MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 2866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022108	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022108	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022108	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022108	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532351364
5	NC_022108	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532351365
6	NC_022108	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532351365
7	NC_022108	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532351366
8	NC_022108	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532351366
9	NC_022108	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532351366
10	NC_022108	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532351367
11	NC_022108	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532351367
12	NC_022108	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532351367
13	NC_022108	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532351367
14	NC_022108	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532351368
15	NC_022108	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532351368
16	NC_022108	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532351368
17	NC_022108	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022108	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532351369
19	NC_022108	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532351369
20	NC_022108	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022108	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532352196
22	NC_022108	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532352196
23	NC_022108	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	532351370
24	NC_022108	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	532351371
25	NC_022108	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	532351371
26	NC_022108	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	532351371
27	NC_022108	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	532351371
28	NC_022108	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022108	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	532351372
30	NC_022108	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	532351372
31	NC_022108	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	532351372
32	NC_022108	CTTT	2	8	10207	10214	0 %	75 %	0 %	25 %	532351373
33	NC_022108	GCAA	2	8	10424	10431	50 %	0 %	25 %	25 %	532351373
34	NC_022108	AGCC	2	8	10654	10661	25 %	0 %	25 %	50 %	532351373
35	NC_022108	GAAA	2	8	10797	10804	75 %	0 %	25 %	0 %	532351373
36	NC_022108	AGAA	2	8	11201	11208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022108	AATG	2	8	11540	11547	50 %	25 %	25 %	0 %	532351374
38	NC_022108	GTTT	2	8	12572	12579	0 %	75 %	25 %	0 %	532351375
39	NC_022108	ATGC	2	8	13002	13009	25 %	25 %	25 %	25 %	532351375
40	NC_022108	AAGG	2	8	13437	13444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022108	TTGT	2	8	14038	14045	0 %	75 %	25 %	0 %	532351376
42	NC_022108	TTCT	2	8	14209	14216	0 %	75 %	0 %	25 %	532351376
43	NC_022108	ATTT	2	8	14415	14422	25 %	75 %	0 %	0 %	532351376
44	NC_022108	TTTC	2	8	15076	15083	0 %	75 %	0 %	25 %	532351377
45	NC_022108	AAAT	2	8	15558	15565	75 %	25 %	0 %	0 %	532351377
46	NC_022108	CAAA	2	8	16070	16077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022108	GTAA	2	8	16400	16407	50 %	25 %	25 %	0 %	532351378
48	NC_022108	CTAA	2	8	16593	16600	50 %	25 %	0 %	25 %	532351378
49	NC_022108	AGAA	2	8	16856	16863	75 %	0 %	25 %	0 %	532351378
50	NC_022108	ATTT	2	8	17002	17009	25 %	75 %	0 %	0 %	532351378
51	NC_022108	TGCG	2	8	18524	18531	0 %	25 %	50 %	25 %	532351380
52	NC_022108	GAAG	2	8	19508	19515	50 %	0 %	50 %	0 %	532351380
53	NC_022108	TTTG	2	8	19534	19541	0 %	75 %	25 %	0 %	532351380
54	NC_022108	TGTA	2	8	20226	20233	25 %	50 %	25 %	0 %	532351381
55	NC_022108	GCCA	2	8	21017	21024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022108	CGCT	2	8	21265	21272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022108	TTAA	2	8	21286	21293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022108	GTTA	2	8	21323	21330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022108	GATC	2	8	21378	21385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022108	TGGG	2	8	21643	21650	0 %	25 %	75 %	0 %	532351382
61	NC_022108	CATT	2	8	22700	22707	25 %	50 %	0 %	25 %	532351382
62	NC_022108	GCTT	2	8	23043	23050	0 %	50 %	25 %	25 %	532351382
63	NC_022108	GGTT	2	8	23091	23098	0 %	50 %	50 %	0 %	532351382
64	NC_022108	TTCT	2	8	23461	23468	0 %	75 %	0 %	25 %	532351382
65	NC_022108	TAAC	2	8	23563	23570	50 %	25 %	0 %	25 %	532351382
66	NC_022108	CATT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	532351382
67	NC_022108	GGTA	2	8	24056	24063	25 %	25 %	50 %	0 %	532351382
68	NC_022108	TTGA	2	8	25051	25058	25 %	50 %	25 %	0 %	532351383
69	NC_022108	TTCG	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	532351383
70	NC_022108	TAGG	2	8	25275	25282	25 %	25 %	50 %	0 %	532351383
71	NC_022108	TTCC	2	8	25399	25406	0 %	50 %	0 %	50 %	532351383
72	NC_022108	TAGG	2	8	25513	25520	25 %	25 %	50 %	0 %	532351383
73	NC_022108	TTTC	2	8	25947	25954	0 %	75 %	0 %	25 %	532351383
74	NC_022108	GCTT	2	8	26284	26291	0 %	50 %	25 %	25 %	532351383
75	NC_022108	GGAA	2	8	26867	26874	50 %	0 %	50 %	0 %	532351384
76	NC_022108	TTAA	2	8	26940	26947	50 %	50 %	0 %	0 %	532351384
77	NC_022108	AAAG	2	8	26990	26997	75 %	0 %	25 %	0 %	532351384
78	NC_022108	GGGC	2	8	27270	27277	0 %	0 %	75 %	25 %	532351384
79	NC_022108	GTTT	2	8	27553	27560	0 %	75 %	25 %	0 %	532351385
80	NC_022108	CAGA	2	8	27575	27582	50 %	0 %	25 %	25 %	532351385
81	NC_022108	ATTG	2	8	27934	27941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022108	CTTT	2	8	29547	29554	0 %	75 %	0 %	25 %	532351387
83	NC_022108	TTTG	2	8	29562	29569	0 %	75 %	25 %	0 %	532351387
84	NC_022108	TTGT	2	8	29597	29604	0 %	75 %	25 %	0 %	532351387
85	NC_022108	TGGC	2	8	29760	29767	0 %	25 %	50 %	25 %	532351387
86	NC_022108	AAAG	2	8	30320	30327	75 %	0 %	25 %	0 %	532351388
87	NC_022108	AAAC	2	8	30390	30397	75 %	0 %	0 %	25 %	532351388
88	NC_022108	GATG	2	8	30533	30540	25 %	25 %	50 %	0 %	532351388
89	NC_022108	GATA	2	8	31642	31649	50 %	25 %	25 %	0 %	532351390
90	NC_022108	TGAT	2	8	34137	34144	25 %	50 %	25 %	0 %	532351393
91	NC_022108	AAGA	3	12	34265	34276	75 %	0 %	25 %	0 %	532351393
92	NC_022108	AAGC	2	8	34485	34492	50 %	0 %	25 %	25 %	532351394
93	NC_022108	GTTC	2	8	34518	34525	0 %	50 %	25 %	25 %	532351394
94	NC_022108	GGCA	2	8	34897	34904	25 %	0 %	50 %	25 %	532351395
95	NC_022108	TCGA	2	8	35154	35161	25 %	25 %	25 %	25 %	532351395
96	NC_022108	TGCT	2	8	35307	35314	0 %	50 %	25 %	25 %	532351395
97	NC_022108	TTGG	2	8	35539	35546	0 %	50 %	50 %	0 %	532351395
98	NC_022108	AGAT	2	8	36259	36266	50 %	25 %	25 %	0 %	532351395
99	NC_022108	CTTT	2	8	36632	36639	0 %	75 %	0 %	25 %	532351396
100	NC_022108	ATGA	2	8	37122	37129	50 %	25 %	25 %	0 %	532351396
101	NC_022108	TAGG	2	8	37281	37288	25 %	25 %	50 %	0 %	532351396
102	NC_022108	CAAT	2	8	37465	37472	50 %	25 %	0 %	25 %	532351396
103	NC_022108	AATG	2	8	38252	38259	50 %	25 %	25 %	0 %	532351396
104	NC_022108	AGAA	2	8	39089	39096	75 %	0 %	25 %	0 %	532351397
105	NC_022108	AAGA	2	8	39141	39148	75 %	0 %	25 %	0 %	532351397
106	NC_022108	ATCC	2	8	39149	39156	25 %	25 %	0 %	50 %	532351397
107	NC_022108	TAAT	2	8	39360	39367	50 %	50 %	0 %	0 %	532351397
108	NC_022108	GTGC	2	8	41449	41456	0 %	25 %	50 %	25 %	532351399
109	NC_022108	AGAA	2	8	41868	41875	75 %	0 %	25 %	0 %	532351399
110	NC_022108	GGAT	2	8	42019	42026	25 %	25 %	50 %	0 %	532351399
111	NC_022108	AAAC	2	8	43227	43234	75 %	0 %	0 %	25 %	532351401
112	NC_022108	CAAT	2	8	43431	43438	50 %	25 %	0 %	25 %	532351401
113	NC_022108	TGTT	2	8	43810	43817	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022108	AATA	2	8	44049	44056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022108	ATTT	2	8	44187	44194	25 %	75 %	0 %	0 %	532351403
116	NC_022108	GCTC	2	8	44495	44502	0 %	25 %	25 %	50 %	532351403
117	NC_022108	TTCT	2	8	44637	44644	0 %	75 %	0 %	25 %	532351403
118	NC_022108	TTGA	2	8	45237	45244	25 %	50 %	25 %	0 %	532351404
119	NC_022108	TGTT	2	8	45409	45416	0 %	75 %	25 %	0 %	532351404
120	NC_022108	CTAT	2	8	45439	45446	25 %	50 %	0 %	25 %	532351404
121	NC_022108	TGTT	2	8	45468	45475	0 %	75 %	25 %	0 %	532351404
122	NC_022108	CTAT	2	8	45764	45771	25 %	50 %	0 %	25 %	532351404
123	NC_022108	AAGA	2	8	46260	46267	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
124	NC_022108	AAGA	2	8	46317	46324	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
125	NC_022108	AAAG	2	8	46357	46364	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
126	NC_022108	AAGA	2	8	46472	46479	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
127	NC_022108	ACTT	2	8	46733	46740	25 %	50 %	0 %	25 %	532351405
128	NC_022108	ATGG	2	8	47359	47366	25 %	25 %	50 %	0 %	532351405
129	NC_022108	AGGA	2	8	47390	47397	50 %	0 %	50 %	0 %	532351405
130	NC_022108	GAAC	2	8	47937	47944	50 %	0 %	25 %	25 %	532351405
131	NC_022108	AAGT	2	8	47972	47979	50 %	25 %	25 %	0 %	532351405
132	NC_022108	AACA	2	8	48181	48188	75 %	0 %	0 %	25 %	532351406
133	NC_022108	CTTT	2	8	48377	48384	0 %	75 %	0 %	25 %	532351406
134	NC_022108	CTTT	2	8	49268	49275	0 %	75 %	0 %	25 %	532351407
135	NC_022108	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	532351407
136	NC_022108	GAAG	2	8	50714	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	532351408
137	NC_022108	TTCA	2	8	51135	51142	25 %	50 %	0 %	25 %	532351408
138	NC_022108	TCTA	2	8	51352	51359	25 %	50 %	0 %	25 %	532351408
139	NC_022108	TATT	2	8	52286	52293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022108	GGAA	2	8	52516	52523	50 %	0 %	50 %	0 %	532351410
141	NC_022108	TTAA	2	8	53257	53264	50 %	50 %	0 %	0 %	532351410
142	NC_022108	CCTT	2	8	53464	53471	0 %	50 %	0 %	50 %	532351411
143	NC_022108	TTTA	2	8	53631	53638	25 %	75 %	0 %	0 %	532351411
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280	NC_022108	TATT	2	8	97777	97784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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