MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022107	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	532350437
2	NC_022107	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	532350438
3	NC_022107	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	532350438
4	NC_022107	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	532350438
5	NC_022107	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	532350438
6	NC_022107	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	532350439
7	NC_022107	TATTT	2	10	7032	7041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022107	TGGTA	2	10	7690	7699	20 %	40 %	40 %	0 %	532350441
9	NC_022107	CGAAA	2	10	9098	9107	60 %	0 %	20 %	20 %	532350442
10	NC_022107	GGCTG	2	10	9734	9743	0 %	20 %	60 %	20 %	532350443
11	NC_022107	CCTCT	2	10	10526	10535	0 %	40 %	0 %	60 %	532350444
12	NC_022107	AAAGG	2	10	10685	10694	60 %	0 %	40 %	0 %	532350444
13	NC_022107	AAGAA	2	10	11805	11814	80 %	0 %	20 %	0 %	532350445
14	NC_022107	AAAGA	2	10	13203	13212	80 %	0 %	20 %	0 %	532350446
15	NC_022107	GGTGT	2	10	13307	13316	0 %	40 %	60 %	0 %	532350446
16	NC_022107	GATTT	2	10	15050	15059	20 %	60 %	20 %	0 %	532350448
17	NC_022107	CGTTC	2	10	16161	16170	0 %	40 %	20 %	40 %	532350449
18	NC_022107	GCTTC	2	10	16534	16543	0 %	40 %	20 %	40 %	532350449
19	NC_022107	GAAGG	2	10	16905	16914	40 %	0 %	60 %	0 %	532350449
20	NC_022107	GTTGT	2	10	20331	20340	0 %	60 %	40 %	0 %	532350452
21	NC_022107	AAGAT	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	532350453
22	NC_022107	TTTGC	2	10	22054	22063	0 %	60 %	20 %	20 %	532350453
23	NC_022107	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	532350453
24	NC_022107	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	532350454
25	NC_022107	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	532350455
26	NC_022107	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	532350457
27	NC_022107	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	532350457
28	NC_022107	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	532350458
29	NC_022107	AAGGA	2	10	30422	30431	60 %	0 %	40 %	0 %	532350459
30	NC_022107	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	532350460
31	NC_022107	AAAGA	2	10	33094	33103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022107	TCAGT	2	10	35701	35710	20 %	40 %	20 %	20 %	532350466
33	NC_022107	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	532350466
34	NC_022107	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	532350466
35	NC_022107	ACGAT	2	10	38098	38107	40 %	20 %	20 %	20 %	532350467
36	NC_022107	TTTGA	2	10	38463	38472	20 %	60 %	20 %	0 %	532350467
37	NC_022107	AGCAA	2	10	42114	42123	60 %	0 %	20 %	20 %	532350470
38	NC_022107	CGATG	2	10	42171	42180	20 %	20 %	40 %	20 %	532350470
39	NC_022107	TGCAA	2	10	42329	42338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022107	CAAAA	2	10	42647	42656	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022107	TTTAT	2	10	44244	44253	20 %	80 %	0 %	0 %	532350474
42	NC_022107	CTTTC	2	10	46341	46350	0 %	60 %	0 %	40 %	532350476
43	NC_022107	AGTTT	2	10	46880	46889	20 %	60 %	20 %	0 %	532350476
44	NC_022107	GAAGA	2	10	48013	48022	60 %	0 %	40 %	0 %	532350476
45	NC_022107	CTATT	2	10	49592	49601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022107	CTTTT	2	10	50043	50052	0 %	80 %	0 %	20 %	532350479
47	NC_022107	ATTAA	2	10	51383	51392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022107	CCGTA	2	10	53926	53935	20 %	20 %	20 %	40 %	532350482
49	NC_022107	AATTT	2	10	54166	54175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022107	TTATC	2	10	55335	55344	20 %	60 %	0 %	20 %	532350483
51	NC_022107	TGAGT	2	10	55356	55365	20 %	40 %	40 %	0 %	532350483
52	NC_022107	GTTGT	2	10	56403	56412	0 %	60 %	40 %	0 %	532351274
53	NC_022107	GAGCA	2	10	59851	59860	40 %	0 %	40 %	20 %	532350484
54	NC_022107	TGTGA	2	10	62300	62309	20 %	40 %	40 %	0 %	532350486
55	NC_022107	AGTGA	2	10	63821	63830	40 %	20 %	40 %	0 %	532350487
56	NC_022107	CCTTC	2	10	64095	64104	0 %	40 %	0 %	60 %	532350487
57	NC_022107	AGGAG	2	10	66323	66332	40 %	0 %	60 %	0 %	532350489
58	NC_022107	GTTAA	2	10	66453	66462	40 %	40 %	20 %	0 %	532350489
59	NC_022107	AAAAG	2	10	69079	69088	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022107	GGAGC	2	10	69701	69710	20 %	0 %	60 %	20 %	532350492
61	NC_022107	GCGAT	2	10	69891	69900	20 %	20 %	40 %	20 %	532350492
62	NC_022107	CTCTT	2	10	70245	70254	0 %	60 %	0 %	40 %	532350492
63	NC_022107	AGGGG	2	10	70891	70900	20 %	0 %	80 %	0 %	532350492
64	NC_022107	AAGAA	2	10	70933	70942	80 %	0 %	20 %	0 %	532350492
65	NC_022107	CTTGC	2	10	72022	72031	0 %	40 %	20 %	40 %	532351277
66	NC_022107	ATTGG	2	10	72223	72232	20 %	40 %	40 %	0 %	532350494
67	NC_022107	GAAAA	2	10	73295	73304	80 %	0 %	20 %	0 %	532350494
68	NC_022107	TGGGA	2	10	73712	73721	20 %	20 %	60 %	0 %	532350495
69	NC_022107	TATTT	2	10	76239	76248	20 %	80 %	0 %	0 %	532350496
70	NC_022107	AAAAG	2	10	76772	76781	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022107	ATCAA	2	10	78470	78479	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022107	TGTCT	2	10	80033	80042	0 %	60 %	20 %	20 %	532350499
73	NC_022107	TTACT	2	10	80540	80549	20 %	60 %	0 %	20 %	532350499
74	NC_022107	AGAAA	2	10	81930	81939	80 %	0 %	20 %	0 %	532350501
75	NC_022107	GGAAG	2	10	82443	82452	40 %	0 %	60 %	0 %	532350501
76	NC_022107	AGCGA	2	10	84909	84918	40 %	0 %	40 %	20 %	532350503
77	NC_022107	TTTGT	2	10	85208	85217	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022107	GATCC	2	10	85994	86003	20 %	20 %	20 %	40 %	532350504
79	NC_022107	AGAGC	2	10	87329	87338	40 %	0 %	40 %	20 %	532351279
80	NC_022107	AATAA	2	10	88207	88216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022107	TTTTC	2	10	91061	91070	0 %	80 %	0 %	20 %	532350507
82	NC_022107	GGATG	2	10	91321	91330	20 %	20 %	60 %	0 %	532350508
83	NC_022107	CAACA	2	10	92860	92869	60 %	0 %	0 %	40 %	532350509
84	NC_022107	TTTAA	2	10	93743	93752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022107	ACAGC	2	10	93904	93913	40 %	0 %	20 %	40 %	532350511
86	NC_022107	CTTTT	2	10	94278	94287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022107	GGAAC	2	10	94617	94626	40 %	0 %	40 %	20 %	532350512
88	NC_022107	GGATT	2	10	95517	95526	20 %	40 %	40 %	0 %	532350512
89	NC_022107	CAATC	2	10	96619	96628	40 %	20 %	0 %	40 %	532350514
90	NC_022107	TTTGC	2	10	96753	96762	0 %	60 %	20 %	20 %	532350514
91	NC_022107	ATTCA	2	10	97017	97026	40 %	40 %	0 %	20 %	532350514
92	NC_022107	GATCC	2	10	97276	97285	20 %	20 %	20 %	40 %	532350514
93	NC_022107	GTTTT	2	10	97697	97706	0 %	80 %	20 %	0 %	532350514
94	NC_022107	ACAAA	2	10	97824	97833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022107	AAGCT	2	10	98900	98909	40 %	20 %	20 %	20 %	532350515
96	NC_022107	AGGGG	2	10	99259	99268	20 %	0 %	80 %	0 %	532350515
97	NC_022107	ATAGC	2	10	99958	99967	40 %	20 %	20 %	20 %	532350516
98	NC_022107	AGCGA	2	10	102886	102895	40 %	0 %	40 %	20 %	532350519
99	NC_022107	TTTCT	2	10	103244	103253	0 %	80 %	0 %	20 %	532350519
100	NC_022107	ATCAT	2	10	104450	104459	40 %	40 %	0 %	20 %	532350520
101	NC_022107	GGCAT	2	10	105158	105167	20 %	20 %	40 %	20 %	532350520
102	NC_022107	AAAGC	2	10	108884	108893	60 %	0 %	20 %	20 %	532350523
103	NC_022107	GCATT	2	10	110044	110053	20 %	40 %	20 %	20 %	532350524
104	NC_022107	GCTCT	2	10	114097	114106	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_022107	TGTTT	2	10	114721	114730	0 %	80 %	20 %	0 %	532350526
106	NC_022107	CATGT	2	10	115099	115108	20 %	40 %	20 %	20 %	532350526
107	NC_022107	TATCG	2	10	115803	115812	20 %	40 %	20 %	20 %	532350526
108	NC_022107	TTTCT	2	10	116319	116328	0 %	80 %	0 %	20 %	532350527
109	NC_022107	AAAGA	2	10	118564	118573	80 %	0 %	20 %	0 %	532350529
110	NC_022107	GCTTC	2	10	122554	122563	0 %	40 %	20 %	40 %	532350532
111	NC_022107	TACAA	2	10	126342	126351	60 %	20 %	0 %	20 %	532350536
112	NC_022107	ATCCA	2	10	128750	128759	40 %	20 %	0 %	40 %	532350539
113	NC_022107	GAAGA	2	10	130300	130309	60 %	0 %	40 %	0 %	532350539
114	NC_022107	AAAAG	2	10	132213	132222	80 %	0 %	20 %	0 %	532350540
115	NC_022107	GATTC	2	10	132544	132553	20 %	40 %	20 %	20 %	532350540
116	NC_022107	ATTGG	2	10	135829	135838	20 %	40 %	40 %	0 %	532350543
117	NC_022107	TGTTT	2	10	136288	136297	0 %	80 %	20 %	0 %	532350544
118	NC_022107	TTGCA	2	10	137078	137087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022107	TCCAG	2	10	140034	140043	20 %	20 %	20 %	40 %	532350549
120	NC_022107	GTACA	2	10	140765	140774	40 %	20 %	20 %	20 %	532350550
121	NC_022107	TAGAT	2	10	141138	141147	40 %	40 %	20 %	0 %	532350550
122	NC_022107	AAAAG	2	10	141550	141559	80 %	0 %	20 %	0 %	532351287
123	NC_022107	AAAAC	2	10	142030	142039	80 %	0 %	0 %	20 %	532350551
124	NC_022107	TGCTA	2	10	143116	143125	20 %	40 %	20 %	20 %	532350553
125	NC_022107	GGAGC	2	10	143163	143172	20 %	0 %	60 %	20 %	532350553
126	NC_022107	CTGGG	2	10	144577	144586	0 %	20 %	60 %	20 %	532350555
127	NC_022107	GTTTT	2	10	145324	145333	0 %	80 %	20 %	0 %	532350556
128	NC_022107	GAACC	2	10	149058	149067	40 %	0 %	20 %	40 %	532350557
129	NC_022107	ATTCT	2	10	152554	152563	20 %	60 %	0 %	20 %	532350561
130	NC_022107	CTGTG	2	10	152758	152767	0 %	40 %	40 %	20 %	532350561
131	NC_022107	TTCTT	2	10	155231	155240	0 %	80 %	0 %	20 %	532350564
132	NC_022107	TTCTA	2	10	157336	157345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022107	AGGAA	2	10	159789	159798	60 %	0 %	40 %	0 %	532350568
134	NC_022107	CAAAA	2	10	161792	161801	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022107	AGAGA	2	10	163020	163029	60 %	0 %	40 %	0 %	532350571
136	NC_022107	AGCAA	2	10	163455	163464	60 %	0 %	20 %	20 %	532350571
137	NC_022107	CAAAA	2	10	166958	166967	80 %	0 %	0 %	20 %	532350573
138	NC_022107	AAGAG	2	10	167791	167800	60 %	0 %	40 %	0 %	532350573
139	NC_022107	GATTG	2	10	168136	168145	20 %	40 %	40 %	0 %	532350573
140	NC_022107	GTTTT	2	10	174618	174627	0 %	80 %	20 %	0 %	532350577
141	NC_022107	TATTG	2	10	174641	174650	20 %	60 %	20 %	0 %	532350577
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150	NC_022107	TTGAG	2	10	182528	182537	20 %	40 %	40 %	0 %	532351289
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174	NC_022107	CTTGT	2	10	214613	214622	0 %	60 %	20 %	20 %	532350604
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178	NC_022107	GAAAC	2	10	222261	222270	60 %	0 %	20 %	20 %	532350611
179	NC_022107	CAATA	2	10	224223	224232	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
180	NC_022107	TATCT	2	10	224441	224450	20 %	60 %	0 %	20 %	532350613
181	NC_022107	TTTTC	2	10	224643	224652	0 %	80 %	0 %	20 %	532350613
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249	NC_022107	CTAAA	2	10	331622	331631	60 %	20 %	0 %	20 %	532350712
250	NC_022107	CAAAA	2	10	332102	332111	80 %	0 %	0 %	20 %	532350712
251	NC_022107	GCAAC	2	10	333803	333812	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
252	NC_022107	CTTGT	2	10	333863	333872	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_022107	CCTTT	2	10	334321	334330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
254	NC_022107	CTAAA	2	10	337424	337433	60 %	20 %	0 %	20 %	532350715
255	NC_022107	TCCAA	2	10	338059	338068	40 %	20 %	0 %	40 %	532350715
256	NC_022107	TCCAT	2	10	338142	338151	20 %	40 %	0 %	40 %	532350715
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259	NC_022107	CATTG	2	10	342338	342347	20 %	40 %	20 %	20 %	532350717
260	NC_022107	ATCCC	2	10	344394	344403	20 %	20 %	0 %	60 %	532350719
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262	NC_022107	GTTAC	2	10	350047	350056	20 %	40 %	20 %	20 %	532350725
263	NC_022107	ATCTC	2	10	351265	351274	20 %	40 %	0 %	40 %	532350726
264	NC_022107	CCTTC	2	10	353471	353480	0 %	40 %	0 %	60 %	532350726
265	NC_022107	ACACT	2	10	353635	353644	40 %	20 %	0 %	40 %	532350726
266	NC_022107	CACGA	2	10	356982	356991	40 %	0 %	20 %	40 %	532350727
267	NC_022107	ATTTA	2	10	357567	357576	40 %	60 %	0 %	0 %	532350727
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269	NC_022107	GCTTC	2	10	364189	364198	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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