MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022108	AGA	2	6	46898	46903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351405
1002	NC_022108	AGA	2	6	46957	46962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351405
1003	NC_022108	AGT	2	6	47042	47047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351405
1004	NC_022108	ATA	2	6	47117	47122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351405
1005	NC_022108	A	6	6	47298	47303	100 %	0 %	0 %	0 %	532351405
1006	NC_022108	GAA	2	6	47310	47315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351405
1007	NC_022108	ATGG	2	8	47359	47366	25 %	25 %	50 %	0 %	532351405
1008	NC_022108	AGGA	2	8	47390	47397	50 %	0 %	50 %	0 %	532351405
1009	NC_022108	GTT	2	6	47419	47424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351405
1010	NC_022108	GGT	2	6	47428	47433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351405
1011	NC_022108	T	6	6	47437	47442	0 %	100 %	0 %	0 %	532351405
1012	NC_022108	ATA	2	6	47445	47450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351405
1013	NC_022108	AGA	2	6	47798	47803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351405
1014	NC_022108	CTG	2	6	47855	47860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351405
1015	NC_022108	GAA	2	6	47868	47873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351405
1016	NC_022108	T	6	6	47906	47911	0 %	100 %	0 %	0 %	532351405
1017	NC_022108	GAAC	2	8	47937	47944	50 %	0 %	25 %	25 %	532351405
1018	NC_022108	AAGT	2	8	47972	47979	50 %	25 %	25 %	0 %	532351405
1019	NC_022108	TAA	2	6	47981	47986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351405
1020	NC_022108	GAAGA	2	10	48005	48014	60 %	0 %	40 %	0 %	532351405
1021	NC_022108	G	6	6	48015	48020	0 %	0 %	100 %	0 %	532351405
1022	NC_022108	AG	3	6	48037	48042	50 %	0 %	50 %	0 %	532351405
1023	NC_022108	TGT	2	6	48056	48061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022108	CTG	2	6	48091	48096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351406
1025	NC_022108	GAG	2	6	48097	48102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351406
1026	NC_022108	TCC	2	6	48110	48115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351406
1027	NC_022108	AACA	2	8	48181	48188	75 %	0 %	0 %	25 %	532351406
1028	NC_022108	TAG	2	6	48298	48303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351406
1029	NC_022108	CCA	2	6	48318	48323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351406
1030	NC_022108	AAC	2	6	48354	48359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351406
1031	NC_022108	CTTT	2	8	48377	48384	0 %	75 %	0 %	25 %	532351406
1032	NC_022108	AAG	2	6	48407	48412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351406
1033	NC_022108	TTC	2	6	48443	48448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351406
1034	NC_022108	CAA	2	6	48478	48483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351406
1035	NC_022108	TAT	2	6	48496	48501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351406
1036	NC_022108	T	6	6	48546	48551	0 %	100 %	0 %	0 %	532351406
1037	NC_022108	T	8	8	48602	48609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_022108	TAGCAT	2	12	48615	48626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1039	NC_022108	GTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_022108	AAG	2	6	48762	48767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022108	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022108	T	8	8	48885	48892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022108	A	6	6	48936	48941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_022108	T	6	6	49046	49051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022108	TGT	2	6	49053	49058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_022108	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	532351407
1055	NC_022108	TCT	2	6	49355	49360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351407
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1057	NC_022108	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	532351407
1058	NC_022108	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022108	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_022108	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_022108	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_022108	ACT	2	6	49678	49683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_022108	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022108	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022108	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022108	GCC	2	6	49782	49787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_022108	ATT	2	6	49831	49836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022108	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_022108	TTC	2	6	49924	49929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351408
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1074	NC_022108	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	532351408
1075	NC_022108	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	532351408
1076	NC_022108	A	6	6	50074	50079	100 %	0 %	0 %	0 %	532351408
1077	NC_022108	TTC	2	6	50083	50088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351408
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1080	NC_022108	CTA	2	6	50149	50154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351408
1081	NC_022108	CAA	2	6	50200	50205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351408
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1083	NC_022108	GCA	2	6	50250	50255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351408
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1085	NC_022108	TGC	2	6	50459	50464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351408
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1092	NC_022108	GGC	2	6	50731	50736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351408
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1094	NC_022108	GCA	2	6	50889	50894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351408
1095	NC_022108	CAT	2	6	50965	50970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351408
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1097	NC_022108	T	6	6	51029	51034	0 %	100 %	0 %	0 %	532351408
1098	NC_022108	ACG	2	6	51042	51047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351408
1099	NC_022108	TCA	2	6	51074	51079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351408
1100	NC_022108	TTCA	2	8	51135	51142	25 %	50 %	0 %	25 %	532351408
1101	NC_022108	GCA	2	6	51168	51173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351408
1102	NC_022108	AGA	2	6	51280	51285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351408
1103	NC_022108	GTT	2	6	51324	51329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351408
1104	NC_022108	TCTA	2	8	51352	51359	25 %	50 %	0 %	25 %	532351408
1105	NC_022108	GTT	3	9	51364	51372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351408
1106	NC_022108	TG	4	8	51389	51396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022108	TAA	2	6	51406	51411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022108	T	6	6	51430	51435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022108	AGT	3	9	51474	51482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022108	GCA	2	6	51530	51535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351409
1111	NC_022108	CTG	2	6	51545	51550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351409
1112	NC_022108	GTA	2	6	51562	51567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351409
1113	NC_022108	AAG	2	6	51583	51588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351409
1114	NC_022108	A	6	6	51598	51603	100 %	0 %	0 %	0 %	532351409
1115	NC_022108	AAG	2	6	51628	51633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351409
1116	NC_022108	A	7	7	51658	51664	100 %	0 %	0 %	0 %	532351409
1117	NC_022108	AGC	2	6	51669	51674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351409
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1119	NC_022108	A	7	7	51766	51772	100 %	0 %	0 %	0 %	532351409
1120	NC_022108	AGC	2	6	51777	51782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351409
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1123	NC_022108	AGC	2	6	51885	51890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351409
1124	NC_022108	AAG	2	6	51952	51957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351409
1125	NC_022108	A	7	7	51982	51988	100 %	0 %	0 %	0 %	532351409
1126	NC_022108	AGC	2	6	51993	51998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351409
1127	NC_022108	CAA	2	6	52028	52033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351409
1128	NC_022108	A	7	7	52032	52038	100 %	0 %	0 %	0 %	532351409
1129	NC_022108	A	6	6	52072	52077	100 %	0 %	0 %	0 %	532351409
1130	NC_022108	GCT	2	6	52108	52113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351409
1131	NC_022108	CAA	2	6	52192	52197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351409
1132	NC_022108	GAT	2	6	52235	52240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022108	T	6	6	52279	52284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022108	TATT	2	8	52286	52293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022108	AAG	2	6	52313	52318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022108	AAT	2	6	52340	52345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022108	ATT	2	6	52352	52357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022108	CTA	2	6	52410	52415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351410
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1142	NC_022108	T	6	6	52528	52533	0 %	100 %	0 %	0 %	532351410
1143	NC_022108	CAA	2	6	52552	52557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351410
1144	NC_022108	TAT	2	6	52656	52661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351410
1145	NC_022108	GTT	2	6	52695	52700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351410
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1148	NC_022108	TC	3	6	53009	53014	0 %	50 %	0 %	50 %	532351410
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1155	NC_022108	T	6	6	53337	53342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_022108	T	6	6	53352	53357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_022108	TCT	2	6	53425	53430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351411
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1164	NC_022108	TGA	2	6	53592	53597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351411
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1173	NC_022108	A	6	6	54086	54091	100 %	0 %	0 %	0 %	532351411
1174	NC_022108	TATT	2	8	54108	54115	25 %	75 %	0 %	0 %	532351411
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1242	NC_022108	GTTG	2	8	57302	57309	0 %	50 %	50 %	0 %	532352198
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1249	NC_022108	ATT	2	6	57427	57432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352198
1250	NC_022108	T	6	6	57436	57441	0 %	100 %	0 %	0 %	532352198
1251	NC_022108	GCT	2	6	57647	57652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352199
1252	NC_022108	CCAAGA	2	12	57655	57666	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532352199
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1254	NC_022108	TCC	2	6	57700	57705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352199
1255	NC_022108	GAG	2	6	57719	57724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352199
1256	NC_022108	AGTTGT	2	12	57761	57772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352199
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1258	NC_022108	CAT	2	6	57933	57938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352199
1259	NC_022108	CTG	2	6	58026	58031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352199
1260	NC_022108	TGT	2	6	58093	58098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352199
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1263	NC_022108	CT	3	6	58176	58181	0 %	50 %	0 %	50 %	532352199
1264	NC_022108	AGGT	2	8	58205	58212	25 %	25 %	50 %	0 %	532352199
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1282	NC_022108	TGT	2	6	58997	59002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352199
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1287	NC_022108	T	6	6	59142	59147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1292	NC_022108	GGAG	2	8	59372	59379	25 %	0 %	75 %	0 %	532351413
1293	NC_022108	GTAA	2	8	59424	59431	50 %	25 %	25 %	0 %	532351413
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1337	NC_022108	AAAAAT	2	12	60986	60997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1386	NC_022108	TATG	2	8	63564	63571	25 %	50 %	25 %	0 %	532351415
1387	NC_022108	AAG	2	6	63577	63582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351415
1388	NC_022108	AGT	2	6	63672	63677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351415
1389	NC_022108	AG	3	6	63753	63758	50 %	0 %	50 %	0 %	532351415
1390	NC_022108	AGTGA	2	10	63807	63816	40 %	20 %	40 %	0 %	532351416
1391	NC_022108	AGG	2	6	63842	63847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351416
1392	NC_022108	AG	3	6	63881	63886	50 %	0 %	50 %	0 %	532351416
1393	NC_022108	ATT	2	6	63984	63989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351416
1394	NC_022108	ATT	2	6	64074	64079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351416
1395	NC_022108	CCTTC	2	10	64081	64090	0 %	40 %	0 %	60 %	532351416
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1401	NC_022108	TAG	2	6	64483	64488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351416
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1413	NC_022108	CTG	2	6	64954	64959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351417
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1422	NC_022108	CCT	2	6	65476	65481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351417
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1425	NC_022108	ATC	2	6	65529	65534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351417
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1430	NC_022108	AG	3	6	65984	65989	50 %	0 %	50 %	0 %	532351418
1431	NC_022108	AC	3	6	66116	66121	50 %	0 %	0 %	50 %	532351418
1432	NC_022108	TGT	2	6	66135	66140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351418
1433	NC_022108	A	7	7	66148	66154	100 %	0 %	0 %	0 %	532351418
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1440	NC_022108	AAG	2	6	66278	66283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351418
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1442	NC_022108	GAA	2	6	66397	66402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351418
1443	NC_022108	GTTAA	2	10	66438	66447	40 %	40 %	20 %	0 %	532351418
1444	NC_022108	AGG	2	6	66473	66478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351418
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1449	NC_022108	AAG	2	6	66659	66664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351418
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1452	NC_022108	GA	3	6	66997	67002	50 %	0 %	50 %	0 %	532351418
1453	NC_022108	TCA	2	6	67009	67014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351418
1454	NC_022108	TCA	2	6	67041	67046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351418
1455	NC_022108	GAAA	2	8	67147	67154	75 %	0 %	25 %	0 %	532351418
1456	NC_022108	GCAT	2	8	67217	67224	25 %	25 %	25 %	25 %	532351418
1457	NC_022108	ACGA	2	8	67253	67260	50 %	0 %	25 %	25 %	532351418
1458	NC_022108	TCCA	2	8	67304	67311	25 %	25 %	0 %	50 %	532351418
1459	NC_022108	TGG	2	6	67318	67323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351418
1460	NC_022108	GTC	2	6	67329	67334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351418
1461	NC_022108	CAA	2	6	67366	67371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351418
1462	NC_022108	ACAA	2	8	67452	67459	75 %	0 %	0 %	25 %	532351418
1463	NC_022108	G	6	6	67514	67519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_022108	AAGG	2	8	67550	67557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_022108	T	6	6	67650	67655	0 %	100 %	0 %	0 %	532351419
1466	NC_022108	T	6	6	67661	67666	0 %	100 %	0 %	0 %	532351419
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1472	NC_022108	TCC	2	6	68070	68075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351419
1473	NC_022108	CT	3	6	68081	68086	0 %	50 %	0 %	50 %	532351419
1474	NC_022108	GCA	2	6	68122	68127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351419
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1477	NC_022108	TCCA	2	8	68300	68307	25 %	25 %	0 %	50 %	532351419
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1479	NC_022108	GGA	4	12	68359	68370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351419
1480	NC_022108	CAG	2	6	68417	68422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351419
1481	NC_022108	CAG	2	6	68519	68524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351419
1482	NC_022108	AAG	2	6	68648	68653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351419
1483	NC_022108	ACA	2	6	68733	68738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1484	NC_022108	GCA	2	6	68806	68811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351420
1485	NC_022108	A	6	6	68852	68857	100 %	0 %	0 %	0 %	532351420
1486	NC_022108	TCT	2	6	68993	68998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351420
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1489	NC_022108	AAAAG	2	10	69064	69073	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_022108	A	6	6	69165	69170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1491	NC_022108	TTC	2	6	69240	69245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351421
1492	NC_022108	CTT	3	9	69249	69257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351421
1493	NC_022108	AT	3	6	69262	69267	50 %	50 %	0 %	0 %	532351421
1494	NC_022108	TTCG	2	8	69282	69289	0 %	50 %	25 %	25 %	532351421
1495	NC_022108	TGT	2	6	69307	69312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351421
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1497	NC_022108	T	6	6	69447	69452	0 %	100 %	0 %	0 %	532351421
1498	NC_022108	TCT	2	6	69563	69568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351421
1499	NC_022108	GGAGC	2	10	69686	69695	20 %	0 %	60 %	20 %	532351421
1500	NC_022108	TGC	2	6	69769	69774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351421

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