MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 22968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022117	TTCG	2	8	69296	69303	0 %	50 %	25 %	25 %	532419092
1502	NC_022117	TGT	2	6	69321	69326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419092
1503	NC_022117	TGAT	2	8	69413	69420	25 %	50 %	25 %	0 %	532419092
1504	NC_022117	T	6	6	69461	69466	0 %	100 %	0 %	0 %	532419092
1505	NC_022117	TCT	2	6	69577	69582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419092
1506	NC_022117	GGAGC	2	10	69700	69709	20 %	0 %	60 %	20 %	532419092
1507	NC_022117	TGC	2	6	69783	69788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419092
1508	NC_022117	A	7	7	69820	69826	100 %	0 %	0 %	0 %	532419092
1509	NC_022117	CT	3	6	69828	69833	0 %	50 %	0 %	50 %	532419092
1510	NC_022117	AGA	2	6	69837	69842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419092
1511	NC_022117	GCGAT	2	10	69890	69899	20 %	20 %	40 %	20 %	532419092
1512	NC_022117	GTT	2	6	69912	69917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419092
1513	NC_022117	GCT	2	6	69934	69939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419092
1514	NC_022117	GCA	3	9	70036	70044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419092
1515	NC_022117	AAAG	2	8	70069	70076	75 %	0 %	25 %	0 %	532419092
1516	NC_022117	GCA	2	6	70083	70088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419092
1517	NC_022117	ATT	2	6	70097	70102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419092
1518	NC_022117	TAT	2	6	70205	70210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419092
1519	NC_022117	CTT	2	6	70229	70234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419092
1520	NC_022117	GA	3	6	70238	70243	50 %	0 %	50 %	0 %	532419092
1521	NC_022117	CTCTT	2	10	70244	70253	0 %	60 %	0 %	40 %	532419092
1522	NC_022117	AGAA	2	8	70256	70263	75 %	0 %	25 %	0 %	532419092
1523	NC_022117	TGA	2	6	70284	70289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419092
1524	NC_022117	TTG	2	6	70373	70378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419092
1525	NC_022117	TCT	2	6	70396	70401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419092
1526	NC_022117	GA	3	6	70437	70442	50 %	0 %	50 %	0 %	532419092
1527	NC_022117	AGCT	2	8	70478	70485	25 %	25 %	25 %	25 %	532419092
1528	NC_022117	TGA	2	6	70524	70529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419092
1529	NC_022117	GCAT	2	8	70539	70546	25 %	25 %	25 %	25 %	532419092
1530	NC_022117	AGA	2	6	70557	70562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419092
1531	NC_022117	TCAA	2	8	70683	70690	50 %	25 %	0 %	25 %	532419092
1532	NC_022117	GT	3	6	70713	70718	0 %	50 %	50 %	0 %	532419092
1533	NC_022117	CT	3	6	70794	70799	0 %	50 %	0 %	50 %	532419092
1534	NC_022117	GA	3	6	70815	70820	50 %	0 %	50 %	0 %	532419092
1535	NC_022117	AGT	2	6	70857	70862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419092
1536	NC_022117	AGGGG	2	10	70890	70899	20 %	0 %	80 %	0 %	532419092
1537	NC_022117	AAGAA	2	10	70932	70941	80 %	0 %	20 %	0 %	532419092
1538	NC_022117	AGA	2	6	71004	71009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419092
1539	NC_022117	TGA	2	6	71040	71045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419092
1540	NC_022117	TAT	2	6	71051	71056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419092
1541	NC_022117	T	6	6	71140	71145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_022117	T	8	8	71161	71168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_022117	CAT	2	6	71226	71231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419093
1544	NC_022117	GCTT	2	8	71285	71292	0 %	50 %	25 %	25 %	532419093
1545	NC_022117	A	6	6	71380	71385	100 %	0 %	0 %	0 %	532419093
1546	NC_022117	ATT	2	6	71430	71435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419093
1547	NC_022117	CAA	2	6	71577	71582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419093
1548	NC_022117	TCC	2	6	71601	71606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419093
1549	NC_022117	TTCT	2	8	71623	71630	0 %	75 %	0 %	25 %	532419093
1550	NC_022117	ATG	2	6	71635	71640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419093
1551	NC_022117	GCTT	2	8	71669	71676	0 %	50 %	25 %	25 %	532419093
1552	NC_022117	AGA	2	6	71678	71683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419093
1553	NC_022117	GAGC	2	8	71697	71704	25 %	0 %	50 %	25 %	532419093
1554	NC_022117	TCA	2	6	71722	71727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419093
1555	NC_022117	A	7	7	71729	71735	100 %	0 %	0 %	0 %	532419093
1556	NC_022117	CTATTT	2	12	71740	71751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532419093
1557	NC_022117	TGA	2	6	71774	71779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419093
1558	NC_022117	ATG	2	6	71812	71817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419093
1559	NC_022117	AGA	2	6	71942	71947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022117	CGT	2	6	71990	71995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419871
1561	NC_022117	T	7	7	71995	72001	0 %	100 %	0 %	0 %	532419871
1562	NC_022117	CTTGC	2	10	72021	72030	0 %	40 %	20 %	40 %	532419871
1563	NC_022117	GATA	2	8	72045	72052	50 %	25 %	25 %	0 %	532419871
1564	NC_022117	TTC	2	6	72136	72141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419094
1565	NC_022117	CTT	2	6	72204	72209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419094
1566	NC_022117	ATTGG	2	10	72222	72231	20 %	40 %	40 %	0 %	532419094
1567	NC_022117	T	6	6	72238	72243	0 %	100 %	0 %	0 %	532419094
1568	NC_022117	AGC	2	6	72253	72258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419094
1569	NC_022117	TTG	2	6	72282	72287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419094
1570	NC_022117	ATA	2	6	72366	72371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419094
1571	NC_022117	GCT	2	6	72386	72391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419094
1572	NC_022117	GCTA	2	8	72395	72402	25 %	25 %	25 %	25 %	532419094
1573	NC_022117	AAT	2	6	72425	72430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419094
1574	NC_022117	TGG	2	6	72456	72461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419094
1575	NC_022117	T	6	6	72463	72468	0 %	100 %	0 %	0 %	532419094
1576	NC_022117	AGC	2	6	72525	72530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419094
1577	NC_022117	TTAT	2	8	72571	72578	25 %	75 %	0 %	0 %	532419094
1578	NC_022117	TGC	2	6	72579	72584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419094
1579	NC_022117	TGT	2	6	72622	72627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419094
1580	NC_022117	GGAG	2	8	72638	72645	25 %	0 %	75 %	0 %	532419094
1581	NC_022117	GATT	2	8	72673	72680	25 %	50 %	25 %	0 %	532419094
1582	NC_022117	GAA	2	6	72748	72753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419094
1583	NC_022117	CTGG	2	8	72781	72788	0 %	25 %	50 %	25 %	532419094
1584	NC_022117	CTC	2	6	72801	72806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419094
1585	NC_022117	ACTCTT	2	12	72869	72880	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532419094
1586	NC_022117	GAA	2	6	72890	72895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419094
1587	NC_022117	TGA	2	6	72907	72912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419094
1588	NC_022117	GAA	2	6	72940	72945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419094
1589	NC_022117	T	6	6	73022	73027	0 %	100 %	0 %	0 %	532419094
1590	NC_022117	TAG	2	6	73062	73067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419094
1591	NC_022117	TAG	2	6	73071	73076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419094
1592	NC_022117	AGA	2	6	73178	73183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419094
1593	NC_022117	ATCA	2	8	73208	73215	50 %	25 %	0 %	25 %	532419094
1594	NC_022117	TGT	2	6	73281	73286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419094
1595	NC_022117	GAAAA	2	10	73294	73303	80 %	0 %	20 %	0 %	532419094
1596	NC_022117	A	7	7	73300	73306	100 %	0 %	0 %	0 %	532419094
1597	NC_022117	AGG	2	6	73326	73331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419094
1598	NC_022117	TGG	2	6	73404	73409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419095
1599	NC_022117	TTTCTG	2	12	73419	73430	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532419095
1600	NC_022117	AGA	2	6	73456	73461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419095
1601	NC_022117	GA	3	6	73479	73484	50 %	0 %	50 %	0 %	532419095
1602	NC_022117	TAC	2	6	73504	73509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419095
1603	NC_022117	GATCAT	2	12	73549	73560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532419095
1604	NC_022117	TGA	2	6	73582	73587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419095
1605	NC_022117	G	6	6	73640	73645	0 %	0 %	100 %	0 %	532419095
1606	NC_022117	TAT	2	6	73652	73657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419095
1607	NC_022117	A	6	6	73688	73693	100 %	0 %	0 %	0 %	532419095
1608	NC_022117	TGGGA	2	10	73711	73720	20 %	20 %	60 %	0 %	532419095
1609	NC_022117	GCT	2	6	73820	73825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419095
1610	NC_022117	TGGA	2	8	73830	73837	25 %	25 %	50 %	0 %	532419095
1611	NC_022117	AGG	2	6	73864	73869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419095
1612	NC_022117	TC	3	6	73966	73971	0 %	50 %	0 %	50 %	532419095
1613	NC_022117	T	6	6	73994	73999	0 %	100 %	0 %	0 %	532419095
1614	NC_022117	AGC	3	9	74038	74046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419095
1615	NC_022117	AGGC	2	8	74154	74161	25 %	0 %	50 %	25 %	532419095
1616	NC_022117	ATT	2	6	74177	74182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419095
1617	NC_022117	AAG	2	6	74217	74222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419095
1618	NC_022117	AAG	2	6	74280	74285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419095
1619	NC_022117	TGC	2	6	74358	74363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419095
1620	NC_022117	TC	3	6	74373	74378	0 %	50 %	0 %	50 %	532419095
1621	NC_022117	TCA	2	6	74467	74472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419095
1622	NC_022117	ATT	2	6	74517	74522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419095
1623	NC_022117	TCT	2	6	74609	74614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419095
1624	NC_022117	ATG	2	6	74628	74633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419095
1625	NC_022117	AAG	2	6	74783	74788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022117	ACT	2	6	74798	74803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1628	NC_022117	AGT	2	6	74834	74839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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