MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022118	ATT	2	6	114015	114020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_022118	AGA	2	6	114043	114048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421915
2503	NC_022118	TTC	3	9	114049	114057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2504	NC_022118	AG	3	6	114169	114174	50 %	0 %	50 %	0 %	532421915
2505	NC_022118	TAC	2	6	114283	114288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421915
2506	NC_022118	T	7	7	114372	114378	0 %	100 %	0 %	0 %	532421915
2507	NC_022118	CTTT	2	8	114380	114387	0 %	75 %	0 %	25 %	532421915
2508	NC_022118	ACAG	2	8	114392	114399	50 %	0 %	25 %	25 %	532421915
2509	NC_022118	T	6	6	114424	114429	0 %	100 %	0 %	0 %	532421915
2510	NC_022118	T	6	6	114454	114459	0 %	100 %	0 %	0 %	532421915
2511	NC_022118	CTG	2	6	114549	114554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421915
2512	NC_022118	TTC	2	6	114580	114585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2513	NC_022118	TGTTT	2	10	114605	114614	0 %	80 %	20 %	0 %	532421915
2514	NC_022118	GA	4	8	114625	114632	50 %	0 %	50 %	0 %	532421915
2515	NC_022118	AGAA	2	8	114655	114662	75 %	0 %	25 %	0 %	532421915
2516	NC_022118	ACT	2	6	114665	114670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421915
2517	NC_022118	TCA	2	6	114677	114682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421915
2518	NC_022118	TTG	2	6	114686	114691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421915
2519	NC_022118	CTT	2	6	114762	114767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2520	NC_022118	AAGG	2	8	114789	114796	50 %	0 %	50 %	0 %	532421915
2521	NC_022118	GGA	2	6	114830	114835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421915
2522	NC_022118	TCT	2	6	114840	114845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2523	NC_022118	TTTG	2	8	114873	114880	0 %	75 %	25 %	0 %	532421915
2524	NC_022118	GAT	2	6	114922	114927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421915
2525	NC_022118	CATGT	2	10	114983	114992	20 %	40 %	20 %	20 %	532421915
2526	NC_022118	TCT	2	6	115144	115149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2527	NC_022118	ACA	2	6	115154	115159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421915
2528	NC_022118	CGA	2	6	115166	115171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421915
2529	NC_022118	ATC	2	6	115219	115224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421915
2530	NC_022118	TCT	2	6	115236	115241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2531	NC_022118	GGAA	2	8	115262	115269	50 %	0 %	50 %	0 %	532421915
2532	NC_022118	ACC	2	6	115297	115302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421915
2533	NC_022118	TTG	2	6	115383	115388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421915
2534	NC_022118	AAC	2	6	115405	115410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421915
2535	NC_022118	ACTTCG	2	12	115445	115456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532421915
2536	NC_022118	ACA	3	9	115535	115543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421915
2537	NC_022118	CAA	2	6	115560	115565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421915
2538	NC_022118	TTC	3	9	115609	115617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2539	NC_022118	TCT	2	6	115670	115675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2540	NC_022118	AAGC	2	8	115679	115686	50 %	0 %	25 %	25 %	532421915
2541	NC_022118	TATCG	2	10	115687	115696	20 %	40 %	20 %	20 %	532421915
2542	NC_022118	T	6	6	115703	115708	0 %	100 %	0 %	0 %	532421915
2543	NC_022118	ATG	2	6	115744	115749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421915
2544	NC_022118	AGT	2	6	115778	115783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_022118	A	6	6	115799	115804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_022118	TAA	2	6	115830	115835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_022118	A	7	7	115852	115858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_022118	TTTTAG	2	12	115880	115891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_022118	TG	3	6	115896	115901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_022118	GGTT	2	8	116011	116018	0 %	50 %	50 %	0 %	532421916
2551	NC_022118	T	7	7	116027	116033	0 %	100 %	0 %	0 %	532421916
2552	NC_022118	GCT	2	6	116153	116158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2553	NC_022118	TTTCT	2	10	116203	116212	0 %	80 %	0 %	20 %	532421916
2554	NC_022118	ACA	2	6	116240	116245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421916
2555	NC_022118	TAT	2	6	116428	116433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421916
2556	NC_022118	TATC	2	8	116460	116467	25 %	50 %	0 %	25 %	532421916
2557	NC_022118	TTTG	2	8	116557	116564	0 %	75 %	25 %	0 %	532421916
2558	NC_022118	AGG	3	9	116569	116577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421916
2559	NC_022118	AGA	2	6	116590	116595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421916
2560	NC_022118	GA	3	6	116644	116649	50 %	0 %	50 %	0 %	532421916
2561	NC_022118	A	6	6	116697	116702	100 %	0 %	0 %	0 %	532421916
2562	NC_022118	GTTC	2	8	116753	116760	0 %	50 %	25 %	25 %	532421916
2563	NC_022118	TAA	2	6	116773	116778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421916
2564	NC_022118	ACC	2	6	116789	116794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421916
2565	NC_022118	GCT	2	6	116807	116812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2566	NC_022118	AGG	2	6	116857	116862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421916
2567	NC_022118	ATT	2	6	116891	116896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421916
2568	NC_022118	TTC	2	6	116908	116913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421916
2569	NC_022118	TGC	2	6	116938	116943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2570	NC_022118	CTG	2	6	116985	116990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2571	NC_022118	GCA	2	6	117190	117195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421917
2572	NC_022118	TGC	2	6	117201	117206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421917
2573	NC_022118	AAG	2	6	117209	117214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421917
2574	NC_022118	GAAA	2	8	117261	117268	75 %	0 %	25 %	0 %	532421917
2575	NC_022118	GTT	2	6	117304	117309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421917
2576	NC_022118	TAT	2	6	117320	117325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421917
2577	NC_022118	TCC	2	6	117347	117352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421917
2578	NC_022118	TAA	3	9	117410	117418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421917
2579	NC_022118	AGA	2	6	117493	117498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422674
2580	NC_022118	AGC	2	6	117515	117520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422674
2581	NC_022118	TTG	2	6	117525	117530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422674
2582	NC_022118	CAA	2	6	117541	117546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422674
2583	NC_022118	AGA	2	6	117547	117552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422674
2584	NC_022118	AAG	2	6	117593	117598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422675
2585	NC_022118	TAA	2	6	117606	117611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422675
2586	NC_022118	T	6	6	117627	117632	0 %	100 %	0 %	0 %	532422675
2587	NC_022118	CA	3	6	117814	117819	50 %	0 %	0 %	50 %	532422675
2588	NC_022118	ATC	2	6	117862	117867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422675
2589	NC_022118	T	6	6	117876	117881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_022118	TAA	2	6	117933	117938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_022118	AT	3	6	118020	118025	50 %	50 %	0 %	0 %	532421918
2592	NC_022118	T	6	6	118030	118035	0 %	100 %	0 %	0 %	532421918
2593	NC_022118	AGA	3	9	118036	118044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421918
2594	NC_022118	CTTT	2	8	118073	118080	0 %	75 %	0 %	25 %	532421918
2595	NC_022118	GTAG	2	8	118118	118125	25 %	25 %	50 %	0 %	532421918
2596	NC_022118	G	6	6	118166	118171	0 %	0 %	100 %	0 %	532421918
2597	NC_022118	T	6	6	118189	118194	0 %	100 %	0 %	0 %	532421918
2598	NC_022118	GTT	2	6	118307	118312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421918
2599	NC_022118	GA	3	6	118316	118321	50 %	0 %	50 %	0 %	532421918
2600	NC_022118	TTA	2	6	118337	118342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421918
2601	NC_022118	TCC	2	6	118351	118356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421918
2602	NC_022118	A	8	8	118392	118399	100 %	0 %	0 %	0 %	532421918
2603	NC_022118	CTC	2	6	118407	118412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421918
2604	NC_022118	AAAGA	2	10	118448	118457	80 %	0 %	20 %	0 %	532421918
2605	NC_022118	AAT	2	6	118458	118463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421918
2606	NC_022118	AG	4	8	118482	118489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_022118	CTT	2	6	118490	118495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_022118	TTA	2	6	118512	118517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421919
2609	NC_022118	T	6	6	118617	118622	0 %	100 %	0 %	0 %	532421919
2610	NC_022118	TTC	2	6	118703	118708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421919
2611	NC_022118	TCC	2	6	118716	118721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421919
2612	NC_022118	TTTA	2	8	118734	118741	25 %	75 %	0 %	0 %	532421919
2613	NC_022118	CTG	2	6	118932	118937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421919
2614	NC_022118	AGA	2	6	118961	118966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421919
2615	NC_022118	TTGCCA	2	12	118984	118995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532421919
2616	NC_022118	GA	4	8	119007	119014	50 %	0 %	50 %	0 %	532421919
2617	NC_022118	GAA	2	6	119021	119026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421919
2618	NC_022118	TTC	2	6	119060	119065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421919
2619	NC_022118	TACT	2	8	119122	119129	25 %	50 %	0 %	25 %	532421919
2620	NC_022118	GTT	2	6	119166	119171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421919
2621	NC_022118	TAT	2	6	119201	119206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421919
2622	NC_022118	GAT	2	6	119217	119222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421919
2623	NC_022118	GAG	2	6	119248	119253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421919
2624	NC_022118	TC	3	6	119339	119344	0 %	50 %	0 %	50 %	532421919
2625	NC_022118	AG	3	6	119442	119447	50 %	0 %	50 %	0 %	532421920
2626	NC_022118	GCTA	2	8	119464	119471	25 %	25 %	25 %	25 %	532421920
2627	NC_022118	GA	3	6	119475	119480	50 %	0 %	50 %	0 %	532421920
2628	NC_022118	AAG	2	6	119483	119488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421920
2629	NC_022118	GCT	3	9	119489	119497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421920
2630	NC_022118	GTA	2	6	119548	119553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421920
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2632	NC_022118	TC	3	6	119563	119568	0 %	50 %	0 %	50 %	532421920
2633	NC_022118	GCTA	2	8	119596	119603	25 %	25 %	25 %	25 %	532421920
2634	NC_022118	CGGC	2	8	119645	119652	0 %	0 %	50 %	50 %	532421920
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2639	NC_022118	GA	4	8	119796	119803	50 %	0 %	50 %	0 %	532421920
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2642	NC_022118	TCT	2	6	120020	120025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421920
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2644	NC_022118	ATC	2	6	120223	120228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421920
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2646	NC_022118	GA	3	6	120304	120309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_022118	TAT	2	6	120328	120333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_022118	ATA	2	6	120349	120354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2649	NC_022118	CTGG	2	8	120372	120379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2650	NC_022118	TAAAAA	2	12	120476	120487	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_022118	TTGGTA	2	12	120524	120535	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532421921
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2682	NC_022118	TGA	2	6	122034	122039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421921
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2691	NC_022118	T	6	6	122585	122590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2708	NC_022118	T	6	6	123572	123577	0 %	100 %	0 %	0 %	532421923
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2710	NC_022118	GGGTTT	2	12	123673	123684	0 %	50 %	50 %	0 %	532421923
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2721	NC_022118	A	7	7	123973	123979	100 %	0 %	0 %	0 %	532421923
2722	NC_022118	CTG	2	6	123982	123987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421923
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2734	NC_022118	GA	3	6	124432	124437	50 %	0 %	50 %	0 %	532421923
2735	NC_022118	TAG	2	6	124451	124456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421923
2736	NC_022118	CTTC	2	8	124458	124465	0 %	50 %	0 %	50 %	532421923
2737	NC_022118	TCA	2	6	124578	124583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421923
2738	NC_022118	T	6	6	124607	124612	0 %	100 %	0 %	0 %	532421923
2739	NC_022118	ATAA	2	8	124660	124667	75 %	25 %	0 %	0 %	532421923
2740	NC_022118	T	6	6	124683	124688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2741	NC_022118	T	7	7	124708	124714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2742	NC_022118	TGAA	2	8	124745	124752	50 %	25 %	25 %	0 %	532421924
2743	NC_022118	TAA	2	6	125040	125045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421924
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2746	NC_022118	GAA	2	6	125211	125216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421924
2747	NC_022118	TCT	2	6	125224	125229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421924
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2749	NC_022118	TCA	2	6	125297	125302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421924
2750	NC_022118	TGA	2	6	125313	125318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421924
2751	NC_022118	T	6	6	125355	125360	0 %	100 %	0 %	0 %	532421924
2752	NC_022118	TTAA	2	8	125469	125476	50 %	50 %	0 %	0 %	532421924
2753	NC_022118	CTC	2	6	125547	125552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421925
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2762	NC_022118	AGA	2	6	125938	125943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421925
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2766	NC_022118	T	7	7	126205	126211	0 %	100 %	0 %	0 %	532421925
2767	NC_022118	TACAA	2	10	126226	126235	60 %	20 %	0 %	20 %	532421925
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2770	NC_022118	GCA	2	6	126440	126445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421926
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2775	NC_022118	TTG	2	6	126628	126633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421926
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2869	NC_022118	T	6	6	130525	130530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2870	NC_022118	TTTG	2	8	130815	130822	0 %	75 %	25 %	0 %	532421929
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