MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022108	TCCCT	2	10	274466	274475	0 %	40 %	0 %	60 %	532351590
6002	NC_022108	ATT	2	6	274484	274489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351590
6003	NC_022108	ATGG	2	8	274497	274504	25 %	25 %	50 %	0 %	532351590
6004	NC_022108	TCTT	2	8	274576	274583	0 %	75 %	0 %	25 %	532351590
6005	NC_022108	ATTT	2	8	274605	274612	25 %	75 %	0 %	0 %	532351590
6006	NC_022108	CAC	2	6	274643	274648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351590
6007	NC_022108	CAA	2	6	274652	274657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351590
6008	NC_022108	TAT	2	6	274669	274674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351590
6009	NC_022108	TCT	2	6	274756	274761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351590
6010	NC_022108	ATCCT	2	10	274770	274779	20 %	40 %	0 %	40 %	532351590
6011	NC_022108	GAT	2	6	274823	274828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351590
6012	NC_022108	AGA	2	6	274918	274923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351590
6013	NC_022108	TGA	2	6	274982	274987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351590
6014	NC_022108	AGGAG	2	10	275021	275030	40 %	0 %	60 %	0 %	532351591
6015	NC_022108	GCT	2	6	275121	275126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351591
6016	NC_022108	TGGAAT	2	12	275132	275143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351591
6017	NC_022108	AGC	2	6	275147	275152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351591
6018	NC_022108	ATT	2	6	275172	275177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351591
6019	NC_022108	TC	3	6	275197	275202	0 %	50 %	0 %	50 %	532351591
6020	NC_022108	TGC	2	6	275207	275212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351591
6021	NC_022108	GCA	2	6	275232	275237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351591
6022	NC_022108	TAT	2	6	275244	275249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351591
6023	NC_022108	GCT	2	6	275301	275306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351591
6024	NC_022108	CTT	2	6	275409	275414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351591
6025	NC_022108	AAC	2	6	275433	275438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351591
6026	NC_022108	AGA	2	6	275495	275500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351591
6027	NC_022108	AAG	2	6	275536	275541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351591
6028	NC_022108	GCT	2	6	275595	275600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351591
6029	NC_022108	AAC	2	6	275611	275616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351591
6030	NC_022108	CT	3	6	275625	275630	0 %	50 %	0 %	50 %	532351591
6031	NC_022108	ACGA	2	8	275648	275655	50 %	0 %	25 %	25 %	532351591
6032	NC_022108	CTC	2	6	275679	275684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351591
6033	NC_022108	A	7	7	275694	275700	100 %	0 %	0 %	0 %	532351591
6034	NC_022108	TTGTC	2	10	275708	275717	0 %	60 %	20 %	20 %	532351591
6035	NC_022108	GAA	2	6	275721	275726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351591
6036	NC_022108	ATT	2	6	275731	275736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351591
6037	NC_022108	ACG	2	6	275763	275768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351591
6038	NC_022108	ATC	2	6	275797	275802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351591
6039	NC_022108	CTC	2	6	275803	275808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351591
6040	NC_022108	ATA	2	6	275842	275847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351591
6041	NC_022108	A	6	6	275902	275907	100 %	0 %	0 %	0 %	532351591
6042	NC_022108	A	6	6	275992	275997	100 %	0 %	0 %	0 %	532351592
6043	NC_022108	TGGT	2	8	276081	276088	0 %	50 %	50 %	0 %	532351592
6044	NC_022108	AAG	2	6	276107	276112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351592
6045	NC_022108	GAA	2	6	276199	276204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351592
6046	NC_022108	TGT	2	6	276207	276212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351592
6047	NC_022108	ATG	2	6	276292	276297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351592
6048	NC_022108	TCCG	2	8	276302	276309	0 %	25 %	25 %	50 %	532351592
6049	NC_022108	ACC	2	6	276312	276317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351592
6050	NC_022108	CTC	2	6	276326	276331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351592
6051	NC_022108	A	7	7	276378	276384	100 %	0 %	0 %	0 %	532351592
6052	NC_022108	CT	3	6	276409	276414	0 %	50 %	0 %	50 %	532351592
6053	NC_022108	GGA	2	6	276436	276441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351592
6054	NC_022108	AAAG	2	8	276450	276457	75 %	0 %	25 %	0 %	532351592
6055	NC_022108	CTC	2	6	276470	276475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351592
6056	NC_022108	TA	3	6	276532	276537	50 %	50 %	0 %	0 %	532351592
6057	NC_022108	GAA	2	6	276538	276543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351592
6058	NC_022108	GCT	2	6	276586	276591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351592
6059	NC_022108	C	6	6	276638	276643	0 %	0 %	0 %	100 %	532351592
6060	NC_022108	ATT	2	6	276651	276656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351592
6061	NC_022108	CT	3	6	276685	276690	0 %	50 %	0 %	50 %	532351592
6062	NC_022108	ATTGT	2	10	276698	276707	20 %	60 %	20 %	0 %	532351592
6063	NC_022108	AATT	2	8	276744	276751	50 %	50 %	0 %	0 %	532351592
6064	NC_022108	ATT	2	6	276778	276783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351592
6065	NC_022108	A	6	6	276864	276869	100 %	0 %	0 %	0 %	532351592
6066	NC_022108	CAG	2	6	276919	276924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351592
6067	NC_022108	AGA	3	9	276933	276941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351592
6068	NC_022108	AGG	2	6	276948	276953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351592
6069	NC_022108	TTCT	2	8	276954	276961	0 %	75 %	0 %	25 %	532351592
6070	NC_022108	TCC	2	6	277014	277019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351592
6071	NC_022108	GCT	2	6	277024	277029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351592
6072	NC_022108	AAC	2	6	277055	277060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351592
6073	NC_022108	AGCT	2	8	277079	277086	25 %	25 %	25 %	25 %	532351592
6074	NC_022108	TGAT	2	8	277130	277137	25 %	50 %	25 %	0 %	532351592
6075	NC_022108	CTC	2	6	277177	277182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351592
6076	NC_022108	AAG	2	6	277212	277217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351592
6077	NC_022108	CTT	2	6	277229	277234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351592
6078	NC_022108	TCT	2	6	277235	277240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351592
6079	NC_022108	AAG	2	6	277241	277246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351592
6080	NC_022108	C	6	6	277317	277322	0 %	0 %	0 %	100 %	532351593
6081	NC_022108	CTT	2	6	277338	277343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351593
6082	NC_022108	TA	3	6	277395	277400	50 %	50 %	0 %	0 %	532351593
6083	NC_022108	TCT	2	6	277480	277485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351593
6084	NC_022108	GA	3	6	277487	277492	50 %	0 %	50 %	0 %	532351593
6085	NC_022108	TTG	2	6	277529	277534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351593
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6087	NC_022108	CCAT	2	8	277657	277664	25 %	25 %	0 %	50 %	532351593
6088	NC_022108	ATT	2	6	277842	277847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351593
6089	NC_022108	AAC	2	6	277848	277853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351593
6090	NC_022108	GCT	2	6	277855	277860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351593
6091	NC_022108	ATT	2	6	277863	277868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351593
6092	NC_022108	CATAG	2	10	277893	277902	40 %	20 %	20 %	20 %	532351593
6093	NC_022108	TC	3	6	277946	277951	0 %	50 %	0 %	50 %	532351593
6094	NC_022108	AAAT	2	8	277978	277985	75 %	25 %	0 %	0 %	532351593
6095	NC_022108	GCT	2	6	278095	278100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351593
6096	NC_022108	AACTT	2	10	278234	278243	40 %	40 %	0 %	20 %	532351593
6097	NC_022108	CCAA	2	8	278258	278265	50 %	0 %	0 %	50 %	532351593
6098	NC_022108	CAA	2	6	278318	278323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351593
6099	NC_022108	CAA	2	6	278393	278398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351593
6100	NC_022108	CTTC	2	8	278431	278438	0 %	50 %	0 %	50 %	532351593
6101	NC_022108	ATA	2	6	278443	278448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351593
6102	NC_022108	ATAA	2	8	278523	278530	75 %	25 %	0 %	0 %	532351593
6103	NC_022108	GAA	2	6	278546	278551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351593
6104	NC_022108	AAAT	2	8	278559	278566	75 %	25 %	0 %	0 %	532351593
6105	NC_022108	TC	3	6	278577	278582	0 %	50 %	0 %	50 %	532351593
6106	NC_022108	GAA	2	6	278594	278599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351593
6107	NC_022108	TAA	2	6	278676	278681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351593
6108	NC_022108	CAT	2	6	278685	278690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351593
6109	NC_022108	ACG	2	6	278781	278786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351593
6110	NC_022108	ATT	2	6	279006	279011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351593
6111	NC_022108	GGAACA	2	12	279019	279030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532351593
6112	NC_022108	ATGCT	2	10	279097	279106	20 %	40 %	20 %	20 %	532351593
6113	NC_022108	TCT	2	6	279218	279223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351593
6114	NC_022108	CAT	2	6	279341	279346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351593
6115	NC_022108	CTT	2	6	279395	279400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351593
6116	NC_022108	AGA	2	6	279412	279417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351593
6117	NC_022108	GTA	2	6	279474	279479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351593
6118	NC_022108	ATA	2	6	279501	279506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351593
6119	NC_022108	ACC	2	6	279524	279529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351593
6120	NC_022108	CCAT	2	8	279536	279543	25 %	25 %	0 %	50 %	532351593
6121	NC_022108	GAG	2	6	279596	279601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351593
6122	NC_022108	GCTT	2	8	279637	279644	0 %	50 %	25 %	25 %	532351593
6123	NC_022108	GTTT	2	8	279704	279711	0 %	75 %	25 %	0 %	532351593
6124	NC_022108	ATATTA	2	12	279727	279738	50 %	50 %	0 %	0 %	532351593
6125	NC_022108	AAAG	2	8	279739	279746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_022108	A	6	6	279794	279799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_022108	T	6	6	279818	279823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_022108	AGG	2	6	279829	279834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_022108	GCA	2	6	279913	279918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351594
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6139	NC_022108	TCT	2	6	280247	280252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_022108	TGA	2	6	280276	280281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_022108	CT	3	6	280324	280329	0 %	50 %	0 %	50 %	532351595
6142	NC_022108	ATC	2	6	280330	280335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351595
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6154	NC_022108	TAAT	2	8	280845	280852	50 %	50 %	0 %	0 %	532351595
6155	NC_022108	TTC	2	6	280855	280860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351595
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6213	NC_022108	TAC	2	6	283883	283888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351596
6214	NC_022108	GCT	2	6	283933	283938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351596
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6217	NC_022108	CGTT	2	8	284033	284040	0 %	50 %	25 %	25 %	532351596
6218	NC_022108	ATTC	2	8	284042	284049	25 %	50 %	0 %	25 %	532351596
6219	NC_022108	GGGA	2	8	284075	284082	25 %	0 %	75 %	0 %	532351596
6220	NC_022108	CAAA	2	8	284120	284127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6221	NC_022108	C	6	6	284282	284287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6222	NC_022108	AT	4	8	284341	284348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6223	NC_022108	CAT	2	6	284361	284366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6224	NC_022108	T	9	9	284366	284374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6225	NC_022108	TTC	2	6	284450	284455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351597
6226	NC_022108	GT	3	6	284474	284479	0 %	50 %	50 %	0 %	532351597
6227	NC_022108	CTG	2	6	284530	284535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351597
6228	NC_022108	CCA	2	6	284655	284660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351597
6229	NC_022108	A	6	6	284665	284670	100 %	0 %	0 %	0 %	532351597
6230	NC_022108	CAC	2	6	284846	284851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351597
6231	NC_022108	CCT	2	6	284880	284885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351597
6232	NC_022108	CTCC	2	8	284928	284935	0 %	25 %	0 %	75 %	532351597
6233	NC_022108	AAGC	2	8	284950	284957	50 %	0 %	25 %	25 %	532351597
6234	NC_022108	ATG	2	6	284967	284972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351597
6235	NC_022108	T	6	6	285023	285028	0 %	100 %	0 %	0 %	532351597
6236	NC_022108	CTC	2	6	285029	285034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351597
6237	NC_022108	GAT	2	6	285078	285083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351597
6238	NC_022108	A	7	7	285084	285090	100 %	0 %	0 %	0 %	532351597
6239	NC_022108	AG	3	6	285151	285156	50 %	0 %	50 %	0 %	532351597
6240	NC_022108	CT	3	6	285193	285198	0 %	50 %	0 %	50 %	532351597
6241	NC_022108	AGA	2	6	285204	285209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351597
6242	NC_022108	TAAA	2	8	285217	285224	75 %	25 %	0 %	0 %	532351597
6243	NC_022108	A	6	6	285222	285227	100 %	0 %	0 %	0 %	532351597
6244	NC_022108	T	6	6	285242	285247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_022108	A	6	6	285262	285267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_022108	TC	4	8	285284	285291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6247	NC_022108	T	6	6	285412	285417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_022108	CTT	2	6	285454	285459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6496	NC_022108	AAG	2	6	296298	296303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351609
6497	NC_022108	AGC	2	6	296320	296325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351609
6498	NC_022108	AATT	2	8	296339	296346	50 %	50 %	0 %	0 %	532351609
6499	NC_022108	A	6	6	296363	296368	100 %	0 %	0 %	0 %	532351609
6500	NC_022108	GTT	2	6	296373	296378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351609

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