MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 22979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022107	CTT	2	6	205954	205959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350597
4502	NC_022107	AGA	2	6	205973	205978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350597
4503	NC_022107	TTG	2	6	206029	206034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350597
4504	NC_022107	GATG	2	8	206050	206057	25 %	25 %	50 %	0 %	532350597
4505	NC_022107	ATTC	2	8	206123	206130	25 %	50 %	0 %	25 %	532350597
4506	NC_022107	GCT	2	6	206133	206138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350597
4507	NC_022107	CAA	3	9	206182	206190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350598
4508	NC_022107	T	6	6	206193	206198	0 %	100 %	0 %	0 %	532350598
4509	NC_022107	A	6	6	206215	206220	100 %	0 %	0 %	0 %	532350598
4510	NC_022107	CT	3	6	206292	206297	0 %	50 %	0 %	50 %	532350598
4511	NC_022107	TAT	2	6	206325	206330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350598
4512	NC_022107	AGT	2	6	206352	206357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350598
4513	NC_022107	TTC	2	6	206547	206552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350598
4514	NC_022107	GA	4	8	206642	206649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_022107	T	7	7	206672	206678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_022107	CT	4	8	206690	206697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_022107	A	6	6	206699	206704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_022107	GAA	2	6	206733	206738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350599
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4520	NC_022107	AGGA	2	8	206854	206861	50 %	0 %	50 %	0 %	532350599
4521	NC_022107	TTTG	2	8	206877	206884	0 %	75 %	25 %	0 %	532350599
4522	NC_022107	GAA	2	6	206928	206933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350599
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4532	NC_022107	TGA	2	6	207293	207298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350599
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4534	NC_022107	CT	3	6	207376	207381	0 %	50 %	0 %	50 %	532350599
4535	NC_022107	TTC	2	6	207465	207470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350599
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4541	NC_022107	TTC	2	6	207604	207609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350599
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4552	NC_022107	TGA	2	6	208208	208213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350599
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4560	NC_022107	GC	3	6	208469	208474	0 %	0 %	50 %	50 %	532350600
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4572	NC_022107	TGA	2	6	209170	209175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350601
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4600	NC_022107	CT	3	6	210435	210440	0 %	50 %	0 %	50 %	532350602
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4607	NC_022107	TG	3	6	210683	210688	0 %	50 %	50 %	0 %	532350603
4608	NC_022107	GAAC	2	8	210824	210831	50 %	0 %	25 %	25 %	532350603
4609	NC_022107	CA	4	8	210897	210904	50 %	0 %	0 %	50 %	532350603
4610	NC_022107	T	6	6	210962	210967	0 %	100 %	0 %	0 %	532350603
4611	NC_022107	CTC	2	6	210984	210989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350603
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4614	NC_022107	CAT	2	6	211113	211118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350603
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4619	NC_022107	TTCC	2	8	211275	211282	0 %	50 %	0 %	50 %	532350603
4620	NC_022107	TAA	2	6	211290	211295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
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4622	NC_022107	TTC	2	6	211433	211438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
4623	NC_022107	ATC	2	6	211513	211518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350603
4624	NC_022107	TGA	2	6	211530	211535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350603
4625	NC_022107	ATA	2	6	211553	211558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
4626	NC_022107	TCT	2	6	211559	211564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
4627	NC_022107	ACG	2	6	211603	211608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350603
4628	NC_022107	TTC	2	6	211642	211647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
4629	NC_022107	TAAC	2	8	211662	211669	50 %	25 %	0 %	25 %	532350603
4630	NC_022107	TCT	2	6	211670	211675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
4631	NC_022107	ATA	2	6	211693	211698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
4632	NC_022107	TGT	2	6	211829	211834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350603
4633	NC_022107	TAC	2	6	211873	211878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350603
4634	NC_022107	AAG	2	6	211904	211909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350603
4635	NC_022107	TTTA	2	8	211939	211946	25 %	75 %	0 %	0 %	532350603
4636	NC_022107	TTC	3	9	211959	211967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
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4639	NC_022107	ATTT	2	8	212244	212251	25 %	75 %	0 %	0 %	532350603
4640	NC_022107	AAT	2	6	212275	212280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
4641	NC_022107	GC	3	6	212324	212329	0 %	0 %	50 %	50 %	532350603
4642	NC_022107	AAT	2	6	212386	212391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
4643	NC_022107	CCT	2	6	212393	212398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350603
4644	NC_022107	AATT	2	8	212482	212489	50 %	50 %	0 %	0 %	532350603
4645	NC_022107	TTG	2	6	212514	212519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350603
4646	NC_022107	GAG	2	6	212540	212545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350603
4647	NC_022107	GCA	2	6	212699	212704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350603
4648	NC_022107	CAA	2	6	212745	212750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350603
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4650	NC_022107	GAT	2	6	213031	213036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350603
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4653	NC_022107	ATT	2	6	213081	213086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350604
4654	NC_022107	TTG	2	6	213227	213232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350604
4655	NC_022107	TC	3	6	213257	213262	0 %	50 %	0 %	50 %	532350604
4656	NC_022107	TTC	2	6	213296	213301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4657	NC_022107	AGT	2	6	213314	213319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350604
4658	NC_022107	AACA	2	8	213341	213348	75 %	0 %	0 %	25 %	532350604
4659	NC_022107	TCT	2	6	213367	213372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4660	NC_022107	TGGA	2	8	213399	213406	25 %	25 %	50 %	0 %	532350604
4661	NC_022107	TTC	2	6	213453	213458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4662	NC_022107	TA	3	6	213473	213478	50 %	50 %	0 %	0 %	532350604
4663	NC_022107	TTC	2	6	213501	213506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4664	NC_022107	GCA	2	6	213511	213516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350604
4665	NC_022107	GCT	2	6	213520	213525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350604
4666	NC_022107	GGA	2	6	213577	213582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350604
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4668	NC_022107	AACG	2	8	213693	213700	50 %	0 %	25 %	25 %	532350604
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4671	NC_022107	CCAT	2	8	213784	213791	25 %	25 %	0 %	50 %	532350604
4672	NC_022107	GA	3	6	213802	213807	50 %	0 %	50 %	0 %	532350604
4673	NC_022107	T	6	6	213822	213827	0 %	100 %	0 %	0 %	532350604
4674	NC_022107	AGG	2	6	213846	213851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350604
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4679	NC_022107	GCT	2	6	214027	214032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350604
4680	NC_022107	GAA	2	6	214112	214117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350604
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4682	NC_022107	AGCG	2	8	214238	214245	25 %	0 %	50 %	25 %	532350604
4683	NC_022107	CT	3	6	214275	214280	0 %	50 %	0 %	50 %	532350604
4684	NC_022107	CT	3	6	214283	214288	0 %	50 %	0 %	50 %	532350604
4685	NC_022107	AGC	2	6	214290	214295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350604
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4689	NC_022107	CTA	2	6	214484	214489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350604
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4691	NC_022107	TAGA	2	8	214535	214542	50 %	25 %	25 %	0 %	532350604
4692	NC_022107	CTTGT	2	10	214613	214622	0 %	60 %	20 %	20 %	532350604
4693	NC_022107	ATT	2	6	214629	214634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350604
4694	NC_022107	CAT	2	6	214703	214708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350604
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4697	NC_022107	CTGGAT	2	12	214940	214951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532350604
4698	NC_022107	GTA	2	6	215165	215170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350604
4699	NC_022107	ACC	2	6	215179	215184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350604
4700	NC_022107	CTTG	2	8	215207	215214	0 %	50 %	25 %	25 %	532350604
4701	NC_022107	GAAATA	2	12	215263	215274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532350604
4702	NC_022107	AAC	2	6	215295	215300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350604
4703	NC_022107	CCA	2	6	215345	215350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350604
4704	NC_022107	CGT	2	6	215456	215461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350604
4705	NC_022107	TTTCT	2	10	215463	215472	0 %	80 %	0 %	20 %	532350604
4706	NC_022107	TAA	2	6	215492	215497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350605
4707	NC_022107	CTG	2	6	215530	215535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350605
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4710	NC_022107	CCTT	2	8	215864	215871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4711	NC_022107	TTG	2	6	215890	215895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4712	NC_022107	A	6	6	215902	215907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4713	NC_022107	ACA	2	6	216033	216038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350606
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4715	NC_022107	CTT	2	6	216128	216133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350606
4716	NC_022107	TTG	2	6	216261	216266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350606
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4719	NC_022107	CTT	2	6	216317	216322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350606
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4724	NC_022107	CCA	2	6	216505	216510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350606
4725	NC_022107	TAC	2	6	216557	216562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350606
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4731	NC_022107	ATG	2	6	216800	216805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350607
4732	NC_022107	TGT	2	6	216808	216813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350607
4733	NC_022107	GC	3	6	216873	216878	0 %	0 %	50 %	50 %	532350607
4734	NC_022107	AGA	2	6	216935	216940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350607
4735	NC_022107	ATT	2	6	216950	216955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350607
4736	NC_022107	CTG	2	6	217102	217107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350607
4737	NC_022107	CAC	2	6	217130	217135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350607
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4739	NC_022107	C	6	6	217244	217249	0 %	0 %	0 %	100 %	532350607
4740	NC_022107	ATGA	2	8	217250	217257	50 %	25 %	25 %	0 %	532350607
4741	NC_022107	T	6	6	217284	217289	0 %	100 %	0 %	0 %	532350607
4742	NC_022107	GCA	2	6	217372	217377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350607
4743	NC_022107	GAA	2	6	217390	217395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350607
4744	NC_022107	GAAA	2	8	217443	217450	75 %	0 %	25 %	0 %	532350607
4745	NC_022107	TCA	2	6	217491	217496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350607
4746	NC_022107	ATG	2	6	217506	217511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350607
4747	NC_022107	TCC	2	6	217517	217522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350607
4748	NC_022107	T	6	6	217523	217528	0 %	100 %	0 %	0 %	532350607
4749	NC_022107	TAA	2	6	217603	217608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350607
4750	NC_022107	CCAC	2	8	217641	217648	25 %	0 %	0 %	75 %	532350607
4751	NC_022107	AGC	2	6	217649	217654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350607
4752	NC_022107	GAT	2	6	217684	217689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350607
4753	NC_022107	T	7	7	217826	217832	0 %	100 %	0 %	0 %	532350607
4754	NC_022107	A	7	7	217894	217900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_022107	TAA	2	6	217901	217906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_022107	AG	4	8	217926	217933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_022107	A	6	6	217951	217956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_022107	GAA	2	6	217961	217966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_022107	AGA	2	6	218116	218121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350608
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4765	NC_022107	TTC	2	6	218323	218328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
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4782	NC_022107	TTC	2	6	219046	219051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
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4786	NC_022107	CTG	2	6	219328	219333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350608
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4791	NC_022107	GTC	2	6	219499	219504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4793	NC_022107	T	6	6	219570	219575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4800	NC_022107	ATG	2	6	219884	219889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350609
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4823	NC_022107	AAATA	2	10	220647	220656	80 %	20 %	0 %	0 %	532350609
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4832	NC_022107	TAA	2	6	221073	221078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4833	NC_022107	ATTTC	2	10	221100	221109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4834	NC_022107	CT	3	6	221121	221126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4835	NC_022107	AATT	2	8	221133	221140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4844	NC_022107	TCG	2	6	221384	221389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350610
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4846	NC_022107	CTTG	2	8	221482	221489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4847	NC_022107	T	6	6	221537	221542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4852	NC_022107	CTAT	2	8	221809	221816	25 %	50 %	0 %	25 %	532350611
4853	NC_022107	GAT	2	6	222022	222027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350611
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4856	NC_022107	GATGCA	2	12	222118	222129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532350611
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4858	NC_022107	GAAAC	2	10	222261	222270	60 %	0 %	20 %	20 %	532350611
4859	NC_022107	GCA	2	6	222274	222279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350611
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4864	NC_022107	CTT	2	6	222437	222442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350611
4865	NC_022107	GA	4	8	222485	222492	50 %	0 %	50 %	0 %	532350611
4866	NC_022107	CA	3	6	222507	222512	50 %	0 %	0 %	50 %	532350611
4867	NC_022107	AGG	2	6	222521	222526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350611
4868	NC_022107	TGCT	2	8	222558	222565	0 %	50 %	25 %	25 %	532350611
4869	NC_022107	TCC	2	6	222597	222602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350612
4870	NC_022107	CA	3	6	222633	222638	50 %	0 %	0 %	50 %	532350612
4871	NC_022107	GAT	2	6	222657	222662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350612
4872	NC_022107	CTT	2	6	222693	222698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350612
4873	NC_022107	TCA	2	6	222716	222721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350612
4874	NC_022107	TCT	2	6	222787	222792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350612
4875	NC_022107	A	7	7	222804	222810	100 %	0 %	0 %	0 %	532350612
4876	NC_022107	A	6	6	222828	222833	100 %	0 %	0 %	0 %	532350612
4877	NC_022107	TTA	2	6	222856	222861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350612
4878	NC_022107	GTTC	2	8	222876	222883	0 %	50 %	25 %	25 %	532350612
4879	NC_022107	ATG	2	6	222889	222894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350612
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4881	NC_022107	T	6	6	222966	222971	0 %	100 %	0 %	0 %	532350612
4882	NC_022107	GAT	2	6	222978	222983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350612
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4911	NC_022107	TC	3	6	223895	223900	0 %	50 %	0 %	50 %	532350612
4912	NC_022107	A	7	7	223912	223918	100 %	0 %	0 %	0 %	532350612
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4989	NC_022107	T	6	6	227474	227479	0 %	100 %	0 %	0 %	532350616
4990	NC_022107	TCA	2	6	227482	227487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350616
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4993	NC_022107	CTT	2	6	227613	227618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350616
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