MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022108	TCT	2	6	611607	611612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351882
13502	NC_022108	TTC	2	6	611636	611641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351882
13503	NC_022108	TGCCA	2	10	611668	611677	20 %	20 %	20 %	40 %	532351882
13504	NC_022108	GTA	2	6	611727	611732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351882
13505	NC_022108	CT	3	6	611733	611738	0 %	50 %	0 %	50 %	532351882
13506	NC_022108	GATT	2	8	611817	611824	25 %	50 %	25 %	0 %	532351882
13507	NC_022108	TCT	2	6	611844	611849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351882
13508	NC_022108	TC	3	6	611854	611859	0 %	50 %	0 %	50 %	532351882
13509	NC_022108	GGTT	2	8	611900	611907	0 %	50 %	50 %	0 %	532351882
13510	NC_022108	GGATGG	2	12	611912	611923	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532351882
13511	NC_022108	AG	4	8	611965	611972	50 %	0 %	50 %	0 %	532351882
13512	NC_022108	TGG	2	6	611978	611983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351882
13513	NC_022108	ATA	2	6	612003	612008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351882
13514	NC_022108	GGCGC	2	10	612063	612072	0 %	0 %	60 %	40 %	532351882
13515	NC_022108	ATT	2	6	612089	612094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351882
13516	NC_022108	TAT	2	6	612097	612102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351882
13517	NC_022108	ATCG	2	8	612119	612126	25 %	25 %	25 %	25 %	532351882
13518	NC_022108	AGA	2	6	612181	612186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351882
13519	NC_022108	GAA	2	6	612203	612208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351882
13520	NC_022108	AG	3	6	612242	612247	50 %	0 %	50 %	0 %	532351882
13521	NC_022108	CT	3	6	612248	612253	0 %	50 %	0 %	50 %	532351882
13522	NC_022108	TTAC	2	8	612270	612277	25 %	50 %	0 %	25 %	532351882
13523	NC_022108	TAA	2	6	612286	612291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351882
13524	NC_022108	CCT	2	6	612315	612320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351882
13525	NC_022108	TTTA	2	8	612323	612330	25 %	75 %	0 %	0 %	532351882
13526	NC_022108	CT	3	6	612363	612368	0 %	50 %	0 %	50 %	532351882
13527	NC_022108	ATT	2	6	612387	612392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351882
13528	NC_022108	TTTG	2	8	612421	612428	0 %	75 %	25 %	0 %	532351882
13529	NC_022108	ATT	2	6	612439	612444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351882
13530	NC_022108	GGCT	2	8	612461	612468	0 %	25 %	50 %	25 %	532351882
13531	NC_022108	TCT	2	6	612513	612518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351882
13532	NC_022108	ATT	2	6	612526	612531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351882
13533	NC_022108	TGG	2	6	612575	612580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351882
13534	NC_022108	T	6	6	612610	612615	0 %	100 %	0 %	0 %	532351882
13535	NC_022108	ATG	2	6	612632	612637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351882
13536	NC_022108	ATTGG	2	10	612638	612647	20 %	40 %	40 %	0 %	532351882
13537	NC_022108	A	6	6	612668	612673	100 %	0 %	0 %	0 %	532351882
13538	NC_022108	AGC	2	6	612721	612726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351882
13539	NC_022108	TTG	2	6	612783	612788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351882
13540	NC_022108	TCAA	2	8	612948	612955	50 %	25 %	0 %	25 %	532351882
13541	NC_022108	TTG	2	6	612961	612966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351882
13542	NC_022108	CGCT	2	8	612994	613001	0 %	25 %	25 %	50 %	532351883
13543	NC_022108	TTTG	2	8	613019	613026	0 %	75 %	25 %	0 %	532351883
13544	NC_022108	ATC	2	6	613074	613079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351883
13545	NC_022108	A	9	9	613119	613127	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13546	NC_022108	CTT	2	6	613161	613166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351883
13547	NC_022108	GAA	2	6	613176	613181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13548	NC_022108	TTTG	2	8	613195	613202	0 %	75 %	25 %	0 %	532351883
13549	NC_022108	CTCTC	2	10	613203	613212	0 %	40 %	0 %	60 %	532351883
13550	NC_022108	ATAG	2	8	613248	613255	50 %	25 %	25 %	0 %	532351883
13551	NC_022108	GAA	2	6	613341	613346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13552	NC_022108	AAG	2	6	613387	613392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13553	NC_022108	AGA	2	6	613427	613432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13554	NC_022108	GAA	2	6	613449	613454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13555	NC_022108	AAAAC	2	10	613463	613472	80 %	0 %	0 %	20 %	532351883
13556	NC_022108	AAC	2	6	613492	613497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351883
13557	NC_022108	GCTC	2	8	613591	613598	0 %	25 %	25 %	50 %	532351883
13558	NC_022108	AG	3	6	613625	613630	50 %	0 %	50 %	0 %	532351883
13559	NC_022108	TAG	2	6	613690	613695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351883
13560	NC_022108	ATTTT	2	10	613699	613708	20 %	80 %	0 %	0 %	532351883
13561	NC_022108	GCA	2	6	613739	613744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351883
13562	NC_022108	CTATC	2	10	613819	613828	20 %	40 %	0 %	40 %	532351883
13563	NC_022108	A	8	8	613848	613855	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13564	NC_022108	AGA	2	6	613867	613872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13565	NC_022108	CTT	2	6	613897	613902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351883
13566	NC_022108	AGA	2	6	613903	613908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13567	NC_022108	AC	3	6	613938	613943	50 %	0 %	0 %	50 %	532351883
13568	NC_022108	TAT	3	9	614029	614037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351883
13569	NC_022108	ATT	2	6	614078	614083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351883
13570	NC_022108	TTC	2	6	614198	614203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351883
13571	NC_022108	TCA	2	6	614211	614216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351883
13572	NC_022108	CGATAT	3	18	614239	614256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532351883
13573	NC_022108	AG	3	6	614270	614275	50 %	0 %	50 %	0 %	532351883
13574	NC_022108	TTA	2	6	614280	614285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351883
13575	NC_022108	ATT	2	6	614327	614332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351883
13576	NC_022108	TGTA	2	8	614487	614494	25 %	50 %	25 %	0 %	532351883
13577	NC_022108	A	6	6	614531	614536	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13578	NC_022108	TGC	2	6	614569	614574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351883
13579	NC_022108	T	6	6	614701	614706	0 %	100 %	0 %	0 %	532351883
13580	NC_022108	CA	3	6	614740	614745	50 %	0 %	0 %	50 %	532351883
13581	NC_022108	A	7	7	614756	614762	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13582	NC_022108	TC	3	6	614814	614819	0 %	50 %	0 %	50 %	532351883
13583	NC_022108	TTC	2	6	614820	614825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351883
13584	NC_022108	GAA	2	6	614909	614914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13585	NC_022108	CAT	2	6	614964	614969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351883
13586	NC_022108	CGC	2	6	615128	615133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351883
13587	NC_022108	GA	3	6	615174	615179	50 %	0 %	50 %	0 %	532351883
13588	NC_022108	TAA	2	6	615271	615276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351883
13589	NC_022108	ACA	2	6	615311	615316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351883
13590	NC_022108	GCC	2	6	615353	615358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351883
13591	NC_022108	AAG	2	6	615408	615413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13592	NC_022108	CCT	2	6	615440	615445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351883
13593	NC_022108	TTG	2	6	615546	615551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351883
13594	NC_022108	AG	4	8	615553	615560	50 %	0 %	50 %	0 %	532351883
13595	NC_022108	A	7	7	615561	615567	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13596	NC_022108	A	6	6	615614	615619	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13597	NC_022108	TGG	2	6	615645	615650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351883
13598	NC_022108	TAA	2	6	615679	615684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351883
13599	NC_022108	A	8	8	615735	615742	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13600	NC_022108	GCT	2	6	615746	615751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351883
13601	NC_022108	T	7	7	615767	615773	0 %	100 %	0 %	0 %	532351883
13602	NC_022108	TC	3	6	615813	615818	0 %	50 %	0 %	50 %	532351883
13603	NC_022108	GTT	2	6	615850	615855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351883
13604	NC_022108	ATT	2	6	615980	615985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351883
13605	NC_022108	ACT	2	6	616013	616018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351883
13606	NC_022108	GCAGA	2	10	616031	616040	40 %	0 %	40 %	20 %	532351883
13607	NC_022108	A	6	6	616040	616045	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13608	NC_022108	GAA	2	6	616133	616138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351883
13609	NC_022108	TTAT	2	8	616146	616153	25 %	75 %	0 %	0 %	532351883
13610	NC_022108	CGA	2	6	616252	616257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351883
13611	NC_022108	A	6	6	616301	616306	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13612	NC_022108	A	7	7	616336	616342	100 %	0 %	0 %	0 %	532351883
13613	NC_022108	AG	3	6	616352	616357	50 %	0 %	50 %	0 %	532351883
13614	NC_022108	TC	3	6	616359	616364	0 %	50 %	0 %	50 %	532351883
13615	NC_022108	TAAA	2	8	616386	616393	75 %	25 %	0 %	0 %	532351883
13616	NC_022108	TTAT	2	8	616409	616416	25 %	75 %	0 %	0 %	532351883
13617	NC_022108	CT	4	8	616457	616464	0 %	50 %	0 %	50 %	532351883
13618	NC_022108	TC	3	6	616500	616505	0 %	50 %	0 %	50 %	532351883
13619	NC_022108	T	6	6	616516	616521	0 %	100 %	0 %	0 %	532351883
13620	NC_022108	GAT	2	6	616529	616534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351883
13621	NC_022108	TCTCT	2	10	616536	616545	0 %	60 %	0 %	40 %	532351883
13622	NC_022108	CTC	2	6	616622	616627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351883
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13624	NC_022108	CT	3	6	616735	616740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13750	NC_022108	TCT	2	6	622070	622075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351890
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13752	NC_022108	GAA	2	6	622134	622139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351890
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13815	NC_022108	GATT	2	8	624892	624899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13816	NC_022108	TCA	2	6	624932	624937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13994	NC_022108	GGA	2	6	633393	633398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351898
13995	NC_022108	CTT	2	6	633441	633446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351898
13996	NC_022108	AGA	2	6	633465	633470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351898
13997	NC_022108	GATA	2	8	633549	633556	50 %	25 %	25 %	0 %	532351898
13998	NC_022108	TCT	2	6	633629	633634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351898
13999	NC_022108	AT	3	6	633653	633658	50 %	50 %	0 %	0 %	532351898
14000	NC_022108	A	11	11	633661	633671	100 %	0 %	0 %	0 %	532351898

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