MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 22968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022117	ATG	2	6	611002	611007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419923
13502	NC_022117	A	6	6	611037	611042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_022117	AC	3	6	611110	611115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13504	NC_022117	CCT	2	6	611162	611167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13505	NC_022117	TCT	2	6	611235	611240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419545
13506	NC_022117	TTC	2	6	611264	611269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419545
13507	NC_022117	TGCCA	2	10	611296	611305	20 %	20 %	20 %	40 %	532419545
13508	NC_022117	GTA	2	6	611355	611360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419545
13509	NC_022117	CT	3	6	611361	611366	0 %	50 %	0 %	50 %	532419545
13510	NC_022117	GATT	2	8	611445	611452	25 %	50 %	25 %	0 %	532419545
13511	NC_022117	TCT	2	6	611472	611477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419545
13512	NC_022117	TC	3	6	611482	611487	0 %	50 %	0 %	50 %	532419545
13513	NC_022117	GGTT	2	8	611528	611535	0 %	50 %	50 %	0 %	532419545
13514	NC_022117	GGATGG	2	12	611540	611551	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532419545
13515	NC_022117	AG	4	8	611593	611600	50 %	0 %	50 %	0 %	532419545
13516	NC_022117	TGG	2	6	611606	611611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419545
13517	NC_022117	ATA	2	6	611631	611636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419545
13518	NC_022117	GGCGC	2	10	611691	611700	0 %	0 %	60 %	40 %	532419545
13519	NC_022117	ATT	2	6	611717	611722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419545
13520	NC_022117	TAT	2	6	611725	611730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419545
13521	NC_022117	ATCG	2	8	611747	611754	25 %	25 %	25 %	25 %	532419545
13522	NC_022117	AGA	2	6	611809	611814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419545
13523	NC_022117	GAA	2	6	611831	611836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419545
13524	NC_022117	AG	3	6	611870	611875	50 %	0 %	50 %	0 %	532419545
13525	NC_022117	CT	3	6	611876	611881	0 %	50 %	0 %	50 %	532419545
13526	NC_022117	TTAC	2	8	611898	611905	25 %	50 %	0 %	25 %	532419545
13527	NC_022117	TAA	2	6	611914	611919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419545
13528	NC_022117	CCT	2	6	611943	611948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419545
13529	NC_022117	TTTA	2	8	611951	611958	25 %	75 %	0 %	0 %	532419545
13530	NC_022117	CT	3	6	611991	611996	0 %	50 %	0 %	50 %	532419545
13531	NC_022117	ATT	2	6	612015	612020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419545
13532	NC_022117	TTTG	2	8	612049	612056	0 %	75 %	25 %	0 %	532419545
13533	NC_022117	ATT	2	6	612067	612072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419545
13534	NC_022117	GGCT	2	8	612089	612096	0 %	25 %	50 %	25 %	532419545
13535	NC_022117	TCT	2	6	612141	612146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419545
13536	NC_022117	ATT	2	6	612154	612159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419545
13537	NC_022117	TGG	2	6	612203	612208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419545
13538	NC_022117	T	6	6	612238	612243	0 %	100 %	0 %	0 %	532419545
13539	NC_022117	ATG	2	6	612260	612265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419545
13540	NC_022117	ATTGG	2	10	612266	612275	20 %	40 %	40 %	0 %	532419545
13541	NC_022117	A	6	6	612296	612301	100 %	0 %	0 %	0 %	532419545
13542	NC_022117	AGC	2	6	612349	612354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419545
13543	NC_022117	TTG	2	6	612411	612416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419545
13544	NC_022117	TCAA	2	8	612576	612583	50 %	25 %	0 %	25 %	532419546
13545	NC_022117	TTG	2	6	612589	612594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419546
13546	NC_022117	CGCT	2	8	612622	612629	0 %	25 %	25 %	50 %	532419546
13547	NC_022117	TTTG	2	8	612647	612654	0 %	75 %	25 %	0 %	532419546
13548	NC_022117	ATC	2	6	612702	612707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419546
13549	NC_022117	A	9	9	612747	612755	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13550	NC_022117	CTT	2	6	612789	612794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419546
13551	NC_022117	GAA	2	6	612804	612809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13552	NC_022117	TTTG	2	8	612823	612830	0 %	75 %	25 %	0 %	532419546
13553	NC_022117	CTCTC	2	10	612831	612840	0 %	40 %	0 %	60 %	532419546
13554	NC_022117	ATAG	2	8	612876	612883	50 %	25 %	25 %	0 %	532419546
13555	NC_022117	GAA	2	6	612969	612974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13556	NC_022117	AAG	2	6	613015	613020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13557	NC_022117	AGA	2	6	613055	613060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13558	NC_022117	GAA	2	6	613077	613082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13559	NC_022117	AAAAC	2	10	613091	613100	80 %	0 %	0 %	20 %	532419546
13560	NC_022117	AAC	2	6	613120	613125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419546
13561	NC_022117	GCTC	2	8	613220	613227	0 %	25 %	25 %	50 %	532419546
13562	NC_022117	AG	3	6	613254	613259	50 %	0 %	50 %	0 %	532419546
13563	NC_022117	TAG	2	6	613319	613324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419546
13564	NC_022117	ATTTT	2	10	613328	613337	20 %	80 %	0 %	0 %	532419546
13565	NC_022117	GCA	2	6	613368	613373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419546
13566	NC_022117	CTATC	2	10	613448	613457	20 %	40 %	0 %	40 %	532419546
13567	NC_022117	A	8	8	613477	613484	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13568	NC_022117	AGA	2	6	613496	613501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13569	NC_022117	CTT	2	6	613526	613531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419546
13570	NC_022117	AGA	2	6	613532	613537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13571	NC_022117	AC	3	6	613567	613572	50 %	0 %	0 %	50 %	532419546
13572	NC_022117	TAT	3	9	613658	613666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419546
13573	NC_022117	ATT	2	6	613707	613712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419546
13574	NC_022117	TTC	2	6	613827	613832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419546
13575	NC_022117	TCA	2	6	613840	613845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419546
13576	NC_022117	CGATAT	3	18	613868	613885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532419546
13577	NC_022117	AG	3	6	613899	613904	50 %	0 %	50 %	0 %	532419546
13578	NC_022117	TTA	2	6	613909	613914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419546
13579	NC_022117	ATT	2	6	613956	613961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419546
13580	NC_022117	TGTA	2	8	614116	614123	25 %	50 %	25 %	0 %	532419546
13581	NC_022117	A	6	6	614160	614165	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13582	NC_022117	TGC	2	6	614198	614203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419546
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13584	NC_022117	CA	3	6	614369	614374	50 %	0 %	0 %	50 %	532419546
13585	NC_022117	A	7	7	614385	614391	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13586	NC_022117	TC	3	6	614443	614448	0 %	50 %	0 %	50 %	532419546
13587	NC_022117	TTC	2	6	614449	614454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419546
13588	NC_022117	GAA	2	6	614538	614543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13589	NC_022117	CAT	2	6	614593	614598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419546
13590	NC_022117	CGC	2	6	614757	614762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532419546
13591	NC_022117	GA	3	6	614803	614808	50 %	0 %	50 %	0 %	532419546
13592	NC_022117	TAA	2	6	614900	614905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419546
13593	NC_022117	ACA	2	6	614940	614945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419546
13594	NC_022117	GCC	2	6	614982	614987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532419546
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13596	NC_022117	CCT	2	6	615069	615074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419546
13597	NC_022117	TTG	2	6	615175	615180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419546
13598	NC_022117	AG	4	8	615182	615189	50 %	0 %	50 %	0 %	532419546
13599	NC_022117	A	7	7	615190	615196	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13600	NC_022117	A	6	6	615243	615248	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13601	NC_022117	TGG	2	6	615274	615279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419546
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13603	NC_022117	A	8	8	615364	615371	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13604	NC_022117	GCT	2	6	615375	615380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419546
13605	NC_022117	T	7	7	615396	615402	0 %	100 %	0 %	0 %	532419546
13606	NC_022117	TC	3	6	615442	615447	0 %	50 %	0 %	50 %	532419546
13607	NC_022117	GTT	2	6	615479	615484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419546
13608	NC_022117	ATT	2	6	615609	615614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419546
13609	NC_022117	ACT	2	6	615642	615647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419546
13610	NC_022117	GCAGA	2	10	615660	615669	40 %	0 %	40 %	20 %	532419546
13611	NC_022117	A	6	6	615669	615674	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13612	NC_022117	GAA	2	6	615762	615767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419546
13613	NC_022117	TTAT	2	8	615775	615782	25 %	75 %	0 %	0 %	532419546
13614	NC_022117	CGA	2	6	615881	615886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419546
13615	NC_022117	A	6	6	615930	615935	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13616	NC_022117	A	7	7	615965	615971	100 %	0 %	0 %	0 %	532419546
13617	NC_022117	AG	3	6	615981	615986	50 %	0 %	50 %	0 %	532419546
13618	NC_022117	TC	3	6	615988	615993	0 %	50 %	0 %	50 %	532419546
13619	NC_022117	TAAA	2	8	616015	616022	75 %	25 %	0 %	0 %	532419546
13620	NC_022117	TTAT	2	8	616038	616045	25 %	75 %	0 %	0 %	532419546
13621	NC_022117	CT	4	8	616086	616093	0 %	50 %	0 %	50 %	532419546
13622	NC_022117	TC	3	6	616129	616134	0 %	50 %	0 %	50 %	532419546
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13992	NC_022117	CTAC	2	8	632732	632739	25 %	25 %	0 %	50 %	532419561
13993	NC_022117	TCC	2	6	632765	632770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419561
13994	NC_022117	AGA	2	6	632780	632785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419561
13995	NC_022117	ATGCT	2	10	632812	632821	20 %	40 %	20 %	20 %	532419561
13996	NC_022117	ATT	2	6	632965	632970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419561
13997	NC_022117	GGA	2	6	633023	633028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419561
13998	NC_022117	CTT	2	6	633071	633076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419561
13999	NC_022117	AGA	2	6	633095	633100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419561
14000	NC_022117	GATA	2	8	633179	633186	50 %	25 %	25 %	0 %	532419561

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