MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_022118	AGA	2	6	46963	46968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421865
1003	NC_022118	AGT	2	6	47048	47053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421865
1004	NC_022118	ATA	2	6	47123	47128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421865
1005	NC_022118	A	6	6	47304	47309	100 %	0 %	0 %	0 %	532421865
1006	NC_022118	GAA	2	6	47316	47321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421865
1007	NC_022118	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	532421865
1008	NC_022118	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	532421865
1009	NC_022118	GTT	2	6	47425	47430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421865
1010	NC_022118	GGT	2	6	47434	47439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421865
1011	NC_022118	T	6	6	47443	47448	0 %	100 %	0 %	0 %	532421865
1012	NC_022118	ATA	2	6	47451	47456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421865
1013	NC_022118	AGA	2	6	47804	47809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421865
1014	NC_022118	CTG	2	6	47861	47866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421865
1015	NC_022118	GAA	2	6	47874	47879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421865
1016	NC_022118	T	6	6	47912	47917	0 %	100 %	0 %	0 %	532421865
1017	NC_022118	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	532421865
1018	NC_022118	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	532421865
1019	NC_022118	TAA	2	6	47987	47992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421865
1020	NC_022118	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	532421865
1021	NC_022118	G	6	6	48021	48026	0 %	0 %	100 %	0 %	532421865
1022	NC_022118	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022118	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022118	CTG	2	6	48097	48102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421866
1025	NC_022118	GAG	2	6	48103	48108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421866
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1031	NC_022118	CTTT	2	8	48383	48390	0 %	75 %	0 %	25 %	532421866
1032	NC_022118	AAG	2	6	48413	48418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421866
1033	NC_022118	TTC	2	6	48449	48454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421866
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1040	NC_022118	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022118	T	8	8	48885	48892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022118	A	6	6	48936	48941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022118	T	6	6	49046	49051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_022118	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_022118	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_022118	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022118	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_022118	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022118	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022118	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1065	NC_022118	ATT	2	6	49831	49836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022118	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1072	NC_022118	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	532421868
1073	NC_022118	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	532421868
1074	NC_022118	A	6	6	50074	50079	100 %	0 %	0 %	0 %	532421868
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1095	NC_022118	ACG	2	6	51043	51048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421868
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1098	NC_022118	GCA	2	6	51169	51174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421868
1099	NC_022118	AGA	2	6	51281	51286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421868
1100	NC_022118	GTT	2	6	51325	51330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421868
1101	NC_022118	TCTA	2	8	51353	51360	25 %	50 %	0 %	25 %	532421868
1102	NC_022118	ATTAA	2	10	51381	51390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022118	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022118	TAA	2	6	51408	51413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022118	T	6	6	51432	51437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022118	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022118	GCA	2	6	51532	51537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421869
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1109	NC_022118	GTA	2	6	51564	51569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421869
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1111	NC_022118	A	6	6	51600	51605	100 %	0 %	0 %	0 %	532421869
1112	NC_022118	AAG	2	6	51630	51635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421869
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1115	NC_022118	AAG	2	6	51738	51743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421869
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1119	NC_022118	A	7	7	51876	51882	100 %	0 %	0 %	0 %	532421869
1120	NC_022118	AGC	2	6	51887	51892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421869
1121	NC_022118	CAA	2	6	51922	51927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421869
1122	NC_022118	A	7	7	51926	51932	100 %	0 %	0 %	0 %	532421869
1123	NC_022118	A	6	6	51966	51971	100 %	0 %	0 %	0 %	532421869
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1127	NC_022118	T	6	6	52173	52178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022118	TATT	2	8	52180	52187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022118	AAG	2	6	52207	52212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022118	AAT	2	6	52234	52239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022118	ATT	2	6	52246	52251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022118	CTA	2	6	52304	52309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421870
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1151	NC_022118	TCT	2	6	53320	53325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421871
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1283	NC_022118	T	8	8	58963	58970	0 %	100 %	0 %	0 %	532422666
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1336	NC_022118	AAAAAT	2	12	60889	60900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1389	NC_022118	AGTGA	2	10	63710	63719	40 %	20 %	40 %	0 %	532421876
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