_022118	CAT	2	6	188299	188304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_022118	GGT	2	6	188346	188351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_022118	CCT	2	6	188407	188412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422682
4122	NC_022118	CCT	2	6	188422	188427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422682
4123	NC_022118	CTC	2	6	188515	188520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422682
4124	NC_022118	TTA	2	6	188539	188544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422682
4125	NC_022118	CGTA	2	8	188562	188569	25 %	25 %	25 %	25 %	532422682
4126	NC_022118	G	10	10	188581	188590	0 %	0 %	100 %	0 %	532422682
4127	NC_022118	TCC	2	6	188615	188620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422682
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4132	NC_022118	GGA	2	6	188669	188674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422682
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4136	NC_022118	CAA	2	6	188871	188876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422683
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4157	NC_022118	GTAT	2	8	189757	189764	25 %	50 %	25 %	0 %	532422683
4158	NC_022118	GGA	2	6	189770	189775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422683
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4200	NC_022118	TGT	2	6	192248	192253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4209	NC_022118	GTT	2	6	192616	192621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422686
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4234	NC_022118	ACTC	2	8	193795	193802	25 %	25 %	0 %	50 %	532421976
4235	NC_022118	GATTA	2	10	193814	193823	40 %	40 %	20 %	0 %	532421976
4236	NC_022118	T	6	6	193911	193916	0 %	100 %	0 %	0 %	532421976
4237	NC_022118	ATT	2	6	193939	193944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421976
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4240	NC_022118	GGC	2	6	194176	194181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421977
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4243	NC_022118	TA	3	6	194367	194372	50 %	50 %	0 %	0 %	532421977
4244	NC_022118	CTA	2	6	194374	194379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421977
4245	NC_022118	GT	3	6	194442	194447	0 %	50 %	50 %	0 %	532421977
4246	NC_022118	T	6	6	194495	194500	0 %	100 %	0 %	0 %	532421977
4247	NC_022118	TAT	2	6	194603	194608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421977
4248	NC_022118	GA	3	6	194626	194631	50 %	0 %	50 %	0 %	532421977
4249	NC_022118	AGA	2	6	194650	194655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421977
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4251	NC_022118	A	6	6	194717	194722	100 %	0 %	0 %	0 %	532421977
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4381	NC_022118	CTA	2	6	200136	200141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421982
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4500	NC_022118	CT	3	6	206191	206196	0 %	50 %	0 %	50 %	532421988

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