MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022108	AGG	2	6	159799	159804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351497
3502	NC_022108	CTG	2	6	159819	159824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351497
3503	NC_022108	AG	3	6	159850	159855	50 %	0 %	50 %	0 %	532351497
3504	NC_022108	TCT	2	6	159878	159883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351497
3505	NC_022108	AGG	2	6	159997	160002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351497
3506	NC_022108	GAA	2	6	160010	160015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351497
3507	NC_022108	AGA	2	6	160058	160063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351498
3508	NC_022108	ATAC	2	8	160182	160189	50 %	25 %	0 %	25 %	532351498
3509	NC_022108	AGG	2	6	160208	160213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351498
3510	NC_022108	AGG	2	6	160223	160228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351498
3511	NC_022108	CT	3	6	160321	160326	0 %	50 %	0 %	50 %	532351498
3512	NC_022108	GA	3	6	160331	160336	50 %	0 %	50 %	0 %	532351498
3513	NC_022108	ATT	2	6	160351	160356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351498
3514	NC_022108	ATA	2	6	160447	160452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351498
3515	NC_022108	AC	3	6	160471	160476	50 %	0 %	0 %	50 %	532351498
3516	NC_022108	A	8	8	160516	160523	100 %	0 %	0 %	0 %	532351498
3517	NC_022108	ATG	2	6	160597	160602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351498
3518	NC_022108	TCT	2	6	160612	160617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351498
3519	NC_022108	TTC	2	6	160826	160831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351498
3520	NC_022108	AGG	2	6	160837	160842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351498
3521	NC_022108	ACA	2	6	160853	160858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351498
3522	NC_022108	ATA	3	9	160863	160871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351498
3523	NC_022108	TTTC	2	8	160881	160888	0 %	75 %	0 %	25 %	532351499
3524	NC_022108	AACAGC	2	12	160966	160977	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532351499
3525	NC_022108	AGT	2	6	161009	161014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351499
3526	NC_022108	TGG	2	6	161095	161100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351499
3527	NC_022108	TC	3	6	161422	161427	0 %	50 %	0 %	50 %	532351499
3528	NC_022108	A	6	6	161440	161445	100 %	0 %	0 %	0 %	532351499
3529	NC_022108	CTG	2	6	161508	161513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351499
3530	NC_022108	TTA	2	6	161531	161536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351499
3531	NC_022108	ACA	2	6	161570	161575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351499
3532	NC_022108	GCA	2	6	161594	161599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351499
3533	NC_022108	CTT	2	6	161613	161618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351499
3534	NC_022108	ATTG	2	8	161632	161639	25 %	50 %	25 %	0 %	532351499
3535	NC_022108	TCT	2	6	161663	161668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351499
3536	NC_022108	CT	4	8	161667	161674	0 %	50 %	0 %	50 %	532351499
3537	NC_022108	TGT	2	6	161695	161700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351499
3538	NC_022108	GCTT	2	8	161736	161743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_022108	CAAAA	2	10	161766	161775	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3540	NC_022108	TGT	2	6	161788	161793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_022108	CAA	2	6	161868	161873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_022108	GAG	2	6	161887	161892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_022108	TGG	2	6	162110	162115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351500
3544	NC_022108	TGT	2	6	162153	162158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351500
3545	NC_022108	GAA	2	6	162163	162168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351500
3546	NC_022108	GGAA	2	8	162205	162212	50 %	0 %	50 %	0 %	532351500
3547	NC_022108	GAA	3	9	162220	162228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351500
3548	NC_022108	TTTC	2	8	162323	162330	0 %	75 %	0 %	25 %	532351500
3549	NC_022108	ATCT	2	8	162349	162356	25 %	50 %	0 %	25 %	532351500
3550	NC_022108	CTT	2	6	162374	162379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351500
3551	NC_022108	GA	3	6	162428	162433	50 %	0 %	50 %	0 %	532351500
3552	NC_022108	TTG	2	6	162454	162459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351500
3553	NC_022108	GAA	2	6	162475	162480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351500
3554	NC_022108	TTA	2	6	162531	162536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351500
3555	NC_022108	TAG	2	6	162542	162547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351500
3556	NC_022108	GTT	2	6	162629	162634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351500
3557	NC_022108	ACA	3	9	162636	162644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351500
3558	NC_022108	AGA	2	6	162756	162761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351500
3559	NC_022108	TG	3	6	162815	162820	0 %	50 %	50 %	0 %	532351500
3560	NC_022108	AGC	2	6	162833	162838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351500
3561	NC_022108	TAG	2	6	162851	162856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351500
3562	NC_022108	TCGA	2	8	162865	162872	25 %	25 %	25 %	25 %	532351500
3563	NC_022108	AGAGA	2	10	162994	163003	60 %	0 %	40 %	0 %	532351500
3564	NC_022108	ATT	2	6	163017	163022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351500
3565	NC_022108	GAGG	2	8	163042	163049	25 %	0 %	75 %	0 %	532351500
3566	NC_022108	TC	3	6	163055	163060	0 %	50 %	0 %	50 %	532351500
3567	NC_022108	TGT	2	6	163287	163292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351500
3568	NC_022108	CTT	3	9	163313	163321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351500
3569	NC_022108	TTG	2	6	163326	163331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351500
3570	NC_022108	AGC	2	6	163371	163376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351500
3571	NC_022108	AGG	2	6	163380	163385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351500
3572	NC_022108	GAA	2	6	163414	163419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351500
3573	NC_022108	AGCAA	2	10	163429	163438	60 %	0 %	20 %	20 %	532351500
3574	NC_022108	TAC	2	6	163455	163460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351500
3575	NC_022108	TGGC	2	8	163505	163512	0 %	25 %	50 %	25 %	532351500
3576	NC_022108	CCT	2	6	163594	163599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351500
3577	NC_022108	GT	3	6	163613	163618	0 %	50 %	50 %	0 %	532351500
3578	NC_022108	GAG	2	6	163622	163627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351500
3579	NC_022108	GAT	2	6	163648	163653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351500
3580	NC_022108	AAT	2	6	163678	163683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351500
3581	NC_022108	GAT	2	6	163766	163771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_022108	TAT	2	6	163814	163819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351501
3583	NC_022108	TCAA	2	8	163824	163831	50 %	25 %	0 %	25 %	532351501
3584	NC_022108	CGA	2	6	163833	163838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351501
3585	NC_022108	ATG	2	6	163854	163859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351501
3586	NC_022108	TGT	2	6	163986	163991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351501
3587	NC_022108	T	7	7	164030	164036	0 %	100 %	0 %	0 %	532351501
3588	NC_022108	ATT	2	6	164050	164055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351501
3589	NC_022108	GAG	2	6	164253	164258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351501
3590	NC_022108	TTTC	2	8	164264	164271	0 %	75 %	0 %	25 %	532351501
3591	NC_022108	GGA	2	6	164351	164356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351501
3592	NC_022108	TCT	2	6	164372	164377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351501
3593	NC_022108	GCT	2	6	164384	164389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351501
3594	NC_022108	A	8	8	164433	164440	100 %	0 %	0 %	0 %	532351501
3595	NC_022108	GGT	2	6	164527	164532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351501
3596	NC_022108	GA	3	6	164544	164549	50 %	0 %	50 %	0 %	532351501
3597	NC_022108	GC	3	6	164560	164565	0 %	0 %	50 %	50 %	532351501
3598	NC_022108	GTC	2	6	164591	164596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351501
3599	NC_022108	GGA	2	6	164704	164709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351501
3600	NC_022108	T	7	7	164769	164775	0 %	100 %	0 %	0 %	532351501
3601	NC_022108	A	8	8	164826	164833	100 %	0 %	0 %	0 %	532351501
3602	NC_022108	AGG	2	6	164869	164874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351501
3603	NC_022108	TTG	2	6	164892	164897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351501
3604	NC_022108	AG	3	6	164923	164928	50 %	0 %	50 %	0 %	532351501
3605	NC_022108	TGT	2	6	164974	164979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351501
3606	NC_022108	G	6	6	165023	165028	0 %	0 %	100 %	0 %	532351501
3607	NC_022108	GA	3	6	165087	165092	50 %	0 %	50 %	0 %	532351501
3608	NC_022108	ATT	2	6	165106	165111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351501
3609	NC_022108	AT	3	6	165141	165146	50 %	50 %	0 %	0 %	532351501
3610	NC_022108	AGA	3	9	165157	165165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351501
3611	NC_022108	CTT	2	6	165345	165350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351501
3612	NC_022108	ATCG	2	8	165397	165404	25 %	25 %	25 %	25 %	532351501
3613	NC_022108	TTC	2	6	165410	165415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351501
3614	NC_022108	AG	3	6	165431	165436	50 %	0 %	50 %	0 %	532351501
3615	NC_022108	TCG	2	6	165442	165447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351501
3616	NC_022108	TTCT	2	8	165471	165478	0 %	75 %	0 %	25 %	532351501
3617	NC_022108	G	6	6	165584	165589	0 %	0 %	100 %	0 %	532351501
3618	NC_022108	A	6	6	165659	165664	100 %	0 %	0 %	0 %	532351501
3619	NC_022108	ATT	2	6	165703	165708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351501
3620	NC_022108	T	7	7	165747	165753	0 %	100 %	0 %	0 %	532351501
3621	NC_022108	CTTC	2	8	165807	165814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_022108	CTTT	2	8	165876	165883	0 %	75 %	0 %	25 %	532351502
3623	NC_022108	TGT	2	6	166007	166012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351502
3624	NC_022108	A	6	6	166050	166055	100 %	0 %	0 %	0 %	532351502
3625	NC_022108	AT	3	6	166062	166067	50 %	50 %	0 %	0 %	532351502
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3721	NC_022108	GCA	2	6	170265	170270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3740	NC_022108	T	8	8	171217	171224	0 %	100 %	0 %	0 %	532351503
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3743	NC_022108	AATA	2	8	171350	171357	75 %	25 %	0 %	0 %	532351503
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3998	NC_022108	GA	3	6	182821	182826	50 %	0 %	50 %	0 %	532352212
3999	NC_022108	GCG	2	6	182829	182834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352212
4000	NC_022108	ACT	2	6	182877	182882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352212

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