MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_022110	TG	3	6	46404	46409	0 %	50 %	50 %	0 %	532353247
1003	NC_022110	AG	3	6	46457	46462	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
1004	NC_022110	AAGA	2	8	46464	46471	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
1005	NC_022110	TGG	2	6	46505	46510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353247
1006	NC_022110	CAT	2	6	46637	46642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353247
1007	NC_022110	ACTT	2	8	46725	46732	25 %	50 %	0 %	25 %	532353247
1008	NC_022110	AGTTT	2	10	46864	46873	20 %	60 %	20 %	0 %	532353247
1009	NC_022110	AGA	2	6	46949	46954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353247
1010	NC_022110	AGT	2	6	47034	47039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353247
1011	NC_022110	ATA	2	6	47109	47114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353247
1012	NC_022110	A	6	6	47290	47295	100 %	0 %	0 %	0 %	532353247
1013	NC_022110	GAA	2	6	47302	47307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353247
1014	NC_022110	ATGG	2	8	47351	47358	25 %	25 %	50 %	0 %	532353247
1015	NC_022110	AGGA	2	8	47382	47389	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
1016	NC_022110	GTT	2	6	47411	47416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353247
1017	NC_022110	GGT	2	6	47420	47425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353247
1018	NC_022110	T	6	6	47429	47434	0 %	100 %	0 %	0 %	532353247
1019	NC_022110	ATA	2	6	47437	47442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353247
1020	NC_022110	AGA	2	6	47789	47794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353247
1021	NC_022110	CTG	2	6	47846	47851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353247
1022	NC_022110	GAA	2	6	47859	47864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353247
1023	NC_022110	T	6	6	47897	47902	0 %	100 %	0 %	0 %	532353247
1024	NC_022110	GAAC	2	8	47928	47935	50 %	0 %	25 %	25 %	532353247
1025	NC_022110	AAGT	2	8	47963	47970	50 %	25 %	25 %	0 %	532353247
1026	NC_022110	TAA	2	6	47972	47977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353247
1027	NC_022110	GAAGA	2	10	47996	48005	60 %	0 %	40 %	0 %	532353247
1028	NC_022110	G	6	6	48006	48011	0 %	0 %	100 %	0 %	532353247
1029	NC_022110	AG	3	6	48028	48033	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
1030	NC_022110	TGT	2	6	48047	48052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022110	CTG	2	6	48082	48087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353248
1032	NC_022110	GAG	2	6	48088	48093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353248
1033	NC_022110	TCC	2	6	48101	48106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353248
1034	NC_022110	AACA	2	8	48172	48179	75 %	0 %	0 %	25 %	532353248
1035	NC_022110	TAG	2	6	48289	48294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353248
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1038	NC_022110	CTTT	2	8	48368	48375	0 %	75 %	0 %	25 %	532353248
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1042	NC_022110	TAT	2	6	48487	48492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353248
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1044	NC_022110	T	8	8	48593	48600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022110	GTC	2	6	48725	48730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_022110	AAG	2	6	48747	48752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022110	TAT	2	6	48776	48781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022110	T	8	8	48870	48877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_022110	A	6	6	48921	48926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_022110	TCT	2	6	49340	49345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353249
1062	NC_022110	GTC	2	6	49374	49379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353249
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1064	NC_022110	AGA	2	6	49546	49551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022110	CTATT	2	10	49575	49584	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_022110	AAG	2	6	49608	49613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022110	TCT	2	6	49622	49627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_022110	T	7	7	49683	49689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022110	AAT	2	6	49698	49703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022110	TGT	2	6	49720	49725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_022110	ATT	2	6	49816	49821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022110	CAA	2	6	49835	49840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1103	NC_022110	ACG	2	6	51028	51033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353250
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1109	NC_022110	TCTA	2	8	51338	51345	25 %	50 %	0 %	25 %	532353250
1110	NC_022110	TG	4	8	51374	51381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022110	TAA	2	6	51391	51396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022110	T	6	6	51415	51420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022110	AGT	3	9	51459	51467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022110	GCA	2	6	51515	51520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353251
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1116	NC_022110	GTA	2	6	51547	51552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353251
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1119	NC_022110	AAG	2	6	51613	51618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353251
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1127	NC_022110	AGC	2	6	51870	51875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353251
1128	NC_022110	CAA	2	6	51905	51910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353251
1129	NC_022110	A	7	7	51909	51915	100 %	0 %	0 %	0 %	532353251
1130	NC_022110	A	6	6	51949	51954	100 %	0 %	0 %	0 %	532353251
1131	NC_022110	GCT	2	6	51985	51990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353251
1132	NC_022110	CAA	2	6	52069	52074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353251
1133	NC_022110	GAT	2	6	52112	52117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353251
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1135	NC_022110	TATT	2	8	52163	52170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022110	AAG	2	6	52190	52195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022110	AAT	2	6	52217	52222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022110	ATT	2	6	52229	52234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_022110	CTA	2	6	52287	52292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353252
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1156	NC_022110	T	6	6	53215	53220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_022110	T	6	6	53230	53235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1158	NC_022110	TCT	2	6	53303	53308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1204	NC_022110	TGC	2	6	55339	55344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1251	NC_022110	TGT	2	6	57472	57477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_022110	AGTTGT	2	12	57638	57649	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_022110	AGA	2	6	57709	57714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1261	NC_022110	TGA	2	6	57894	57899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_022110	TGT	2	6	57966	57971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_022110	AGAA	2	8	58035	58042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_022110	CT	3	6	58046	58051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_022110	GTT	2	6	58055	58060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_022110	AGGT	2	8	58075	58082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_022110	CAC	2	6	58188	58193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1273	NC_022110	TCT	2	6	58513	58518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_022110	TGT	2	6	58537	58542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_022110	TTGTTC	2	12	58556	58567	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1280	NC_022110	TCC	2	6	58712	58717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1281	NC_022110	TAGA	2	8	58753	58760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_022110	N	126	126	58786	58911	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1285	NC_022110	T	6	6	58965	58970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1287	NC_022110	T	6	6	59016	59021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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