MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022110	TGC	2	6	69635	69640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353262
1502	NC_022110	A	7	7	69672	69678	100 %	0 %	0 %	0 %	532353262
1503	NC_022110	CT	3	6	69680	69685	0 %	50 %	0 %	50 %	532353262
1504	NC_022110	AGA	2	6	69689	69694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353262
1505	NC_022110	GCGAT	2	10	69742	69751	20 %	20 %	40 %	20 %	532353262
1506	NC_022110	GTT	2	6	69764	69769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353262
1507	NC_022110	GCT	2	6	69786	69791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353262
1508	NC_022110	GCA	3	9	69888	69896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353262
1509	NC_022110	AAAG	2	8	69921	69928	75 %	0 %	25 %	0 %	532353262
1510	NC_022110	GCA	2	6	69935	69940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353262
1511	NC_022110	ATT	2	6	69949	69954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353262
1512	NC_022110	TAT	2	6	70057	70062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353262
1513	NC_022110	CTT	2	6	70081	70086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353262
1514	NC_022110	GA	3	6	70090	70095	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
1515	NC_022110	CTCTT	2	10	70096	70105	0 %	60 %	0 %	40 %	532353262
1516	NC_022110	AGAA	2	8	70108	70115	75 %	0 %	25 %	0 %	532353262
1517	NC_022110	TGA	2	6	70136	70141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353262
1518	NC_022110	TTG	2	6	70225	70230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353262
1519	NC_022110	TCT	2	6	70248	70253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353262
1520	NC_022110	GA	3	6	70289	70294	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
1521	NC_022110	AGCT	2	8	70330	70337	25 %	25 %	25 %	25 %	532353262
1522	NC_022110	TGA	2	6	70376	70381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353262
1523	NC_022110	GCAT	2	8	70391	70398	25 %	25 %	25 %	25 %	532353262
1524	NC_022110	AGA	2	6	70409	70414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353262
1525	NC_022110	TCAA	2	8	70535	70542	50 %	25 %	0 %	25 %	532353262
1526	NC_022110	GT	3	6	70565	70570	0 %	50 %	50 %	0 %	532353262
1527	NC_022110	CT	3	6	70646	70651	0 %	50 %	0 %	50 %	532353262
1528	NC_022110	GA	3	6	70667	70672	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
1529	NC_022110	AGT	2	6	70709	70714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353262
1530	NC_022110	AGGGG	2	10	70742	70751	20 %	0 %	80 %	0 %	532353262
1531	NC_022110	AAGAA	2	10	70784	70793	80 %	0 %	20 %	0 %	532353262
1532	NC_022110	AGA	2	6	70856	70861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353262
1533	NC_022110	TGA	2	6	70892	70897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353262
1534	NC_022110	TAT	2	6	70903	70908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353262
1535	NC_022110	T	6	6	70992	70997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_022110	T	8	8	71013	71020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_022110	CAT	2	6	71078	71083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353263
1538	NC_022110	CCTT	2	8	71107	71114	0 %	50 %	0 %	50 %	532353263
1539	NC_022110	GCTT	2	8	71137	71144	0 %	50 %	25 %	25 %	532353263
1540	NC_022110	A	6	6	71232	71237	100 %	0 %	0 %	0 %	532353263
1541	NC_022110	ATT	2	6	71282	71287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353263
1542	NC_022110	CAA	2	6	71429	71434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353263
1543	NC_022110	TCC	2	6	71453	71458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353263
1544	NC_022110	TTCT	2	8	71475	71482	0 %	75 %	0 %	25 %	532353263
1545	NC_022110	ATG	2	6	71487	71492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353263
1546	NC_022110	GCTT	2	8	71521	71528	0 %	50 %	25 %	25 %	532353263
1547	NC_022110	AGA	2	6	71530	71535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353263
1548	NC_022110	GAGC	2	8	71549	71556	25 %	0 %	50 %	25 %	532353263
1549	NC_022110	TCA	2	6	71574	71579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353263
1550	NC_022110	A	7	7	71581	71587	100 %	0 %	0 %	0 %	532353263
1551	NC_022110	CTATTT	2	12	71592	71603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532353263
1552	NC_022110	TGA	2	6	71626	71631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353263
1553	NC_022110	ATG	2	6	71664	71669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353263
1554	NC_022110	AGA	2	6	71794	71799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353263
1555	NC_022110	CT	3	6	71802	71807	0 %	50 %	0 %	50 %	532353263
1556	NC_022110	CGT	2	6	71842	71847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_022110	T	7	7	71847	71853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_022110	CTTGC	2	10	71873	71882	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1559	NC_022110	GATA	2	8	71897	71904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022110	TTC	2	6	71987	71992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353264
1561	NC_022110	CTT	2	6	72055	72060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353264
1562	NC_022110	ATTGG	2	10	72073	72082	20 %	40 %	40 %	0 %	532353264
1563	NC_022110	T	6	6	72089	72094	0 %	100 %	0 %	0 %	532353264
1564	NC_022110	AGC	2	6	72104	72109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353264
1565	NC_022110	TTG	2	6	72133	72138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353264
1566	NC_022110	ATA	2	6	72217	72222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353264
1567	NC_022110	GCT	2	6	72237	72242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353264
1568	NC_022110	GCTA	2	8	72246	72253	25 %	25 %	25 %	25 %	532353264
1569	NC_022110	AAT	2	6	72276	72281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353264
1570	NC_022110	TGG	2	6	72307	72312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353264
1571	NC_022110	T	6	6	72314	72319	0 %	100 %	0 %	0 %	532353264
1572	NC_022110	AGC	2	6	72376	72381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353264
1573	NC_022110	TTAT	2	8	72422	72429	25 %	75 %	0 %	0 %	532353264
1574	NC_022110	TGC	2	6	72430	72435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353264
1575	NC_022110	TGT	2	6	72473	72478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353264
1576	NC_022110	GGAG	2	8	72489	72496	25 %	0 %	75 %	0 %	532353264
1577	NC_022110	GATT	2	8	72524	72531	25 %	50 %	25 %	0 %	532353264
1578	NC_022110	GAA	2	6	72599	72604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353264
1579	NC_022110	CTGG	2	8	72632	72639	0 %	25 %	50 %	25 %	532353264
1580	NC_022110	CTC	2	6	72652	72657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353264
1581	NC_022110	ACTCTT	2	12	72720	72731	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532353264
1582	NC_022110	GAA	2	6	72741	72746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353264
1583	NC_022110	TGA	2	6	72758	72763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353264
1584	NC_022110	GAA	2	6	72791	72796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353264
1585	NC_022110	T	6	6	72873	72878	0 %	100 %	0 %	0 %	532353264
1586	NC_022110	TAG	2	6	72913	72918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353264
1587	NC_022110	TAG	2	6	72922	72927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353264
1588	NC_022110	AGA	2	6	73029	73034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353264
1589	NC_022110	ATCA	2	8	73059	73066	50 %	25 %	0 %	25 %	532353264
1590	NC_022110	TGT	2	6	73132	73137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353264
1591	NC_022110	GAAAA	2	10	73145	73154	80 %	0 %	20 %	0 %	532353264
1592	NC_022110	A	7	7	73151	73157	100 %	0 %	0 %	0 %	532353264
1593	NC_022110	AGG	2	6	73177	73182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353264
1594	NC_022110	TGG	2	6	73255	73260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353265
1595	NC_022110	TTTCTG	2	12	73270	73281	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532353265
1596	NC_022110	AGA	2	6	73307	73312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353265
1597	NC_022110	GA	3	6	73330	73335	50 %	0 %	50 %	0 %	532353265
1598	NC_022110	TAC	2	6	73355	73360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353265
1599	NC_022110	GATCAT	2	12	73400	73411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532353265
1600	NC_022110	TGA	2	6	73433	73438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353265
1601	NC_022110	G	6	6	73491	73496	0 %	0 %	100 %	0 %	532353265
1602	NC_022110	TAT	2	6	73503	73508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353265
1603	NC_022110	A	6	6	73539	73544	100 %	0 %	0 %	0 %	532353265
1604	NC_022110	TGGGA	2	10	73562	73571	20 %	20 %	60 %	0 %	532353265
1605	NC_022110	GCT	2	6	73671	73676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353265
1606	NC_022110	TGGA	2	8	73681	73688	25 %	25 %	50 %	0 %	532353265
1607	NC_022110	AGG	2	6	73715	73720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353265
1608	NC_022110	TC	3	6	73817	73822	0 %	50 %	0 %	50 %	532353265
1609	NC_022110	T	6	6	73845	73850	0 %	100 %	0 %	0 %	532353265
1610	NC_022110	AGC	3	9	73889	73897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353265
1611	NC_022110	AGGC	2	8	74005	74012	25 %	0 %	50 %	25 %	532353265
1612	NC_022110	ATT	2	6	74028	74033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353265
1613	NC_022110	AAG	2	6	74068	74073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353265
1614	NC_022110	AAG	2	6	74131	74136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353265
1615	NC_022110	TGC	2	6	74209	74214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353265
1616	NC_022110	TC	3	6	74224	74229	0 %	50 %	0 %	50 %	532353265
1617	NC_022110	TCA	2	6	74318	74323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353265
1618	NC_022110	ATT	2	6	74368	74373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353265
1619	NC_022110	TCT	2	6	74460	74465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353265
1620	NC_022110	ATG	2	6	74479	74484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353265
1621	NC_022110	AAG	2	6	74634	74639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353265
1622	NC_022110	ACT	2	6	74649	74654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353265
1623	NC_022110	T	6	6	74660	74665	0 %	100 %	0 %	0 %	532353265
1624	NC_022110	AGT	2	6	74685	74690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022110	CAA	2	6	74711	74716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_022110	T	6	6	74769	74774	0 %	100 %	0 %	0 %	532353266
1627	NC_022110	CCA	2	6	74812	74817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353266
1628	NC_022110	TC	3	6	74858	74863	0 %	50 %	0 %	50 %	532353266
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