MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 2381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022108	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022108	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022108	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022108	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	532351366
5	NC_022108	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	532351366
6	NC_022108	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	532351367
7	NC_022108	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532351368
8	NC_022108	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532351368
9	NC_022108	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532351368
10	NC_022108	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532351368
11	NC_022108	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	532351368
12	NC_022108	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	532351369
13	NC_022108	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022108	AC	3	6	7647	7652	50 %	0 %	0 %	50 %	532351370
15	NC_022108	AG	3	6	8390	8395	50 %	0 %	50 %	0 %	532351371
16	NC_022108	CT	4	8	8509	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	532351371
17	NC_022108	GT	3	6	8591	8596	0 %	50 %	50 %	0 %	532351371
18	NC_022108	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022108	GA	3	6	9867	9872	50 %	0 %	50 %	0 %	532351373
20	NC_022108	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	532351373
21	NC_022108	TA	3	6	11247	11252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022108	AG	3	6	11308	11313	50 %	0 %	50 %	0 %	532351374
23	NC_022108	TA	3	6	11868	11873	50 %	50 %	0 %	0 %	532351374
24	NC_022108	TG	3	6	12771	12776	0 %	50 %	50 %	0 %	532351375
25	NC_022108	AG	3	6	12920	12925	50 %	0 %	50 %	0 %	532351375
26	NC_022108	TC	3	6	13054	13059	0 %	50 %	0 %	50 %	532351375
27	NC_022108	AG	4	8	13076	13083	50 %	0 %	50 %	0 %	532351375
28	NC_022108	TA	3	6	13338	13343	50 %	50 %	0 %	0 %	532351375
29	NC_022108	TA	4	8	13562	13569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022108	AC	3	6	14405	14410	50 %	0 %	0 %	50 %	532351376
31	NC_022108	AG	3	6	15743	15748	50 %	0 %	50 %	0 %	532351377
32	NC_022108	TC	3	6	15783	15788	0 %	50 %	0 %	50 %	532351377
33	NC_022108	GA	3	6	16312	16317	50 %	0 %	50 %	0 %	532351378
34	NC_022108	AG	3	6	16383	16388	50 %	0 %	50 %	0 %	532351378
35	NC_022108	GA	3	6	17167	17172	50 %	0 %	50 %	0 %	532351378
36	NC_022108	AG	3	6	17513	17518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022108	GA	3	6	17526	17531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022108	GA	3	6	17770	17775	50 %	0 %	50 %	0 %	532351379
39	NC_022108	TC	3	6	18220	18225	0 %	50 %	0 %	50 %	532351379
40	NC_022108	CT	3	6	18448	18453	0 %	50 %	0 %	50 %	532351380
41	NC_022108	TC	3	6	18648	18653	0 %	50 %	0 %	50 %	532351380
42	NC_022108	GA	3	6	18663	18668	50 %	0 %	50 %	0 %	532351380
43	NC_022108	GA	3	6	18762	18767	50 %	0 %	50 %	0 %	532351380
44	NC_022108	AG	3	6	19228	19233	50 %	0 %	50 %	0 %	532351380
45	NC_022108	AG	4	8	19514	19521	50 %	0 %	50 %	0 %	532351380
46	NC_022108	GT	3	6	19777	19782	0 %	50 %	50 %	0 %	532351380
47	NC_022108	TG	3	6	20118	20123	0 %	50 %	50 %	0 %	532351381
48	NC_022108	AG	3	6	20514	20519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022108	GA	3	6	20672	20677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022108	AG	3	6	21188	21193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022108	CT	3	6	21257	21262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022108	CT	4	8	21914	21921	0 %	50 %	0 %	50 %	532351382
53	NC_022108	AT	3	6	22184	22189	50 %	50 %	0 %	0 %	532351382
54	NC_022108	AT	3	6	22508	22513	50 %	50 %	0 %	0 %	532351382
55	NC_022108	GA	3	6	23827	23832	50 %	0 %	50 %	0 %	532351382
56	NC_022108	GA	3	6	23919	23924	50 %	0 %	50 %	0 %	532351382
57	NC_022108	AG	3	6	24300	24305	50 %	0 %	50 %	0 %	532351382
58	NC_022108	GA	3	6	25716	25721	50 %	0 %	50 %	0 %	532351383
59	NC_022108	GT	3	6	25736	25741	0 %	50 %	50 %	0 %	532351383
60	NC_022108	GA	3	6	26384	26389	50 %	0 %	50 %	0 %	532351383
61	NC_022108	GA	3	6	26508	26513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022108	CT	3	6	26515	26520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022108	AT	3	6	26801	26806	50 %	50 %	0 %	0 %	532351384
64	NC_022108	GA	3	6	27015	27020	50 %	0 %	50 %	0 %	532351384
65	NC_022108	TC	3	6	27883	27888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022108	AG	3	6	27966	27971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022108	TG	3	6	28389	28394	0 %	50 %	50 %	0 %	532351386
68	NC_022108	TC	3	6	28442	28447	0 %	50 %	0 %	50 %	532351386
69	NC_022108	GC	4	8	28856	28863	0 %	0 %	50 %	50 %	532351386
70	NC_022108	TA	3	6	28978	28983	50 %	50 %	0 %	0 %	532351386
71	NC_022108	GA	3	6	29929	29934	50 %	0 %	50 %	0 %	532351387
72	NC_022108	AG	3	6	30027	30032	50 %	0 %	50 %	0 %	532351388
73	NC_022108	TC	3	6	30136	30141	0 %	50 %	0 %	50 %	532351388
74	NC_022108	GA	3	6	30757	30762	50 %	0 %	50 %	0 %	532351388
75	NC_022108	GA	3	6	31225	31230	50 %	0 %	50 %	0 %	532351388
76	NC_022108	TC	3	6	31651	31656	0 %	50 %	0 %	50 %	532351390
77	NC_022108	CT	3	6	32131	32136	0 %	50 %	0 %	50 %	532351390
78	NC_022108	AG	3	6	32263	32268	50 %	0 %	50 %	0 %	532351390
79	NC_022108	TC	3	6	33760	33765	0 %	50 %	0 %	50 %	532351392
80	NC_022108	AG	3	6	33773	33778	50 %	0 %	50 %	0 %	532351392
81	NC_022108	AG	3	6	33911	33916	50 %	0 %	50 %	0 %	532351393
82	NC_022108	AG	3	6	34604	34609	50 %	0 %	50 %	0 %	532351394
83	NC_022108	GA	4	8	34627	34634	50 %	0 %	50 %	0 %	532351394
84	NC_022108	TG	3	6	35452	35457	0 %	50 %	50 %	0 %	532351395
85	NC_022108	GA	3	6	36380	36385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022108	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022108	GA	3	6	36530	36535	50 %	0 %	50 %	0 %	532351396
88	NC_022108	CT	3	6	37014	37019	0 %	50 %	0 %	50 %	532351396
89	NC_022108	AG	3	6	37525	37530	50 %	0 %	50 %	0 %	532351396
90	NC_022108	AG	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	532351396
91	NC_022108	AG	3	6	38598	38603	50 %	0 %	50 %	0 %	532351396
92	NC_022108	CT	3	6	38749	38754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022108	GA	3	6	39382	39387	50 %	0 %	50 %	0 %	532351397
94	NC_022108	AG	3	6	39519	39524	50 %	0 %	50 %	0 %	532351397
95	NC_022108	AG	3	6	39619	39624	50 %	0 %	50 %	0 %	532351397
96	NC_022108	CT	3	6	40120	40125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022108	AG	3	6	40596	40601	50 %	0 %	50 %	0 %	532351398
98	NC_022108	GC	3	6	40645	40650	0 %	0 %	50 %	50 %	532351398
99	NC_022108	GA	3	6	40810	40815	50 %	0 %	50 %	0 %	532351398
100	NC_022108	TC	3	6	40819	40824	0 %	50 %	0 %	50 %	532351398
101	NC_022108	GC	3	6	40884	40889	0 %	0 %	50 %	50 %	532351398
102	NC_022108	GA	3	6	41024	41029	50 %	0 %	50 %	0 %	532351398
103	NC_022108	GT	3	6	41462	41467	0 %	50 %	50 %	0 %	532351399
104	NC_022108	GA	3	6	41999	42004	50 %	0 %	50 %	0 %	532351399
105	NC_022108	GA	4	8	42009	42016	50 %	0 %	50 %	0 %	532351399
106	NC_022108	AG	3	6	42245	42250	50 %	0 %	50 %	0 %	532351399
107	NC_022108	CT	3	6	42311	42316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022108	GA	5	10	42586	42595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022108	AG	3	6	42710	42715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022108	TG	3	6	43073	43078	0 %	50 %	50 %	0 %	532351400
111	NC_022108	AC	3	6	43468	43473	50 %	0 %	0 %	50 %	532351401
112	NC_022108	TC	3	6	43637	43642	0 %	50 %	0 %	50 %	532351401
113	NC_022108	TC	3	6	43801	43806	0 %	50 %	0 %	50 %	532351401
114	NC_022108	TA	3	6	43954	43959	50 %	50 %	0 %	0 %	532351402
115	NC_022108	TC	3	6	44866	44871	0 %	50 %	0 %	50 %	532351403
116	NC_022108	GA	3	6	45349	45354	50 %	0 %	50 %	0 %	532351404
117	NC_022108	TG	3	6	45567	45572	0 %	50 %	50 %	0 %	532351404
118	NC_022108	AG	3	6	45578	45583	50 %	0 %	50 %	0 %	532351404
119	NC_022108	AG	4	8	46020	46027	50 %	0 %	50 %	0 %	532351405
120	NC_022108	CT	3	6	46211	46216	0 %	50 %	0 %	50 %	532351405
121	NC_022108	TG	3	6	46412	46417	0 %	50 %	50 %	0 %	532351405
122	NC_022108	AG	3	6	46465	46470	50 %	0 %	50 %	0 %	532351405
123	NC_022108	AG	3	6	48037	48042	50 %	0 %	50 %	0 %	532351405
124	NC_022108	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	532351407
125	NC_022108	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	532351408
126	NC_022108	TG	4	8	51389	51396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022108	TC	3	6	53009	53014	0 %	50 %	0 %	50 %	532351410
128	NC_022108	CA	3	6	53060	53065	50 %	0 %	0 %	50 %	532351410
129	NC_022108	GA	3	6	53481	53486	50 %	0 %	50 %	0 %	532351411
130	NC_022108	CT	3	6	53798	53803	0 %	50 %	0 %	50 %	532351411
131	NC_022108	CT	3	6	54461	54466	0 %	50 %	0 %	50 %	532351412
132	NC_022108	AT	3	6	55669	55674	50 %	50 %	0 %	0 %	532351412
133	NC_022108	GA	3	6	55706	55711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022108	AG	3	6	56305	56310	50 %	0 %	50 %	0 %	532352198
135	NC_022108	CT	3	6	56604	56609	0 %	50 %	0 %	50 %	532352198
136	NC_022108	GT	3	6	56654	56659	0 %	50 %	50 %	0 %	532352198
137	NC_022108	TG	3	6	57292	57297	0 %	50 %	50 %	0 %	532352198
138	NC_022108	CT	3	6	58176	58181	0 %	50 %	0 %	50 %	532352199
139	NC_022108	GA	3	6	59737	59742	50 %	0 %	50 %	0 %	532351413
140	NC_022108	GT	3	6	59875	59880	0 %	50 %	50 %	0 %	532351413
141	NC_022108	TC	3	6	60623	60628	0 %	50 %	0 %	50 %	532351414
142	NC_022108	GA	3	6	60851	60856	50 %	0 %	50 %	0 %	532352200
143	NC_022108	CA	3	6	61249	61254	50 %	0 %	0 %	50 %	532351415
144	NC_022108	AT	3	6	61499	61504	50 %	50 %	0 %	0 %	532351415
145	NC_022108	GA	3	6	61522	61527	50 %	0 %	50 %	0 %	532351415
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