MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022109	AAC	2	6	135665	135670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352394
3002	NC_022109	GTT	2	6	135708	135713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352394
3003	NC_022109	ATT	2	6	135720	135725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352394
3004	NC_022109	ATTGG	2	10	135783	135792	20 %	40 %	40 %	0 %	532352394
3005	NC_022109	ATTGT	2	10	135816	135825	20 %	60 %	20 %	0 %	532352394
3006	NC_022109	TGG	2	6	135865	135870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352394
3007	NC_022109	GTG	2	6	136069	136074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352395
3008	NC_022109	GCTA	2	8	136080	136087	25 %	25 %	25 %	25 %	532352395
3009	NC_022109	CGC	2	6	136113	136118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352395
3010	NC_022109	TG	3	6	136139	136144	0 %	50 %	50 %	0 %	532352395
3011	NC_022109	TG	3	6	136165	136170	0 %	50 %	50 %	0 %	532352395
3012	NC_022109	TAG	2	6	136202	136207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352395
3013	NC_022109	ACA	2	6	136210	136215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352395
3014	NC_022109	CTT	2	6	136224	136229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352395
3015	NC_022109	TGTTT	2	10	136242	136251	0 %	80 %	20 %	0 %	532352395
3016	NC_022109	GCT	2	6	136255	136260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352395
3017	NC_022109	GGAT	2	8	136270	136277	25 %	25 %	50 %	0 %	532352395
3018	NC_022109	CTG	2	6	136391	136396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_022109	CAAT	2	8	136419	136426	50 %	25 %	0 %	25 %	532352396
3020	NC_022109	AAGC	2	8	136473	136480	50 %	0 %	25 %	25 %	532352396
3021	NC_022109	TTTG	2	8	136499	136506	0 %	75 %	25 %	0 %	532352396
3022	NC_022109	GCG	2	6	136542	136547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352396
3023	NC_022109	CTG	3	9	136564	136572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352396
3024	NC_022109	TTC	2	6	136573	136578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352396
3025	NC_022109	CTG	2	6	136584	136589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352396
3026	NC_022109	AAC	2	6	136595	136600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352396
3027	NC_022109	TTTG	2	8	136614	136621	0 %	75 %	25 %	0 %	532352396
3028	NC_022109	CAG	2	6	136651	136656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352396
3029	NC_022109	GAA	2	6	136686	136691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352396
3030	NC_022109	GCT	2	6	136701	136706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352396
3031	NC_022109	CAG	2	6	136719	136724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352396
3032	NC_022109	AGG	2	6	136730	136735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352396
3033	NC_022109	GAG	2	6	136746	136751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352396
3034	NC_022109	CAC	2	6	136759	136764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352396
3035	NC_022109	GAT	2	6	136842	136847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352396
3036	NC_022109	ATAA	2	8	136848	136855	75 %	25 %	0 %	0 %	532352396
3037	NC_022109	ACA	2	6	136858	136863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352396
3038	NC_022109	AGG	2	6	136919	136924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_022109	CCT	2	6	136929	136934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_022109	T	9	9	136936	136944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_022109	TTGCA	2	10	137031	137040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_022109	GAG	2	6	137095	137100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352397
3043	NC_022109	TC	3	6	137105	137110	0 %	50 %	0 %	50 %	532352397
3044	NC_022109	CT	3	6	137134	137139	0 %	50 %	0 %	50 %	532352397
3045	NC_022109	TTC	2	6	137232	137237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352397
3046	NC_022109	CTT	2	6	137282	137287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352397
3047	NC_022109	CT	3	6	137316	137321	0 %	50 %	0 %	50 %	532352397
3048	NC_022109	A	6	6	137366	137371	100 %	0 %	0 %	0 %	532352397
3049	NC_022109	TCT	2	6	137383	137388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352397
3050	NC_022109	CAG	2	6	137477	137482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352397
3051	NC_022109	AG	3	6	137481	137486	50 %	0 %	50 %	0 %	532352397
3052	NC_022109	GAA	2	6	137522	137527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352397
3053	NC_022109	TTCT	2	8	137529	137536	0 %	75 %	0 %	25 %	532352397
3054	NC_022109	AATT	2	8	137555	137562	50 %	50 %	0 %	0 %	532352397
3055	NC_022109	AAG	2	6	137667	137672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352397
3056	NC_022109	CAA	2	6	137705	137710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352397
3057	NC_022109	GCT	2	6	137767	137772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352397
3058	NC_022109	AAG	2	6	137795	137800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352397
3059	NC_022109	TTG	2	6	137985	137990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353129
3060	NC_022109	ATGT	2	8	138135	138142	25 %	50 %	25 %	0 %	532353129
3061	NC_022109	AGG	2	6	138152	138157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353129
3062	NC_022109	AAT	2	6	138185	138190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353129
3063	NC_022109	CTT	2	6	138208	138213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353129
3064	NC_022109	GA	3	6	138282	138287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_022109	A	6	6	138298	138303	100 %	0 %	0 %	0 %	532352398
3066	NC_022109	TAT	2	6	138327	138332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352398
3067	NC_022109	AGA	2	6	138375	138380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352398
3068	NC_022109	ATGG	2	8	138412	138419	25 %	25 %	50 %	0 %	532352398
3069	NC_022109	GTT	2	6	138454	138459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352398
3070	NC_022109	ATT	2	6	138601	138606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352398
3071	NC_022109	TC	3	6	138647	138652	0 %	50 %	0 %	50 %	532352398
3072	NC_022109	AGAA	2	8	138762	138769	75 %	0 %	25 %	0 %	532352398
3073	NC_022109	GAAG	2	8	138808	138815	50 %	0 %	50 %	0 %	532352398
3074	NC_022109	TTGA	2	8	138820	138827	25 %	50 %	25 %	0 %	532352398
3075	NC_022109	GGT	2	6	138835	138840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352398
3076	NC_022109	CCT	2	6	138899	138904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352398
3077	NC_022109	T	7	7	138906	138912	0 %	100 %	0 %	0 %	532352398
3078	NC_022109	GAAA	2	8	138933	138940	75 %	0 %	25 %	0 %	532352398
3079	NC_022109	GAA	2	6	138961	138966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352398
3080	NC_022109	AGT	2	6	139030	139035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352399
3081	NC_022109	TTA	2	6	139074	139079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352399
3082	NC_022109	GA	3	6	139118	139123	50 %	0 %	50 %	0 %	532352399
3083	NC_022109	AAG	2	6	139149	139154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352399
3084	NC_022109	T	6	6	139326	139331	0 %	100 %	0 %	0 %	532352399
3085	NC_022109	AGG	2	6	139405	139410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352399
3086	NC_022109	A	6	6	139415	139420	100 %	0 %	0 %	0 %	532352399
3087	NC_022109	TTA	2	6	139479	139484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352399
3088	NC_022109	TAA	2	6	139582	139587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352400
3089	NC_022109	GAGTTA	2	12	139622	139633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352400
3090	NC_022109	AAGA	2	8	139704	139711	75 %	0 %	25 %	0 %	532352400
3091	NC_022109	AG	3	6	139753	139758	50 %	0 %	50 %	0 %	532352400
3092	NC_022109	GAA	2	6	139765	139770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352400
3093	NC_022109	TTA	2	6	139860	139865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352400
3094	NC_022109	GTT	2	6	139895	139900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352400
3095	NC_022109	AGA	2	6	139960	139965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352400
3096	NC_022109	TCCAG	2	10	139987	139996	20 %	20 %	20 %	40 %	532352400
3097	NC_022109	GAA	2	6	140038	140043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352400
3098	NC_022109	ATTG	2	8	140047	140054	25 %	50 %	25 %	0 %	532352401
3099	NC_022109	ATT	2	6	140081	140086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352401
3100	NC_022109	AAG	2	6	140142	140147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352401
3101	NC_022109	CTT	2	6	140159	140164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352401
3102	NC_022109	GCA	2	6	140198	140203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352401
3103	NC_022109	CCTA	2	8	140208	140215	25 %	25 %	0 %	50 %	532352401
3104	NC_022109	GCT	2	6	140234	140239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352401
3105	NC_022109	TCA	2	6	140499	140504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352401
3106	NC_022109	TAA	2	6	140608	140613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352401
3107	NC_022109	GTACA	2	10	140718	140727	40 %	20 %	20 %	20 %	532352401
3108	NC_022109	AGA	2	6	140749	140754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352401
3109	NC_022109	GAA	2	6	140933	140938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352401
3110	NC_022109	TAA	2	6	141067	141072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352401
3111	NC_022109	TAGAT	2	10	141091	141100	40 %	40 %	20 %	0 %	532352401
3112	NC_022109	TAT	2	6	141101	141106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352401
3113	NC_022109	CTCC	2	8	141107	141114	0 %	25 %	0 %	75 %	532352401
3114	NC_022109	CTG	2	6	141123	141128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352401
3115	NC_022109	CCT	2	6	141167	141172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352401
3116	NC_022109	TAT	2	6	141173	141178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352401
3117	NC_022109	TGG	2	6	141268	141273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352401
3118	NC_022109	TCA	2	6	141295	141300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352401
3119	NC_022109	TCT	2	6	141325	141330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352401
3120	NC_022109	ATTA	2	8	141344	141351	50 %	50 %	0 %	0 %	532352401
3121	NC_022109	T	8	8	141413	141420	0 %	100 %	0 %	0 %	532352401
3122	NC_022109	T	6	6	141458	141463	0 %	100 %	0 %	0 %	532353130
3123	NC_022109	AAG	2	6	141467	141472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353130
3124	NC_022109	AAAAG	2	10	141503	141512	80 %	0 %	20 %	0 %	532353130
3125	NC_022109	T	6	6	141527	141532	0 %	100 %	0 %	0 %	532353130
3126	NC_022109	GCT	2	6	141563	141568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353130
3127	NC_022109	A	6	6	141579	141584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_022109	ATC	2	6	141587	141592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_022109	A	6	6	141636	141641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_022109	CTC	2	6	141786	141791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352402
3131	NC_022109	AAAAC	2	10	141983	141992	80 %	0 %	0 %	20 %	532352402
3132	NC_022109	AGA	2	6	142137	142142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352403
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3136	NC_022109	CTT	2	6	142412	142417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352403
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3138	NC_022109	A	6	6	142446	142451	100 %	0 %	0 %	0 %	532352403
3139	NC_022109	AT	3	6	142514	142519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_022109	CTT	2	6	142541	142546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_022109	AAG	2	6	142551	142556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_022109	AAAG	2	8	142631	142638	75 %	0 %	25 %	0 %	532352404
3143	NC_022109	T	6	6	142675	142680	0 %	100 %	0 %	0 %	532352404
3144	NC_022109	GCA	2	6	142683	142688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352404
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3146	NC_022109	TCA	2	6	142714	142719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352404
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3152	NC_022109	GAAA	2	8	142964	142971	75 %	0 %	25 %	0 %	532352404
3153	NC_022109	GA	3	6	142984	142989	50 %	0 %	50 %	0 %	532352404
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3160	NC_022109	A	6	6	143157	143162	100 %	0 %	0 %	0 %	532352404
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3165	NC_022109	AGA	2	6	143258	143263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352404
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3167	NC_022109	TTG	2	6	143453	143458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_022109	TCA	2	6	143501	143506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352405
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3186	NC_022109	T	6	6	144332	144337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3187	NC_022109	T	7	7	144365	144371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3188	NC_022109	TACA	2	8	144397	144404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3231	NC_022109	TAA	2	6	146655	146660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352408
3232	NC_022109	A	6	6	146718	146723	100 %	0 %	0 %	0 %	532352408
3233	NC_022109	AAT	2	6	146743	146748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352408
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3236	NC_022109	TAGA	2	8	146877	146884	50 %	25 %	25 %	0 %	532352408
3237	NC_022109	A	6	6	146892	146897	100 %	0 %	0 %	0 %	532352408
3238	NC_022109	GCC	2	6	146929	146934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352408
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3240	NC_022109	GA	4	8	146946	146953	50 %	0 %	50 %	0 %	532352408
3241	NC_022109	T	7	7	146967	146973	0 %	100 %	0 %	0 %	532352408
3242	NC_022109	AAG	2	6	147059	147064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352408
3243	NC_022109	TCAG	2	8	147116	147123	25 %	25 %	25 %	25 %	532352408
3244	NC_022109	AAG	2	6	147223	147228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352408
3245	NC_022109	TGT	2	6	147284	147289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352408
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3247	NC_022109	TCT	2	6	147419	147424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352408
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3251	NC_022109	AG	3	6	147590	147595	50 %	0 %	50 %	0 %	532352408
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3254	NC_022109	GAA	2	6	147972	147977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352408
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3371	NC_022109	ATTCT	2	10	152508	152517	20 %	60 %	0 %	20 %	532352412
3372	NC_022109	AACG	2	8	152524	152531	50 %	0 %	25 %	25 %	532352412
3373	NC_022109	TGA	3	9	152645	152653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352412
3374	NC_022109	TGTT	2	8	152693	152700	0 %	75 %	25 %	0 %	532352412
3375	NC_022109	CTGTG	2	10	152712	152721	0 %	40 %	40 %	20 %	532352412
3376	NC_022109	AGC	2	6	152790	152795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352412
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3379	NC_022109	TTG	2	6	152912	152917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352412
3380	NC_022109	TTA	2	6	152950	152955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352412
3381	NC_022109	GCA	2	6	152971	152976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352412
3382	NC_022109	GCA	2	6	152989	152994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352412
3383	NC_022109	GTT	2	6	153211	153216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352412
3384	NC_022109	AG	3	6	153295	153300	50 %	0 %	50 %	0 %	532352412
3385	NC_022109	CTTT	2	8	153324	153331	0 %	75 %	0 %	25 %	532352412
3386	NC_022109	A	6	6	153373	153378	100 %	0 %	0 %	0 %	532352412
3387	NC_022109	GCG	2	6	153395	153400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3388	NC_022109	AT	3	6	153449	153454	50 %	50 %	0 %	0 %	532352413
3389	NC_022109	T	7	7	153464	153470	0 %	100 %	0 %	0 %	532352413
3390	NC_022109	T	6	6	153535	153540	0 %	100 %	0 %	0 %	532352413
3391	NC_022109	ATC	2	6	153565	153570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352413
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3393	NC_022109	TGTGCG	2	12	153589	153600	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532352413
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3399	NC_022109	ACG	2	6	153873	153878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352413
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3407	NC_022109	CTT	2	6	154066	154071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352413
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3422	NC_022109	TGT	2	6	154811	154816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352414
3423	NC_022109	CCTCAT	2	12	154887	154898	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352414
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3428	NC_022109	GACT	2	8	155213	155220	25 %	25 %	25 %	25 %	532352415
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3432	NC_022109	TGG	3	9	155400	155408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352415
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3439	NC_022109	GAA	2	6	155785	155790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352415
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3457	NC_022109	GAA	3	9	156840	156848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352416
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3464	NC_022109	AG	3	6	157060	157065	50 %	0 %	50 %	0 %	532352416
3465	NC_022109	AG	3	6	157125	157130	50 %	0 %	50 %	0 %	532352416
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3469	NC_022109	A	6	6	157214	157219	100 %	0 %	0 %	0 %	532352416
3470	NC_022109	ACAT	2	8	157230	157237	50 %	25 %	0 %	25 %	532352416
3471	NC_022109	TGTT	2	8	157276	157283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3472	NC_022109	TTCTA	2	10	157289	157298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3473	NC_022109	AG	3	6	157319	157324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3474	NC_022109	TAA	2	6	157334	157339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3475	NC_022109	ATT	2	6	157428	157433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352417
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3477	NC_022109	CTTG	2	8	157613	157620	0 %	50 %	25 %	25 %	532352417
3478	NC_022109	GA	3	6	157629	157634	50 %	0 %	50 %	0 %	532352417
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3481	NC_022109	CTCCAT	2	12	157714	157725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352417
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3486	NC_022109	T	6	6	157940	157945	0 %	100 %	0 %	0 %	532352417
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3489	NC_022109	T	6	6	158060	158065	0 %	100 %	0 %	0 %	532352417
3490	NC_022109	AGA	2	6	158082	158087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352417
3491	NC_022109	AAAG	2	8	158119	158126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_022109	TTTA	2	8	158128	158135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_022109	CTA	2	6	158189	158194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_022109	AAG	2	6	158231	158236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_022109	TAAT	2	8	158245	158252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_022109	TCCTTG	2	12	158310	158321	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352418
3497	NC_022109	GAA	2	6	158331	158336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352418
3498	NC_022109	GTT	2	6	158348	158353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352418
3499	NC_022109	AAGTTT	2	12	158395	158406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532352418
3500	NC_022109	TTA	2	6	158519	158524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352418

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