MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022109	TC	3	6	69475	69480	0 %	50 %	0 %	50 %	532352343
1502	NC_022109	TCT	2	6	69541	69546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352343
1503	NC_022109	TGC	2	6	69747	69752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352343
1504	NC_022109	A	7	7	69784	69790	100 %	0 %	0 %	0 %	532352343
1505	NC_022109	CT	3	6	69792	69797	0 %	50 %	0 %	50 %	532352343
1506	NC_022109	AGA	2	6	69801	69806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352343
1507	NC_022109	GCGAT	2	10	69854	69863	20 %	20 %	40 %	20 %	532352343
1508	NC_022109	GTT	2	6	69876	69881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352343
1509	NC_022109	GCT	2	6	69898	69903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352343
1510	NC_022109	GCA	3	9	70000	70008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352343
1511	NC_022109	AAAG	2	8	70033	70040	75 %	0 %	25 %	0 %	532352343
1512	NC_022109	GCA	2	6	70047	70052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352343
1513	NC_022109	ATT	2	6	70061	70066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352343
1514	NC_022109	TAT	2	6	70169	70174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352343
1515	NC_022109	CTT	2	6	70193	70198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352343
1516	NC_022109	GA	3	6	70202	70207	50 %	0 %	50 %	0 %	532352343
1517	NC_022109	CTCTT	2	10	70208	70217	0 %	60 %	0 %	40 %	532352343
1518	NC_022109	AGAA	2	8	70220	70227	75 %	0 %	25 %	0 %	532352343
1519	NC_022109	TGA	2	6	70248	70253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352343
1520	NC_022109	TTG	2	6	70337	70342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352343
1521	NC_022109	TCT	2	6	70360	70365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352343
1522	NC_022109	GA	3	6	70401	70406	50 %	0 %	50 %	0 %	532352343
1523	NC_022109	AGCT	2	8	70442	70449	25 %	25 %	25 %	25 %	532352343
1524	NC_022109	TGA	2	6	70488	70493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352343
1525	NC_022109	GCAT	2	8	70503	70510	25 %	25 %	25 %	25 %	532352343
1526	NC_022109	AGA	2	6	70521	70526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352343
1527	NC_022109	GT	3	6	70677	70682	0 %	50 %	50 %	0 %	532352343
1528	NC_022109	CT	3	6	70758	70763	0 %	50 %	0 %	50 %	532352343
1529	NC_022109	GA	3	6	70779	70784	50 %	0 %	50 %	0 %	532352343
1530	NC_022109	AGT	2	6	70821	70826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352343
1531	NC_022109	AGGGG	2	10	70854	70863	20 %	0 %	80 %	0 %	532352343
1532	NC_022109	AAGAA	2	10	70896	70905	80 %	0 %	20 %	0 %	532352343
1533	NC_022109	AGA	2	6	70968	70973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352343
1534	NC_022109	TGA	2	6	71004	71009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352343
1535	NC_022109	TAT	2	6	71015	71020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352343
1536	NC_022109	T	6	6	71104	71109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_022109	T	8	8	71125	71132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_022109	CAT	2	6	71190	71195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352344
1539	NC_022109	CCTT	2	8	71219	71226	0 %	50 %	0 %	50 %	532352344
1540	NC_022109	GCTT	2	8	71249	71256	0 %	50 %	25 %	25 %	532352344
1541	NC_022109	A	6	6	71344	71349	100 %	0 %	0 %	0 %	532352344
1542	NC_022109	ATT	2	6	71394	71399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352344
1543	NC_022109	CAA	2	6	71541	71546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352344
1544	NC_022109	TCC	2	6	71565	71570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352344
1545	NC_022109	TTCT	2	8	71587	71594	0 %	75 %	0 %	25 %	532352344
1546	NC_022109	ATG	2	6	71599	71604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352344
1547	NC_022109	GCTT	2	8	71633	71640	0 %	50 %	25 %	25 %	532352344
1548	NC_022109	AGA	2	6	71642	71647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352344
1549	NC_022109	GAGC	2	8	71661	71668	25 %	0 %	50 %	25 %	532352344
1550	NC_022109	TCA	2	6	71686	71691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352344
1551	NC_022109	A	7	7	71693	71699	100 %	0 %	0 %	0 %	532352344
1552	NC_022109	CTATTT	2	12	71704	71715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532352344
1553	NC_022109	TGA	2	6	71738	71743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352344
1554	NC_022109	ATG	2	6	71776	71781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352344
1555	NC_022109	AGA	2	6	71906	71911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_022109	CT	3	6	71914	71919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_022109	CGT	2	6	71954	71959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_022109	T	7	7	71959	71965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_022109	CTTGC	2	10	71985	71994	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_022109	GATA	2	8	72009	72016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022109	TTC	2	6	72100	72105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352345
1562	NC_022109	CTT	2	6	72168	72173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352345
1563	NC_022109	ATTGG	2	10	72186	72195	20 %	40 %	40 %	0 %	532352345
1564	NC_022109	T	6	6	72202	72207	0 %	100 %	0 %	0 %	532352345
1565	NC_022109	AGC	2	6	72217	72222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352345
1566	NC_022109	TTG	2	6	72246	72251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352345
1567	NC_022109	ATA	2	6	72330	72335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352345
1568	NC_022109	GCT	2	6	72350	72355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352345
1569	NC_022109	GCTA	2	8	72359	72366	25 %	25 %	25 %	25 %	532352345
1570	NC_022109	AAT	2	6	72389	72394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352345
1571	NC_022109	TGG	2	6	72420	72425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352345
1572	NC_022109	T	6	6	72427	72432	0 %	100 %	0 %	0 %	532352345
1573	NC_022109	AGC	2	6	72489	72494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352345
1574	NC_022109	TTAT	2	8	72535	72542	25 %	75 %	0 %	0 %	532352345
1575	NC_022109	TGC	2	6	72543	72548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352345
1576	NC_022109	TGT	2	6	72586	72591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352345
1577	NC_022109	GGAG	2	8	72602	72609	25 %	0 %	75 %	0 %	532352345
1578	NC_022109	GATT	2	8	72637	72644	25 %	50 %	25 %	0 %	532352345
1579	NC_022109	GAA	2	6	72712	72717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352345
1580	NC_022109	CTGG	2	8	72745	72752	0 %	25 %	50 %	25 %	532352345
1581	NC_022109	CTC	2	6	72765	72770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352345
1582	NC_022109	ACTCTT	2	12	72833	72844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532352345
1583	NC_022109	GAA	2	6	72854	72859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352345
1584	NC_022109	TGA	2	6	72871	72876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352345
1585	NC_022109	GAA	2	6	72904	72909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352345
1586	NC_022109	T	6	6	72986	72991	0 %	100 %	0 %	0 %	532352345
1587	NC_022109	TAG	2	6	73026	73031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352345
1588	NC_022109	TAG	2	6	73035	73040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352345
1589	NC_022109	AGA	2	6	73142	73147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352345
1590	NC_022109	ATCA	2	8	73172	73179	50 %	25 %	0 %	25 %	532352345
1591	NC_022109	TGT	2	6	73245	73250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352345
1592	NC_022109	GAAAA	2	10	73258	73267	80 %	0 %	20 %	0 %	532352345
1593	NC_022109	A	7	7	73264	73270	100 %	0 %	0 %	0 %	532352345
1594	NC_022109	AGG	2	6	73290	73295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352345
1595	NC_022109	TGG	2	6	73368	73373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352346
1596	NC_022109	TTTCTG	2	12	73383	73394	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532352346
1597	NC_022109	AGA	2	6	73420	73425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352346
1598	NC_022109	GA	3	6	73443	73448	50 %	0 %	50 %	0 %	532352346
1599	NC_022109	TAC	2	6	73468	73473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352346
1600	NC_022109	GATCAT	2	12	73513	73524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352346
1601	NC_022109	TGA	2	6	73546	73551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352346
1602	NC_022109	G	6	6	73604	73609	0 %	0 %	100 %	0 %	532352346
1603	NC_022109	TAT	2	6	73616	73621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352346
1604	NC_022109	A	6	6	73652	73657	100 %	0 %	0 %	0 %	532352346
1605	NC_022109	TGGGA	2	10	73675	73684	20 %	20 %	60 %	0 %	532352346
1606	NC_022109	GCT	2	6	73784	73789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352346
1607	NC_022109	TGGA	2	8	73794	73801	25 %	25 %	50 %	0 %	532352346
1608	NC_022109	AGG	2	6	73828	73833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352346
1609	NC_022109	TC	3	6	73930	73935	0 %	50 %	0 %	50 %	532352346
1610	NC_022109	T	6	6	73958	73963	0 %	100 %	0 %	0 %	532352346
1611	NC_022109	AGC	3	9	74002	74010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352346
1612	NC_022109	AGGC	2	8	74118	74125	25 %	0 %	50 %	25 %	532352346
1613	NC_022109	ATT	2	6	74141	74146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352346
1614	NC_022109	AAG	2	6	74181	74186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352346
1615	NC_022109	AAG	2	6	74244	74249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352346
1616	NC_022109	TGC	2	6	74322	74327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352346
1617	NC_022109	TC	3	6	74337	74342	0 %	50 %	0 %	50 %	532352346
1618	NC_022109	TCA	2	6	74431	74436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352346
1619	NC_022109	ATT	2	6	74481	74486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352346
1620	NC_022109	TCT	2	6	74573	74578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352346
1621	NC_022109	ATG	2	6	74592	74597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352346
1622	NC_022109	AAG	2	6	74747	74752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352346
1623	NC_022109	ACT	2	6	74762	74767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_022109	T	6	6	74773	74778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022109	AGT	2	6	74798	74803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022109	CAA	2	6	74824	74829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352347
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1628	NC_022109	CCA	2	6	74925	74930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352347
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1755	NC_022109	TATC	2	8	80517	80524	25 %	50 %	0 %	25 %	532352350
1756	NC_022109	GA	3	6	80535	80540	50 %	0 %	50 %	0 %	532352350
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1872	NC_022109	TTTGT	2	10	85169	85178	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1874	NC_022109	TA	3	6	85275	85280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1875	NC_022109	AAT	2	6	85290	85295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352355
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1877	NC_022109	AGC	2	6	85362	85367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352355
1878	NC_022109	AG	3	6	85389	85394	50 %	0 %	50 %	0 %	532352355
1879	NC_022109	GAAA	2	8	85427	85434	75 %	0 %	25 %	0 %	532352355
1880	NC_022109	T	6	6	85564	85569	0 %	100 %	0 %	0 %	532352355
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