MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_022109	TTGC	2	8	1022781	1022788	0 %	50 %	25 %	25 %	532353111
22502	NC_022109	ATG	2	6	1022888	1022893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353111
22503	NC_022109	AAG	2	6	1022916	1022921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353111
22504	NC_022109	GGA	2	6	1022978	1022983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353111
22505	NC_022109	ATA	2	6	1022999	1023004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353111
22506	NC_022109	TTA	2	6	1023015	1023020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353111
22507	NC_022109	AAT	2	6	1023029	1023034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353111
22508	NC_022109	AAAC	2	8	1023074	1023081	75 %	0 %	0 %	25 %	532353111
22509	NC_022109	TTA	2	6	1023097	1023102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22510	NC_022109	A	7	7	1023108	1023114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22511	NC_022109	CTG	2	6	1023123	1023128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22512	NC_022109	TC	3	6	1023175	1023180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22513	NC_022109	TTAGA	2	10	1023206	1023215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22514	NC_022109	A	6	6	1023237	1023242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22515	NC_022109	TC	3	6	1023353	1023358	0 %	50 %	0 %	50 %	532353112
22516	NC_022109	CCT	2	6	1023423	1023428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353112
22517	NC_022109	TGC	2	6	1023430	1023435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353112
22518	NC_022109	GTT	2	6	1023486	1023491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353112
22519	NC_022109	TCT	2	6	1023521	1023526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353112
22520	NC_022109	CGA	2	6	1023569	1023574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353112
22521	NC_022109	TAGC	2	8	1023630	1023637	25 %	25 %	25 %	25 %	532353112
22522	NC_022109	GAG	2	6	1023703	1023708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353112
22523	NC_022109	GTT	2	6	1023710	1023715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353112
22524	NC_022109	GGC	2	6	1023726	1023731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353112
22525	NC_022109	CAG	2	6	1023749	1023754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353112
22526	NC_022109	AG	3	6	1023761	1023766	50 %	0 %	50 %	0 %	532353112
22527	NC_022109	T	6	6	1023796	1023801	0 %	100 %	0 %	0 %	532353112
22528	NC_022109	TCT	2	6	1023803	1023808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353112
22529	NC_022109	GAT	2	6	1023817	1023822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353112
22530	NC_022109	G	6	6	1023851	1023856	0 %	0 %	100 %	0 %	532353112
22531	NC_022109	AAT	2	6	1023916	1023921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353112
22532	NC_022109	GAT	2	6	1023952	1023957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353112
22533	NC_022109	TCG	2	6	1023961	1023966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353112
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22535	NC_022109	TCT	2	6	1024022	1024027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353112
22536	NC_022109	AGG	2	6	1024054	1024059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353112
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22539	NC_022109	G	12	12	1024156	1024167	0 %	0 %	100 %	0 %	532353112
22540	NC_022109	AGG	2	6	1024190	1024195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353112
22541	NC_022109	TAG	2	6	1024237	1024242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353112
22542	NC_022109	GCA	2	6	1024256	1024261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353112
22543	NC_022109	AATC	2	8	1024304	1024311	50 %	25 %	0 %	25 %	532353112
22544	NC_022109	AAC	3	9	1024319	1024327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353112
22545	NC_022109	AAG	2	6	1024328	1024333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353112
22546	NC_022109	TTC	2	6	1024382	1024387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353112
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22548	NC_022109	GAG	2	6	1024417	1024422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353112
22549	NC_022109	CTT	2	6	1024433	1024438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353112
22550	NC_022109	AGTTG	2	10	1024442	1024451	20 %	40 %	40 %	0 %	532353112
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22552	NC_022109	TTAA	2	8	1024478	1024485	50 %	50 %	0 %	0 %	532353112
22553	NC_022109	AAAG	2	8	1024492	1024499	75 %	0 %	25 %	0 %	532353112
22554	NC_022109	AT	3	6	1024501	1024506	50 %	50 %	0 %	0 %	532353112
22555	NC_022109	T	6	6	1024523	1024528	0 %	100 %	0 %	0 %	532353112
22556	NC_022109	AATA	2	8	1025022	1025029	75 %	25 %	0 %	0 %	532353113
22557	NC_022109	A	6	6	1025095	1025100	100 %	0 %	0 %	0 %	532353113
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22562	NC_022109	CTGA	2	8	1025323	1025330	25 %	25 %	25 %	25 %	532353113
22563	NC_022109	GT	4	8	1025345	1025352	0 %	50 %	50 %	0 %	532353113
22564	NC_022109	ATC	2	6	1025363	1025368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353113
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22567	NC_022109	TCC	3	9	1025446	1025454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353113
22568	NC_022109	T	6	6	1025501	1025506	0 %	100 %	0 %	0 %	532353113
22569	NC_022109	AGC	2	6	1025522	1025527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353113
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22572	NC_022109	CCAT	2	8	1025716	1025723	25 %	25 %	0 %	50 %	532353113
22573	NC_022109	ATAG	2	8	1025792	1025799	50 %	25 %	25 %	0 %	532353113
22574	NC_022109	TGA	2	6	1025809	1025814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353113
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22577	NC_022109	CTG	2	6	1025913	1025918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353113
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22582	NC_022109	TTTG	2	8	1026188	1026195	0 %	75 %	25 %	0 %	532353113
22583	NC_022109	TGA	2	6	1026206	1026211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353113
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22589	NC_022109	TA	3	6	1026514	1026519	50 %	50 %	0 %	0 %	532353113
22590	NC_022109	C	6	6	1026527	1026532	0 %	0 %	0 %	100 %	532353113
22591	NC_022109	TTA	2	6	1026533	1026538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353113
22592	NC_022109	GTAG	2	8	1026559	1026566	25 %	25 %	50 %	0 %	532353113
22593	NC_022109	T	6	6	1026617	1026622	0 %	100 %	0 %	0 %	532353113
22594	NC_022109	A	6	6	1026637	1026642	100 %	0 %	0 %	0 %	532353113
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22603	NC_022109	ATAG	2	8	1026883	1026890	50 %	25 %	25 %	0 %	532353113
22604	NC_022109	CTG	2	6	1026903	1026908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353113
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22616	NC_022109	A	6	6	1027276	1027281	100 %	0 %	0 %	0 %	532353113
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22737	NC_022109	ATTT	2	8	1032020	1032027	25 %	75 %	0 %	0 %	532353115
22738	NC_022109	CTG	2	6	1032054	1032059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353115
22739	NC_022109	ATT	2	6	1032071	1032076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353115
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22774	NC_022109	CTC	2	6	1033956	1033961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22841	NC_022109	A	6	6	1037041	1037046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22842	NC_022109	CT	3	6	1037054	1037059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22843	NC_022109	AG	3	6	1037068	1037073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22844	NC_022109	CAAA	2	8	1037093	1037100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22845	NC_022109	T	8	8	1037110	1037117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22846	NC_022109	A	6	6	1037121	1037126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22847	NC_022109	AAG	2	6	1037205	1037210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22848	NC_022109	TGG	2	6	1037239	1037244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22849	NC_022109	ATTTTT	2	12	1037247	1037258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22850	NC_022109	AAT	2	6	1037259	1037264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22851	NC_022109	A	6	6	1037265	1037270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22852	NC_022109	TTA	2	6	1037303	1037308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22853	NC_022109	TAC	2	6	1037371	1037376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353203
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