MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022108	ACA	2	6	251962	251967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351568
5502	NC_022108	TC	3	6	252004	252009	0 %	50 %	0 %	50 %	532351568
5503	NC_022108	TTG	2	6	252061	252066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351568
5504	NC_022108	TCT	2	6	252083	252088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351568
5505	NC_022108	CAA	2	6	252140	252145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351568
5506	NC_022108	AGA	3	9	252213	252221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351568
5507	NC_022108	GGC	2	6	252224	252229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351568
5508	NC_022108	ACA	2	6	252254	252259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351568
5509	NC_022108	CAC	2	6	252261	252266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351568
5510	NC_022108	CAG	2	6	252267	252272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351568
5511	NC_022108	T	8	8	252336	252343	0 %	100 %	0 %	0 %	532351568
5512	NC_022108	TCC	2	6	252427	252432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351568
5513	NC_022108	GAAA	2	8	252448	252455	75 %	0 %	25 %	0 %	532351568
5514	NC_022108	T	7	7	252469	252475	0 %	100 %	0 %	0 %	532351568
5515	NC_022108	GCAG	2	8	252497	252504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_022108	AGAA	2	8	252530	252537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_022108	AG	3	6	252572	252577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_022108	TAT	2	6	252595	252600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_022108	ACA	2	6	252636	252641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_022108	A	6	6	252685	252690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_022108	TTG	2	6	252865	252870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351569
5522	NC_022108	TCT	2	6	252887	252892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351569
5523	NC_022108	TC	3	6	252934	252939	0 %	50 %	0 %	50 %	532351569
5524	NC_022108	T	7	7	252970	252976	0 %	100 %	0 %	0 %	532351569
5525	NC_022108	CCA	2	6	252983	252988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351569
5526	NC_022108	AAC	2	6	253036	253041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351569
5527	NC_022108	AATA	2	8	253090	253097	75 %	25 %	0 %	0 %	532351569
5528	NC_022108	GCT	2	6	253100	253105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351569
5529	NC_022108	ACA	2	6	253165	253170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351569
5530	NC_022108	CCA	2	6	253197	253202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351569
5531	NC_022108	CAA	2	6	253245	253250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351569
5532	NC_022108	CCCA	2	8	253353	253360	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5533	NC_022108	CTT	2	6	253482	253487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351570
5534	NC_022108	AAT	2	6	253561	253566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351570
5535	NC_022108	CTC	2	6	253572	253577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351570
5536	NC_022108	ACT	2	6	253580	253585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351570
5537	NC_022108	GAA	2	6	253598	253603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351570
5538	NC_022108	CTC	2	6	253629	253634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351570
5539	NC_022108	GCAA	2	8	253643	253650	50 %	0 %	25 %	25 %	532351570
5540	NC_022108	AAC	2	6	253660	253665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351570
5541	NC_022108	GTT	2	6	253705	253710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351570
5542	NC_022108	AAC	2	6	253744	253749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351570
5543	NC_022108	A	6	6	253758	253763	100 %	0 %	0 %	0 %	532351570
5544	NC_022108	TAA	2	6	253809	253814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_022108	TTC	2	6	253827	253832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_022108	T	7	7	253868	253874	0 %	100 %	0 %	0 %	532351571
5547	NC_022108	AGCA	2	8	253905	253912	50 %	0 %	25 %	25 %	532351571
5548	NC_022108	CTT	2	6	253922	253927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351571
5549	NC_022108	TCT	3	9	253933	253941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351571
5550	NC_022108	GATAA	2	10	253961	253970	60 %	20 %	20 %	0 %	532351571
5551	NC_022108	TCG	2	6	254027	254032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351571
5552	NC_022108	CATA	2	8	254048	254055	50 %	25 %	0 %	25 %	532351571
5553	NC_022108	TCC	2	6	254067	254072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351571
5554	NC_022108	TAA	2	6	254100	254105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351571
5555	NC_022108	AG	3	6	254125	254130	50 %	0 %	50 %	0 %	532351571
5556	NC_022108	A	6	6	254144	254149	100 %	0 %	0 %	0 %	532351571
5557	NC_022108	AGA	2	6	254155	254160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351571
5558	NC_022108	CAC	2	6	254162	254167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351571
5559	NC_022108	CAA	2	6	254208	254213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351571
5560	NC_022108	TAG	2	6	254230	254235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351571
5561	NC_022108	ACA	2	6	254288	254293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351571
5562	NC_022108	A	8	8	254328	254335	100 %	0 %	0 %	0 %	532351571
5563	NC_022108	TA	3	6	254377	254382	50 %	50 %	0 %	0 %	532351571
5564	NC_022108	CCAA	2	8	254412	254419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_022108	A	7	7	254436	254442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_022108	TAT	2	6	254455	254460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_022108	TTCA	2	8	254487	254494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5568	NC_022108	AGA	2	6	254523	254528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351572
5569	NC_022108	TGTT	2	8	254561	254568	0 %	75 %	25 %	0 %	532351572
5570	NC_022108	CGA	2	6	254682	254687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351572
5571	NC_022108	GCAAA	2	10	254694	254703	60 %	0 %	20 %	20 %	532351572
5572	NC_022108	AATA	2	8	254780	254787	75 %	25 %	0 %	0 %	532351572
5573	NC_022108	A	6	6	254846	254851	100 %	0 %	0 %	0 %	532351572
5574	NC_022108	A	7	7	254877	254883	100 %	0 %	0 %	0 %	532351572
5575	NC_022108	ATA	2	6	254890	254895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351572
5576	NC_022108	AACCCT	2	12	254936	254947	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_022108	AAAC	2	8	255010	255017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5578	NC_022108	AAG	2	6	255134	255139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_022108	AGC	2	6	255168	255173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_022108	CAAT	2	8	255274	255281	50 %	25 %	0 %	25 %	532351573
5581	NC_022108	TTA	2	6	255346	255351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351573
5582	NC_022108	CTTCT	2	10	255378	255387	0 %	60 %	0 %	40 %	532351573
5583	NC_022108	T	6	6	255421	255426	0 %	100 %	0 %	0 %	532351573
5584	NC_022108	CA	3	6	255480	255485	50 %	0 %	0 %	50 %	532351573
5585	NC_022108	AAT	2	6	255495	255500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351573
5586	NC_022108	GCA	2	6	255505	255510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351573
5587	NC_022108	ACA	2	6	255571	255576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351573
5588	NC_022108	TTG	2	6	255635	255640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351573
5589	NC_022108	AGA	2	6	255690	255695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351573
5590	NC_022108	TAG	2	6	255710	255715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351573
5591	NC_022108	ATTTTT	2	12	255731	255742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532351573
5592	NC_022108	GAG	2	6	255859	255864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_022108	ATT	2	6	255871	255876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_022108	T	6	6	255875	255880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_022108	ACG	2	6	255881	255886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_022108	CCTGCA	2	12	255892	255903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_022108	CTG	2	6	255949	255954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5598	NC_022108	TTG	2	6	255980	255985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351574
5599	NC_022108	TCTG	2	8	256005	256012	0 %	50 %	25 %	25 %	532351574
5600	NC_022108	TCC	2	6	256035	256040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351574
5601	NC_022108	TTC	2	6	256091	256096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351574
5602	NC_022108	CGA	2	6	256125	256130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5603	NC_022108	TTC	2	6	256172	256177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351574
5604	NC_022108	ACG	2	6	256232	256237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5605	NC_022108	AACC	2	8	256276	256283	50 %	0 %	0 %	50 %	532351574
5606	NC_022108	AAG	2	6	256309	256314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351574
5607	NC_022108	CTG	2	6	256333	256338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5608	NC_022108	GCT	2	6	256461	256466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5609	NC_022108	ATTT	2	8	256518	256525	25 %	75 %	0 %	0 %	532351574
5610	NC_022108	TAT	2	6	256563	256568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351574
5611	NC_022108	ATA	2	6	256572	256577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_022108	AAT	2	6	256596	256601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_022108	A	8	8	256676	256683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_022108	TC	3	6	256684	256689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_022108	TC	3	6	256770	256775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_022108	A	6	6	256779	256784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_022108	ATG	2	6	256790	256795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351575
5618	NC_022108	ATCT	2	8	256839	256846	25 %	50 %	0 %	25 %	532351575
5619	NC_022108	T	7	7	256881	256887	0 %	100 %	0 %	0 %	532351575
5620	NC_022108	GCT	2	6	256891	256896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351575
5621	NC_022108	CTT	2	6	256901	256906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5622	NC_022108	T	6	6	256922	256927	0 %	100 %	0 %	0 %	532351575
5623	NC_022108	CT	4	8	256990	256997	0 %	50 %	0 %	50 %	532351575
5624	NC_022108	TTA	2	6	257055	257060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351575
5625	NC_022108	GCC	2	6	257189	257194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351575
5626	NC_022108	TTCG	2	8	257252	257259	0 %	50 %	25 %	25 %	532351575
5627	NC_022108	CTT	2	6	257288	257293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
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5632	NC_022108	TC	3	6	257481	257486	0 %	50 %	0 %	50 %	532351575
5633	NC_022108	TCT	2	6	257543	257548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
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5741	NC_022108	A	6	6	262156	262161	100 %	0 %	0 %	0 %	532351579
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5744	NC_022108	A	6	6	262294	262299	100 %	0 %	0 %	0 %	532351579
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5749	NC_022108	TAA	2	6	262572	262577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351579
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