MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 22968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022117	GCA	2	6	273916	273921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419254
6002	NC_022117	GAAA	2	8	273933	273940	75 %	0 %	25 %	0 %	532419254
6003	NC_022117	TG	3	6	273977	273982	0 %	50 %	50 %	0 %	532419254
6004	NC_022117	TGG	2	6	274014	274019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419254
6005	NC_022117	GCA	2	6	274042	274047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419254
6006	NC_022117	TCT	2	6	274072	274077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419254
6007	NC_022117	TCCCT	2	10	274156	274165	0 %	40 %	0 %	60 %	532419254
6008	NC_022117	ATT	2	6	274174	274179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419254
6009	NC_022117	ATGG	2	8	274187	274194	25 %	25 %	50 %	0 %	532419254
6010	NC_022117	TCTT	2	8	274266	274273	0 %	75 %	0 %	25 %	532419254
6011	NC_022117	ATTT	2	8	274295	274302	25 %	75 %	0 %	0 %	532419254
6012	NC_022117	CAC	2	6	274333	274338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419254
6013	NC_022117	CAA	2	6	274342	274347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419254
6014	NC_022117	TAT	2	6	274359	274364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419254
6015	NC_022117	TCT	2	6	274446	274451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419254
6016	NC_022117	ATCCT	2	10	274460	274469	20 %	40 %	0 %	40 %	532419254
6017	NC_022117	GAT	2	6	274513	274518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419254
6018	NC_022117	AGA	2	6	274608	274613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419254
6019	NC_022117	TGA	2	6	274672	274677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419255
6020	NC_022117	AGGAG	2	10	274711	274720	40 %	0 %	60 %	0 %	532419255
6021	NC_022117	GCT	2	6	274811	274816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419255
6022	NC_022117	TGGAAT	2	12	274822	274833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419255
6023	NC_022117	AGC	2	6	274837	274842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419255
6024	NC_022117	ATT	2	6	274862	274867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419255
6025	NC_022117	TC	3	6	274887	274892	0 %	50 %	0 %	50 %	532419255
6026	NC_022117	TGC	2	6	274897	274902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419255
6027	NC_022117	GCA	2	6	274922	274927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419255
6028	NC_022117	TAT	2	6	274934	274939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419255
6029	NC_022117	GCT	2	6	274991	274996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419255
6030	NC_022117	CTT	2	6	275099	275104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419255
6031	NC_022117	AAC	2	6	275123	275128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419255
6032	NC_022117	AGA	2	6	275185	275190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419255
6033	NC_022117	AAG	2	6	275226	275231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419255
6034	NC_022117	GCT	2	6	275285	275290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419255
6035	NC_022117	AAC	2	6	275301	275306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419255
6036	NC_022117	CT	3	6	275315	275320	0 %	50 %	0 %	50 %	532419255
6037	NC_022117	ACGA	2	8	275338	275345	50 %	0 %	25 %	25 %	532419255
6038	NC_022117	CTC	2	6	275369	275374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419255
6039	NC_022117	A	7	7	275384	275390	100 %	0 %	0 %	0 %	532419255
6040	NC_022117	TTGTC	2	10	275398	275407	0 %	60 %	20 %	20 %	532419255
6041	NC_022117	GAA	2	6	275411	275416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419255
6042	NC_022117	ATT	2	6	275421	275426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419255
6043	NC_022117	ACG	2	6	275453	275458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419255
6044	NC_022117	ATC	2	6	275487	275492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419255
6045	NC_022117	CTC	2	6	275493	275498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419255
6046	NC_022117	ATA	2	6	275532	275537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419255
6047	NC_022117	A	6	6	275592	275597	100 %	0 %	0 %	0 %	532419255
6048	NC_022117	A	6	6	275682	275687	100 %	0 %	0 %	0 %	532419256
6049	NC_022117	TGGT	2	8	275771	275778	0 %	50 %	50 %	0 %	532419256
6050	NC_022117	AAG	2	6	275797	275802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419256
6051	NC_022117	GAA	2	6	275889	275894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419256
6052	NC_022117	TGT	2	6	275897	275902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419256
6053	NC_022117	ATG	2	6	275982	275987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419256
6054	NC_022117	TCCG	2	8	275992	275999	0 %	25 %	25 %	50 %	532419256
6055	NC_022117	ACC	2	6	276002	276007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419256
6056	NC_022117	CTC	2	6	276016	276021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419256
6057	NC_022117	A	7	7	276068	276074	100 %	0 %	0 %	0 %	532419256
6058	NC_022117	CT	3	6	276099	276104	0 %	50 %	0 %	50 %	532419256
6059	NC_022117	GGA	2	6	276126	276131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419256
6060	NC_022117	AAAG	2	8	276140	276147	75 %	0 %	25 %	0 %	532419256
6061	NC_022117	CTC	2	6	276160	276165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419256
6062	NC_022117	TA	3	6	276222	276227	50 %	50 %	0 %	0 %	532419256
6063	NC_022117	GAA	2	6	276228	276233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419256
6064	NC_022117	GCT	2	6	276276	276281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419256
6065	NC_022117	C	6	6	276328	276333	0 %	0 %	0 %	100 %	532419256
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6067	NC_022117	CT	3	6	276375	276380	0 %	50 %	0 %	50 %	532419256
6068	NC_022117	ATTGT	2	10	276388	276397	20 %	60 %	20 %	0 %	532419256
6069	NC_022117	AATT	2	8	276434	276441	50 %	50 %	0 %	0 %	532419256
6070	NC_022117	ATT	2	6	276468	276473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419256
6071	NC_022117	A	6	6	276554	276559	100 %	0 %	0 %	0 %	532419256
6072	NC_022117	CAG	2	6	276609	276614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419256
6073	NC_022117	AGA	3	9	276623	276631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419256
6074	NC_022117	AGG	2	6	276638	276643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419256
6075	NC_022117	TTCT	2	8	276644	276651	0 %	75 %	0 %	25 %	532419256
6076	NC_022117	TCC	2	6	276704	276709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419256
6077	NC_022117	GCT	2	6	276714	276719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419256
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6080	NC_022117	TGAT	2	8	276820	276827	25 %	50 %	25 %	0 %	532419256
6081	NC_022117	CTC	2	6	276867	276872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419256
6082	NC_022117	AAG	2	6	276902	276907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419256
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6084	NC_022117	TCT	2	6	276925	276930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419256
6085	NC_022117	AAG	2	6	276931	276936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419256
6086	NC_022117	C	6	6	277007	277012	0 %	0 %	0 %	100 %	532419257
6087	NC_022117	CTT	2	6	277028	277033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419257
6088	NC_022117	TA	3	6	277085	277090	50 %	50 %	0 %	0 %	532419257
6089	NC_022117	TCT	2	6	277170	277175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419257
6090	NC_022117	GA	3	6	277177	277182	50 %	0 %	50 %	0 %	532419257
6091	NC_022117	TTG	2	6	277219	277224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419257
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6093	NC_022117	CCAT	2	8	277347	277354	25 %	25 %	0 %	50 %	532419257
6094	NC_022117	ATT	2	6	277532	277537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419257
6095	NC_022117	AAC	2	6	277538	277543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419257
6096	NC_022117	GCT	2	6	277545	277550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419257
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6098	NC_022117	CATAG	2	10	277583	277592	40 %	20 %	20 %	20 %	532419257
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6100	NC_022117	AAAT	2	8	277668	277675	75 %	25 %	0 %	0 %	532419257
6101	NC_022117	GCT	2	6	277785	277790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419257
6102	NC_022117	AACTT	2	10	277924	277933	40 %	40 %	0 %	20 %	532419257
6103	NC_022117	CCAA	2	8	277948	277955	50 %	0 %	0 %	50 %	532419257
6104	NC_022117	CAA	2	6	278008	278013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419257
6105	NC_022117	CAA	2	6	278083	278088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419257
6106	NC_022117	CTTC	2	8	278121	278128	0 %	50 %	0 %	50 %	532419257
6107	NC_022117	ATA	2	6	278133	278138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419257
6108	NC_022117	ATAA	2	8	278213	278220	75 %	25 %	0 %	0 %	532419257
6109	NC_022117	GAA	2	6	278236	278241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419257
6110	NC_022117	AAAT	2	8	278249	278256	75 %	25 %	0 %	0 %	532419257
6111	NC_022117	TC	3	6	278267	278272	0 %	50 %	0 %	50 %	532419257
6112	NC_022117	GAA	2	6	278284	278289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419257
6113	NC_022117	TAA	2	6	278366	278371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419257
6114	NC_022117	CAT	2	6	278375	278380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419257
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6117	NC_022117	GGAACA	2	12	278709	278720	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532419257
6118	NC_022117	ATGCT	2	10	278787	278796	20 %	40 %	20 %	20 %	532419257
6119	NC_022117	TCT	2	6	278908	278913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419257
6120	NC_022117	CAT	2	6	279031	279036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419257
6121	NC_022117	CTT	2	6	279085	279090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419257
6122	NC_022117	AGA	2	6	279102	279107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419257
6123	NC_022117	GTA	2	6	279164	279169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419257
6124	NC_022117	ATA	2	6	279191	279196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419257
6125	NC_022117	ACC	2	6	279214	279219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419257
6126	NC_022117	CCAT	2	8	279226	279233	25 %	25 %	0 %	50 %	532419257
6127	NC_022117	GAG	2	6	279286	279291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419257
6128	NC_022117	GCTT	2	8	279327	279334	0 %	50 %	25 %	25 %	532419257
6129	NC_022117	GTTT	2	8	279394	279401	0 %	75 %	25 %	0 %	532419257
6130	NC_022117	ATATTA	2	12	279417	279428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_022117	AAAG	2	8	279429	279436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_022117	A	6	6	279484	279489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_022117	T	6	6	279508	279513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_022117	AGG	2	6	279519	279524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_022117	GCA	2	6	279603	279608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419258
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6137	NC_022117	TCT	2	6	279631	279636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419258
6138	NC_022117	GCA	2	6	279661	279666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419258
6139	NC_022117	TTA	2	6	279776	279781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419258
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6142	NC_022117	GTA	2	6	279876	279881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419258
6143	NC_022117	AGG	2	6	279902	279907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419258
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6145	NC_022117	TCT	2	6	279937	279942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6146	NC_022117	TGA	2	6	279966	279971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_022117	CT	3	6	280014	280019	0 %	50 %	0 %	50 %	532419259
6148	NC_022117	ATC	2	6	280020	280025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419259
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6151	NC_022117	GA	3	6	280082	280087	50 %	0 %	50 %	0 %	532419259
6152	NC_022117	AAAG	2	8	280114	280121	75 %	0 %	25 %	0 %	532419259
6153	NC_022117	ATA	2	6	280212	280217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419259
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6160	NC_022117	TAAT	2	8	280535	280542	50 %	50 %	0 %	0 %	532419259
6161	NC_022117	TTC	2	6	280545	280550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419259
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6171	NC_022117	A	6	6	281347	281352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6172	NC_022117	TAC	2	6	281356	281361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6173	NC_022117	TCT	2	6	281385	281390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6174	NC_022117	TGC	2	6	281408	281413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6223	NC_022117	CGTT	2	8	283723	283730	0 %	50 %	25 %	25 %	532419260
6224	NC_022117	ATTC	2	8	283732	283739	25 %	50 %	0 %	25 %	532419260
6225	NC_022117	GGGA	2	8	283765	283772	25 %	0 %	75 %	0 %	532419260
6226	NC_022117	CAAA	2	8	283810	283817	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6227	NC_022117	C	6	6	283972	283977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6228	NC_022117	AT	4	8	284031	284038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6229	NC_022117	CAT	2	6	284051	284056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6230	NC_022117	T	9	9	284056	284064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_022117	TTC	2	6	284140	284145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419261
6232	NC_022117	GT	3	6	284164	284169	0 %	50 %	50 %	0 %	532419261
6233	NC_022117	CTG	2	6	284220	284225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419261
6234	NC_022117	CCA	2	6	284345	284350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419261
6235	NC_022117	A	6	6	284355	284360	100 %	0 %	0 %	0 %	532419261
6236	NC_022117	CAC	2	6	284536	284541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419261
6237	NC_022117	CCT	2	6	284570	284575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419261
6238	NC_022117	CTCC	2	8	284618	284625	0 %	25 %	0 %	75 %	532419261
6239	NC_022117	AAGC	2	8	284640	284647	50 %	0 %	25 %	25 %	532419261
6240	NC_022117	ATG	2	6	284657	284662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419261
6241	NC_022117	T	6	6	284713	284718	0 %	100 %	0 %	0 %	532419261
6242	NC_022117	CTC	2	6	284719	284724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419261
6243	NC_022117	GAT	2	6	284768	284773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419261
6244	NC_022117	A	7	7	284774	284780	100 %	0 %	0 %	0 %	532419261
6245	NC_022117	AG	3	6	284841	284846	50 %	0 %	50 %	0 %	532419261
6246	NC_022117	CT	3	6	284883	284888	0 %	50 %	0 %	50 %	532419261
6247	NC_022117	AGA	2	6	284894	284899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419261
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6496	NC_022117	AAAATA	2	12	295767	295778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532419273
6497	NC_022117	AAAC	2	8	295788	295795	75 %	0 %	0 %	25 %	532419273
6498	NC_022117	ACT	2	6	295830	295835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419273
6499	NC_022117	ACT	2	6	295928	295933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419273
6500	NC_022117	AAG	2	6	295989	295994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419273

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