MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022108	ATT	2	6	114117	114122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_022108	AGA	2	6	114145	114150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351455
2503	NC_022108	TTC	3	9	114151	114159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2504	NC_022108	AG	3	6	114271	114276	50 %	0 %	50 %	0 %	532351455
2505	NC_022108	TAC	2	6	114385	114390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351455
2506	NC_022108	T	7	7	114474	114480	0 %	100 %	0 %	0 %	532351455
2507	NC_022108	CTTT	2	8	114482	114489	0 %	75 %	0 %	25 %	532351455
2508	NC_022108	ACAG	2	8	114494	114501	50 %	0 %	25 %	25 %	532351455
2509	NC_022108	T	6	6	114526	114531	0 %	100 %	0 %	0 %	532351455
2510	NC_022108	T	6	6	114556	114561	0 %	100 %	0 %	0 %	532351455
2511	NC_022108	CTG	2	6	114651	114656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351455
2512	NC_022108	TTC	2	6	114682	114687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2513	NC_022108	TGTTT	2	10	114707	114716	0 %	80 %	20 %	0 %	532351455
2514	NC_022108	GA	4	8	114727	114734	50 %	0 %	50 %	0 %	532351455
2515	NC_022108	AGAA	2	8	114757	114764	75 %	0 %	25 %	0 %	532351455
2516	NC_022108	ACT	2	6	114767	114772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351455
2517	NC_022108	TCA	2	6	114779	114784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351455
2518	NC_022108	TTG	2	6	114788	114793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351455
2519	NC_022108	CTT	2	6	114864	114869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2520	NC_022108	AAGG	2	8	114891	114898	50 %	0 %	50 %	0 %	532351455
2521	NC_022108	GGA	2	6	114932	114937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351455
2522	NC_022108	TCT	2	6	114942	114947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2523	NC_022108	TTTG	2	8	114975	114982	0 %	75 %	25 %	0 %	532351455
2524	NC_022108	GAT	2	6	115024	115029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351455
2525	NC_022108	CATGT	2	10	115085	115094	20 %	40 %	20 %	20 %	532351455
2526	NC_022108	TCT	2	6	115246	115251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2527	NC_022108	ACA	2	6	115256	115261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2528	NC_022108	CGA	2	6	115268	115273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351455
2529	NC_022108	ATC	2	6	115321	115326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351455
2530	NC_022108	TCT	2	6	115338	115343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2531	NC_022108	GGAA	2	8	115364	115371	50 %	0 %	50 %	0 %	532351455
2532	NC_022108	ACC	2	6	115399	115404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351455
2533	NC_022108	TTG	2	6	115485	115490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351455
2534	NC_022108	AAC	2	6	115507	115512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2535	NC_022108	ACTTCG	2	12	115547	115558	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532351455
2536	NC_022108	ACA	3	9	115637	115645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2537	NC_022108	CAA	2	6	115662	115667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2538	NC_022108	TTC	3	9	115711	115719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2539	NC_022108	TCT	2	6	115772	115777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2540	NC_022108	AAGC	2	8	115781	115788	50 %	0 %	25 %	25 %	532351455
2541	NC_022108	TATCG	2	10	115789	115798	20 %	40 %	20 %	20 %	532351455
2542	NC_022108	T	6	6	115805	115810	0 %	100 %	0 %	0 %	532351455
2543	NC_022108	ATG	2	6	115846	115851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351455
2544	NC_022108	AGT	2	6	115880	115885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_022108	A	6	6	115901	115906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_022108	TAA	2	6	115932	115937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_022108	A	7	7	115954	115960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_022108	TTTTAG	2	12	115982	115993	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_022108	TG	3	6	115998	116003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_022108	GGTT	2	8	116113	116120	0 %	50 %	50 %	0 %	532351456
2551	NC_022108	T	7	7	116129	116135	0 %	100 %	0 %	0 %	532351456
2552	NC_022108	GCT	2	6	116255	116260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
2553	NC_022108	TTTCT	2	10	116305	116314	0 %	80 %	0 %	20 %	532351456
2554	NC_022108	ACA	2	6	116342	116347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351456
2555	NC_022108	TAT	2	6	116530	116535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351456
2556	NC_022108	TATC	2	8	116562	116569	25 %	50 %	0 %	25 %	532351456
2557	NC_022108	TTTG	2	8	116659	116666	0 %	75 %	25 %	0 %	532351456
2558	NC_022108	AGG	3	9	116671	116679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351456
2559	NC_022108	AGA	2	6	116692	116697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351456
2560	NC_022108	GA	3	6	116746	116751	50 %	0 %	50 %	0 %	532351456
2561	NC_022108	A	6	6	116799	116804	100 %	0 %	0 %	0 %	532351456
2562	NC_022108	GTTC	2	8	116855	116862	0 %	50 %	25 %	25 %	532351456
2563	NC_022108	TAA	2	6	116875	116880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351456
2564	NC_022108	ACC	2	6	116891	116896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351456
2565	NC_022108	GCT	2	6	116909	116914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
2566	NC_022108	AGG	2	6	116959	116964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351456
2567	NC_022108	ATT	2	6	116993	116998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351456
2568	NC_022108	TTC	2	6	117010	117015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351456
2569	NC_022108	TGC	2	6	117040	117045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
2570	NC_022108	CTG	2	6	117087	117092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
2571	NC_022108	GCA	2	6	117292	117297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351457
2572	NC_022108	TGC	2	6	117303	117308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351457
2573	NC_022108	AAG	2	6	117311	117316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351457
2574	NC_022108	GAAA	2	8	117363	117370	75 %	0 %	25 %	0 %	532351457
2575	NC_022108	GTT	2	6	117406	117411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351457
2576	NC_022108	TAT	2	6	117422	117427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351457
2577	NC_022108	TCC	2	6	117449	117454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351457
2578	NC_022108	TAA	3	9	117512	117520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351457
2579	NC_022108	AGA	2	6	117595	117600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352207
2580	NC_022108	AGC	2	6	117617	117622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352207
2581	NC_022108	TTG	2	6	117627	117632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352207
2582	NC_022108	CAA	2	6	117643	117648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352207
2583	NC_022108	AGA	2	6	117649	117654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352207
2584	NC_022108	AAG	2	6	117695	117700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352207
2585	NC_022108	TAA	2	6	117708	117713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352207
2586	NC_022108	CA	3	6	117915	117920	50 %	0 %	0 %	50 %	532352207
2587	NC_022108	ATC	2	6	117963	117968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352207
2588	NC_022108	T	6	6	117977	117982	0 %	100 %	0 %	0 %	532352207
2589	NC_022108	TAA	2	6	118034	118039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_022108	AT	3	6	118121	118126	50 %	50 %	0 %	0 %	532351458
2591	NC_022108	T	6	6	118131	118136	0 %	100 %	0 %	0 %	532351458
2592	NC_022108	AGA	3	9	118137	118145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351458
2593	NC_022108	CTTT	2	8	118174	118181	0 %	75 %	0 %	25 %	532351458
2594	NC_022108	GTAG	2	8	118219	118226	25 %	25 %	50 %	0 %	532351458
2595	NC_022108	G	6	6	118267	118272	0 %	0 %	100 %	0 %	532351458
2596	NC_022108	T	6	6	118290	118295	0 %	100 %	0 %	0 %	532351458
2597	NC_022108	GTT	2	6	118408	118413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351458
2598	NC_022108	GA	3	6	118417	118422	50 %	0 %	50 %	0 %	532351458
2599	NC_022108	TTA	2	6	118438	118443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351458
2600	NC_022108	TCC	2	6	118452	118457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351458
2601	NC_022108	A	8	8	118492	118499	100 %	0 %	0 %	0 %	532351458
2602	NC_022108	CTC	2	6	118507	118512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351458
2603	NC_022108	AAAGA	2	10	118548	118557	80 %	0 %	20 %	0 %	532351458
2604	NC_022108	AAT	2	6	118558	118563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351458
2605	NC_022108	AG	4	8	118582	118589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_022108	CTT	2	6	118590	118595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_022108	TTA	2	6	118612	118617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351459
2608	NC_022108	T	6	6	118717	118722	0 %	100 %	0 %	0 %	532351459
2609	NC_022108	TTC	2	6	118803	118808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351459
2610	NC_022108	TCC	2	6	118816	118821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351459
2611	NC_022108	TTTA	2	8	118834	118841	25 %	75 %	0 %	0 %	532351459
2612	NC_022108	CTG	2	6	119032	119037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351459
2613	NC_022108	AGA	2	6	119061	119066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351459
2614	NC_022108	TTGCCA	2	12	119084	119095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532351459
2615	NC_022108	GA	4	8	119107	119114	50 %	0 %	50 %	0 %	532351459
2616	NC_022108	GAA	2	6	119121	119126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351459
2617	NC_022108	TTC	2	6	119160	119165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351459
2618	NC_022108	TACT	2	8	119222	119229	25 %	50 %	0 %	25 %	532351459
2619	NC_022108	GTT	2	6	119266	119271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351459
2620	NC_022108	TAT	2	6	119301	119306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351459
2621	NC_022108	GAT	2	6	119317	119322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351459
2622	NC_022108	GAG	2	6	119348	119353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351459
2623	NC_022108	TC	3	6	119439	119444	0 %	50 %	0 %	50 %	532351459
2624	NC_022108	AG	3	6	119542	119547	50 %	0 %	50 %	0 %	532351460
2625	NC_022108	GCTA	2	8	119564	119571	25 %	25 %	25 %	25 %	532351460
2626	NC_022108	GA	3	6	119575	119580	50 %	0 %	50 %	0 %	532351460
2627	NC_022108	AAG	2	6	119583	119588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351460
2628	NC_022108	GCT	3	9	119589	119597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351460
2629	NC_022108	GTA	2	6	119648	119653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351460
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2631	NC_022108	TC	3	6	119663	119668	0 %	50 %	0 %	50 %	532351460
2632	NC_022108	GCTA	2	8	119696	119703	25 %	25 %	25 %	25 %	532351460
2633	NC_022108	CGGC	2	8	119745	119752	0 %	0 %	50 %	50 %	532351460
2634	NC_022108	AGC	2	6	119786	119791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351460
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2638	NC_022108	GA	4	8	119896	119903	50 %	0 %	50 %	0 %	532351460
2639	NC_022108	GGC	2	6	119936	119941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351460
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2641	NC_022108	TCT	2	6	120120	120125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351460
2642	NC_022108	GA	3	6	120229	120234	50 %	0 %	50 %	0 %	532351460
2643	NC_022108	ATC	2	6	120322	120327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351460
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2645	NC_022108	GA	3	6	120403	120408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_022108	TAT	2	6	120427	120432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_022108	ATA	2	6	120448	120453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_022108	CTGG	2	8	120471	120478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2649	NC_022108	TAAAAA	2	12	120575	120586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2650	NC_022108	TTGGTA	2	12	120623	120634	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532351461
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2656	NC_022108	CTG	2	6	120749	120754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351461
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2680	NC_022108	AGA	2	6	122121	122126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351461
2681	NC_022108	TGA	2	6	122133	122138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351461
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2684	NC_022108	ATC	2	6	122382	122387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351461
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2686	NC_022108	GA	3	6	122529	122534	50 %	0 %	50 %	0 %	532351461
2687	NC_022108	GCTTC	2	10	122537	122546	0 %	40 %	20 %	40 %	532351461
2688	NC_022108	TCTA	2	8	122578	122585	25 %	50 %	0 %	25 %	532351461
2689	NC_022108	TA	3	6	122638	122643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2690	NC_022108	T	6	6	122684	122689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2691	NC_022108	ACT	2	6	122739	122744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351462
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2694	NC_022108	T	6	6	122851	122856	0 %	100 %	0 %	0 %	532351462
2695	NC_022108	AGCT	2	8	122884	122891	25 %	25 %	25 %	25 %	532351462
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2701	NC_022108	TGA	2	6	123327	123332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351462
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2710	NC_022108	CAA	2	6	123798	123803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351463
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2719	NC_022108	TTGCAT	2	12	124054	124065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532351463
2720	NC_022108	A	7	7	124072	124078	100 %	0 %	0 %	0 %	532351463
2721	NC_022108	CTG	2	6	124081	124086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351463
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2725	NC_022108	AG	3	6	124161	124166	50 %	0 %	50 %	0 %	532351463
2726	NC_022108	AGC	2	6	124349	124354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351463
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2729	NC_022108	AAGAGA	2	12	124423	124434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351463
2730	NC_022108	TAC	2	6	124461	124466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351463
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2732	NC_022108	TTG	2	6	124484	124489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351463
2733	NC_022108	GA	3	6	124531	124536	50 %	0 %	50 %	0 %	532351463
2734	NC_022108	TAG	2	6	124550	124555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351463
2735	NC_022108	CTTC	2	8	124557	124564	0 %	50 %	0 %	50 %	532351463
2736	NC_022108	TCA	2	6	124677	124682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351463
2737	NC_022108	T	6	6	124706	124711	0 %	100 %	0 %	0 %	532351463
2738	NC_022108	ATAA	2	8	124759	124766	75 %	25 %	0 %	0 %	532351463
2739	NC_022108	T	6	6	124782	124787	0 %	100 %	0 %	0 %	532351463
2740	NC_022108	T	7	7	124807	124813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2741	NC_022108	TGAA	2	8	124844	124851	50 %	25 %	25 %	0 %	532351464
2742	NC_022108	TAA	2	6	125138	125143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351464
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2744	NC_022108	CTT	2	6	125203	125208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351464
2745	NC_022108	GAA	2	6	125309	125314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351464
2746	NC_022108	TCT	2	6	125322	125327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351464
2747	NC_022108	CAG	2	6	125379	125384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351464
2748	NC_022108	TCA	2	6	125395	125400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351464
2749	NC_022108	TGA	2	6	125411	125416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351464
2750	NC_022108	T	6	6	125453	125458	0 %	100 %	0 %	0 %	532351464
2751	NC_022108	TTAA	2	8	125567	125574	50 %	50 %	0 %	0 %	532351464
2752	NC_022108	CTC	2	6	125645	125650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351465
2753	NC_022108	T	7	7	125652	125658	0 %	100 %	0 %	0 %	532351465
2754	NC_022108	AGA	2	6	125679	125684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351465
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2756	NC_022108	GA	3	6	125841	125846	50 %	0 %	50 %	0 %	532351465
2757	NC_022108	GTA	2	6	125857	125862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351465
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2760	NC_022108	TGAT	2	8	125995	126002	25 %	50 %	25 %	0 %	532351465
2761	NC_022108	AGA	2	6	126036	126041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351465
2762	NC_022108	GAA	2	6	126181	126186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351465
2763	NC_022108	CAA	2	6	126290	126295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351465
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2765	NC_022108	T	7	7	126303	126309	0 %	100 %	0 %	0 %	532351465
2766	NC_022108	TACAA	2	10	126324	126333	60 %	20 %	0 %	20 %	532351465
2767	NC_022108	A	9	9	126435	126443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2768	NC_022108	GAA	2	6	126472	126477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2769	NC_022108	GCA	2	6	126538	126543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351466
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2773	NC_022108	TTCG	2	8	126701	126708	0 %	50 %	25 %	25 %	532351466
2774	NC_022108	TTG	2	6	126725	126730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351466
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2777	NC_022108	GCA	2	6	126762	126767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351466
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2822	NC_022108	AGCT	2	8	128661	128668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2853	NC_022108	GAGG	2	8	130092	130099	25 %	0 %	75 %	0 %	532351468
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2862	NC_022108	CAG	2	6	130411	130416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351468
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2865	NC_022108	ATC	2	6	130522	130527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352208
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2867	NC_022108	AG	3	6	130584	130589	50 %	0 %	50 %	0 %	532352208
2868	NC_022108	T	6	6	130621	130626	0 %	100 %	0 %	0 %	532352208
2869	NC_022108	TTTG	2	8	130911	130918	0 %	75 %	25 %	0 %	532351469
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2995	NC_022108	TAG	2	6	136227	136232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351473
2996	NC_022108	ACA	2	6	136235	136240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351473
2997	NC_022108	CTT	2	6	136249	136254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351473
2998	NC_022108	TGTTT	2	10	136267	136276	0 %	80 %	20 %	0 %	532351473
2999	NC_022108	GCT	2	6	136280	136285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351473
3000	NC_022108	GGAT	2	8	136295	136302	25 %	25 %	50 %	0 %	532351473

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