MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_022106	TGG	2	6	1022194	1022199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350338
22502	NC_022106	AG	3	6	1022201	1022206	50 %	0 %	50 %	0 %	532350338
22503	NC_022106	TTC	2	6	1022226	1022231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350338
22504	NC_022106	GAA	2	6	1022324	1022329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350338
22505	NC_022106	GATG	2	8	1022364	1022371	25 %	25 %	50 %	0 %	532350338
22506	NC_022106	ATT	2	6	1022385	1022390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350338
22507	NC_022106	ATG	2	6	1022487	1022492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350338
22508	NC_022106	GTT	2	6	1022495	1022500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350338
22509	NC_022106	TAT	2	6	1022568	1022573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350338
22510	NC_022106	GAAA	2	8	1022598	1022605	75 %	0 %	25 %	0 %	532350338
22511	NC_022106	G	6	6	1022617	1022622	0 %	0 %	100 %	0 %	532350338
22512	NC_022106	GA	3	6	1022638	1022643	50 %	0 %	50 %	0 %	532350338
22513	NC_022106	ATT	2	6	1022674	1022679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350338
22514	NC_022106	ATC	2	6	1022691	1022696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350338
22515	NC_022106	CTC	2	6	1022776	1022781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350338
22516	NC_022106	GTT	2	6	1022819	1022824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350338
22517	NC_022106	GCTTT	2	10	1022861	1022870	0 %	60 %	20 %	20 %	532350338
22518	NC_022106	CAT	2	6	1022876	1022881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350338
22519	NC_022106	TTAC	2	8	1022905	1022912	25 %	50 %	0 %	25 %	532350338
22520	NC_022106	TGA	2	6	1022946	1022951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350338
22521	NC_022106	AG	5	10	1023031	1023040	50 %	0 %	50 %	0 %	532350338
22522	NC_022106	GAT	2	6	1023062	1023067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350338
22523	NC_022106	CTG	2	6	1023082	1023087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350338
22524	NC_022106	CCT	2	6	1023107	1023112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350338
22525	NC_022106	T	6	6	1023126	1023131	0 %	100 %	0 %	0 %	532350338
22526	NC_022106	TC	3	6	1023243	1023248	0 %	50 %	0 %	50 %	532350339
22527	NC_022106	TTC	2	6	1023402	1023407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350339
22528	NC_022106	CTT	2	6	1023428	1023433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350339
22529	NC_022106	GATA	2	8	1023437	1023444	50 %	25 %	25 %	0 %	532350339
22530	NC_022106	TGT	2	6	1023487	1023492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350339
22531	NC_022106	GAA	2	6	1023522	1023527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350339
22532	NC_022106	CTT	2	6	1023626	1023631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350339
22533	NC_022106	CAG	2	6	1023638	1023643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350339
22534	NC_022106	GTC	2	6	1023692	1023697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350339
22535	NC_022106	GGA	2	6	1023721	1023726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350339
22536	NC_022106	CGTTGA	2	12	1023752	1023763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532350339
22537	NC_022106	TGTT	2	8	1023856	1023863	0 %	75 %	25 %	0 %	532350339
22538	NC_022106	AGG	2	6	1023915	1023920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350339
22539	NC_022106	GTT	2	6	1023958	1023963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350339
22540	NC_022106	ATG	2	6	1024066	1024071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350339
22541	NC_022106	AAG	2	6	1024094	1024099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350339
22542	NC_022106	GGA	2	6	1024156	1024161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350339
22543	NC_022106	ATA	2	6	1024177	1024182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350339
22544	NC_022106	TTA	2	6	1024193	1024198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22545	NC_022106	AAT	2	6	1024207	1024212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22546	NC_022106	AAAC	2	8	1024252	1024259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22547	NC_022106	TTA	2	6	1024275	1024280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22548	NC_022106	A	6	6	1024286	1024291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22549	NC_022106	CTG	2	6	1024300	1024305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22550	NC_022106	TC	3	6	1024352	1024357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22551	NC_022106	TTAGA	2	10	1024383	1024392	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22552	NC_022106	TC	3	6	1024530	1024535	0 %	50 %	0 %	50 %	532350340
22553	NC_022106	CCT	2	6	1024600	1024605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350340
22554	NC_022106	TGC	2	6	1024607	1024612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350340
22555	NC_022106	GTT	2	6	1024663	1024668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350340
22556	NC_022106	TCT	2	6	1024698	1024703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350340
22557	NC_022106	CGA	2	6	1024746	1024751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350340
22558	NC_022106	TAGC	2	8	1024807	1024814	25 %	25 %	25 %	25 %	532350340
22559	NC_022106	GAG	2	6	1024880	1024885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350340
22560	NC_022106	GTT	2	6	1024887	1024892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350340
22561	NC_022106	GGC	2	6	1024903	1024908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350340
22562	NC_022106	CAG	2	6	1024926	1024931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350340
22563	NC_022106	AG	3	6	1024938	1024943	50 %	0 %	50 %	0 %	532350340
22564	NC_022106	T	6	6	1024973	1024978	0 %	100 %	0 %	0 %	532350340
22565	NC_022106	TCT	2	6	1024980	1024985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350340
22566	NC_022106	GAT	2	6	1024994	1024999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350340
22567	NC_022106	G	6	6	1025028	1025033	0 %	0 %	100 %	0 %	532350340
22568	NC_022106	AAT	2	6	1025093	1025098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350340
22569	NC_022106	GTC	2	6	1025137	1025142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350340
22570	NC_022106	AGG	2	6	1025193	1025198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350340
22571	NC_022106	TCT	2	6	1025199	1025204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350340
22572	NC_022106	AGG	2	6	1025231	1025236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350340
22573	NC_022106	G	8	8	1025328	1025335	0 %	0 %	100 %	0 %	532350340
22574	NC_022106	AGG	2	6	1025360	1025365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350340
22575	NC_022106	GGA	2	6	1025370	1025375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350340
22576	NC_022106	TAG	2	6	1025407	1025412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350340
22577	NC_022106	GCA	2	6	1025426	1025431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350340
22578	NC_022106	AATC	2	8	1025474	1025481	50 %	25 %	0 %	25 %	532350340
22579	NC_022106	AAC	3	9	1025489	1025497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350340
22580	NC_022106	AAG	2	6	1025498	1025503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350340
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22582	NC_022106	GAG	2	6	1025587	1025592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350340
22583	NC_022106	AGTTG	2	10	1025612	1025621	20 %	40 %	40 %	0 %	532350340
22584	NC_022106	ACA	2	6	1025629	1025634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350340
22585	NC_022106	TTAA	2	8	1025648	1025655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22586	NC_022106	AAAG	2	8	1025662	1025669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22587	NC_022106	AT	3	6	1025671	1025676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22588	NC_022106	T	6	6	1025693	1025698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22589	NC_022106	ACCAA	2	10	1025969	1025978	60 %	0 %	0 %	40 %	532350341
22590	NC_022106	AATA	2	8	1026193	1026200	75 %	25 %	0 %	0 %	532350341
22591	NC_022106	A	6	6	1026266	1026271	100 %	0 %	0 %	0 %	532350341
22592	NC_022106	CTT	2	6	1026400	1026405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350341
22593	NC_022106	AGA	2	6	1026446	1026451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350341
22594	NC_022106	GTT	2	6	1026455	1026460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350341
22595	NC_022106	T	6	6	1026459	1026464	0 %	100 %	0 %	0 %	532350341
22596	NC_022106	CTGA	2	8	1026494	1026501	25 %	25 %	25 %	25 %	532350341
22597	NC_022106	GT	4	8	1026516	1026523	0 %	50 %	50 %	0 %	532350341
22598	NC_022106	ATC	2	6	1026534	1026539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350341
22599	NC_022106	GAT	2	6	1026577	1026582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350341
22600	NC_022106	CAT	2	6	1026605	1026610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350341
22601	NC_022106	TCC	3	9	1026617	1026625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350341
22602	NC_022106	GAT	2	6	1026643	1026648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350341
22603	NC_022106	T	6	6	1026672	1026677	0 %	100 %	0 %	0 %	532350341
22604	NC_022106	AGC	2	6	1026693	1026698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350341
22605	NC_022106	TAG	2	6	1026776	1026781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350341
22606	NC_022106	TTG	2	6	1026823	1026828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350341
22607	NC_022106	CCAT	2	8	1026887	1026894	25 %	25 %	0 %	50 %	532350341
22608	NC_022106	ATAG	2	8	1026963	1026970	50 %	25 %	25 %	0 %	532350341
22609	NC_022106	TGA	2	6	1026980	1026985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350341
22610	NC_022106	TCA	2	6	1027032	1027037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350341
22611	NC_022106	TGAG	2	8	1027039	1027046	25 %	25 %	50 %	0 %	532350341
22612	NC_022106	CTG	2	6	1027084	1027089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350341
22613	NC_022106	CAC	2	6	1027141	1027146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350341
22614	NC_022106	GAA	2	6	1027158	1027163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350341
22615	NC_022106	ACA	2	6	1027263	1027268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350341
22616	NC_022106	TG	3	6	1027278	1027283	0 %	50 %	50 %	0 %	532350341
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22738	NC_022106	TAAT	2	8	1031946	1031953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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