MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022109	ATTT	2	8	227470	227477	25 %	75 %	0 %	0 %	532352468
5002	NC_022109	T	6	6	227507	227512	0 %	100 %	0 %	0 %	532352468
5003	NC_022109	TCA	2	6	227515	227520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352468
5004	NC_022109	CTG	2	6	227533	227538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352468
5005	NC_022109	TAG	2	6	227584	227589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352468
5006	NC_022109	CTT	2	6	227646	227651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352468
5007	NC_022109	T	8	8	227720	227727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_022109	TGT	2	6	227789	227794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_022109	TCCT	2	8	227870	227877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_022109	AGA	2	6	227922	227927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_022109	ATT	2	6	227959	227964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_022109	TTC	2	6	228043	228048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352469
5013	NC_022109	GAA	2	6	228117	228122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352469
5014	NC_022109	TGA	2	6	228149	228154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352469
5015	NC_022109	ATT	2	6	228228	228233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352469
5016	NC_022109	AGA	2	6	228290	228295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352469
5017	NC_022109	TC	3	6	228296	228301	0 %	50 %	0 %	50 %	532352469
5018	NC_022109	TGA	2	6	228323	228328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352469
5019	NC_022109	TCG	2	6	228412	228417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352469
5020	NC_022109	A	7	7	228484	228490	100 %	0 %	0 %	0 %	532352469
5021	NC_022109	CCTT	2	8	228492	228499	0 %	50 %	0 %	50 %	532352469
5022	NC_022109	TTG	2	6	228514	228519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352469
5023	NC_022109	T	6	6	228550	228555	0 %	100 %	0 %	0 %	532352469
5024	NC_022109	GATA	2	8	228587	228594	50 %	25 %	25 %	0 %	532352469
5025	NC_022109	ATT	2	6	228627	228632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352469
5026	NC_022109	GAA	2	6	228636	228641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352469
5027	NC_022109	TCCTC	2	10	228667	228676	0 %	40 %	0 %	60 %	532352469
5028	NC_022109	AGA	2	6	228701	228706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352469
5029	NC_022109	CTT	2	6	228793	228798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352470
5030	NC_022109	TAC	2	6	228895	228900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352470
5031	NC_022109	TAT	2	6	228904	228909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352470
5032	NC_022109	TCT	2	6	228964	228969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352470
5033	NC_022109	TTTC	2	8	229040	229047	0 %	75 %	0 %	25 %	532352470
5034	NC_022109	CTT	2	6	229102	229107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352470
5035	NC_022109	TTA	2	6	229169	229174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352470
5036	NC_022109	TGT	2	6	229225	229230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352470
5037	NC_022109	T	6	6	229294	229299	0 %	100 %	0 %	0 %	532352470
5038	NC_022109	TAT	2	6	229369	229374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352470
5039	NC_022109	ATT	2	6	229448	229453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352470
5040	NC_022109	CAC	2	6	229494	229499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352470
5041	NC_022109	GAA	2	6	229514	229519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352470
5042	NC_022109	ATT	2	6	229580	229585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352470
5043	NC_022109	CAA	2	6	229647	229652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352470
5044	NC_022109	TTCT	2	8	229716	229723	0 %	75 %	0 %	25 %	532352470
5045	NC_022109	ACT	2	6	229727	229732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352470
5046	NC_022109	ATG	2	6	229769	229774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352470
5047	NC_022109	CTTC	2	8	229776	229783	0 %	50 %	0 %	50 %	532352470
5048	NC_022109	TTAT	2	8	229878	229885	25 %	75 %	0 %	0 %	532352470
5049	NC_022109	CTAT	2	8	229897	229904	25 %	50 %	0 %	25 %	532352470
5050	NC_022109	TCTT	2	8	229944	229951	0 %	75 %	0 %	25 %	532352470
5051	NC_022109	TGC	2	6	229987	229992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352470
5052	NC_022109	CTTAGC	2	12	229993	230004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352470
5053	NC_022109	GGA	2	6	230024	230029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352470
5054	NC_022109	CA	3	6	230032	230037	50 %	0 %	0 %	50 %	532352470
5055	NC_022109	TGG	2	6	230096	230101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352470
5056	NC_022109	TTGG	2	8	230140	230147	0 %	50 %	50 %	0 %	532352470
5057	NC_022109	TGG	3	9	230159	230167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352470
5058	NC_022109	GTC	2	6	230213	230218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_022109	CTT	2	6	230251	230256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352471
5060	NC_022109	AGA	2	6	230297	230302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352471
5061	NC_022109	CTT	2	6	230319	230324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352471
5062	NC_022109	CTA	2	6	230378	230383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352471
5063	NC_022109	ATTT	2	8	230387	230394	25 %	75 %	0 %	0 %	532352471
5064	NC_022109	TGG	2	6	230465	230470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352471
5065	NC_022109	AAT	3	9	230565	230573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352471
5066	NC_022109	GAA	2	6	230664	230669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352471
5067	NC_022109	GC	3	6	230676	230681	0 %	0 %	50 %	50 %	532352471
5068	NC_022109	ATT	2	6	230724	230729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352471
5069	NC_022109	GCA	2	6	230837	230842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352471
5070	NC_022109	CTA	2	6	230878	230883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352471
5071	NC_022109	CATC	2	8	230893	230900	25 %	25 %	0 %	50 %	532352471
5072	NC_022109	TTA	2	6	230950	230955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352471
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5075	NC_022109	GCT	2	6	231105	231110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352471
5076	NC_022109	TCT	2	6	231240	231245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352471
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5078	NC_022109	GC	3	6	231578	231583	0 %	0 %	50 %	50 %	532352471
5079	NC_022109	GAC	2	6	231605	231610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352471
5080	NC_022109	A	8	8	231647	231654	100 %	0 %	0 %	0 %	532352471
5081	NC_022109	TAA	2	6	231683	231688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352471
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5084	NC_022109	TGA	2	6	231779	231784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352471
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5086	NC_022109	AATG	2	8	231816	231823	50 %	25 %	25 %	0 %	532352471
5087	NC_022109	ATT	2	6	231865	231870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352471
5088	NC_022109	ATG	2	6	231911	231916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352472
5089	NC_022109	CAA	2	6	231917	231922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352472
5090	NC_022109	A	6	6	231943	231948	100 %	0 %	0 %	0 %	532352472
5091	NC_022109	A	6	6	232017	232022	100 %	0 %	0 %	0 %	532352472
5092	NC_022109	AAG	2	6	232113	232118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352472
5093	NC_022109	A	6	6	232212	232217	100 %	0 %	0 %	0 %	532352472
5094	NC_022109	AGG	2	6	232282	232287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352472
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5098	NC_022109	C	6	6	232414	232419	0 %	0 %	0 %	100 %	532352472
5099	NC_022109	A	6	6	232454	232459	100 %	0 %	0 %	0 %	532352472
5100	NC_022109	AAG	2	6	232515	232520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352472
5101	NC_022109	TTAC	2	8	232531	232538	25 %	50 %	0 %	25 %	532352472
5102	NC_022109	TCA	2	6	232570	232575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352472
5103	NC_022109	AT	3	6	232619	232624	50 %	50 %	0 %	0 %	532352472
5104	NC_022109	TCA	2	6	232636	232641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352472
5105	NC_022109	ATT	2	6	232696	232701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352472
5106	NC_022109	CT	3	6	232720	232725	0 %	50 %	0 %	50 %	532352472
5107	NC_022109	CTT	2	6	232823	232828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352473
5108	NC_022109	GCTA	2	8	232848	232855	25 %	25 %	25 %	25 %	532352473
5109	NC_022109	CTT	3	9	232910	232918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352473
5110	NC_022109	AGG	2	6	232950	232955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352473
5111	NC_022109	ATT	2	6	232989	232994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352473
5112	NC_022109	TAA	2	6	233013	233018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352473
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5114	NC_022109	TA	3	6	233072	233077	50 %	50 %	0 %	0 %	532352473
5115	NC_022109	ATT	2	6	233105	233110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352473
5116	NC_022109	CT	3	6	233134	233139	0 %	50 %	0 %	50 %	532352473
5117	NC_022109	A	6	6	233150	233155	100 %	0 %	0 %	0 %	532352473
5118	NC_022109	CAAAA	2	10	233157	233166	80 %	0 %	0 %	20 %	532352473
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5122	NC_022109	CAG	2	6	233297	233302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352473
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5124	NC_022109	TTCT	2	8	233423	233430	0 %	75 %	0 %	25 %	532352473
5125	NC_022109	CAT	2	6	233443	233448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352473
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5128	NC_022109	CAA	2	6	233740	233745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352473
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5133	NC_022109	ATG	2	6	234115	234120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352473
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5141	NC_022109	GCT	2	6	234457	234462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_022109	ACC	2	6	234466	234471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5144	NC_022109	ACT	2	6	234561	234566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5240	NC_022109	A	6	6	240302	240307	100 %	0 %	0 %	0 %	532352477
5241	NC_022109	AATCT	2	10	240397	240406	40 %	40 %	0 %	20 %	532352477
5242	NC_022109	TCA	2	6	240422	240427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352478
5243	NC_022109	CA	3	6	240439	240444	50 %	0 %	0 %	50 %	532352478
5244	NC_022109	ACT	2	6	240587	240592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352478
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5246	NC_022109	CTT	2	6	240663	240668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352478
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5370	NC_022109	GC	3	6	245756	245761	0 %	0 %	50 %	50 %	532352482
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5372	NC_022109	TTG	2	6	245861	245866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352482
5373	NC_022109	TG	3	6	245870	245875	0 %	50 %	50 %	0 %	532352482
5374	NC_022109	TTCT	2	8	245894	245901	0 %	75 %	0 %	25 %	532352482
5375	NC_022109	TCC	2	6	245927	245932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352482
5376	NC_022109	C	6	6	245931	245936	0 %	0 %	0 %	100 %	532352482
5377	NC_022109	AAG	2	6	245939	245944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352482
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5379	NC_022109	TGT	2	6	246016	246021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352482
5380	NC_022109	ATTA	2	8	246054	246061	50 %	50 %	0 %	0 %	532352482
5381	NC_022109	AAG	2	6	246095	246100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352483
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5383	NC_022109	TCC	2	6	246180	246185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352483
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5386	NC_022109	TCCCC	2	10	246461	246470	0 %	20 %	0 %	80 %	532352483
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5393	NC_022109	ATA	2	6	246839	246844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352483
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5396	NC_022109	ATA	2	6	246961	246966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_022109	TTA	2	6	246982	246987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_022109	ACG	2	6	247066	247071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5411	NC_022109	TCG	2	6	247684	247689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352484
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5416	NC_022109	T	6	6	247939	247944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5417	NC_022109	TACAA	2	10	247968	247977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5418	NC_022109	ATA	2	6	248000	248005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5423	NC_022109	TC	3	6	248132	248137	0 %	50 %	0 %	50 %	532352485
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5452	NC_022109	TTC	2	6	249116	249121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352486
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5454	NC_022109	ATC	2	6	249150	249155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352486
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5459	NC_022109	A	6	6	249275	249280	100 %	0 %	0 %	0 %	532352486
5460	NC_022109	CTC	2	6	249308	249313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352486
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5472	NC_022109	CTC	2	6	249956	249961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352487
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5476	NC_022109	ATC	2	6	250120	250125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352487
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5478	NC_022109	ACA	2	6	250184	250189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352487
5479	NC_022109	GGAA	2	8	250201	250208	50 %	0 %	50 %	0 %	532352487
5480	NC_022109	GCT	2	6	250228	250233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352487
5481	NC_022109	CCA	2	6	250255	250260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352487
5482	NC_022109	GTATG	2	10	250379	250388	20 %	40 %	40 %	0 %	532352487
5483	NC_022109	GA	3	6	250421	250426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5484	NC_022109	ACT	2	6	250481	250486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5485	NC_022109	TG	3	6	250531	250536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_022109	AATA	2	8	250598	250605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_022109	T	6	6	250620	250625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5488	NC_022109	T	7	7	250639	250645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_022109	A	6	6	250647	250652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5490	NC_022109	ACA	2	6	250747	250752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352488
5491	NC_022109	CTT	2	6	250754	250759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352488
5492	NC_022109	AAG	2	6	250785	250790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352488
5493	NC_022109	GCA	2	6	250804	250809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352488
5494	NC_022109	TTG	2	6	250824	250829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352488
5495	NC_022109	CAAA	2	8	250988	250995	75 %	0 %	0 %	25 %	532352489
5496	NC_022109	ATA	2	6	251011	251016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352489
5497	NC_022109	CAAT	2	8	251098	251105	50 %	25 %	0 %	25 %	532352489
5498	NC_022109	CTTT	3	12	251150	251161	0 %	75 %	0 %	25 %	532352489
5499	NC_022109	CGA	2	6	251192	251197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352489
5500	NC_022109	CTT	2	6	251203	251208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352489

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