MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 22979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_022107	CTT	2	6	633378	633383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350966
14003	NC_022107	AGA	2	6	633402	633407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350966
14004	NC_022107	GATA	2	8	633486	633493	50 %	25 %	25 %	0 %	532350966
14005	NC_022107	TCT	2	6	633566	633571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_022107	AT	3	6	633590	633595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_022107	A	11	11	633598	633608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_022107	T	6	6	633632	633637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_022107	A	6	6	633699	633704	100 %	0 %	0 %	0 %	532351328
14010	NC_022107	CCTG	2	8	633790	633797	0 %	25 %	25 %	50 %	532351328
14011	NC_022107	GTC	2	6	633870	633875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350967
14012	NC_022107	TAA	2	6	633878	633883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350967
14013	NC_022107	A	6	6	633882	633887	100 %	0 %	0 %	0 %	532350967
14014	NC_022107	TC	3	6	633890	633895	0 %	50 %	0 %	50 %	532350967
14015	NC_022107	AAG	2	6	633949	633954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350967
14016	NC_022107	GAA	2	6	633984	633989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350967
14017	NC_022107	AGGA	2	8	634030	634037	50 %	0 %	50 %	0 %	532350967
14018	NC_022107	TTA	2	6	634069	634074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350967
14019	NC_022107	CCTC	2	8	634108	634115	0 %	25 %	0 %	75 %	532350967
14020	NC_022107	ATC	2	6	634146	634151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350967
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14022	NC_022107	A	7	7	634292	634298	100 %	0 %	0 %	0 %	532350967
14023	NC_022107	CT	3	6	634326	634331	0 %	50 %	0 %	50 %	532350967
14024	NC_022107	A	6	6	634452	634457	100 %	0 %	0 %	0 %	532350967
14025	NC_022107	ACA	2	6	634473	634478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350967
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14027	NC_022107	TCT	2	6	634540	634545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350968
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14030	NC_022107	CTC	2	6	634633	634638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350968
14031	NC_022107	A	6	6	634663	634668	100 %	0 %	0 %	0 %	532350968
14032	NC_022107	CCT	2	6	634728	634733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350968
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14034	NC_022107	TCC	2	6	634746	634751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350968
14035	NC_022107	CCT	2	6	634843	634848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350968
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14038	NC_022107	CCT	2	6	634908	634913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350968
14039	NC_022107	A	6	6	634995	635000	100 %	0 %	0 %	0 %	532350968
14040	NC_022107	TCGAG	2	10	635005	635014	20 %	20 %	40 %	20 %	532350968
14041	NC_022107	T	6	6	635032	635037	0 %	100 %	0 %	0 %	532350968
14042	NC_022107	TTG	2	6	635062	635067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350968
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14044	NC_022107	CAA	2	6	635181	635186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350968
14045	NC_022107	ATC	2	6	635208	635213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350968
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14048	NC_022107	ATG	3	9	635328	635336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350968
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14050	NC_022107	CTA	2	6	635406	635411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350968
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14053	NC_022107	TTTG	2	8	635482	635489	0 %	75 %	25 %	0 %	532350969
14054	NC_022107	TTA	2	6	635510	635515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350969
14055	NC_022107	CTC	2	6	635532	635537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350969
14056	NC_022107	TAT	2	6	635539	635544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350969
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14060	NC_022107	TGC	2	6	635695	635700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350969
14061	NC_022107	GGCTC	2	10	635769	635778	0 %	20 %	40 %	40 %	532350970
14062	NC_022107	TA	3	6	635792	635797	50 %	50 %	0 %	0 %	532350970
14063	NC_022107	AGCC	2	8	635805	635812	25 %	0 %	25 %	50 %	532350970
14064	NC_022107	TCTT	2	8	635829	635836	0 %	75 %	0 %	25 %	532350970
14065	NC_022107	ATC	2	6	635870	635875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350970
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14067	NC_022107	TGC	2	6	635943	635948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350970
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14070	NC_022107	CT	3	6	636139	636144	0 %	50 %	0 %	50 %	532350970
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14085	NC_022107	GGAG	2	8	636638	636645	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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14087	NC_022107	TTG	2	6	636672	636677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_022107	TGC	2	6	636716	636721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350971
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14093	NC_022107	TG	3	6	637039	637044	0 %	50 %	50 %	0 %	532350971
14094	NC_022107	GAG	2	6	637100	637105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350971
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14096	NC_022107	T	7	7	637145	637151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_022107	ATTAA	2	10	637158	637167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_022107	A	6	6	637212	637217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_022107	TCT	2	6	637234	637239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350972
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14102	NC_022107	AAAG	2	8	637343	637350	75 %	0 %	25 %	0 %	532350972
14103	NC_022107	GCA	2	6	637433	637438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350972
14104	NC_022107	CTG	2	6	637468	637473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350972
14105	NC_022107	CG	3	6	637475	637480	0 %	0 %	50 %	50 %	532350972
14106	NC_022107	GAA	2	6	637548	637553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350972
14107	NC_022107	CAAC	2	8	637666	637673	50 %	0 %	0 %	50 %	532350972
14108	NC_022107	GGA	2	6	637689	637694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350972
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14110	NC_022107	AGCA	2	8	637756	637763	50 %	0 %	25 %	25 %	532350972
14111	NC_022107	GAA	2	6	637856	637861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350972
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14122	NC_022107	TGG	2	6	638256	638261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350973
14123	NC_022107	CCTT	2	8	638273	638280	0 %	50 %	0 %	50 %	532350973
14124	NC_022107	TCCAT	2	10	638339	638348	20 %	40 %	0 %	40 %	532350973
14125	NC_022107	AGAA	2	8	638349	638356	75 %	0 %	25 %	0 %	532350973
14126	NC_022107	CCT	2	6	638390	638395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350973
14127	NC_022107	CT	3	6	638394	638399	0 %	50 %	0 %	50 %	532350973
14128	NC_022107	CTA	2	6	638408	638413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350973
14129	NC_022107	GAAA	2	8	638502	638509	75 %	0 %	25 %	0 %	532350973
14130	NC_022107	A	6	6	638507	638512	100 %	0 %	0 %	0 %	532350973
14131	NC_022107	CTCTTT	2	12	638610	638621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350973
14132	NC_022107	ATATCC	2	12	638627	638638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350973
14133	NC_022107	AGC	2	6	638665	638670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350973
14134	NC_022107	T	6	6	638725	638730	0 %	100 %	0 %	0 %	532350973
14135	NC_022107	TAAACA	2	12	638738	638749	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532350973
14136	NC_022107	AGG	2	6	638847	638852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350974
14137	NC_022107	ACAT	2	8	638904	638911	50 %	25 %	0 %	25 %	532350974
14138	NC_022107	CAA	2	6	638914	638919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350974
14139	NC_022107	GA	3	6	638940	638945	50 %	0 %	50 %	0 %	532350974
14140	NC_022107	TCC	2	6	638976	638981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350974
14141	NC_022107	A	7	7	638987	638993	100 %	0 %	0 %	0 %	532350974
14142	NC_022107	ATGC	2	8	639003	639010	25 %	25 %	25 %	25 %	532350974
14143	NC_022107	ACGA	2	8	639043	639050	50 %	0 %	25 %	25 %	532350974
14144	NC_022107	GA	4	8	639102	639109	50 %	0 %	50 %	0 %	532350974
14145	NC_022107	AAG	2	6	639110	639115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350974
14146	NC_022107	CTA	2	6	639121	639126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350974
14147	NC_022107	A	6	6	639129	639134	100 %	0 %	0 %	0 %	532350974
14148	NC_022107	ACA	2	6	639205	639210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350975
14149	NC_022107	ATC	2	6	639213	639218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350975
14150	NC_022107	TCAT	2	8	639226	639233	25 %	50 %	0 %	25 %	532350975
14151	NC_022107	AAG	2	6	639240	639245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350975
14152	NC_022107	TCT	2	6	639247	639252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350975
14153	NC_022107	AAG	2	6	639267	639272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350975
14154	NC_022107	TTTC	2	8	639273	639280	0 %	75 %	0 %	25 %	532350975
14155	NC_022107	CAC	2	6	639289	639294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350975
14156	NC_022107	TCT	2	6	639301	639306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350975
14157	NC_022107	CAT	2	6	639366	639371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350975
14158	NC_022107	CCA	2	6	639460	639465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350975
14159	NC_022107	ATA	2	6	639466	639471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350975
14160	NC_022107	CAT	2	6	639492	639497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350975
14161	NC_022107	T	8	8	639524	639531	0 %	100 %	0 %	0 %	532350975
14162	NC_022107	TTC	2	6	639535	639540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350975
14163	NC_022107	CCT	2	6	639549	639554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14164	NC_022107	GAA	2	6	639588	639593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350976
14165	NC_022107	AATC	2	8	639607	639614	50 %	25 %	0 %	25 %	532350976
14166	NC_022107	ACC	2	6	639722	639727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350976
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14168	NC_022107	TCC	2	6	639817	639822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350976
14169	NC_022107	AAC	2	6	639826	639831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350976
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14171	NC_022107	CCT	2	6	639920	639925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350976
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14175	NC_022107	TCC	2	6	640078	640083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350976
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14177	NC_022107	AGAA	2	8	640202	640209	75 %	0 %	25 %	0 %	532350976
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14184	NC_022107	TAA	3	9	640531	640539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350976
14185	NC_022107	TC	4	8	640591	640598	0 %	50 %	0 %	50 %	532350976
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14189	NC_022107	CGT	2	6	640685	640690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350976
14190	NC_022107	T	6	6	640690	640695	0 %	100 %	0 %	0 %	532350976
14191	NC_022107	CCT	2	6	640739	640744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14192	NC_022107	CGGAA	2	10	640955	640964	40 %	0 %	40 %	20 %	532350977
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14194	NC_022107	CA	3	6	641052	641057	50 %	0 %	0 %	50 %	532350977
14195	NC_022107	TTG	2	6	641117	641122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350977
14196	NC_022107	ATA	2	6	641126	641131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350977
14197	NC_022107	CAT	2	6	641180	641185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350977
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14200	NC_022107	TA	3	6	641441	641446	50 %	50 %	0 %	0 %	532350977
14201	NC_022107	GTC	2	6	641452	641457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350977
14202	NC_022107	AGG	2	6	641522	641527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350977
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14204	NC_022107	ATGA	2	8	641613	641620	50 %	25 %	25 %	0 %	532350977
14205	NC_022107	TCC	2	6	641655	641660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350977
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14207	NC_022107	GCTC	2	8	641851	641858	0 %	25 %	25 %	50 %	532350977
14208	NC_022107	AAG	2	6	641925	641930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350977
14209	NC_022107	TA	3	6	642014	642019	50 %	50 %	0 %	0 %	532350977
14210	NC_022107	AAT	2	6	642036	642041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350977
14211	NC_022107	CTT	2	6	642047	642052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350977
14212	NC_022107	T	7	7	642119	642125	0 %	100 %	0 %	0 %	532350977
14213	NC_022107	GCA	2	6	642170	642175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350977
14214	NC_022107	AAT	2	6	642176	642181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350977
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14216	NC_022107	CAT	2	6	642246	642251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350977
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14219	NC_022107	TTTC	2	8	642305	642312	0 %	75 %	0 %	25 %	532350978
14220	NC_022107	AGC	2	6	642325	642330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350978
14221	NC_022107	CTG	2	6	642331	642336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350978
14222	NC_022107	CTA	2	6	642342	642347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350978
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14229	NC_022107	AAT	2	6	642580	642585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350978
14230	NC_022107	TAA	2	6	642699	642704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350978
14231	NC_022107	TAA	2	6	642732	642737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350978
14232	NC_022107	GAA	2	6	642741	642746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350978
14233	NC_022107	AGA	2	6	642799	642804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350978
14234	NC_022107	TTC	2	6	642820	642825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350978
14235	NC_022107	ACG	2	6	642863	642868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350978
14236	NC_022107	TTTC	2	8	643076	643083	0 %	75 %	0 %	25 %	532350978
14237	NC_022107	T	7	7	643110	643116	0 %	100 %	0 %	0 %	532350978
14238	NC_022107	CAA	2	6	643135	643140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350978
14239	NC_022107	ATCTTG	2	12	643142	643153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532350978
14240	NC_022107	CTT	2	6	643161	643166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350978
14241	NC_022107	CTT	2	6	643233	643238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350978
14242	NC_022107	ACT	2	6	643327	643332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350978
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14244	NC_022107	CT	3	6	643448	643453	0 %	50 %	0 %	50 %	532350978
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14248	NC_022107	TCT	2	6	643598	643603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350978
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14358	NC_022107	A	7	7	648795	648801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14363	NC_022107	TAG	2	6	648939	648944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14368	NC_022107	A	6	6	649008	649013	100 %	0 %	0 %	0 %	532350982
14369	NC_022107	TAA	2	6	649028	649033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350982
14370	NC_022107	A	6	6	649032	649037	100 %	0 %	0 %	0 %	532350982
14371	NC_022107	TGC	2	6	649061	649066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350982
14372	NC_022107	A	8	8	649069	649076	100 %	0 %	0 %	0 %	532350982
14373	NC_022107	TC	3	6	649196	649201	0 %	50 %	0 %	50 %	532350982
14374	NC_022107	TCC	2	6	649207	649212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350982
14375	NC_022107	TTC	2	6	649383	649388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350982
14376	NC_022107	TAC	2	6	649428	649433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350982
14377	NC_022107	TGA	2	6	649447	649452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350982
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14379	NC_022107	CGAT	2	8	649495	649502	25 %	25 %	25 %	25 %	532350982
14380	NC_022107	GCA	2	6	649546	649551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350982
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14385	NC_022107	A	6	6	649702	649707	100 %	0 %	0 %	0 %	532350983
14386	NC_022107	CAAG	2	8	649716	649723	50 %	0 %	25 %	25 %	532350983
14387	NC_022107	CA	3	6	649724	649729	50 %	0 %	0 %	50 %	532350983
14388	NC_022107	CTT	2	6	649730	649735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350983
14389	NC_022107	A	6	6	649768	649773	100 %	0 %	0 %	0 %	532350983
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14393	NC_022107	CT	3	6	649911	649916	0 %	50 %	0 %	50 %	532350983
14394	NC_022107	TAAA	2	8	650027	650034	75 %	25 %	0 %	0 %	532350983
14395	NC_022107	TGA	2	6	650043	650048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350983
14396	NC_022107	TCGTC	2	10	650056	650065	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14397	NC_022107	AGA	2	6	650083	650088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14398	NC_022107	TCT	2	6	650107	650112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350984
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14401	NC_022107	CTG	2	6	650285	650290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350984
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14405	NC_022107	AGCT	2	8	650418	650425	25 %	25 %	25 %	25 %	532350984
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14427	NC_022107	AAG	2	6	651368	651373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350984
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14431	NC_022107	CAG	2	6	651481	651486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350984
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14438	NC_022107	CTTC	2	8	651943	651950	0 %	50 %	0 %	50 %	532350985
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14456	NC_022107	CTTT	2	8	652913	652920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14460	NC_022107	A	6	6	653112	653117	100 %	0 %	0 %	0 %	532350986
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14462	NC_022107	CAAAT	2	10	653203	653212	60 %	20 %	0 %	20 %	532350986
14463	NC_022107	A	6	6	653216	653221	100 %	0 %	0 %	0 %	532350986
14464	NC_022107	CACAGG	2	12	653265	653276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350986
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14478	NC_022107	TTG	2	6	654017	654022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_022107	A	7	7	654036	654042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14480	NC_022107	A	7	7	654070	654076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14481	NC_022107	A	6	6	654086	654091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14482	NC_022107	TA	3	6	654109	654114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14483	NC_022107	CTC	2	6	654130	654135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14484	NC_022107	T	6	6	654253	654258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14485	NC_022107	AAG	2	6	654296	654301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350987
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14489	NC_022107	AC	3	6	654480	654485	50 %	0 %	0 %	50 %	532350987
14490	NC_022107	CTA	2	6	654570	654575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350987
14491	NC_022107	GAA	2	6	654601	654606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350987
14492	NC_022107	AGA	2	6	654645	654650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350987
14493	NC_022107	GCT	2	6	654691	654696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350987
14494	NC_022107	GAA	2	6	654751	654756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350987
14495	NC_022107	CCTT	2	8	654813	654820	0 %	50 %	0 %	50 %	532350987
14496	NC_022107	TCT	2	6	654859	654864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350987
14497	NC_022107	AT	3	6	654907	654912	50 %	50 %	0 %	0 %	532350987
14498	NC_022107	TCA	2	6	654954	654959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350987
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14500	NC_022107	A	7	7	654972	654978	100 %	0 %	0 %	0 %	532350987

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