MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 2382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022117	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022117	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022117	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022117	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	532419037
5	NC_022117	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	532419037
6	NC_022117	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	532419038
7	NC_022117	TC	3	6	5263	5268	0 %	50 %	0 %	50 %	532419039
8	NC_022117	GA	3	6	5274	5279	50 %	0 %	50 %	0 %	532419039
9	NC_022117	AT	3	6	5378	5383	50 %	50 %	0 %	0 %	532419039
10	NC_022117	TG	3	6	5531	5536	0 %	50 %	50 %	0 %	532419039
11	NC_022117	AG	3	6	5939	5944	50 %	0 %	50 %	0 %	532419039
12	NC_022117	AG	3	6	6413	6418	50 %	0 %	50 %	0 %	532419040
13	NC_022117	GA	3	6	6997	7002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022117	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	532419041
15	NC_022117	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	532419042
16	NC_022117	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	532419042
17	NC_022117	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	532419042
18	NC_022117	AG	3	6	9352	9357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022117	GA	3	6	9868	9873	50 %	0 %	50 %	0 %	532419044
20	NC_022117	AG	3	6	10085	10090	50 %	0 %	50 %	0 %	532419044
21	NC_022117	TA	3	6	11250	11255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022117	AG	3	6	11311	11316	50 %	0 %	50 %	0 %	532419045
23	NC_022117	TA	3	6	11871	11876	50 %	50 %	0 %	0 %	532419045
24	NC_022117	TG	3	6	12774	12779	0 %	50 %	50 %	0 %	532419046
25	NC_022117	AG	3	6	12923	12928	50 %	0 %	50 %	0 %	532419046
26	NC_022117	TC	3	6	13057	13062	0 %	50 %	0 %	50 %	532419046
27	NC_022117	AG	4	8	13079	13086	50 %	0 %	50 %	0 %	532419046
28	NC_022117	TA	3	6	13341	13346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022117	TA	4	8	13565	13572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022117	AC	3	6	14408	14413	50 %	0 %	0 %	50 %	532419047
31	NC_022117	AG	3	6	15747	15752	50 %	0 %	50 %	0 %	532419048
32	NC_022117	TC	3	6	15787	15792	0 %	50 %	0 %	50 %	532419048
33	NC_022117	GA	3	6	16316	16321	50 %	0 %	50 %	0 %	532419049
34	NC_022117	AG	3	6	16387	16392	50 %	0 %	50 %	0 %	532419049
35	NC_022117	GA	3	6	17171	17176	50 %	0 %	50 %	0 %	532419049
36	NC_022117	AG	3	6	17517	17522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022117	GA	3	6	17530	17535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022117	GA	3	6	17774	17779	50 %	0 %	50 %	0 %	532419050
39	NC_022117	TC	3	6	18224	18229	0 %	50 %	0 %	50 %	532419050
40	NC_022117	CT	3	6	18452	18457	0 %	50 %	0 %	50 %	532419051
41	NC_022117	TC	3	6	18652	18657	0 %	50 %	0 %	50 %	532419051
42	NC_022117	GA	3	6	18667	18672	50 %	0 %	50 %	0 %	532419051
43	NC_022117	GA	3	6	18766	18771	50 %	0 %	50 %	0 %	532419051
44	NC_022117	AG	3	6	19232	19237	50 %	0 %	50 %	0 %	532419051
45	NC_022117	AG	4	8	19518	19525	50 %	0 %	50 %	0 %	532419051
46	NC_022117	GT	3	6	19781	19786	0 %	50 %	50 %	0 %	532419051
47	NC_022117	TG	3	6	20122	20127	0 %	50 %	50 %	0 %	532419052
48	NC_022117	AG	3	6	20518	20523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022117	GA	3	6	20676	20681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022117	AG	3	6	21193	21198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022117	CT	3	6	21262	21267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022117	CT	4	8	21919	21926	0 %	50 %	0 %	50 %	532419053
53	NC_022117	AT	3	6	22189	22194	50 %	50 %	0 %	0 %	532419053
54	NC_022117	AT	3	6	22513	22518	50 %	50 %	0 %	0 %	532419053
55	NC_022117	GA	3	6	23832	23837	50 %	0 %	50 %	0 %	532419053
56	NC_022117	GA	3	6	23924	23929	50 %	0 %	50 %	0 %	532419053
57	NC_022117	AG	3	6	24305	24310	50 %	0 %	50 %	0 %	532419053
58	NC_022117	GA	3	6	25723	25728	50 %	0 %	50 %	0 %	532419054
59	NC_022117	GT	3	6	25743	25748	0 %	50 %	50 %	0 %	532419054
60	NC_022117	GA	3	6	26391	26396	50 %	0 %	50 %	0 %	532419054
61	NC_022117	GA	3	6	26515	26520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022117	CT	3	6	26522	26527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022117	AT	3	6	26808	26813	50 %	50 %	0 %	0 %	532419055
64	NC_022117	GA	3	6	27022	27027	50 %	0 %	50 %	0 %	532419055
65	NC_022117	TC	3	6	27890	27895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022117	AG	3	6	27973	27978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022117	TG	3	6	28396	28401	0 %	50 %	50 %	0 %	532419057
68	NC_022117	TC	3	6	28449	28454	0 %	50 %	0 %	50 %	532419057
69	NC_022117	GC	4	8	28863	28870	0 %	0 %	50 %	50 %	532419057
70	NC_022117	TA	3	6	28985	28990	50 %	50 %	0 %	0 %	532419057
71	NC_022117	GA	3	6	29936	29941	50 %	0 %	50 %	0 %	532419058
72	NC_022117	AG	3	6	30034	30039	50 %	0 %	50 %	0 %	532419059
73	NC_022117	TC	3	6	30143	30148	0 %	50 %	0 %	50 %	532419059
74	NC_022117	GA	3	6	30764	30769	50 %	0 %	50 %	0 %	532419059
75	NC_022117	GA	3	6	31232	31237	50 %	0 %	50 %	0 %	532419059
76	NC_022117	TC	3	6	31658	31663	0 %	50 %	0 %	50 %	532419061
77	NC_022117	CT	3	6	32138	32143	0 %	50 %	0 %	50 %	532419061
78	NC_022117	AG	3	6	32270	32275	50 %	0 %	50 %	0 %	532419061
79	NC_022117	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	532419063
80	NC_022117	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	532419063
81	NC_022117	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	532419064
82	NC_022117	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	532419065
83	NC_022117	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	532419065
84	NC_022117	TG	3	6	35458	35463	0 %	50 %	50 %	0 %	532419066
85	NC_022117	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022117	AT	3	6	36488	36493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022117	GA	3	6	36536	36541	50 %	0 %	50 %	0 %	532419067
88	NC_022117	CT	3	6	37020	37025	0 %	50 %	0 %	50 %	532419067
89	NC_022117	AG	3	6	37531	37536	50 %	0 %	50 %	0 %	532419067
90	NC_022117	AG	3	6	38077	38082	50 %	0 %	50 %	0 %	532419067
91	NC_022117	AG	3	6	38604	38609	50 %	0 %	50 %	0 %	532419067
92	NC_022117	CT	3	6	38755	38760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022117	GA	3	6	39388	39393	50 %	0 %	50 %	0 %	532419068
94	NC_022117	AG	3	6	39525	39530	50 %	0 %	50 %	0 %	532419068
95	NC_022117	AG	3	6	39625	39630	50 %	0 %	50 %	0 %	532419068
96	NC_022117	CT	3	6	40126	40131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022117	AG	3	6	40602	40607	50 %	0 %	50 %	0 %	532419069
98	NC_022117	GC	3	6	40651	40656	0 %	0 %	50 %	50 %	532419069
99	NC_022117	GA	3	6	40816	40821	50 %	0 %	50 %	0 %	532419069
100	NC_022117	TC	3	6	40825	40830	0 %	50 %	0 %	50 %	532419069
101	NC_022117	GC	3	6	40890	40895	0 %	0 %	50 %	50 %	532419069
102	NC_022117	GA	3	6	41030	41035	50 %	0 %	50 %	0 %	532419069
103	NC_022117	GT	3	6	41468	41473	0 %	50 %	50 %	0 %	532419070
104	NC_022117	GA	3	6	42006	42011	50 %	0 %	50 %	0 %	532419070
105	NC_022117	GA	4	8	42016	42023	50 %	0 %	50 %	0 %	532419070
106	NC_022117	AG	3	6	42252	42257	50 %	0 %	50 %	0 %	532419070
107	NC_022117	CT	3	6	42318	42323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022117	GA	5	10	42593	42602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022117	AG	3	6	42717	42722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022117	TG	3	6	43080	43085	0 %	50 %	50 %	0 %	532419071
111	NC_022117	AC	3	6	43475	43480	50 %	0 %	0 %	50 %	532419072
112	NC_022117	TC	3	6	43644	43649	0 %	50 %	0 %	50 %	532419072
113	NC_022117	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022117	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	532419073
115	NC_022117	TC	3	6	44873	44878	0 %	50 %	0 %	50 %	532419074
116	NC_022117	GA	3	6	45356	45361	50 %	0 %	50 %	0 %	532419075
117	NC_022117	TG	3	6	45574	45579	0 %	50 %	50 %	0 %	532419075
118	NC_022117	AG	3	6	45585	45590	50 %	0 %	50 %	0 %	532419075
119	NC_022117	AG	4	8	46027	46034	50 %	0 %	50 %	0 %	532419076
120	NC_022117	CT	3	6	46218	46223	0 %	50 %	0 %	50 %	532419076
121	NC_022117	TG	3	6	46419	46424	0 %	50 %	50 %	0 %	532419076
122	NC_022117	AG	3	6	46472	46477	50 %	0 %	50 %	0 %	532419076
123	NC_022117	AG	3	6	48044	48049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022117	AG	3	6	49396	49401	50 %	0 %	50 %	0 %	532419078
125	NC_022117	CA	3	6	50062	50067	50 %	0 %	0 %	50 %	532419079
126	NC_022117	TG	4	8	51392	51399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022117	TC	3	6	53013	53018	0 %	50 %	0 %	50 %	532419081
128	NC_022117	CA	3	6	53064	53069	50 %	0 %	0 %	50 %	532419081
129	NC_022117	GA	3	6	53485	53490	50 %	0 %	50 %	0 %	532419082
130	NC_022117	CT	3	6	53802	53807	0 %	50 %	0 %	50 %	532419082
131	NC_022117	CT	3	6	54471	54476	0 %	50 %	0 %	50 %	532419083
132	NC_022117	AT	3	6	55679	55684	50 %	50 %	0 %	0 %	532419083
133	NC_022117	GA	3	6	55716	55721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022117	AG	3	6	56315	56320	50 %	0 %	50 %	0 %	532419868
135	NC_022117	CT	3	6	56614	56619	0 %	50 %	0 %	50 %	532419868
136	NC_022117	GT	3	6	56664	56669	0 %	50 %	50 %	0 %	532419868
137	NC_022117	TG	3	6	57302	57307	0 %	50 %	50 %	0 %	532419868
138	NC_022117	CT	3	6	58183	58188	0 %	50 %	0 %	50 %	532419869
139	NC_022117	GA	3	6	59750	59755	50 %	0 %	50 %	0 %	532419084
140	NC_022117	GT	3	6	59888	59893	0 %	50 %	50 %	0 %	532419084
141	NC_022117	TC	3	6	60636	60641	0 %	50 %	0 %	50 %	532419085
142	NC_022117	GA	3	6	60864	60869	50 %	0 %	50 %	0 %	532419870
143	NC_022117	CA	3	6	61262	61267	50 %	0 %	0 %	50 %	532419086
144	NC_022117	AT	3	6	61512	61517	50 %	50 %	0 %	0 %	532419086
145	NC_022117	GA	3	6	61535	61540	50 %	0 %	50 %	0 %	532419086
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