MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_022109	GAA	2	6	1000586	1000591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353098
22003	NC_022109	TC	4	8	1000608	1000615	0 %	50 %	0 %	50 %	532353098
22004	NC_022109	GGA	2	6	1000632	1000637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353098
22005	NC_022109	TCA	2	6	1000645	1000650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353098
22006	NC_022109	AAG	2	6	1000670	1000675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353098
22007	NC_022109	TAG	2	6	1000751	1000756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353098
22008	NC_022109	T	6	6	1000805	1000810	0 %	100 %	0 %	0 %	532353098
22009	NC_022109	T	6	6	1000821	1000826	0 %	100 %	0 %	0 %	532353098
22010	NC_022109	AAT	2	6	1000827	1000832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353098
22011	NC_022109	AG	3	6	1000848	1000853	50 %	0 %	50 %	0 %	532353098
22012	NC_022109	A	6	6	1000876	1000881	100 %	0 %	0 %	0 %	532353098
22013	NC_022109	TGT	2	6	1000943	1000948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353098
22014	NC_022109	GAT	2	6	1001014	1001019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353099
22015	NC_022109	AGCC	2	8	1001028	1001035	25 %	0 %	25 %	50 %	532353099
22016	NC_022109	GAA	2	6	1001049	1001054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353099
22017	NC_022109	TCA	3	9	1001070	1001078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353099
22018	NC_022109	TGC	2	6	1001123	1001128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353099
22019	NC_022109	GAA	2	6	1001253	1001258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353099
22020	NC_022109	ACA	2	6	1001297	1001302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353099
22021	NC_022109	ATA	2	6	1001346	1001351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353099
22022	NC_022109	AGC	2	6	1001405	1001410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353099
22023	NC_022109	CTT	2	6	1001417	1001422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353099
22024	NC_022109	CTG	2	6	1001475	1001480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353099
22025	NC_022109	AAAAT	2	10	1001484	1001493	80 %	20 %	0 %	0 %	532353099
22026	NC_022109	A	8	8	1001510	1001517	100 %	0 %	0 %	0 %	532353099
22027	NC_022109	TGG	2	6	1001549	1001554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353099
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22029	NC_022109	TAA	2	6	1001653	1001658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22030	NC_022109	T	8	8	1001678	1001685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22031	NC_022109	GAA	2	6	1001728	1001733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22032	NC_022109	CAA	2	6	1001874	1001879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353100
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22034	NC_022109	AGAA	2	8	1002105	1002112	75 %	0 %	25 %	0 %	532353100
22035	NC_022109	AAC	2	6	1002113	1002118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353100
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22037	NC_022109	T	6	6	1002358	1002363	0 %	100 %	0 %	0 %	532353100
22038	NC_022109	CTGC	2	8	1002400	1002407	0 %	25 %	25 %	50 %	532353100
22039	NC_022109	CTC	2	6	1002422	1002427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353100
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22043	NC_022109	A	6	6	1002555	1002560	100 %	0 %	0 %	0 %	532353100
22044	NC_022109	TCCAA	2	10	1002608	1002617	40 %	20 %	0 %	40 %	532353100
22045	NC_022109	GAGTA	2	10	1002618	1002627	40 %	20 %	40 %	0 %	532353100
22046	NC_022109	TAG	2	6	1002635	1002640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353100
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22048	NC_022109	T	6	6	1002749	1002754	0 %	100 %	0 %	0 %	532353100
22049	NC_022109	A	8	8	1002766	1002773	100 %	0 %	0 %	0 %	532353100
22050	NC_022109	TGC	2	6	1002776	1002781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353100
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22052	NC_022109	AGAATA	2	12	1002883	1002894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532353100
22053	NC_022109	AGT	2	6	1003026	1003031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353100
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22068	NC_022109	A	6	6	1003690	1003695	100 %	0 %	0 %	0 %	532353200
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22072	NC_022109	TGA	2	6	1003791	1003796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353200
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22085	NC_022109	CAGT	2	8	1004647	1004654	25 %	25 %	25 %	25 %	532353200
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22091	NC_022109	CGGGG	2	10	1004979	1004988	0 %	0 %	80 %	20 %	532353200
22092	NC_022109	CT	3	6	1005034	1005039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22093	NC_022109	TAA	2	6	1005044	1005049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22094	NC_022109	GAG	2	6	1005143	1005148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353101
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22099	NC_022109	TAA	2	6	1005297	1005302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353101
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22103	NC_022109	AGAT	2	8	1005450	1005457	50 %	25 %	25 %	0 %	532353101
22104	NC_022109	CAT	2	6	1005492	1005497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353101
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22106	NC_022109	T	6	6	1005570	1005575	0 %	100 %	0 %	0 %	532353101
22107	NC_022109	ATGA	2	8	1005591	1005598	50 %	25 %	25 %	0 %	532353101
22108	NC_022109	AATTAA	2	12	1005627	1005638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353101
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22113	NC_022109	AATT	2	8	1005840	1005847	50 %	50 %	0 %	0 %	532353101
22114	NC_022109	GCT	2	6	1005895	1005900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353101
22115	NC_022109	AGAA	2	8	1005918	1005925	75 %	0 %	25 %	0 %	532353101
22116	NC_022109	TG	3	6	1005977	1005982	0 %	50 %	50 %	0 %	532353101
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22223	NC_022109	CAT	2	6	1011104	1011109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353104
22224	NC_022109	AAAG	2	8	1011121	1011128	75 %	0 %	25 %	0 %	532353104
22225	NC_022109	ATT	2	6	1011138	1011143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353104
22226	NC_022109	GAT	2	6	1011264	1011269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353104
22227	NC_022109	GCT	2	6	1011270	1011275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353104
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22231	NC_022109	TGTA	2	8	1011400	1011407	25 %	50 %	25 %	0 %	532353104
22232	NC_022109	GA	3	6	1011443	1011448	50 %	0 %	50 %	0 %	532353104
22233	NC_022109	AG	3	6	1011455	1011460	50 %	0 %	50 %	0 %	532353104
22234	NC_022109	GAG	2	6	1011463	1011468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353104
22235	NC_022109	ATC	2	6	1011487	1011492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353104
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22474	NC_022109	ATC	2	6	1021513	1021518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353110
22475	NC_022109	CTC	2	6	1021598	1021603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353110
22476	NC_022109	GTT	2	6	1021641	1021646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353110
22477	NC_022109	GCTTT	2	10	1021683	1021692	0 %	60 %	20 %	20 %	532353110
22478	NC_022109	CAT	2	6	1021698	1021703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353110
22479	NC_022109	TTAC	2	8	1021727	1021734	25 %	50 %	0 %	25 %	532353110
22480	NC_022109	TGA	2	6	1021768	1021773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353110
22481	NC_022109	AG	5	10	1021853	1021862	50 %	0 %	50 %	0 %	532353110
22482	NC_022109	GAT	2	6	1021884	1021889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353110
22483	NC_022109	CTG	2	6	1021904	1021909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353110
22484	NC_022109	CCT	2	6	1021929	1021934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353110
22485	NC_022109	TC	3	6	1022065	1022070	0 %	50 %	0 %	50 %	532353111
22486	NC_022109	TTC	2	6	1022224	1022229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353111
22487	NC_022109	CTT	2	6	1022250	1022255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353111
22488	NC_022109	GATA	2	8	1022259	1022266	50 %	25 %	25 %	0 %	532353111
22489	NC_022109	GGC	2	6	1022278	1022283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353111
22490	NC_022109	TGT	2	6	1022309	1022314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353111
22491	NC_022109	TA	3	6	1022323	1022328	50 %	50 %	0 %	0 %	532353111
22492	NC_022109	GAA	2	6	1022344	1022349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353111
22493	NC_022109	CTT	2	6	1022448	1022453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353111
22494	NC_022109	CAG	2	6	1022460	1022465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353111
22495	NC_022109	GTC	2	6	1022514	1022519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353111
22496	NC_022109	GGA	2	6	1022543	1022548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353111
22497	NC_022109	AT	3	6	1022615	1022620	50 %	50 %	0 %	0 %	532353111
22498	NC_022109	TGTT	2	8	1022678	1022685	0 %	75 %	25 %	0 %	532353111
22499	NC_022109	AGG	2	6	1022737	1022742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353111
22500	NC_022109	GTT	2	6	1022763	1022768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353111

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