MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022110	CT	3	6	610938	610943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13502	NC_022110	TCT	2	6	610963	610968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354083
13503	NC_022110	GAC	2	6	611000	611005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354083
13504	NC_022110	TAC	2	6	611008	611013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354083
13505	NC_022110	ATG	2	6	611025	611030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354083
13506	NC_022110	A	6	6	611060	611065	100 %	0 %	0 %	0 %	532354083
13507	NC_022110	AC	3	6	611133	611138	50 %	0 %	0 %	50 %	532354083
13508	NC_022110	CCT	2	6	611185	611190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13509	NC_022110	TCT	2	6	611258	611263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_022110	TTC	2	6	611287	611292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_022110	TGCCA	2	10	611319	611328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13512	NC_022110	GTA	2	6	611378	611383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353715
13513	NC_022110	CT	3	6	611384	611389	0 %	50 %	0 %	50 %	532353715
13514	NC_022110	GATT	2	8	611468	611475	25 %	50 %	25 %	0 %	532353715
13515	NC_022110	TCT	2	6	611495	611500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353715
13516	NC_022110	TC	3	6	611505	611510	0 %	50 %	0 %	50 %	532353715
13517	NC_022110	GGTT	2	8	611551	611558	0 %	50 %	50 %	0 %	532353715
13518	NC_022110	GGATGG	2	12	611563	611574	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532353715
13519	NC_022110	AG	4	8	611616	611623	50 %	0 %	50 %	0 %	532353715
13520	NC_022110	TGG	2	6	611629	611634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353715
13521	NC_022110	ATA	2	6	611654	611659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353715
13522	NC_022110	GGCGC	2	10	611714	611723	0 %	0 %	60 %	40 %	532353715
13523	NC_022110	ATT	2	6	611740	611745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
13524	NC_022110	TAT	2	6	611748	611753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
13525	NC_022110	ATCG	2	8	611770	611777	25 %	25 %	25 %	25 %	532353715
13526	NC_022110	AGA	2	6	611832	611837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353715
13527	NC_022110	GAA	2	6	611854	611859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353715
13528	NC_022110	AG	3	6	611893	611898	50 %	0 %	50 %	0 %	532353715
13529	NC_022110	CT	3	6	611899	611904	0 %	50 %	0 %	50 %	532353715
13530	NC_022110	TTAC	2	8	611921	611928	25 %	50 %	0 %	25 %	532353715
13531	NC_022110	TAA	2	6	611937	611942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353715
13532	NC_022110	CCT	2	6	611966	611971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353715
13533	NC_022110	TTTA	2	8	611974	611981	25 %	75 %	0 %	0 %	532353715
13534	NC_022110	CT	3	6	612014	612019	0 %	50 %	0 %	50 %	532353715
13535	NC_022110	ATT	2	6	612038	612043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
13536	NC_022110	TTTG	2	8	612072	612079	0 %	75 %	25 %	0 %	532353715
13537	NC_022110	ATT	2	6	612090	612095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
13538	NC_022110	GGCT	2	8	612112	612119	0 %	25 %	50 %	25 %	532353715
13539	NC_022110	TCT	2	6	612164	612169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353715
13540	NC_022110	ATT	2	6	612177	612182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
13541	NC_022110	TGG	2	6	612226	612231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353715
13542	NC_022110	T	6	6	612261	612266	0 %	100 %	0 %	0 %	532353715
13543	NC_022110	ATG	2	6	612283	612288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353715
13544	NC_022110	ATTGG	2	10	612289	612298	20 %	40 %	40 %	0 %	532353715
13545	NC_022110	A	6	6	612319	612324	100 %	0 %	0 %	0 %	532353715
13546	NC_022110	AGC	2	6	612372	612377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353715
13547	NC_022110	TTG	2	6	612434	612439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353715
13548	NC_022110	TCAA	2	8	612599	612606	50 %	25 %	0 %	25 %	532353715
13549	NC_022110	TTG	2	6	612612	612617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353715
13550	NC_022110	CGCT	2	8	612645	612652	0 %	25 %	25 %	50 %	532353715
13551	NC_022110	TTTG	2	8	612670	612677	0 %	75 %	25 %	0 %	532353715
13552	NC_022110	ATC	2	6	612725	612730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_022110	A	9	9	612770	612778	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13554	NC_022110	CTT	2	6	612812	612817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353716
13555	NC_022110	GAA	2	6	612827	612832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13556	NC_022110	TTTG	2	8	612846	612853	0 %	75 %	25 %	0 %	532353716
13557	NC_022110	CTCTC	2	10	612854	612863	0 %	40 %	0 %	60 %	532353716
13558	NC_022110	ATAG	2	8	612899	612906	50 %	25 %	25 %	0 %	532353716
13559	NC_022110	GAA	2	6	612992	612997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13560	NC_022110	AAG	2	6	613038	613043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13561	NC_022110	AGA	2	6	613078	613083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13562	NC_022110	GAA	2	6	613100	613105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13563	NC_022110	AAAAC	2	10	613114	613123	80 %	0 %	0 %	20 %	532353716
13564	NC_022110	AAC	2	6	613143	613148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353716
13565	NC_022110	GCTC	2	8	613243	613250	0 %	25 %	25 %	50 %	532353716
13566	NC_022110	AG	3	6	613277	613282	50 %	0 %	50 %	0 %	532353716
13567	NC_022110	TAG	2	6	613342	613347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353716
13568	NC_022110	ATTTT	2	10	613351	613360	20 %	80 %	0 %	0 %	532353716
13569	NC_022110	GCA	2	6	613391	613396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353716
13570	NC_022110	CTATC	2	10	613471	613480	20 %	40 %	0 %	40 %	532353716
13571	NC_022110	A	8	8	613500	613507	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13572	NC_022110	AGA	2	6	613519	613524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13573	NC_022110	CTT	2	6	613549	613554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353716
13574	NC_022110	AGA	2	6	613555	613560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13575	NC_022110	AC	3	6	613590	613595	50 %	0 %	0 %	50 %	532353716
13576	NC_022110	TAT	3	9	613681	613689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353716
13577	NC_022110	ATT	2	6	613730	613735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353716
13578	NC_022110	TTC	2	6	613850	613855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353716
13579	NC_022110	TCA	2	6	613863	613868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353716
13580	NC_022110	CGATAT	3	18	613891	613908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532353716
13581	NC_022110	AG	3	6	613922	613927	50 %	0 %	50 %	0 %	532353716
13582	NC_022110	TTA	2	6	613932	613937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353716
13583	NC_022110	ATT	2	6	613979	613984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353716
13584	NC_022110	TGTA	2	8	614139	614146	25 %	50 %	25 %	0 %	532353716
13585	NC_022110	A	6	6	614183	614188	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13586	NC_022110	TGC	2	6	614221	614226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353716
13587	NC_022110	T	6	6	614353	614358	0 %	100 %	0 %	0 %	532353716
13588	NC_022110	CA	3	6	614392	614397	50 %	0 %	0 %	50 %	532353716
13589	NC_022110	A	7	7	614408	614414	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13590	NC_022110	TC	3	6	614466	614471	0 %	50 %	0 %	50 %	532353716
13591	NC_022110	TTC	2	6	614472	614477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353716
13592	NC_022110	GAA	2	6	614561	614566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13593	NC_022110	CAT	2	6	614616	614621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353716
13594	NC_022110	CGC	2	6	614780	614785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353716
13595	NC_022110	GA	3	6	614826	614831	50 %	0 %	50 %	0 %	532353716
13596	NC_022110	TAA	2	6	614923	614928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353716
13597	NC_022110	ACA	2	6	614963	614968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353716
13598	NC_022110	GCC	2	6	615005	615010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353716
13599	NC_022110	AAG	2	6	615060	615065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13600	NC_022110	CCT	2	6	615092	615097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353716
13601	NC_022110	TTG	2	6	615198	615203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353716
13602	NC_022110	AG	4	8	615205	615212	50 %	0 %	50 %	0 %	532353716
13603	NC_022110	A	7	7	615213	615219	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13604	NC_022110	A	6	6	615266	615271	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13605	NC_022110	TGG	2	6	615297	615302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353716
13606	NC_022110	TAA	2	6	615331	615336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353716
13607	NC_022110	A	8	8	615387	615394	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13608	NC_022110	GCT	2	6	615398	615403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353716
13609	NC_022110	T	7	7	615419	615425	0 %	100 %	0 %	0 %	532353716
13610	NC_022110	TC	3	6	615465	615470	0 %	50 %	0 %	50 %	532353716
13611	NC_022110	GTT	2	6	615502	615507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353716
13612	NC_022110	ATT	2	6	615632	615637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353716
13613	NC_022110	ACT	2	6	615665	615670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353716
13614	NC_022110	GCAGA	2	10	615683	615692	40 %	0 %	40 %	20 %	532353716
13615	NC_022110	A	6	6	615692	615697	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13616	NC_022110	GAA	2	6	615785	615790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353716
13617	NC_022110	TTAT	2	8	615798	615805	25 %	75 %	0 %	0 %	532353716
13618	NC_022110	CGA	2	6	615904	615909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353716
13619	NC_022110	A	6	6	615953	615958	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13620	NC_022110	A	7	7	615988	615994	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
13621	NC_022110	AG	3	6	616004	616009	50 %	0 %	50 %	0 %	532353716
13622	NC_022110	TC	3	6	616011	616016	0 %	50 %	0 %	50 %	532353716
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13624	NC_022110	TTAT	2	8	616061	616068	25 %	75 %	0 %	0 %	532353716
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13992	NC_022110	TCCC	2	8	632630	632637	0 %	25 %	0 %	75 %	532353730
13993	NC_022110	ATT	2	6	632652	632657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353731
13994	NC_022110	ACT	2	6	632688	632693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353731
13995	NC_022110	GCT	2	6	632732	632737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353731
13996	NC_022110	CTAC	2	8	632754	632761	25 %	25 %	0 %	50 %	532353731
13997	NC_022110	TCC	2	6	632787	632792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353731
13998	NC_022110	AGA	2	6	632802	632807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353731
13999	NC_022110	ATGCT	2	10	632834	632843	20 %	40 %	20 %	20 %	532353731
14000	NC_022110	ACGGA	2	10	632968	632977	40 %	0 %	40 %	20 %	532353731

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