MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022118	GCTT	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	532421842
502	NC_022118	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	532421842
503	NC_022118	TGC	2	6	23121	23126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421842
504	NC_022118	ATT	2	6	23173	23178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421842
505	NC_022118	AAT	2	6	23215	23220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421842
506	NC_022118	TTG	2	6	23278	23283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421842
507	NC_022118	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	532421842
508	NC_022118	TGC	2	6	23529	23534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421842
509	NC_022118	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	532421842
510	NC_022118	GCA	2	6	23635	23640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421842
511	NC_022118	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	532421842
512	NC_022118	AGA	2	6	23709	23714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421842
513	NC_022118	GAG	2	6	23732	23737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421842
514	NC_022118	TTC	2	6	23795	23800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421842
515	NC_022118	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	532421842
516	NC_022118	GA	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
517	NC_022118	GA	3	6	23923	23928	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
518	NC_022118	GAA	2	6	24054	24059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421842
519	NC_022118	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	532421842
520	NC_022118	GTT	2	6	24148	24153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421842
521	NC_022118	CTT	2	6	24242	24247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421842
522	NC_022118	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
523	NC_022118	TAA	2	6	24315	24320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421842
524	NC_022118	GAA	2	6	24335	24340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421842
525	NC_022118	AAG	2	6	24476	24481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421842
526	NC_022118	A	7	7	24561	24567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022118	TTA	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022118	T	9	9	24589	24597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022118	T	6	6	24621	24626	0 %	100 %	0 %	0 %	532421843
530	NC_022118	AGA	2	6	24748	24753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421843
531	NC_022118	TAA	2	6	24880	24885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421843
532	NC_022118	GGA	3	9	24912	24920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421843
533	NC_022118	GAT	2	6	24957	24962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421843
534	NC_022118	TTGA	2	8	25055	25062	25 %	50 %	25 %	0 %	532421843
535	NC_022118	TTCG	2	8	25200	25207	0 %	50 %	25 %	25 %	532421843
536	NC_022118	TAGG	2	8	25279	25286	25 %	25 %	50 %	0 %	532421843
537	NC_022118	TGT	2	6	25370	25375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421843
538	NC_022118	TTA	2	6	25380	25385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421843
539	NC_022118	TTCC	2	8	25403	25410	0 %	50 %	0 %	50 %	532421843
540	NC_022118	TAG	2	6	25441	25446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421843
541	NC_022118	GTGAGG	2	12	25475	25486	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532421843
542	NC_022118	TAGG	2	8	25517	25524	25 %	25 %	50 %	0 %	532421843
543	NC_022118	AGAGG	2	10	25533	25542	40 %	0 %	60 %	0 %	532421843
544	NC_022118	AGC	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421843
545	NC_022118	T	6	6	25568	25573	0 %	100 %	0 %	0 %	532421843
546	NC_022118	T	6	6	25599	25604	0 %	100 %	0 %	0 %	532421843
547	NC_022118	AAG	2	6	25705	25710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421843
548	NC_022118	GA	3	6	25721	25726	50 %	0 %	50 %	0 %	532421843
549	NC_022118	GT	3	6	25741	25746	0 %	50 %	50 %	0 %	532421843
550	NC_022118	TTTC	2	8	25952	25959	0 %	75 %	0 %	25 %	532421843
551	NC_022118	GAT	2	6	25964	25969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421843
552	NC_022118	CTC	2	6	26032	26037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421843
553	NC_022118	TGT	2	6	26099	26104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421843
554	NC_022118	A	6	6	26196	26201	100 %	0 %	0 %	0 %	532421843
555	NC_022118	GCA	2	6	26211	26216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421843
556	NC_022118	AGT	2	6	26243	26248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421843
557	NC_022118	T	6	6	26272	26277	0 %	100 %	0 %	0 %	532421843
558	NC_022118	GCTT	2	8	26289	26296	0 %	50 %	25 %	25 %	532421843
559	NC_022118	CTT	2	6	26359	26364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421843
560	NC_022118	GA	3	6	26389	26394	50 %	0 %	50 %	0 %	532421843
561	NC_022118	GAA	2	6	26424	26429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421843
562	NC_022118	GAA	2	6	26431	26436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421843
563	NC_022118	CGA	2	6	26439	26444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421843
564	NC_022118	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022118	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_022118	ACT	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022118	A	6	6	26544	26549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022118	T	7	7	26556	26562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022118	GGC	2	6	26704	26709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421844
570	NC_022118	TAA	2	6	26733	26738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421844
571	NC_022118	AT	3	6	26806	26811	50 %	50 %	0 %	0 %	532421844
572	NC_022118	T	7	7	26819	26825	0 %	100 %	0 %	0 %	532421844
573	NC_022118	GAA	2	6	26837	26842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421844
574	NC_022118	GGAA	2	8	26872	26879	50 %	0 %	50 %	0 %	532421844
575	NC_022118	TTAA	2	8	26945	26952	50 %	50 %	0 %	0 %	532421844
576	NC_022118	AAAG	2	8	26995	27002	75 %	0 %	25 %	0 %	532421844
577	NC_022118	GA	3	6	27020	27025	50 %	0 %	50 %	0 %	532421844
578	NC_022118	T	7	7	27094	27100	0 %	100 %	0 %	0 %	532421844
579	NC_022118	TTC	2	6	27125	27130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421844
580	NC_022118	CTA	2	6	27144	27149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421844
581	NC_022118	T	8	8	27151	27158	0 %	100 %	0 %	0 %	532421844
582	NC_022118	GAA	2	6	27209	27214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421844
583	NC_022118	GGGC	2	8	27275	27282	0 %	0 %	75 %	25 %	532421844
584	NC_022118	T	6	6	27291	27296	0 %	100 %	0 %	0 %	532421844
585	NC_022118	TGA	2	6	27304	27309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421844
586	NC_022118	GGAGA	2	10	27312	27321	40 %	0 %	60 %	0 %	532421844
587	NC_022118	A	7	7	27362	27368	100 %	0 %	0 %	0 %	532421844
588	NC_022118	AAG	2	6	27379	27384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421844
589	NC_022118	T	6	6	27399	27404	0 %	100 %	0 %	0 %	532421844
590	NC_022118	A	8	8	27496	27503	100 %	0 %	0 %	0 %	532421845
591	NC_022118	TTC	2	6	27540	27545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421845
592	NC_022118	GTTT	2	8	27558	27565	0 %	75 %	25 %	0 %	532421845
593	NC_022118	CAGA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	25 %	25 %	532421845
594	NC_022118	TTC	2	6	27658	27663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421845
595	NC_022118	AAG	2	6	27673	27678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421845
596	NC_022118	TTC	2	6	27773	27778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421845
597	NC_022118	AAG	2	6	27787	27792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421845
598	NC_022118	AAG	2	6	27805	27810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421845
599	NC_022118	A	6	6	27811	27816	100 %	0 %	0 %	0 %	532421845
600	NC_022118	T	7	7	27870	27876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022118	TAA	2	6	27881	27886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022118	TC	3	6	27888	27893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_022118	ATTG	2	8	27939	27946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022118	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022118	AGA	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022118	GAA	2	6	28043	28048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
607	NC_022118	ATCCG	2	10	28063	28072	20 %	20 %	20 %	40 %	532421846
608	NC_022118	TTC	2	6	28176	28181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421846
609	NC_022118	TAG	2	6	28224	28229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421846
610	NC_022118	AGA	2	6	28237	28242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
611	NC_022118	GAT	3	9	28319	28327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421846
612	NC_022118	GAG	2	6	28362	28367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421846
613	NC_022118	TG	3	6	28394	28399	0 %	50 %	50 %	0 %	532421846
614	NC_022118	GCA	2	6	28418	28423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421846
615	NC_022118	TC	3	6	28447	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	532421846
616	NC_022118	AGGGT	2	10	28581	28590	20 %	20 %	60 %	0 %	532421846
617	NC_022118	TTC	2	6	28617	28622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421846
618	NC_022118	CAG	2	6	28629	28634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421846
619	NC_022118	GAA	2	6	28643	28648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
620	NC_022118	TGA	2	6	28657	28662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421846
621	NC_022118	TTC	2	6	28690	28695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421846
622	NC_022118	GC	4	8	28861	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	532421846
623	NC_022118	AAG	2	6	28869	28874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
624	NC_022118	TA	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	532421846
625	NC_022118	GAA	2	6	29072	29077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
626	NC_022118	TGT	2	6	29104	29109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421847
627	NC_022118	TCT	2	6	29172	29177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421847
628	NC_022118	ACA	2	6	29400	29405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421847
629	NC_022118	ATG	2	6	29410	29415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421847
630	NC_022118	CTTT	2	8	29552	29559	0 %	75 %	0 %	25 %	532421847
631	NC_022118	TTTG	2	8	29567	29574	0 %	75 %	25 %	0 %	532421847
632	NC_022118	TTGT	2	8	29602	29609	0 %	75 %	25 %	0 %	532421847
633	NC_022118	CCTAT	2	10	29621	29630	20 %	40 %	0 %	40 %	532421847
634	NC_022118	T	6	6	29637	29642	0 %	100 %	0 %	0 %	532421847
635	NC_022118	ATC	2	6	29716	29721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421847
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637	NC_022118	T	8	8	29871	29878	0 %	100 %	0 %	0 %	532421847
638	NC_022118	ATG	2	6	29896	29901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421847
639	NC_022118	GA	3	6	29934	29939	50 %	0 %	50 %	0 %	532421847
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641	NC_022118	GTT	2	6	30113	30118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421848
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643	NC_022118	TC	3	6	30141	30146	0 %	50 %	0 %	50 %	532421848
644	NC_022118	TCT	2	6	30188	30193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421848
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649	NC_022118	AAAC	2	8	30395	30402	75 %	0 %	0 %	25 %	532421848
650	NC_022118	T	6	6	30412	30417	0 %	100 %	0 %	0 %	532421848
651	NC_022118	AAGGA	2	10	30421	30430	60 %	0 %	40 %	0 %	532421848
652	NC_022118	GGC	2	6	30448	30453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421848
653	NC_022118	GAT	2	6	30527	30532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421848
654	NC_022118	GATG	2	8	30538	30545	25 %	25 %	50 %	0 %	532421848
655	NC_022118	TAG	2	6	30549	30554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421848
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659	NC_022118	AGA	2	6	30892	30897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421848
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664	NC_022118	ATT	2	6	31070	31075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421848
665	NC_022118	ATG	2	6	31193	31198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421848
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667	NC_022118	T	6	6	31211	31216	0 %	100 %	0 %	0 %	532421848
668	NC_022118	GA	3	6	31230	31235	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
669	NC_022118	A	7	7	31253	31259	100 %	0 %	0 %	0 %	532421848
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672	NC_022118	T	6	6	31439	31444	0 %	100 %	0 %	0 %	532421849
673	NC_022118	GAGCT	2	10	31460	31469	20 %	20 %	40 %	20 %	532421849
674	NC_022118	A	6	6	31534	31539	100 %	0 %	0 %	0 %	532421849
675	NC_022118	A	6	6	31565	31570	100 %	0 %	0 %	0 %	532421849
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692	NC_022118	GGA	2	6	32602	32607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421850
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698	NC_022118	CTG	2	6	33122	33127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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704	NC_022118	AGG	2	6	33471	33476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421852
705	NC_022118	CTT	2	6	33495	33500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421852
706	NC_022118	T	6	6	33517	33522	0 %	100 %	0 %	0 %	532421852
707	NC_022118	GTT	2	6	33535	33540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421852
708	NC_022118	TGA	2	6	33642	33647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421852
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715	NC_022118	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421853
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723	NC_022118	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	532421853
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747	NC_022118	TG	3	6	35456	35461	0 %	50 %	50 %	0 %	532421855
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750	NC_022118	TTGG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	50 %	0 %	532421855
751	NC_022118	ATA	2	6	35587	35592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421855
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754	NC_022118	TCT	2	6	35928	35933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421855
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758	NC_022118	CTATT	2	10	36133	36142	20 %	60 %	0 %	20 %	532421855
759	NC_022118	TCCTA	2	10	36180	36189	20 %	40 %	0 %	40 %	532421855
760	NC_022118	AGAT	2	8	36263	36270	50 %	25 %	25 %	0 %	532421855
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762	NC_022118	ATT	2	6	36338	36343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421855
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893	NC_022118	T	7	7	42483	42489	0 %	100 %	0 %	0 %	532422664
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