MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022110	TAG	2	6	227367	227372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353383
5002	NC_022110	CTT	2	6	227429	227434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353383
5003	NC_022110	T	8	8	227503	227510	0 %	100 %	0 %	0 %	532353383
5004	NC_022110	AGA	2	6	227701	227706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_022110	ATT	2	6	227738	227743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_022110	TTC	2	6	227822	227827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353384
5007	NC_022110	GAA	2	6	227896	227901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353384
5008	NC_022110	TGA	2	6	227928	227933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353384
5009	NC_022110	ATT	2	6	228007	228012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353384
5010	NC_022110	AGA	2	6	228069	228074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353384
5011	NC_022110	TC	3	6	228075	228080	0 %	50 %	0 %	50 %	532353384
5012	NC_022110	TGA	2	6	228102	228107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353384
5013	NC_022110	TCG	2	6	228191	228196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353384
5014	NC_022110	A	7	7	228263	228269	100 %	0 %	0 %	0 %	532353384
5015	NC_022110	CCTT	2	8	228271	228278	0 %	50 %	0 %	50 %	532353384
5016	NC_022110	TTG	2	6	228293	228298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353384
5017	NC_022110	T	6	6	228329	228334	0 %	100 %	0 %	0 %	532353384
5018	NC_022110	GATA	2	8	228366	228373	50 %	25 %	25 %	0 %	532353384
5019	NC_022110	ATT	2	6	228406	228411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353384
5020	NC_022110	GAA	2	6	228415	228420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353384
5021	NC_022110	TCT	2	6	228446	228451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353384
5022	NC_022110	AGA	2	6	228480	228485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353384
5023	NC_022110	CTT	2	6	228572	228577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353384
5024	NC_022110	TAC	2	6	228674	228679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353385
5025	NC_022110	TAT	2	6	228683	228688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353385
5026	NC_022110	TCT	2	6	228743	228748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353385
5027	NC_022110	GCTTG	2	10	228807	228816	0 %	40 %	40 %	20 %	532353385
5028	NC_022110	TTTC	2	8	228819	228826	0 %	75 %	0 %	25 %	532353385
5029	NC_022110	CTT	2	6	228881	228886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353385
5030	NC_022110	TTA	2	6	228948	228953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353385
5031	NC_022110	TGT	2	6	229004	229009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353385
5032	NC_022110	T	6	6	229073	229078	0 %	100 %	0 %	0 %	532353385
5033	NC_022110	TAT	2	6	229148	229153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353385
5034	NC_022110	ATT	2	6	229227	229232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353385
5035	NC_022110	CAC	2	6	229273	229278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353385
5036	NC_022110	GAA	2	6	229293	229298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353385
5037	NC_022110	ATT	2	6	229359	229364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353385
5038	NC_022110	CAA	2	6	229426	229431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353385
5039	NC_022110	TTCT	2	8	229495	229502	0 %	75 %	0 %	25 %	532353385
5040	NC_022110	ACT	2	6	229506	229511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353385
5041	NC_022110	ATG	2	6	229548	229553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353385
5042	NC_022110	CTTC	2	8	229555	229562	0 %	50 %	0 %	50 %	532353385
5043	NC_022110	TTAT	2	8	229657	229664	25 %	75 %	0 %	0 %	532353385
5044	NC_022110	CTAT	2	8	229676	229683	25 %	50 %	0 %	25 %	532353385
5045	NC_022110	TCTT	2	8	229723	229730	0 %	75 %	0 %	25 %	532353385
5046	NC_022110	TGC	2	6	229766	229771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353385
5047	NC_022110	CTTAGC	2	12	229772	229783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532353385
5048	NC_022110	GGA	2	6	229803	229808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353385
5049	NC_022110	CA	3	6	229811	229816	50 %	0 %	0 %	50 %	532353385
5050	NC_022110	TGG	2	6	229875	229880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353385
5051	NC_022110	TTGG	2	8	229919	229926	0 %	50 %	50 %	0 %	532353385
5052	NC_022110	TGG	3	9	229938	229946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353385
5053	NC_022110	GTC	2	6	229992	229997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353385
5054	NC_022110	CTT	2	6	230030	230035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353385
5055	NC_022110	AGA	2	6	230076	230081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_022110	CTT	2	6	230098	230103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353386
5057	NC_022110	CTA	2	6	230157	230162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353386
5058	NC_022110	ATTT	2	8	230166	230173	25 %	75 %	0 %	0 %	532353386
5059	NC_022110	TGG	2	6	230244	230249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353386
5060	NC_022110	AAT	3	9	230344	230352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353386
5061	NC_022110	GAA	2	6	230443	230448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353386
5062	NC_022110	GC	3	6	230455	230460	0 %	0 %	50 %	50 %	532353386
5063	NC_022110	ATT	2	6	230503	230508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353386
5064	NC_022110	GCA	2	6	230616	230621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353386
5065	NC_022110	CTA	2	6	230657	230662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353386
5066	NC_022110	CATC	2	8	230672	230679	25 %	25 %	0 %	50 %	532353386
5067	NC_022110	TTA	2	6	230729	230734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353386
5068	NC_022110	TCT	3	9	230749	230757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353386
5069	NC_022110	A	6	6	230825	230830	100 %	0 %	0 %	0 %	532353386
5070	NC_022110	GCT	2	6	230884	230889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353386
5071	NC_022110	TCT	2	6	231019	231024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353386
5072	NC_022110	T	6	6	231198	231203	0 %	100 %	0 %	0 %	532353386
5073	NC_022110	GC	3	6	231357	231362	0 %	0 %	50 %	50 %	532353386
5074	NC_022110	GAC	2	6	231384	231389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353386
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5079	NC_022110	TCC	2	6	231567	231572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353386
5080	NC_022110	AATG	2	8	231595	231602	50 %	25 %	25 %	0 %	532353386
5081	NC_022110	ATT	2	6	231644	231649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353386
5082	NC_022110	ATG	2	6	231690	231695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353386
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5085	NC_022110	A	6	6	231796	231801	100 %	0 %	0 %	0 %	532353387
5086	NC_022110	AAG	2	6	231892	231897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353387
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5088	NC_022110	AGG	2	6	232061	232066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353387
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5090	NC_022110	AGA	2	6	232154	232159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353387
5091	NC_022110	CT	3	6	232181	232186	0 %	50 %	0 %	50 %	532353387
5092	NC_022110	C	6	6	232193	232198	0 %	0 %	0 %	100 %	532353387
5093	NC_022110	A	6	6	232233	232238	100 %	0 %	0 %	0 %	532353387
5094	NC_022110	AAG	2	6	232294	232299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353387
5095	NC_022110	TTAC	2	8	232310	232317	25 %	50 %	0 %	25 %	532353387
5096	NC_022110	TCA	2	6	232349	232354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353387
5097	NC_022110	AT	3	6	232398	232403	50 %	50 %	0 %	0 %	532353387
5098	NC_022110	TCA	2	6	232415	232420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353387
5099	NC_022110	ATT	2	6	232475	232480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353387
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5101	NC_022110	CTT	2	6	232602	232607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353387
5102	NC_022110	GCTA	2	8	232627	232634	25 %	25 %	25 %	25 %	532353388
5103	NC_022110	CTT	3	9	232689	232697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353388
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5107	NC_022110	TTA	2	6	232818	232823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353388
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5109	NC_022110	ATT	2	6	232884	232889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353388
5110	NC_022110	CT	3	6	232913	232918	0 %	50 %	0 %	50 %	532353388
5111	NC_022110	A	6	6	232929	232934	100 %	0 %	0 %	0 %	532353388
5112	NC_022110	CAAAA	2	10	232936	232945	80 %	0 %	0 %	20 %	532353388
5113	NC_022110	AGA	2	6	232950	232955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353388
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5118	NC_022110	TTCT	2	8	233202	233209	0 %	75 %	0 %	25 %	532353388
5119	NC_022110	CAT	2	6	233222	233227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353388
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5121	NC_022110	CAAA	2	8	233434	233441	75 %	0 %	0 %	25 %	532353388
5122	NC_022110	CAA	2	6	233519	233524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353388
5123	NC_022110	TCTCT	2	10	233550	233559	0 %	60 %	0 %	40 %	532353388
5124	NC_022110	CTT	2	6	233649	233654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353388
5125	NC_022110	GCT	2	6	233786	233791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353388
5126	NC_022110	TC	3	6	233792	233797	0 %	50 %	0 %	50 %	532353388
5127	NC_022110	ATG	2	6	233894	233899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353388
5128	NC_022110	TCAA	2	8	233916	233923	50 %	25 %	0 %	25 %	532353388
5129	NC_022110	TTA	2	6	234005	234010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353388
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5135	NC_022110	GCT	2	6	234236	234241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353388
5136	NC_022110	ACC	2	6	234245	234250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5137	NC_022110	A	6	6	234276	234281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_022110	ACT	2	6	234340	234345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_022110	TTC	2	6	234442	234447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_022110	A	6	6	234455	234460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_022110	T	7	7	234491	234497	0 %	100 %	0 %	0 %	532353389
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5145	NC_022110	TAA	2	6	234646	234651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353389
5146	NC_022110	CCT	2	6	234659	234664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353389
5147	NC_022110	TCC	2	6	234682	234687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353389
5148	NC_022110	CTG	2	6	234702	234707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353389
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5150	NC_022110	TAG	2	6	234814	234819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353389
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5152	NC_022110	AG	3	6	235010	235015	50 %	0 %	50 %	0 %	532353389
5153	NC_022110	GTT	2	6	235086	235091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353389
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5157	NC_022110	A	6	6	235241	235246	100 %	0 %	0 %	0 %	532353389
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5162	NC_022110	AAG	2	6	235453	235458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353389
5163	NC_022110	AT	3	6	235568	235573	50 %	50 %	0 %	0 %	532353389
5164	NC_022110	A	6	6	235596	235601	100 %	0 %	0 %	0 %	532353389
5165	NC_022110	A	7	7	235618	235624	100 %	0 %	0 %	0 %	532353389
5166	NC_022110	CAT	2	6	235641	235646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353389
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5169	NC_022110	CTT	3	9	235775	235783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353389
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5171	NC_022110	CTGT	2	8	235850	235857	0 %	50 %	25 %	25 %	532353390
5172	NC_022110	AAC	2	6	235921	235926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353390
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5176	NC_022110	TTGA	2	8	236460	236467	25 %	50 %	25 %	0 %	532353390
5177	NC_022110	CTT	2	6	236472	236477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353390
5178	NC_022110	AAGT	2	8	236541	236548	50 %	25 %	25 %	0 %	532353390
5179	NC_022110	TTCCTT	2	12	236604	236615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353390
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5182	NC_022110	TGC	2	6	236940	236945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353390
5183	NC_022110	GAT	2	6	236951	236956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353390
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5196	NC_022110	A	7	7	237715	237721	100 %	0 %	0 %	0 %	532353390
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5199	NC_022110	GT	3	6	237849	237854	0 %	50 %	50 %	0 %	532353390
5200	NC_022110	TCC	2	6	238054	238059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353390
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5202	NC_022110	TGT	2	6	238144	238149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353390
5203	NC_022110	TC	3	6	238164	238169	0 %	50 %	0 %	50 %	532353390
5204	NC_022110	AG	3	6	238190	238195	50 %	0 %	50 %	0 %	532353390
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5211	NC_022110	T	6	6	238615	238620	0 %	100 %	0 %	0 %	532353391
5212	NC_022110	CTG	2	6	238687	238692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353391
5213	NC_022110	GAC	2	6	238717	238722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353391
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5220	NC_022110	TCTCCT	2	12	239482	239493	0 %	50 %	0 %	50 %	532353391
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5222	NC_022110	TAG	3	9	239593	239601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353391
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5224	NC_022110	AAT	2	6	239689	239694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353391
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5228	NC_022110	AGA	2	6	239871	239876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353392
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5230	NC_022110	TCA	2	6	239959	239964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353392
5231	NC_022110	TCT	2	6	239986	239991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353392
5232	NC_022110	AAACCA	2	12	240056	240067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353392
5233	NC_022110	A	6	6	240077	240082	100 %	0 %	0 %	0 %	532353392
5234	NC_022110	AATCT	2	10	240172	240181	40 %	40 %	0 %	20 %	532353392
5235	NC_022110	TCA	2	6	240197	240202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353392
5236	NC_022110	CA	3	6	240214	240219	50 %	0 %	0 %	50 %	532353392
5237	NC_022110	ACT	2	6	240362	240367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353393
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5239	NC_022110	CTT	2	6	240438	240443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353393
5240	NC_022110	CTG	2	6	240444	240449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353393
5241	NC_022110	T	6	6	240463	240468	0 %	100 %	0 %	0 %	532353393
5242	NC_022110	AAT	2	6	240529	240534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353393
5243	NC_022110	ATTA	2	8	240571	240578	50 %	50 %	0 %	0 %	532353393
5244	NC_022110	T	7	7	240629	240635	0 %	100 %	0 %	0 %	532353393
5245	NC_022110	AAT	2	6	240701	240706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353393
5246	NC_022110	TC	3	6	240825	240830	0 %	50 %	0 %	50 %	532353394
5247	NC_022110	AGA	2	6	240872	240877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353394
5248	NC_022110	CTA	2	6	240946	240951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353394
5249	NC_022110	GAA	3	9	240976	240984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353394
5250	NC_022110	T	6	6	240985	240990	0 %	100 %	0 %	0 %	532353394
5251	NC_022110	CTC	2	6	241009	241014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353394
5252	NC_022110	TCCA	2	8	241052	241059	25 %	25 %	0 %	50 %	532353394
5253	NC_022110	CT	3	6	241205	241210	0 %	50 %	0 %	50 %	532353394
5254	NC_022110	CA	4	8	241235	241242	50 %	0 %	0 %	50 %	532353394
5255	NC_022110	CCA	2	6	241252	241257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353394
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5257	NC_022110	GTT	2	6	241327	241332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353394
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5261	NC_022110	CT	3	6	241484	241489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5262	NC_022110	TAG	2	6	241523	241528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5282	NC_022110	TCT	2	6	242297	242302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353395
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5364	NC_022110	TG	3	6	245645	245650	0 %	50 %	50 %	0 %	532353397
5365	NC_022110	TTCT	2	8	245669	245676	0 %	75 %	0 %	25 %	532353397
5366	NC_022110	TCC	2	6	245702	245707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353397
5367	NC_022110	C	6	6	245706	245711	0 %	0 %	0 %	100 %	532353397
5368	NC_022110	AAG	2	6	245714	245719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353397
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5372	NC_022110	AAG	2	6	245870	245875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353397
5373	NC_022110	TTTC	2	8	245880	245887	0 %	75 %	0 %	25 %	532353397
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5391	NC_022110	ATG	2	6	246864	246869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5473	NC_022110	GTATG	2	10	250150	250159	20 %	40 %	40 %	0 %	532353402
5474	NC_022110	GA	3	6	250192	250197	50 %	0 %	50 %	0 %	532353402
5475	NC_022110	ACT	2	6	250252	250257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353402
5476	NC_022110	TG	3	6	250302	250307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5477	NC_022110	AATA	2	8	250367	250374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5478	NC_022110	T	6	6	250389	250394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5479	NC_022110	T	7	7	250408	250414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5480	NC_022110	A	6	6	250416	250421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5481	NC_022110	ACA	2	6	250516	250521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5482	NC_022110	CTT	2	6	250523	250528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5483	NC_022110	AAG	2	6	250554	250559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5484	NC_022110	GCA	2	6	250573	250578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353403
5485	NC_022110	TTG	2	6	250593	250598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353403
5486	NC_022110	CAAA	2	8	250756	250763	75 %	0 %	0 %	25 %	532353404
5487	NC_022110	ATA	2	6	250779	250784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353404
5488	NC_022110	CTTT	3	12	250918	250929	0 %	75 %	0 %	25 %	532353404
5489	NC_022110	CTG	2	6	250932	250937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353404
5490	NC_022110	CGA	2	6	250960	250965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353404
5491	NC_022110	CTT	2	6	250971	250976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353404
5492	NC_022110	ACA	2	6	250993	250998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353404
5493	NC_022110	CAA	2	6	251056	251061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353404
5494	NC_022110	AG	3	6	251101	251106	50 %	0 %	50 %	0 %	532353404
5495	NC_022110	A	8	8	251107	251114	100 %	0 %	0 %	0 %	532353404
5496	NC_022110	AGA	2	6	251125	251130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_022110	CAT	4	12	251174	251185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5498	NC_022110	TTA	2	6	251320	251325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353405
5499	NC_022110	TCGT	2	8	251355	251362	0 %	50 %	25 %	25 %	532353405
5500	NC_022110	AGT	2	6	251375	251380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353405

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