MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022108	GTA	2	6	91524	91529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351437
2002	NC_022108	GTTT	2	8	91849	91856	0 %	75 %	25 %	0 %	532351437
2003	NC_022108	ATT	2	6	91899	91904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351437
2004	NC_022108	TTG	2	6	91953	91958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351437
2005	NC_022108	AGT	2	6	92028	92033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351437
2006	NC_022108	GGA	2	6	92057	92062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351437
2007	NC_022108	AGG	2	6	92080	92085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351437
2008	NC_022108	A	6	6	92094	92099	100 %	0 %	0 %	0 %	532351437
2009	NC_022108	CCA	2	6	92148	92153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351438
2010	NC_022108	ACA	2	6	92184	92189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351438
2011	NC_022108	T	6	6	92275	92280	0 %	100 %	0 %	0 %	532351438
2012	NC_022108	ATC	2	6	92286	92291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351438
2013	NC_022108	TTTA	2	8	92294	92301	25 %	75 %	0 %	0 %	532351438
2014	NC_022108	TAAG	2	8	92422	92429	50 %	25 %	25 %	0 %	532351438
2015	NC_022108	AAC	2	6	92471	92476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351438
2016	NC_022108	ATA	2	6	92501	92506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351438
2017	NC_022108	CAG	2	6	92527	92532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351438
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2019	NC_022108	TCA	2	6	92694	92699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351438
2020	NC_022108	TGG	2	6	92709	92714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351438
2021	NC_022108	ATT	2	6	92831	92836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351438
2022	NC_022108	CAACA	2	10	92843	92852	60 %	0 %	0 %	40 %	532351438
2023	NC_022108	TTG	2	6	92896	92901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351438
2024	NC_022108	GCT	2	6	92916	92921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351438
2025	NC_022108	TAA	2	6	92933	92938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351438
2026	NC_022108	GTT	2	6	92974	92979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_022108	CT	3	6	93000	93005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2028	NC_022108	TGA	2	6	93024	93029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_022108	AGA	2	6	93042	93047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_022108	GAG	2	6	93067	93072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351439
2031	NC_022108	AGA	2	6	93093	93098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351439
2032	NC_022108	CCA	2	6	93124	93129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351439
2033	NC_022108	AAG	2	6	93152	93157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351439
2034	NC_022108	TA	3	6	93166	93171	50 %	50 %	0 %	0 %	532351439
2035	NC_022108	GAA	2	6	93188	93193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351439
2036	NC_022108	AG	3	6	93209	93214	50 %	0 %	50 %	0 %	532351439
2037	NC_022108	TGA	2	6	93244	93249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351439
2038	NC_022108	TAA	2	6	93274	93279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351439
2039	NC_022108	AG	3	6	93306	93311	50 %	0 %	50 %	0 %	532351439
2040	NC_022108	AGC	2	6	93393	93398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351439
2041	NC_022108	AGT	2	6	93425	93430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351439
2042	NC_022108	GA	3	6	93528	93533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_022108	GAA	2	6	93539	93544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_022108	TGA	2	6	93550	93555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_022108	TAA	2	6	93676	93681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_022108	TTTAA	2	10	93726	93735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_022108	AAAT	2	8	93753	93760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_022108	A	7	7	93781	93787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_022108	AGCT	2	8	93800	93807	25 %	25 %	25 %	25 %	532351440
2050	NC_022108	AAGA	2	8	93865	93872	75 %	0 %	25 %	0 %	532351440
2051	NC_022108	CAT	2	6	93880	93885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351440
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2053	NC_022108	AAAAGA	2	12	93900	93911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532351440
2054	NC_022108	TTA	2	6	93958	93963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351440
2055	NC_022108	A	6	6	94091	94096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_022108	TAA	2	6	94098	94103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_022108	TA	3	6	94144	94149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_022108	TAA	2	6	94171	94176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_022108	CTTTT	2	10	94261	94270	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2060	NC_022108	T	6	6	94283	94288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_022108	T	7	7	94291	94297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_022108	T	9	9	94319	94327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_022108	ATT	3	9	94389	94397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_022108	T	6	6	94411	94416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_022108	T	6	6	94418	94423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_022108	A	6	6	94427	94432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_022108	CATC	2	8	94487	94494	25 %	25 %	0 %	50 %	532351441
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2088	NC_022108	A	7	7	95297	95303	100 %	0 %	0 %	0 %	532351441
2089	NC_022108	CT	3	6	95314	95319	0 %	50 %	0 %	50 %	532351441
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2094	NC_022108	GA	3	6	95541	95546	50 %	0 %	50 %	0 %	532351441
2095	NC_022108	AAT	2	6	95548	95553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351441
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2098	NC_022108	GA	3	6	95723	95728	50 %	0 %	50 %	0 %	532351441
2099	NC_022108	CTG	2	6	95738	95743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351441
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2101	NC_022108	TTCC	2	8	95783	95790	0 %	50 %	0 %	50 %	532351441
2102	NC_022108	GGA	2	6	95872	95877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351441
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2109	NC_022108	GA	3	6	96077	96082	50 %	0 %	50 %	0 %	532351441
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2112	NC_022108	AGA	2	6	96208	96213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351442
2113	NC_022108	AAG	2	6	96264	96269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351442
2114	NC_022108	A	8	8	96276	96283	100 %	0 %	0 %	0 %	532351442
2115	NC_022108	A	6	6	96311	96316	100 %	0 %	0 %	0 %	532351442
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2120	NC_022108	CAATC	2	10	96595	96604	40 %	20 %	0 %	40 %	532351442
2121	NC_022108	AGC	2	6	96606	96611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2122	NC_022108	T	8	8	96615	96622	0 %	100 %	0 %	0 %	532351443
2123	NC_022108	AGG	2	6	96627	96632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351443
2124	NC_022108	TCTTTT	2	12	96652	96663	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532351443
2125	NC_022108	CT	3	6	96696	96701	0 %	50 %	0 %	50 %	532351443
2126	NC_022108	TTTGC	2	10	96729	96738	0 %	60 %	20 %	20 %	532351443
2127	NC_022108	TCT	2	6	96772	96777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351443
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2129	NC_022108	ATG	2	6	96855	96860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351443
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2245	NC_022108	GA	3	6	101364	101369	50 %	0 %	50 %	0 %	532351446
2246	NC_022108	TGC	2	6	101372	101377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351446
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2250	NC_022108	AG	3	6	101610	101615	50 %	0 %	50 %	0 %	532351446
2251	NC_022108	TATC	2	8	101652	101659	25 %	50 %	0 %	25 %	532351446
2252	NC_022108	GAT	2	6	101692	101697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351446
2253	NC_022108	ATAC	2	8	101737	101744	50 %	25 %	0 %	25 %	532351447
2254	NC_022108	TGC	2	6	101804	101809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351447
2255	NC_022108	A	6	6	101811	101816	100 %	0 %	0 %	0 %	532351447
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2498	NC_022108	A	7	7	114040	114046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2499	NC_022108	A	8	8	114049	114056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_022108	GCTCT	2	10	114083	114092	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

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