MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022118	GGA	2	6	159633	159638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421957
3502	NC_022118	AGGAA	2	10	159662	159671	60 %	0 %	40 %	0 %	532421957
3503	NC_022118	TAG	2	6	159692	159697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421957
3504	NC_022118	AGG	2	6	159698	159703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421957
3505	NC_022118	CTG	2	6	159718	159723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421957
3506	NC_022118	AG	3	6	159749	159754	50 %	0 %	50 %	0 %	532421957
3507	NC_022118	TCT	2	6	159777	159782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421957
3508	NC_022118	AGG	2	6	159896	159901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421957
3509	NC_022118	GAA	2	6	159909	159914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421957
3510	NC_022118	AGA	2	6	159957	159962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421958
3511	NC_022118	ATAC	2	8	160081	160088	50 %	25 %	0 %	25 %	532421958
3512	NC_022118	AGG	2	6	160107	160112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421958
3513	NC_022118	AGG	2	6	160122	160127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421958
3514	NC_022118	CT	3	6	160220	160225	0 %	50 %	0 %	50 %	532421958
3515	NC_022118	GA	3	6	160230	160235	50 %	0 %	50 %	0 %	532421958
3516	NC_022118	ATT	2	6	160250	160255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421958
3517	NC_022118	ATA	2	6	160346	160351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421958
3518	NC_022118	AC	3	6	160370	160375	50 %	0 %	0 %	50 %	532421958
3519	NC_022118	A	8	8	160415	160422	100 %	0 %	0 %	0 %	532421958
3520	NC_022118	ATG	2	6	160496	160501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421958
3521	NC_022118	TCT	2	6	160511	160516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421958
3522	NC_022118	TTC	2	6	160725	160730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421958
3523	NC_022118	AGG	2	6	160736	160741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421958
3524	NC_022118	ATA	3	9	160762	160770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421959
3525	NC_022118	AACAGC	2	12	160865	160876	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532421959
3526	NC_022118	AGT	2	6	160908	160913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421959
3527	NC_022118	TGG	2	6	160994	160999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421959
3528	NC_022118	TC	3	6	161321	161326	0 %	50 %	0 %	50 %	532421959
3529	NC_022118	A	6	6	161339	161344	100 %	0 %	0 %	0 %	532421959
3530	NC_022118	CTG	2	6	161407	161412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421959
3531	NC_022118	GCG	2	6	161423	161428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421959
3532	NC_022118	ACA	2	6	161469	161474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421959
3533	NC_022118	GCA	2	6	161493	161498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421959
3534	NC_022118	CTT	2	6	161512	161517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421959
3535	NC_022118	ATTG	2	8	161531	161538	25 %	50 %	25 %	0 %	532421959
3536	NC_022118	TCT	2	6	161562	161567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421959
3537	NC_022118	CT	4	8	161566	161573	0 %	50 %	0 %	50 %	532421959
3538	NC_022118	TGT	2	6	161594	161599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421959
3539	NC_022118	GCTT	2	8	161635	161642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_022118	CAAAA	2	10	161665	161674	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_022118	TGT	2	6	161687	161692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_022118	GAG	2	6	161786	161791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_022118	TGG	2	6	162009	162014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421960
3544	NC_022118	TGT	2	6	162052	162057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421960
3545	NC_022118	GAA	2	6	162062	162067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421960
3546	NC_022118	GGAA	2	8	162104	162111	50 %	0 %	50 %	0 %	532421960
3547	NC_022118	GAA	3	9	162119	162127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421960
3548	NC_022118	TTTC	2	8	162222	162229	0 %	75 %	0 %	25 %	532421960
3549	NC_022118	ATCT	2	8	162248	162255	25 %	50 %	0 %	25 %	532421960
3550	NC_022118	CTT	2	6	162273	162278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421960
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3552	NC_022118	GA	3	6	162327	162332	50 %	0 %	50 %	0 %	532421960
3553	NC_022118	TTG	2	6	162353	162358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421960
3554	NC_022118	GAA	2	6	162374	162379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421960
3555	NC_022118	TTA	2	6	162430	162435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421960
3556	NC_022118	TAG	2	6	162441	162446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421960
3557	NC_022118	GTT	2	6	162528	162533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421960
3558	NC_022118	ACA	3	9	162535	162543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421960
3559	NC_022118	AGA	2	6	162655	162660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421960
3560	NC_022118	TG	3	6	162714	162719	0 %	50 %	50 %	0 %	532421960
3561	NC_022118	AGC	2	6	162732	162737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421960
3562	NC_022118	TAG	2	6	162750	162755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421960
3563	NC_022118	TCGA	2	8	162764	162771	25 %	25 %	25 %	25 %	532421960
3564	NC_022118	AGAGA	2	10	162893	162902	60 %	0 %	40 %	0 %	532421960
3565	NC_022118	ATT	2	6	162916	162921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421960
3566	NC_022118	GAGG	2	8	162941	162948	25 %	0 %	75 %	0 %	532421960
3567	NC_022118	TC	3	6	162954	162959	0 %	50 %	0 %	50 %	532421960
3568	NC_022118	TGT	2	6	163186	163191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421960
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3570	NC_022118	TTG	2	6	163225	163230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421960
3571	NC_022118	AGC	2	6	163270	163275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421960
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3574	NC_022118	AGCAA	2	10	163328	163337	60 %	0 %	20 %	20 %	532421960
3575	NC_022118	TAC	2	6	163354	163359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421960
3576	NC_022118	TGGC	2	8	163404	163411	0 %	25 %	50 %	25 %	532421960
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3578	NC_022118	GT	3	6	163512	163517	0 %	50 %	50 %	0 %	532421960
3579	NC_022118	GAG	2	6	163521	163526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421960
3580	NC_022118	GAT	2	6	163547	163552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421960
3581	NC_022118	AAT	2	6	163577	163582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421960
3582	NC_022118	GAT	2	6	163665	163670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421961
3583	NC_022118	TAT	2	6	163713	163718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421961
3584	NC_022118	TCAA	2	8	163723	163730	50 %	25 %	0 %	25 %	532421961
3585	NC_022118	CGA	2	6	163732	163737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421961
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3588	NC_022118	T	7	7	163929	163935	0 %	100 %	0 %	0 %	532421961
3589	NC_022118	ATT	2	6	163949	163954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421961
3590	NC_022118	GAG	2	6	164152	164157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421961
3591	NC_022118	TTTC	2	8	164163	164170	0 %	75 %	0 %	25 %	532421961
3592	NC_022118	GGA	2	6	164250	164255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421961
3593	NC_022118	TCT	2	6	164271	164276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421961
3594	NC_022118	GCT	2	6	164283	164288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421961
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3598	NC_022118	GC	3	6	164459	164464	0 %	0 %	50 %	50 %	532421961
3599	NC_022118	GTC	2	6	164490	164495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421961
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3601	NC_022118	T	7	7	164668	164674	0 %	100 %	0 %	0 %	532421961
3602	NC_022118	A	8	8	164725	164732	100 %	0 %	0 %	0 %	532421961
3603	NC_022118	AGG	2	6	164768	164773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421961
3604	NC_022118	TTG	2	6	164791	164796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421961
3605	NC_022118	AG	3	6	164822	164827	50 %	0 %	50 %	0 %	532421961
3606	NC_022118	TGT	2	6	164873	164878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421961
3607	NC_022118	G	6	6	164922	164927	0 %	0 %	100 %	0 %	532421961
3608	NC_022118	GA	3	6	164986	164991	50 %	0 %	50 %	0 %	532421961
3609	NC_022118	ATT	2	6	165005	165010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421961
3610	NC_022118	AT	3	6	165040	165045	50 %	50 %	0 %	0 %	532421961
3611	NC_022118	AGA	3	9	165056	165064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421961
3612	NC_022118	CTT	2	6	165244	165249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421961
3613	NC_022118	ATCG	2	8	165296	165303	25 %	25 %	25 %	25 %	532421961
3614	NC_022118	TTC	2	6	165309	165314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421961
3615	NC_022118	AG	3	6	165330	165335	50 %	0 %	50 %	0 %	532421961
3616	NC_022118	TCG	2	6	165341	165346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421961
3617	NC_022118	TTCT	2	8	165370	165377	0 %	75 %	0 %	25 %	532421961
3618	NC_022118	G	6	6	165483	165488	0 %	0 %	100 %	0 %	532421961
3619	NC_022118	A	6	6	165558	165563	100 %	0 %	0 %	0 %	532421961
3620	NC_022118	ATT	2	6	165602	165607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421961
3621	NC_022118	T	7	7	165646	165652	0 %	100 %	0 %	0 %	532421961
3622	NC_022118	CTTC	2	8	165706	165713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_022118	CTTT	2	8	165775	165782	0 %	75 %	0 %	25 %	532421962
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3718	NC_022118	TTAG	2	8	170114	170121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3736	NC_022118	TTC	2	6	171063	171068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421963
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3739	NC_022118	GAG	2	6	171141	171146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421963
3740	NC_022118	TC	3	6	171206	171211	0 %	50 %	0 %	50 %	532421963
3741	NC_022118	AATA	2	8	171249	171256	75 %	25 %	0 %	0 %	532421963
3742	NC_022118	TAA	2	6	171360	171365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421963
3743	NC_022118	TGA	2	6	171387	171392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421963
3744	NC_022118	TTGA	2	8	171393	171400	25 %	50 %	25 %	0 %	532421963
3745	NC_022118	GTT	2	6	171419	171424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421963
3746	NC_022118	AAG	2	6	171495	171500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421963
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