MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_022108	GA	3	6	1022795	1022800	50 %	0 %	50 %	0 %	532352187
22502	NC_022108	ATT	2	6	1022831	1022836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352187
22503	NC_022108	ATC	2	6	1022848	1022853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352187
22504	NC_022108	CTC	2	6	1022933	1022938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352187
22505	NC_022108	GTT	2	6	1022976	1022981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352187
22506	NC_022108	GCTTT	2	10	1023018	1023027	0 %	60 %	20 %	20 %	532352187
22507	NC_022108	CAT	2	6	1023033	1023038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352187
22508	NC_022108	TTAC	2	8	1023062	1023069	25 %	50 %	0 %	25 %	532352187
22509	NC_022108	TGA	2	6	1023103	1023108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352187
22510	NC_022108	AG	5	10	1023188	1023197	50 %	0 %	50 %	0 %	532352187
22511	NC_022108	GAT	2	6	1023219	1023224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352187
22512	NC_022108	CTG	2	6	1023239	1023244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352187
22513	NC_022108	CCT	2	6	1023264	1023269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352187
22514	NC_022108	T	6	6	1023283	1023288	0 %	100 %	0 %	0 %	532352187
22515	NC_022108	TC	3	6	1023400	1023405	0 %	50 %	0 %	50 %	532352187
22516	NC_022108	TTC	2	6	1023559	1023564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352188
22517	NC_022108	CTT	2	6	1023585	1023590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352188
22518	NC_022108	GATA	2	8	1023594	1023601	50 %	25 %	25 %	0 %	532352188
22519	NC_022108	TGT	2	6	1023644	1023649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352188
22520	NC_022108	GAA	2	6	1023679	1023684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352188
22521	NC_022108	CTT	2	6	1023783	1023788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352188
22522	NC_022108	CAG	2	6	1023795	1023800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352188
22523	NC_022108	GTC	2	6	1023849	1023854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352188
22524	NC_022108	GGA	2	6	1023878	1023883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352188
22525	NC_022108	CGTTGA	2	12	1023909	1023920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352188
22526	NC_022108	TGTT	2	8	1024013	1024020	0 %	75 %	25 %	0 %	532352188
22527	NC_022108	AGG	2	6	1024072	1024077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352188
22528	NC_022108	GTT	2	6	1024098	1024103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352188
22529	NC_022108	GTT	2	6	1024115	1024120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352188
22530	NC_022108	ATG	2	6	1024223	1024228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352188
22531	NC_022108	AAG	2	6	1024251	1024256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352188
22532	NC_022108	GGA	2	6	1024313	1024318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352188
22533	NC_022108	ATA	2	6	1024334	1024339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352188
22534	NC_022108	TTA	2	6	1024350	1024355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352188
22535	NC_022108	AAT	2	6	1024364	1024369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352188
22536	NC_022108	AAAC	2	8	1024409	1024416	75 %	0 %	0 %	25 %	532352188
22537	NC_022108	TTA	2	6	1024432	1024437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352188
22538	NC_022108	A	6	6	1024443	1024448	100 %	0 %	0 %	0 %	532352188
22539	NC_022108	CTG	2	6	1024457	1024462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352188
22540	NC_022108	TC	3	6	1024509	1024514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22541	NC_022108	TTAGA	2	10	1024540	1024549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22542	NC_022108	TC	3	6	1024687	1024692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22543	NC_022108	CCT	2	6	1024757	1024762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352189
22544	NC_022108	TGC	2	6	1024764	1024769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352189
22545	NC_022108	GTT	2	6	1024820	1024825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352189
22546	NC_022108	TCT	2	6	1024855	1024860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352189
22547	NC_022108	TAGC	2	8	1024964	1024971	25 %	25 %	25 %	25 %	532352189
22548	NC_022108	GAG	2	6	1025037	1025042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352189
22549	NC_022108	GTT	2	6	1025044	1025049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352189
22550	NC_022108	GGC	2	6	1025060	1025065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352189
22551	NC_022108	CAG	2	6	1025083	1025088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352189
22552	NC_022108	AG	3	6	1025095	1025100	50 %	0 %	50 %	0 %	532352189
22553	NC_022108	T	6	6	1025130	1025135	0 %	100 %	0 %	0 %	532352189
22554	NC_022108	TCT	2	6	1025137	1025142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352189
22555	NC_022108	GAT	2	6	1025151	1025156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352189
22556	NC_022108	G	6	6	1025185	1025190	0 %	0 %	100 %	0 %	532352189
22557	NC_022108	AAT	2	6	1025250	1025255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352189
22558	NC_022108	GTC	2	6	1025294	1025299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352189
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22563	NC_022108	AGG	2	6	1025517	1025522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352189
22564	NC_022108	GGA	2	6	1025527	1025532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352189
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22566	NC_022108	GCA	2	6	1025583	1025588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352189
22567	NC_022108	AATC	2	8	1025631	1025638	50 %	25 %	0 %	25 %	532352189
22568	NC_022108	AAC	3	9	1025646	1025654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352189
22569	NC_022108	AAG	2	6	1025655	1025660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352189
22570	NC_022108	TTC	2	6	1025709	1025714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352189
22571	NC_022108	GAG	2	6	1025744	1025749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352189
22572	NC_022108	AGTTG	2	10	1025769	1025778	20 %	40 %	40 %	0 %	532352189
22573	NC_022108	ACA	2	6	1025786	1025791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352189
22574	NC_022108	TTAA	2	8	1025805	1025812	50 %	50 %	0 %	0 %	532352189
22575	NC_022108	AAAG	2	8	1025819	1025826	75 %	0 %	25 %	0 %	532352189
22576	NC_022108	AT	3	6	1025828	1025833	50 %	50 %	0 %	0 %	532352189
22577	NC_022108	T	6	6	1025850	1025855	0 %	100 %	0 %	0 %	532352189
22578	NC_022108	ACCAA	2	10	1026126	1026135	60 %	0 %	0 %	40 %	532352190
22579	NC_022108	AATA	2	8	1026350	1026357	75 %	25 %	0 %	0 %	532352190
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22583	NC_022108	GTT	2	6	1026612	1026617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352190
22584	NC_022108	T	6	6	1026616	1026621	0 %	100 %	0 %	0 %	532352190
22585	NC_022108	CTGA	2	8	1026651	1026658	25 %	25 %	25 %	25 %	532352190
22586	NC_022108	GT	4	8	1026673	1026680	0 %	50 %	50 %	0 %	532352190
22587	NC_022108	ATC	2	6	1026691	1026696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352190
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22590	NC_022108	TCC	3	9	1026774	1026782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352190
22591	NC_022108	T	6	6	1026829	1026834	0 %	100 %	0 %	0 %	532352190
22592	NC_022108	AGC	2	6	1026850	1026855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352190
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22596	NC_022108	ATAG	2	8	1027120	1027127	50 %	25 %	25 %	0 %	532352190
22597	NC_022108	TGA	2	6	1027137	1027142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352190
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22599	NC_022108	TGAG	2	8	1027196	1027203	25 %	25 %	50 %	0 %	532352190
22600	NC_022108	CTG	2	6	1027241	1027246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352190
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22602	NC_022108	GAA	2	6	1027315	1027320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352190
22603	NC_022108	ACA	2	6	1027420	1027425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352190
22604	NC_022108	TG	3	6	1027435	1027440	0 %	50 %	50 %	0 %	532352190
22605	NC_022108	TTTG	2	8	1027516	1027523	0 %	75 %	25 %	0 %	532352190
22606	NC_022108	TGA	2	6	1027534	1027539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352190
22607	NC_022108	TAC	2	6	1027572	1027577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352190
22608	NC_022108	A	6	6	1027649	1027654	100 %	0 %	0 %	0 %	532352190
22609	NC_022108	TCT	2	6	1027722	1027727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352190
22610	NC_022108	AGG	2	6	1027728	1027733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352190
22611	NC_022108	ATA	2	6	1027795	1027800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352190
22612	NC_022108	TA	3	6	1027842	1027847	50 %	50 %	0 %	0 %	532352190
22613	NC_022108	C	6	6	1027855	1027860	0 %	0 %	0 %	100 %	532352190
22614	NC_022108	TTA	2	6	1027861	1027866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352190
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22616	NC_022108	T	6	6	1027945	1027950	0 %	100 %	0 %	0 %	532352190
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22724	NC_022108	T	6	6	1032089	1032094	0 %	100 %	0 %	0 %	532352191
22725	NC_022108	TAAT	2	8	1032106	1032113	50 %	50 %	0 %	0 %	532352191
22726	NC_022108	TC	3	6	1032118	1032123	0 %	50 %	0 %	50 %	532352191
22727	NC_022108	TG	3	6	1032130	1032135	0 %	50 %	50 %	0 %	532352191
22728	NC_022108	TTCT	2	8	1032157	1032164	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22729	NC_022108	TGC	2	6	1032187	1032192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22730	NC_022108	G	9	9	1032202	1032210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22731	NC_022108	GCA	2	6	1032214	1032219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22732	NC_022108	ACT	2	6	1032303	1032308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352192
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22734	NC_022108	A	6	6	1032335	1032340	100 %	0 %	0 %	0 %	532352192
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